253 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_0872 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_0872  hypothetical protein  100 
 
 		 302 aa  621  1e-177  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.128408  normal  0.238224 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0477  hypothetical protein  67.86 
 
 		 292 aa  394  1e-108  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0619  hypothetical protein  69.07 
 
 		 291 aa  380  1e-104  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.437288  normal  0.868848 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0464  hypothetical protein  56.54 
 
 		 299 aa  315  4e-85  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0968  hypothetical protein  54.58 
 
 		 279 aa  310  2e-83  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.736551  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1355  hypothetical protein  54.21 
 
 		 279 aa  310  2e-83  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.774682  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1027  hypothetical protein  54.58 
 
 		 276 aa  309  4e-83  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0063  hypothetical protein  55.43 
 
 		 288 aa  309  4e-83  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0155271 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0641  hypothetical protein  53.29 
 
 		 297 aa  307  1.0000000000000001e-82  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.576648  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2105  hypothetical protein  55.52 
 
 		 305 aa  306  2.0000000000000002e-82  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0622096 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0471  hypothetical protein  55.51 
 
 		 292 aa  303  2.0000000000000002e-81  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.359118  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0080  hypothetical protein  54.24 
 
 		 288 aa  302  4.0000000000000003e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.569789  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0004  hypothetical protein  51.68 
 
 		 285 aa  300  2e-80  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2099  hypothetical protein  55.2 
 
 		 303 aa  296  3e-79  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2793  hypothetical protein  52.94 
 
 		 268 aa  296  3e-79  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0045  hypothetical protein  52.21 
 
 		 268 aa  295  5e-79  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2515  hypothetical protein  53.31 
 
 		 284 aa  293  2e-78  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.921995  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1132  hypothetical protein  52.21 
 
 		 274 aa  293  3e-78  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0070  hypothetical protein  58.75 
 
 		 299 aa  290  3e-77  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.631232  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1322  hypothetical protein  50 
 
 		 272 aa  288  5.0000000000000004e-77  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0347  hypothetical protein  52.63 
 
 		 279 aa  279  4e-74  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0540  hypothetical protein  49.82 
 
 		 299 aa  278  9e-74  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.612157  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0386  hypothetical protein  51.92 
 
 		 283 aa  276  2e-73  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.254572  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1082  hypothetical protein  52.67 
 
 		 301 aa  275  6e-73  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.868958  normal  0.280339 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3301  hypothetical protein  52.57 
 
 		 301 aa  271  1e-71  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0516405  normal  0.954723 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3075  hypothetical protein  50.99 
 
 		 287 aa  270  2.9999999999999997e-71  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.162736 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1298  hypothetical protein  50.19 
 
 		 288 aa  268  8.999999999999999e-71  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.244078  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1265  hypothetical protein  51.33 
 
 		 288 aa  268  1e-70  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0810477  normal  0.0231273 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2235  hypothetical protein  51.38 
 
 		 287 aa  267  2e-70  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_3012  hypothetical protein  53.41 
 
 		 282 aa  265  1e-69  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.290365 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1373  hypothetical protein  51.38 
 
 		 287 aa  264  1e-69  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2487  hypothetical protein  51.38 
 
 		 287 aa  264  1e-69  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.100188 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1624  hypothetical protein  47.91 
 
 		 287 aa  263  2e-69  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.216103  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4735  hypothetical protein  49.8 
 
 		 289 aa  258  6e-68  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.691032 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1359  hypothetical protein  48.45 
 
 		 285 aa  258  7e-68  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.220346  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2341  hypothetical protein  47.67 
 
 		 284 aa  258  8e-68  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.97784 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0269  hypothetical protein  46.82 
 
 		 270 aa  256  3e-67  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0149  hypothetical protein  50.39 
 
 		 296 aa  249  4e-65  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1542  hypothetical protein  45.36 
 
 		 304 aa  249  5e-65  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0225266  normal  0.747447 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1777  hypothetical protein  49.8 
 
 		 297 aa  241  7.999999999999999e-63  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16211  dehydrogenase  45.49 
 
 		 288 aa  240  2e-62  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_11771  Rossmann fold nucleotide-binding protein  46.9 
 
 		 282 aa  240  2e-62  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.0454643 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0462  putative dape gene and orf2  46.51 
 
 		 282 aa  239  5e-62  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1077  hypothetical protein  48.5 
 
 		 276 aa  238  6.999999999999999e-62  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1495  putative dape protein  48.25 
 
 		 291 aa  238  1e-61  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.395565  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0454  decarboxylase family protein  44.52 
 
 		 318 aa  234  1.0000000000000001e-60  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1022  decarboxylase family protein  45.49 
 
 		 315 aa  233  2.0000000000000002e-60  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0106  hypothetical protein  48.03 
 
 		 273 aa  233  3e-60  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.402019  normal  0.787059 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2756  decarboxylase family protein  45.49 
 
 		 292 aa  233  3e-60  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2614  decarboxylase family protein  45.49 
 
 		 292 aa  233  3e-60  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.672113  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0158  decarboxylase family protein  45.14 
 
 		 319 aa  231  1e-59  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0183  decarboxylase family protein  45.14 
 
 		 319 aa  231  1e-59  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1095  hypothetical protein  46.24 
 
 		 275 aa  231  1e-59  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.537193  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1327  decarboxylase family protein  45.14 
 
 		 319 aa  231  1e-59  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_12211  dehydrogenase  42.18 
 
 		 294 aa  230  3e-59  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.316821  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5908  hypothetical protein  42.86 
 
 		 342 aa  221  8e-57  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0391937  normal  0.412056 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6192  hypothetical protein  42.49 
 
 		 342 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.194706  normal  0.269121 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7791  hypothetical protein  45.28 
 
 		 261 aa  216  4e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4407  hypothetical protein  44.98 
 
 		 318 aa  216  4e-55  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3325  hypothetical protein  46.22 
 
 		 251 aa  199  3e-50  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0590  hypothetical protein  52.6 
 
 		 175 aa  199  5e-50  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2839  hypothetical protein  43.39 
 
 		 271 aa  196  4.0000000000000005e-49  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1009  hypothetical protein  60.58 
 
 		 147 aa  181  2e-44  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0974  hypothetical protein  42.49 
 
 		 229 aa  151  1e-35  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.130247 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1555  hypothetical protein  44.32 
 
 		 273 aa  148  1.0000000000000001e-34  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4084  hypothetical protein  44.19 
 
 		 275 aa  145  7.0000000000000006e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0496  hypothetical protein  35.68 
 
 		 269 aa  144  2e-33  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1089  hypothetical protein  45.61 
 
 		 247 aa  144  2e-33  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25950  conserved hypothetical protein, DprA/Smf-related, family 2  37.75 
 
 		 280 aa  143  4e-33  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.256647  normal  0.891073 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3030  hypothetical protein  44.12 
 
 		 235 aa  143  4e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.862157  hitchhiker  0.00666776 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2043  hypothetical protein  42.62 
 
 		 317 aa  143  4e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2436  hypothetical protein  42.62 
 
 		 317 aa  142  5e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.14401  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4048  hypothetical protein  36.98 
 
 		 266 aa  142  6e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2231  hypothetical protein  42.62 
 
 		 317 aa  141  9.999999999999999e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0682  putative DNA uptake protein  37.39 
 
 		 313 aa  142  9.999999999999999e-33  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4510  hypothetical protein  40.32 
 
 		 242 aa  141  9.999999999999999e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.649813  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4418  hypothetical protein  43.09 
 
 		 247 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.52452  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1082  hypothetical protein  41.34 
 
 		 225 aa  140  1.9999999999999998e-32  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.396045  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15410  conserved hypothetical protein, DprA/Smf-related, family 1 TIGR00725/conserved hypothetical protein, DprA/Smf-related, family 2 TIGR00730  39.21 
 
 		 267 aa  140  1.9999999999999998e-32  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.47781  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0086  hypothetical protein  45.05 
 
 		 241 aa  140  3e-32  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2215  hypothetical protein  47.26 
 
 		 263 aa  140  3e-32  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.531186  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0806  hypothetical protein  36.14 
 
 		 267 aa  139  4.999999999999999e-32  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.489855 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0977  hypothetical protein  36.55 
 
 		 268 aa  139  4.999999999999999e-32  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.213763  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10023  hypothetical protein  37.5 
 
 		 229 aa  139  6e-32  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2625  hypothetical protein  42.31 
 
 		 239 aa  139  7e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.553648 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6911  hypothetical protein  38.04 
 
 		 261 aa  138  8.999999999999999e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.135288  normal  0.167118 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0872  hypothetical protein  42.86 
 
 		 239 aa  138  1e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.736442  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3662  hypothetical protein  37.87 
 
 		 263 aa  138  1e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0914373  normal  0.810533 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2426  lysine decarboxylase family protein  42.11 
 
 		 249 aa  137  2e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000109192 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0299  hypothetical protein  42.37 
 
 		 244 aa  137  2e-31  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000000150026  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0357  hypothetical protein  40.44 
 
 		 245 aa  136  3.0000000000000003e-31  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.216985  normal  0.764349 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2861  hypothetical protein  45.81 
 
 		 241 aa  137  3.0000000000000003e-31  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.33158  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3751  hypothetical protein  48.57 
 
 		 283 aa  136  4e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0136365  normal  0.197215 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6789  hypothetical protein  40.54 
 
 		 218 aa  136  4e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0818446  hitchhiker  0.00000113726 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4133  hypothetical protein  48.57 
 
 		 283 aa  135  6.0000000000000005e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.242281  normal  0.352812 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2835  hypothetical protein  40.54 
 
 		 247 aa  135  6.0000000000000005e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2461  hypothetical protein  44.74 
 
 		 220 aa  135  6.0000000000000005e-31  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000124566  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1161  hypothetical protein  34.71 
 
 		 264 aa  135  7.000000000000001e-31  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1689  hypothetical protein  43.33 
 
 		 239 aa  135  9e-31  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0604  decarboxylase family protein  39.27 
 
 		 249 aa  135  9e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.266669  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>