More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_3451 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009953  Sare_3830  CBS domain-containing protein  94.18 
 
 
464 aa  798    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0304655 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3451  CBS domain-containing protein  100 
 
 
464 aa  896    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.553184  normal  0.0782726 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1660  CBS domain containing protein  65.9 
 
 
461 aa  536  1e-151  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4625  CBS domain-containing protein  68.42 
 
 
426 aa  510  1e-143  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.373685  hitchhiker  0.00665585 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1914  CBS domain-containing protein  58.49 
 
 
430 aa  459  9.999999999999999e-129  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2297  Hemolysin and related protein containing CBS domains-like protein  62.15 
 
 
434 aa  457  1e-127  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1251  CBS domain-containing protein  62.93 
 
 
435 aa  453  1.0000000000000001e-126  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3245  protein of unknown function DUF21  62.47 
 
 
442 aa  455  1.0000000000000001e-126  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0319126  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0791  CBS domain-containing protein  58.71 
 
 
483 aa  453  1.0000000000000001e-126  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.847387  normal  0.143113 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13600  CBS domain-containing protein  57.89 
 
 
457 aa  448  1e-125  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1158  CBS domain-containing protein  57.99 
 
 
452 aa  443  1e-123  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.992942  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3157  CBS domain containing protein  57.52 
 
 
490 aa  436  1e-121  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.00650526  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7047  CBS domain containing protein  59.51 
 
 
425 aa  432  1e-120  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1578  CBS domain containing protein  61.19 
 
 
537 aa  430  1e-119  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.110465  normal  0.116098 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12392  transmembrane protein  55.24 
 
 
435 aa  425  1e-118  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3465  hypothetical protein  55.35 
 
 
436 aa  419  1e-116  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0200076 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3454  hypothetical protein  55.35 
 
 
436 aa  419  1e-116  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0757862  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3517  hypothetical protein  55.35 
 
 
436 aa  419  1e-116  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.70435 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2760  protein of unknown function DUF21  55.63 
 
 
437 aa  414  1e-114  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.24757  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1269  CBS  56.15 
 
 
454 aa  405  1e-111  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.183003 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2114  CBS domain-containing protein  57.48 
 
 
484 aa  404  1e-111  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2708  CBS domain-containing protein  56.46 
 
 
432 aa  395  1e-108  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.642417 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3830  CBS domain-containing protein  55.93 
 
 
432 aa  394  1e-108  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11750  CBS domain-containing protein  50.99 
 
 
495 aa  367  1e-100  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.885708  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3385  CBS domain containing protein  52.23 
 
 
438 aa  367  1e-100  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.669345 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0846  CBS domain-containing protein  52.58 
 
 
439 aa  358  9.999999999999999e-98  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.330981  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0709  CBS domain containing protein  48.84 
 
 
465 aa  357  2.9999999999999997e-97  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1967  CBS domain containing protein  45.69 
 
 
443 aa  322  7e-87  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000080224 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2230  CBS domain-containing protein  43.69 
 
 
447 aa  309  5.9999999999999995e-83  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00904717  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2204  CBS domain containing protein  43.24 
 
 
456 aa  297  2e-79  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00693904 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13490  CBS domain-containing protein  42.89 
 
 
448 aa  278  1e-73  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.740551  normal  0.0781314 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12560  putative membrane CBS domain protein  34.26 
 
 
420 aa  251  2e-65  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17230  CBS domain-containing protein  44.06 
 
 
444 aa  244  1.9999999999999999e-63  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0117633  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3011  hypothetical protein  33.57 
 
 
429 aa  231  3e-59  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0594  hemolysin-like protein  36.63 
 
 
477 aa  225  1e-57  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2186  CBS domain containing protein  44.95 
 
 
476 aa  224  2e-57  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12320  CBS domain-containing protein  43.45 
 
 
441 aa  220  5e-56  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.509948  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0531  protein of unknown function DUF21  34.82 
 
 
421 aa  219  7.999999999999999e-56  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0811523  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0015  CBS domain containing protein  35.38 
 
 
434 aa  218  2e-55  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1891  hypothetical protein  34.85 
 
 
425 aa  214  1.9999999999999998e-54  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.471251 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1548  protein of unknown function DUF21  31.8 
 
 
468 aa  214  2.9999999999999995e-54  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1269  CBS domain containing protein  38.86 
 
 
420 aa  213  4.9999999999999996e-54  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1544  CBS domain containing protein  41.99 
 
 
441 aa  211  2e-53  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0616  protein of unknown function DUF21  30.34 
 
 
422 aa  211  2e-53  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000000839014  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1002  hypothetical protein  29.93 
 
 
443 aa  211  2e-53  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4395  hypothetical protein  43.56 
 
 
439 aa  211  2e-53  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0154532  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0738  CBS domain-containing protein  36.43 
 
 
435 aa  210  5e-53  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0862  CBS domain protein  45.71 
 
 
499 aa  209  7e-53  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0036  transporter, putative  32.34 
 
 
421 aa  208  1e-52  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0394  protein of unknown function DUF21  29.31 
 
 
414 aa  207  2e-52  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0591737  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0036  putative transporter  32.09 
 
 
421 aa  206  1e-51  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1507  hypothetical protein  31.35 
 
 
430 aa  204  3e-51  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0252  protein of unknown function DUF21  30.99 
 
 
434 aa  203  6e-51  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000514588  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0082  hypothetical protein  28.87 
 
 
455 aa  201  1.9999999999999998e-50  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.00000000179952  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1207  hypothetical protein  30.31 
 
 
424 aa  201  3e-50  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.213322  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1233  hypothetical protein  29.74 
 
 
424 aa  200  3.9999999999999996e-50  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0762  hypothetical protein  34.25 
 
 
456 aa  200  3.9999999999999996e-50  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0171545  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1425  hypothetical protein  29.26 
 
 
424 aa  200  5e-50  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.196446  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1468  CBS domain containing protein  40.66 
 
 
447 aa  199  7e-50  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0356908  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2368  CBS:transporter-associated region  42.86 
 
 
284 aa  197  2.0000000000000003e-49  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2036  CBS domain-containing protein  42.41 
 
 
296 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3260  CBS domain containing protein  40.38 
 
 
287 aa  197  3e-49  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1000  CBS domain containing protein  40.38 
 
 
287 aa  197  5.000000000000001e-49  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0370099  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3015  hypothetical protein  29.93 
 
 
429 aa  196  8.000000000000001e-49  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.204841  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1977  hypothetical protein  34.55 
 
 
426 aa  195  1e-48  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.890218  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0082  hypothetical protein  28.54 
 
 
455 aa  195  2e-48  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.0000182254  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2111  CBS domain containing protein  40.95 
 
 
421 aa  194  2e-48  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.241811  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2318  protein of unknown function DUF21  32.56 
 
 
464 aa  194  3e-48  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.142674  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1713  protein of unknown function DUF21  31.12 
 
 
477 aa  193  5e-48  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0832  hypothetical protein  30.63 
 
 
417 aa  193  6e-48  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000822238 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2230  protein of unknown function DUF21  32.87 
 
 
464 aa  192  8e-48  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.214459  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3512  protein of unknown function DUF21  34.71 
 
 
431 aa  190  5e-47  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.257501  normal  0.374436 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0722  CBS domain-containing protein  38.58 
 
 
276 aa  190  5e-47  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1007  hypothetical protein  28.47 
 
 
422 aa  189  7e-47  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0049  protein of unknown function DUF21  30.77 
 
 
467 aa  188  1e-46  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1784  CBS domain-containing protein  43.21 
 
 
284 aa  188  2e-46  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000339521  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1630  hypothetical protein  31.95 
 
 
464 aa  188  2e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2611  protein of unknown function DUF21  32.63 
 
 
445 aa  187  3e-46  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4780  protein of unknown function DUF21  32.27 
 
 
443 aa  187  3e-46  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  hitchhiker  0.000717269  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1827  hypothetical protein  28.07 
 
 
448 aa  187  4e-46  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0885  protein of unknown function DUF21  30.46 
 
 
470 aa  186  6e-46  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.182877  normal  0.402091 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2181  hypothetical protein  32.21 
 
 
454 aa  185  1.0000000000000001e-45  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1419  protein of unknown function DUF21  31.41 
 
 
423 aa  184  2.0000000000000003e-45  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1235  putative Mg2+ and co2+ transporter CorC  38.55 
 
 
285 aa  184  3e-45  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1183  protein of unknown function DUF21  32.37 
 
 
424 aa  183  5.0000000000000004e-45  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000010351  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0064  protein of unknown function DUF21  37.12 
 
 
447 aa  181  2e-44  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1383  transport protein  30.02 
 
 
434 aa  182  2e-44  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.283032  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1153  hypothetical protein  32.21 
 
 
447 aa  179  5.999999999999999e-44  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000974304  normal  0.0417904 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0247  protein of unknown function DUF21  32.08 
 
 
446 aa  179  8e-44  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1278  aminotransferase class-III  32.9 
 
 
420 aa  179  1e-43  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.429678 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2282  CBS domain-containing protein  42.49 
 
 
250 aa  177  3e-43  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1326  protein of unknown function DUF21  30.1 
 
 
425 aa  177  5e-43  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00045717  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1066  protein of unknown function DUF21  34.74 
 
 
426 aa  176  7e-43  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.905964  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0240  Mg2+/Co2+ transporter  40.76 
 
 
291 aa  176  9.999999999999999e-43  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2136  CBS domain containing protein  39.58 
 
 
311 aa  175  9.999999999999999e-43  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0496158  normal  0.0714936 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3277  protein of unknown function DUF21  30.29 
 
 
437 aa  176  9.999999999999999e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000233033  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2741  transporter-associated region  38.34 
 
 
281 aa  176  9.999999999999999e-43  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.835583  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2870  hypothetical protein  35.34 
 
 
433 aa  174  1.9999999999999998e-42  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.221651  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1001  CBS domain-containing protein  40.33 
 
 
291 aa  175  1.9999999999999998e-42  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.243259  normal  0.0641056 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1066  CBS domain-containing protein  40.33 
 
 
291 aa  175  1.9999999999999998e-42  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.354605  normal  0.0599682 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>