166 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Suden_1601 on replicon NC_007575
Organism: Sulfurimonas denitrificans DSM 1251



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007575  Suden_1601  hypothetical protein  100 
 
 		 378 aa  775    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1346  TrkA domain-containing protein  57.67 
 
 		 376 aa  467  9.999999999999999e-131  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.538374  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0972  hypothetical protein  55.29 
 
 		 376 aa  457  1e-127  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.625398  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1030  conserved hypothetical protein (TrkA domain protein)  52.65 
 
 		 375 aa  422  1e-117  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.583921  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0771  hypothetical protein  49.47 
 
 		 376 aa  419  1e-116  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.94547  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0721  hypothetical protein  56.55 
 
 		 335 aa  421  1e-116  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2680  TrkA domain-containing protein  29.45 
 
 		 397 aa  152  1e-35  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000721375  normal  0.421945 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0063  TrkA family potassium uptake protein  27.73 
 
 		 351 aa  150  3e-35  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4160  TrkA domain-containing protein  27.93 
 
 		 351 aa  150  4e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2971  TrkA domain-containing protein  28.49 
 
 		 350 aa  148  2.0000000000000003e-34  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2743  TrkA domain-containing protein  29.41 
 
 		 333 aa  142  9.999999999999999e-33  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0875  TrkA-N domain protein  25.99 
 
 		 350 aa  141  9.999999999999999e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5153  TrkA-N domain protein  26.67 
 
 		 355 aa  136  6.0000000000000005e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000053583 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3127  K+ transport systems, NAD-binding component  26.48 
 
 		 337 aa  136  7.000000000000001e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3915  TrkA domain-containing protein  26.97 
 
 		 330 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.557122  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3794  TrkA-N domain protein  26.72 
 
 		 350 aa  132  9e-30  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.434274  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3877  TrkA-N domain protein  26.72 
 
 		 350 aa  132  1.0000000000000001e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.705897 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0453  TrkA-N domain protein  28.44 
 
 		 346 aa  131  2.0000000000000002e-29  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5187  TrkA domain-containing protein  26.65 
 
 		 330 aa  131  2.0000000000000002e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1120  TrkA-N domain protein  27.67 
 
 		 335 aa  130  5.0000000000000004e-29  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000439413  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0556  TrkA domain-containing protein  23.85 
 
 		 346 aa  130  5.0000000000000004e-29  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1528  TrkA domain-containing protein  27.54 
 
 		 347 aa  129  1.0000000000000001e-28  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.857437  normal  0.417483 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0451  TrkA domain-containing protein  28.1 
 
 		 336 aa  129  1.0000000000000001e-28  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.278158  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2888  TrkA-N  26.29 
 
 		 357 aa  128  2.0000000000000002e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5517  potassium uptake protein, TrkA family  26.96 
 
 		 330 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3731  hypothetical protein  25.44 
 
 		 338 aa  127  3e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  unclonable  0.00000000000159336  normal  0.309617 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5573  potassium uptake protein, TrkA family  26.65 
 
 		 330 aa  127  3e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0368  TrkA-N domain protein  26.25 
 
 		 356 aa  127  3e-28  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0800  TrkA-N domain protein  24.77 
 
 		 331 aa  127  4.0000000000000003e-28  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.501698  normal  0.632091 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5092  potassium channel protein  26.65 
 
 		 334 aa  127  4.0000000000000003e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00108262  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5075  potassium channel protein  26.65 
 
 		 334 aa  126  5e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000793674  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0361  TrkA-N domain protein  26.25 
 
 		 356 aa  126  5e-28  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5489  potassium uptake protein, TrkA family  26.65 
 
 		 330 aa  126  6e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3004  TrkA-N domain-containing protein  25.53 
 
 		 354 aa  126  6e-28  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3283  TrkA-N  27.39 
 
 		 332 aa  125  1e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.825743  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00100  potassium channel protein  25.61 
 
 		 335 aa  124  2e-27  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.377928  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1142  TrkA domain-containing protein  26.61 
 
 		 341 aa  122  8e-27  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1045  TrkA domain-containing protein  27.39 
 
 		 350 aa  122  9.999999999999999e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.00000596347  hitchhiker  0.00364441 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5434  potassium uptake protein, TrkA family  26.37 
 
 		 337 aa  120  3.9999999999999996e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2079  TrkA-N domain protein  27.02 
 
 		 371 aa  117  3e-25  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0922  TrkA domain-containing protein  25.66 
 
 		 335 aa  117  3.9999999999999997e-25  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1634  TrkA domain-containing protein  30.03 
 
 		 339 aa  116  7.999999999999999e-25  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.853014  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2095  TrkA family potassium uptake protein  24.85 
 
 		 346 aa  115  1.0000000000000001e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.188907  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1654  TrkA domain-containing protein  26.47 
 
 		 335 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.190782  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2518  TrkA-N domain protein  23.24 
 
 		 362 aa  114  3e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1024  TrkA domain-containing protein  26.01 
 
 		 335 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.282206 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0471  TrkA domain-containing protein  24.37 
 
 		 325 aa  110  5e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0683  potassium channel protein  28.9 
 
 		 341 aa  108  1e-22  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1520  TrkA domain-containing protein  26.55 
 
 		 324 aa  109  1e-22  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.639077  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3347  TrkA-N  25.15 
 
 		 352 aa  106  5e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.220422  normal  0.349567 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1694  TrkA domain-containing protein  26.01 
 
 		 332 aa  106  8e-22  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.249596  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3909  TrkA domain-containing protein  22.99 
 
 		 355 aa  105  1e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0877338 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0117  TrkA-N domain protein  25 
 
 		 345 aa  104  2e-21  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_08671  VIC family potassium channel protein  25 
 
 		 351 aa  102  1e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0715  VIC family potassium channel protein  24.39 
 
 		 351 aa  100  3e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.4714  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3680  TrkA domain-containing protein  26 
 
 		 509 aa  101  3e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_07711  VIC family potassium channel protein  24.39 
 
 		 351 aa  100  3e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.584573  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5545  TrkA-N domain protein  25.19 
 
 		 341 aa  100  3e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.789205 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_07731  VIC family potassium channel protein  24.39 
 
 		 351 aa  100  4e-20  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1751  TrkA domain-containing protein  24.84 
 
 		 332 aa  99.8  7e-20  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0303  response regulator receiver domain-containing protein  25.78 
 
 		 384 aa  99.8  8e-20  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1744  TrkA-N domain protein  24.32 
 
 		 368 aa  94.7  3e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.844821 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1744  VIC family potassium channel protein  25.15 
 
 		 352 aa  94  4e-18  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2039  TrkA-N domain protein  24.84 
 
 		 350 aa  94  4e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0618  VIC family potassium channel protein  25.58 
 
 		 351 aa  90.1  5e-17  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1323  TrkA-N domain protein  25.58 
 
 		 346 aa  85.5  0.000000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06531  putative potassium channel, VIC family protein  25.15 
 
 		 359 aa  84  0.000000000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_10941  hypothetical protein  24.62 
 
 		 346 aa  80.9  0.00000000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00275534 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0403  VIC family potassium channel protein  24.62 
 
 		 346 aa  80.5  0.00000000000004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.133961  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5246  potassium channel protein, N-terminus  31.54 
 
 		 146 aa  79.7  0.00000000000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0630714  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0577  TrkA-N domain protein  26.45 
 
 		 395 aa  78.6  0.0000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2566  TrkA-N  23.42 
 
 		 366 aa  77.8  0.0000000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.353731  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_14401  K+ transport system, NAD-binding component  24.51 
 
 		 352 aa  77.8  0.0000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000716154 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0064  TrkA-N domain protein  22.47 
 
 		 337 aa  77.8  0.0000000000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2212  TrkA domain-containing protein  27.21 
 
 		 347 aa  73.6  0.000000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.217414  normal  0.271729 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3113  potassium channel protein  25.96 
 
 		 347 aa  73.2  0.000000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.144823  normal  0.715084 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0126  TrkA-N domain protein  25 
 
 		 546 aa  71.2  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.379824  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0419  TrkA-N domain protein  23.26 
 
 		 313 aa  68.6  0.0000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2999  TrkA-N domain protein  24 
 
 		 388 aa  67.8  0.0000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2970  TrkA-N domain protein  26.72 
 
 		 393 aa  67.4  0.0000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.489017  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2691  TrkA-N domain protein  25.08 
 
 		 562 aa  67.4  0.0000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.557317  normal  0.0657771 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1529  TrkA-N domain protein  25.09 
 
 		 395 aa  67.4  0.0000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.479554  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2378  TrkA-N  23.86 
 
 		 575 aa  65.1  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2537  voltage-gated potassium channel  25.54 
 
 		 438 aa  65.5  0.000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.863959  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1968  TrkA-N domain protein  26.57 
 
 		 544 aa  65.1  0.000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.0623944 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2922  voltage-gated potassium channel  25.54 
 
 		 408 aa  64.7  0.000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1993  TrkA-N domain protein  22.69 
 
 		 399 aa  62.4  0.00000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.0873902 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2398  TrkA-N domain protein  23.25 
 
 		 417 aa  61.6  0.00000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00329227  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01224  voltage-gated potassium channel  24.35 
 
 		 417 aa  60.8  0.00000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.308891  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1737  voltage-gated potassium channel  24.35 
 
 		 402 aa  60.8  0.00000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000607493  normal  0.0325074 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01234  hypothetical protein  24.35 
 
 		 417 aa  60.8  0.00000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.302174  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1359  voltage-gated potassium channel  24.35 
 
 		 417 aa  60.8  0.00000004  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000079785  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1398  voltage-gated potassium channel  24.35 
 
 		 417 aa  60.5  0.00000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.488594  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2377  voltage-gated potassium channel  24.35 
 
 		 417 aa  60.8  0.00000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.408742  hitchhiker  0.0000021243 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1890  voltage-gated potassium channel  24.35 
 
 		 402 aa  60.8  0.00000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0139159 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1715  voltage-gated potassium channel  24.14 
 
 		 391 aa  60.5  0.00000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1419  voltage-gated potassium channel  24.35 
 
 		 417 aa  60.5  0.00000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0226544  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4016  sodium/hydrogen exchanger  22.78 
 
 		 775 aa  59.7  0.00000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00920037  hitchhiker  0.000000797462 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3716  voltage-gated potassium channel  23.75 
 
 		 391 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.947773 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4298  voltage-gated potassium channel  24.81 
 
 		 391 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>