More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_2002 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007794  Saro_2002  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 782 aa  1536    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0262543  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0162  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  49.62 
 
 		 787 aa  665    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.842242  normal  0.67921 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2675  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  46.19 
 
 		 798 aa  618  1e-175  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4942  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  35.75 
 
 		 857 aa  373  1e-102  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.485802  normal  0.436687 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0500  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.8 
 
 		 830 aa  372  1e-101  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.919247  hitchhiker  0.00131243 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4896  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  35.59 
 
 		 842 aa  361  3e-98  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4432  ATPase domain-containing protein  35.59 
 
 		 846 aa  360  5e-98  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.645763 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1605  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  35.76 
 
 		 830 aa  359  8e-98  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0705844  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0118  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.02 
 
 		 861 aa  352  2e-95  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.235165  normal  0.571653 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3577  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.12 
 
 		 843 aa  335  2e-90  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0382  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 		 843 aa  329  1.0000000000000001e-88  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0207  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.08 
 
 		 837 aa  327  4.0000000000000003e-88  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.749864  normal  0.519956 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2016  putative sensory box histidine kinase  31.46 
 
 		 837 aa  325  2e-87  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.377194  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2099  sensory box histidine kinase, putative  31.46 
 
 		 859 aa  324  4e-87  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.320612  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0080  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.51 
 
 		 829 aa  322  1.9999999999999998e-86  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.572947 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0667  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.87 
 
 		 859 aa  321  3.9999999999999996e-86  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.370657 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0045  histidine kinase  34.11 
 
 		 838 aa  320  6e-86  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.327934 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3963  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.59 
 
 		 861 aa  320  7.999999999999999e-86  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4290  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.64 
 
 		 861 aa  318  2e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.731111  normal  0.889005 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0050  two component sensor kinase  33.23 
 
 		 911 aa  318  3e-85  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0624  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.62 
 
 		 837 aa  316  9.999999999999999e-85  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0348163  normal  0.542065 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0588  histidine kinase  32.14 
 
 		 903 aa  316  9.999999999999999e-85  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.416059  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3443  PAS/PAC sensor Signal transduction histidine kinase  34.38 
 
 		 801 aa  315  1.9999999999999998e-84  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0821  histidine kinase  33.18 
 
 		 858 aa  314  2.9999999999999996e-84  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0742  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.88 
 
 		 862 aa  315  2.9999999999999996e-84  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3246  histidine kinase  32.83 
 
 		 826 aa  313  1e-83  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0082  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.63 
 
 		 837 aa  311  2.9999999999999997e-83  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0053  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  35.08 
 
 		 838 aa  305  2.0000000000000002e-81  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3296  histidine kinase  34.71 
 
 		 837 aa  303  6.000000000000001e-81  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.584314 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0085  putative sensor histidine kinase  33.48 
 
 		 835 aa  298  4e-79  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.376568 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4834  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.36 
 
 		 770 aa  287  5.999999999999999e-76  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1354  sensor histidine kinase  27.42 
 
 		 824 aa  268  2e-70  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1449  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  30.53 
 
 		 775 aa  147  1e-33  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  decreased coverage  0.00109411  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3213  PAS/PAC sensor Signal transduction histidine kinase  38.98 
 
 		 778 aa  144  5e-33  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1358  histidine kinase  34.78 
 
 		 288 aa  139  3.0000000000000003e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.688927  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0327  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  36.95 
 
 		 620 aa  135  3e-30  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0905  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.79 
 
 		 774 aa  135  3e-30  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.226148  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1200  Signal transduction histidine kinase  27.87 
 
 		 779 aa  134  6.999999999999999e-30  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0159  response regulator/sensor histidine kinase  36.4 
 
 		 1032 aa  133  1.0000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.636877  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0268  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.56 
 
 		 764 aa  133  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0862951 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0180  response regulator/sensor histidine kinase  36.4 
 
 		 1014 aa  133  1.0000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.696748  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3007  two component system histidine kinase  32.76 
 
 		 729 aa  132  2.0000000000000002e-29  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0422303  hitchhiker  0.00299589 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1627  two-component system sensor protein  36.4 
 
 		 988 aa  133  2.0000000000000002e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0255919  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2689  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.34 
 
 		 646 aa  132  2.0000000000000002e-29  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.119288 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0083  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.31 
 
 		 763 aa  131  4.0000000000000003e-29  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.172925  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4466  histidine kinase  34.73 
 
 		 464 aa  130  7.000000000000001e-29  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.734574  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4321  histidine kinase  34.9 
 
 		 461 aa  130  9.000000000000001e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.332203  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0899  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  36.93 
 
 		 562 aa  130  9.000000000000001e-29  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.000736499  normal  0.0870171 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2944  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  32.39 
 
 		 573 aa  129  2.0000000000000002e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3543  multi-sensor hybrid histidine kinase  26.72 
 
 		 1603 aa  129  2.0000000000000002e-28  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00143205 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5476  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.28 
 
 		 782 aa  129  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2386  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  36.97 
 
 		 417 aa  128  3e-28  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.459893  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2663  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.04 
 
 		 784 aa  128  4.0000000000000003e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.501852  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2674  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.12 
 
 		 585 aa  127  6e-28  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.239294  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2148  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  35.19 
 
 		 769 aa  127  7e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2474  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  36.55 
 
 		 417 aa  127  8.000000000000001e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0596181  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1481  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  35.32 
 
 		 418 aa  127  1e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0615  sensory box histidine kinase  29.51 
 
 		 783 aa  126  2e-27  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0616  sensory box histidine kinase  29.51 
 
 		 783 aa  126  2e-27  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.260748  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4476  histidine kinase  34.12 
 
 		 461 aa  125  2e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0860551  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4245  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.89 
 
 		 654 aa  125  2e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0141  two-component system sensor protein  34.87 
 
 		 952 aa  125  2e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4457  histidine kinase  34.12 
 
 		 461 aa  125  2e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0950  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.74 
 
 		 911 aa  126  2e-27  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.666627 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1221  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.9 
 
 		 637 aa  125  3e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2018  ATP-binding region, ATPase-like  30.28 
 
 		 771 aa  125  3e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.88254  normal  0.468508 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0047  histidine kinase  35.53 
 
 		 508 aa  125  4e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4061  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.04 
 
 		 885 aa  124  5e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.193403  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0613  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.56 
 
 		 641 aa  124  7e-27  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2185  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.34 
 
 		 531 aa  124  8e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1626  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  35.66 
 
 		 770 aa  124  9e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.255804  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1031  histidine kinase  31.4 
 
 		 617 aa  123  9.999999999999999e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0066  PAS/PAC sensor Signal transduction histidine kinase  32.32 
 
 		 773 aa  123  9.999999999999999e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.712477  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3395  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.34 
 
 		 530 aa  123  9.999999999999999e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.109713  normal  0.424622 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4719  sensory box histidine kinase PhoR  30 
 
 		 587 aa  123  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3460  putative sensor histidine kinase, putative membrane protein  35.34 
 
 		 532 aa  122  1.9999999999999998e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.305573 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4329  phosphate regulon sensor protein  30 
 
 		 587 aa  122  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0540  sensory box histidine kinase PhoR  30.28 
 
 		 587 aa  122  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000110325 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0955  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  25.76 
 
 		 765 aa  123  1.9999999999999998e-26  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1052  sensory transduction histidine kinase  30.99 
 
 		 1046 aa  122  3e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1212  Signal transduction histidine kinase  35.19 
 
 		 536 aa  122  3e-26  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.39876  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0786  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.05 
 
 		 582 aa  122  3e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3094  two-component sensor histidine kinase  33.83 
 
 		 774 aa  122  3e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1923  histidine kinase  30.34 
 
 		 468 aa  122  3e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3142  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.81 
 
 		 1352 aa  122  3e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4713  sensory box histidine kinase PhoR  30 
 
 		 587 aa  122  3e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4698  sensory box histidine kinase PhoR  30.28 
 
 		 587 aa  122  3e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.92933  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1749  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.09 
 
 		 511 aa  122  3e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3419  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.72 
 
 		 899 aa  122  3e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1884  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  34.62 
 
 		 389 aa  121  4.9999999999999996e-26  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.329348  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1700  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.47 
 
 		 798 aa  121  4.9999999999999996e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0658643 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2694  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.11 
 
 		 589 aa  121  4.9999999999999996e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.87998 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4418  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30 
 
 		 587 aa  121  4.9999999999999996e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1958  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.33 
 
 		 816 aa  121  6e-26  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.952692  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0820  multisensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 		 519 aa  121  6e-26  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1571  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.21 
 
 		 592 aa  120  7e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000011549  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3515  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.92 
 
 		 627 aa  120  7.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.1939  normal  0.239363 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0673  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.07 
 
 		 643 aa  120  7.999999999999999e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.431385 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1100  PAS  32.35 
 
 		 576 aa  120  9e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.897667  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2051  two component sensor kinase  31.91 
 
 		 511 aa  120  9e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>