More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_2675 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_2675  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 798 aa  1582    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2002  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  45.15 
 
 		 782 aa  628  1e-178  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0262543  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0162  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  45.49 
 
 		 787 aa  625  1e-177  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.842242  normal  0.67921 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0118  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  36.2 
 
 		 861 aa  396  1e-109  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.235165  normal  0.571653 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0080  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  35.82 
 
 		 829 aa  368  1e-100  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.572947 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0500  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.7 
 
 		 830 aa  352  1e-95  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.919247  hitchhiker  0.00131243 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3296  histidine kinase  38.29 
 
 		 837 aa  351  3e-95  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.584314 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3443  PAS/PAC sensor Signal transduction histidine kinase  34.64 
 
 		 801 aa  351  4e-95  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4942  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.1 
 
 		 857 aa  350  4e-95  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.485802  normal  0.436687 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1605  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  36.12 
 
 		 830 aa  346  8e-94  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0705844  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0045  histidine kinase  34.04 
 
 		 838 aa  339  9.999999999999999e-92  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.327934 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0588  histidine kinase  32.02 
 
 		 903 aa  336  1e-90  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.416059  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4896  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.24 
 
 		 842 aa  332  2e-89  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4432  ATPase domain-containing protein  34.3 
 
 		 846 aa  332  2e-89  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.645763 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0207  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.37 
 
 		 837 aa  331  3e-89  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.749864  normal  0.519956 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0082  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.43 
 
 		 837 aa  330  6e-89  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0085  putative sensor histidine kinase  33.59 
 
 		 835 aa  325  2e-87  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.376568 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0667  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.38 
 
 		 859 aa  325  3e-87  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.370657 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0382  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.27 
 
 		 843 aa  324  4e-87  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4834  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  36.29 
 
 		 770 aa  320  9e-86  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3963  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.42 
 
 		 861 aa  317  6e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0742  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.82 
 
 		 862 aa  317  7e-85  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4290  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.27 
 
 		 861 aa  313  9e-84  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.731111  normal  0.889005 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3577  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.82 
 
 		 843 aa  309  1.0000000000000001e-82  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2016  putative sensory box histidine kinase  32.28 
 
 		 837 aa  308  3e-82  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.377194  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0050  two component sensor kinase  31.39 
 
 		 911 aa  308  3e-82  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0821  histidine kinase  32.28 
 
 		 858 aa  307  5.0000000000000004e-82  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0624  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.63 
 
 		 837 aa  307  6e-82  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0348163  normal  0.542065 
 
 
-
 
NC_004310  BR2099  sensory box histidine kinase, putative  32.12 
 
 		 859 aa  304  4.0000000000000003e-81  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.320612  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0053  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.67 
 
 		 838 aa  300  5e-80  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3246  histidine kinase  30.98 
 
 		 826 aa  292  2e-77  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1354  sensor histidine kinase  27.32 
 
 		 824 aa  261  3e-68  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0950  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.63 
 
 		 911 aa  167  1.0000000000000001e-39  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.666627 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1052  sensory transduction histidine kinase  33.92 
 
 		 1046 aa  161  6e-38  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2689  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38.56 
 
 		 646 aa  160  8e-38  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.119288 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0786  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38.79 
 
 		 582 aa  156  1e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0066  PAS/PAC sensor Signal transduction histidine kinase  37 
 
 		 773 aa  154  4e-36  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.712477  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4432  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.1 
 
 		 1002 aa  154  5e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1142  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.85 
 
 		 631 aa  154  8.999999999999999e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0047  histidine kinase  37.71 
 
 		 508 aa  153  1e-35  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0142  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.26 
 
 		 421 aa  152  2e-35  Methanococcus vannielii SB  Archaea  decreased coverage  0.00283134  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2725  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  36.9 
 
 		 568 aa  152  3e-35  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3648  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.17 
 
 		 1237 aa  151  4e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.289797  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3084  histidine kinase  34.3 
 
 		 496 aa  151  4e-35  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000309277  hitchhiker  0.00206907 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5514  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38.46 
 
 		 1010 aa  151  5e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1885  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38.43 
 
 		 792 aa  150  1.0000000000000001e-34  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3094  two-component sensor histidine kinase  29.26 
 
 		 774 aa  149  3e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0083  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.68 
 
 		 763 aa  148  4.0000000000000006e-34  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.172925  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2194  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.14 
 
 		 1363 aa  148  5e-34  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0141  two-component system sensor protein  36.8 
 
 		 952 aa  147  6e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0828  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.69 
 
 		 604 aa  147  7.0000000000000006e-34  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000197924  normal  0.403449 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2018  ATP-binding region, ATPase-like  28.97 
 
 		 771 aa  147  8.000000000000001e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.88254  normal  0.468508 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4719  sensory box histidine kinase PhoR  29.64 
 
 		 587 aa  146  1e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4483  sensory box histidine kinase PhoR  29.36 
 
 		 587 aa  146  1e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4698  sensory box histidine kinase PhoR  29.09 
 
 		 587 aa  146  1e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.92933  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4703  sensory box histidine kinase PhoR  29.36 
 
 		 587 aa  146  1e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.53621e-18 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4832  sensory box histidine kinase PhoR  29.36 
 
 		 587 aa  146  1e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.714625  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0644  GAF sensor hybrid histidine kinase  37.89 
 
 		 754 aa  146  1e-33  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0540  sensory box histidine kinase PhoR  29.36 
 
 		 587 aa  146  1e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000110325 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4061  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.06 
 
 		 885 aa  147  1e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.193403  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1373  two component sensor kinase  27.71 
 
 		 790 aa  146  1e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4318  phosphate regulon sensor protein  29.36 
 
 		 587 aa  146  2e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4329  phosphate regulon sensor protein  29.36 
 
 		 587 aa  145  2e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3876  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.22 
 
 		 1022 aa  145  2e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3436  histidine kinase  28.87 
 
 		 771 aa  145  2e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.416045  normal  0.0284383 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5235  GAF sensor hybrid histidine kinase  31.97 
 
 		 757 aa  145  2e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1078  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.95 
 
 		 458 aa  145  2e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0839  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.27 
 
 		 1207 aa  146  2e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2674  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.89 
 
 		 585 aa  145  2e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.239294  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4713  sensory box histidine kinase PhoR  29.36 
 
 		 587 aa  145  3e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1100  PAS  32.38 
 
 		 576 aa  144  5e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.897667  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1639  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 		 583 aa  144  6e-33  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.19247  normal  0.411999 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0159  response regulator/sensor histidine kinase  37.31 
 
 		 1032 aa  144  6e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.636877  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2759  multi-sensor signal transduction histidine kinase  39.29 
 
 		 785 aa  144  6e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3771  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.51 
 
 		 1039 aa  144  6e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000191257 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0180  response regulator/sensor histidine kinase  37.31 
 
 		 1014 aa  144  7e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.696748  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1700  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.68 
 
 		 798 aa  144  7e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0658643 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4418  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.09 
 
 		 587 aa  144  8e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1628  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.12 
 
 		 1070 aa  144  9e-33  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2403  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  25.82 
 
 		 371 aa  144  9e-33  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03280  hybrid sensory histidine protein kinase  36.12 
 
 		 957 aa  143  9.999999999999999e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.558043  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3552  Cache sensor hybrid histidine kinase  36.47 
 
 		 970 aa  143  9.999999999999999e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1284  histidine kinase  34.66 
 
 		 560 aa  143  9.999999999999999e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0983353  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1627  two-component system sensor protein  36.94 
 
 		 988 aa  142  1.9999999999999998e-32  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0255919  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2947  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.96 
 
 		 503 aa  142  1.9999999999999998e-32  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2148  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.13 
 
 		 769 aa  142  1.9999999999999998e-32  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0156  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.98 
 
 		 720 aa  142  3e-32  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0932  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.97 
 
 		 827 aa  142  3e-32  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.202098 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43120  periplasmic sensory histidine protein kinase  35.69 
 
 		 830 aa  142  3e-32  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0204  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  35.06 
 
 		 687 aa  141  3.9999999999999997e-32  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.478023 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0626  histidine kinase  37.19 
 
 		 1137 aa  141  3.9999999999999997e-32  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3270  histidine kinase  35.02 
 
 		 565 aa  141  3.9999999999999997e-32  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0800  histidine kinase  33.21 
 
 		 882 aa  141  4.999999999999999e-32  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.127646  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1437  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.36 
 
 		 640 aa  141  4.999999999999999e-32  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1217  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.13 
 
 		 1877 aa  140  6e-32  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1430  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.11 
 
 		 737 aa  141  6e-32  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.224344 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0065  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.5 
 
 		 377 aa  140  7e-32  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4990  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.14 
 
 		 955 aa  140  7.999999999999999e-32  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3250  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.2 
 
 		 880 aa  139  1e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0318  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.62 
 
 		 1223 aa  140  1e-31  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.455432  normal  0.438074 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>