260 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_3302 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_3302  SirA family protein  100 
 
 		 76 aa  146  9e-35  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.267105 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3534  SirA family protein  86.84 
 
 		 76 aa  135  1e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.724974  decreased coverage  0.000159335 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3151  SirA family protein  46.38 
 
 		 82 aa  76.3  0.0000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3080  SirA family protein  47.83 
 
 		 115 aa  73.9  0.0000000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000709238  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1014  putative aminotransferase  44.93 
 
 		 78 aa  72.4  0.000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0541001  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1287  SirA family protein  47.14 
 
 		 104 aa  71.2  0.000000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.413798  normal  0.313223 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2668  SirA-like protein  42.25 
 
 		 89 aa  69.7  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.220469  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0436  SirA-like  34.67 
 
 		 75 aa  66.2  0.0000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2339  SirA family protein  40.54 
 
 		 75 aa  62.8  0.000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0889916  normal  0.318145 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3143  SirA family protein  59.42 
 
 		 82 aa  62.8  0.000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3894  SirA family protein  37.5 
 
 		 74 aa  62  0.000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.401469  hitchhiker  0.00420681 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3436  SirA family protein  37.04 
 
 		 81 aa  61.2  0.000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000543679  normal  0.174019 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0967  SirA family protein  32.86 
 
 		 72 aa  61.6  0.000000004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.500955  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1626  SirA-like  38.57 
 
 		 75 aa  60.8  0.000000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000122761  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1210  SirA family protein  45.31 
 
 		 75 aa  60.5  0.000000007  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15610  predicted redox protein, regulator of disulfide bond formation  53.45 
 
 		 110 aa  58.9  0.00000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1218  SirA family protein  46.67 
 
 		 77 aa  59.3  0.00000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3601  SirA family protein  36.62 
 
 		 74 aa  58.5  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1451  SirA family protein  42.19 
 
 		 75 aa  58.2  0.00000004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1455  SirA family protein  56 
 
 		 74 aa  57.4  0.00000006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.316855  normal  0.421643 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2324  SirA family protein  27.03 
 
 		 77 aa  57  0.00000008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0434291  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2791  SirA family protein  39.39 
 
 		 76 aa  56.6  0.0000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.281845  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0404  SirA family protein  36 
 
 		 81 aa  56.6  0.0000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.188444  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1458  SirA-like  39.13 
 
 		 78 aa  55.5  0.0000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.000274297  normal  0.357093 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1311  SirA family protein  45.45 
 
 		 200 aa  55.5  0.0000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1300  SirA family protein  34.78 
 
 		 77 aa  56.2  0.0000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0506875  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0093  SirA-like protein  31.65 
 
 		 82 aa  55.5  0.0000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2642  SirA family protein  30.16 
 
 		 201 aa  54.7  0.0000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.140879  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2558  SirA family protein  50 
 
 		 80 aa  54.7  0.0000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.488236 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2705  SirA family protein  43.55 
 
 		 81 aa  54.3  0.0000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1524  SirA family protein  41.82 
 
 		 189 aa  53.9  0.0000007  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1254  hypothetical protein  32.88 
 
 		 77 aa  53.5  0.0000009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0094  SirA family protein  42.11 
 
 		 97 aa  53.5  0.0000009  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.249319  normal  0.118348 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0810  hypothetical protein  32 
 
 		 75 aa  52.8  0.000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.566586 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1085  SirA family protein  28.77 
 
 		 77 aa  53.1  0.000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0598  SirA family protein  38.36 
 
 		 75 aa  53.1  0.000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0033  hypothetical protein  26.67 
 
 		 78 aa  53.1  0.000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00000671264  normal  0.064173 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3059  SirA-like  35.71 
 
 		 76 aa  53.1  0.000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.282994  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0830  SirA family protein  41.07 
 
 		 82 aa  52.4  0.000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.183754  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1799  SirA family protein  51.43 
 
 		 79 aa  52.8  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.297701 
 
 
-
 
NC_004310  BR2034  hypothetical protein  35.71 
 
 		 85 aa  52  0.000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.358481  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0756  SirA family protein  30.67 
 
 		 75 aa  52  0.000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0477358 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0826  SirA family protein  30.67 
 
 		 75 aa  52  0.000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.24854 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1593  SirA family protein  35.71 
 
 		 78 aa  52  0.000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.433427  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0904  SirA family protein  34.29 
 
 		 78 aa  51.2  0.000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.849606  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1959  redox protein regulator of disulfide bond formation-like  27.54 
 
 		 103 aa  51.2  0.000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.0000373287  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1779  SirA family protein  33.82 
 
 		 81 aa  51.2  0.000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2098  SirA family protein  40 
 
 		 80 aa  50.8  0.000006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2572  SirA family protein  40 
 
 		 80 aa  50.8  0.000006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.410608  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4578  SirA-like protein  33.33 
 
 		 75 aa  50.8  0.000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.408362  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0166  SirA family protein  38.6 
 
 		 81 aa  50.8  0.000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.766434  normal  0.899413 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3119  putative aminotransferase  46.67 
 
 		 62 aa  50.8  0.000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.711998  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0952  SirA-like  33.33 
 
 		 75 aa  50.8  0.000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.872302  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1412  SirA family protein  33.33 
 
 		 75 aa  50.8  0.000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.960057 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1434  SirA family protein  33.33 
 
 		 75 aa  50.8  0.000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1881  SirA family protein  33.33 
 
 		 75 aa  50.8  0.000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.045708 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0861  SirA-like  33.33 
 
 		 75 aa  50.4  0.000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2653  SirA-like protein  44 
 
 		 78 aa  50.8  0.000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00012248  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0734  hypothetical protein  32.89 
 
 		 76 aa  50.4  0.000008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0738  rhodanese domain-containing protein  27.94 
 
 		 186 aa  50.4  0.000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0001064  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0920  hypothetical protein  32.89 
 
 		 76 aa  50.4  0.000008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1839  hypothetical protein  32.89 
 
 		 76 aa  50.4  0.000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0776  rhodanese domain-containing protein  27.94 
 
 		 186 aa  50.4  0.000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2640  hypothetical protein  32.89 
 
 		 76 aa  50.4  0.000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0863392  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1684  hypothetical protein  32.89 
 
 		 76 aa  50.4  0.000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.109756  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0811  SirA-like protein  32 
 
 		 75 aa  50.4  0.000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0842772 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0125  SirA family protein  26.09 
 
 		 78 aa  50.4  0.000008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0939  hypothetical protein  27.03 
 
 		 75 aa  50.4  0.000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000269274  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1453  hypothetical protein  32.89 
 
 		 76 aa  50.4  0.000008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0429  hypothetical protein  32.89 
 
 		 76 aa  50.4  0.000008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0594568  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1662  hypothetical protein  32.89 
 
 		 76 aa  50.4  0.000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0398143  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4162  SirA family protein  31.94 
 
 		 84 aa  50.4  0.000009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4189  SirA family protein  31.94 
 
 		 84 aa  50.4  0.000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.388351  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0686  hypothetical protein  27.94 
 
 		 186 aa  49.7  0.00001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.745505  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1548  SirA family protein  38.18 
 
 		 80 aa  49.7  0.00001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.0325283 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1982  hypothetical protein  26.76 
 
 		 79 aa  49.7  0.00001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.948606  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4046  SirA-like  31.94 
 
 		 84 aa  49.7  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2399  SirA-like  39.29 
 
 		 74 aa  49.7  0.00001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.433209  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0870  rhodanese domain protein  27.94 
 
 		 186 aa  49.7  0.00001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000347313 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1314  SirA family protein  33.33 
 
 		 75 aa  49.7  0.00001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1353  SirA family protein  33.33 
 
 		 75 aa  49.7  0.00001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.563442  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0524  SirA family protein  34.21 
 
 		 78 aa  50.1  0.00001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.842922 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1718  SirA family protein  33.33 
 
 		 81 aa  50.1  0.00001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2572  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  37.14 
 
 		 834 aa  50.1  0.00001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0240201  hitchhiker  0.00088706 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3614  SirA family protein  32.89 
 
 		 76 aa  49.7  0.00001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000103575 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1186  SirA family protein  32.69 
 
 		 83 aa  48.9  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0868  hypothetical protein  27.03 
 
 		 75 aa  49.3  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0672  hypothetical protein  29.63 
 
 		 186 aa  49.7  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00074605  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0574  hypothetical protein  25.33 
 
 		 75 aa  48.9  0.00002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000789219  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0962  SirA family protein  38.03 
 
 		 92 aa  49.3  0.00002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.3564  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2570  SirA family protein  32.35 
 
 		 78 aa  49.3  0.00002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0845145  normal  0.388571 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0688  SirA family protein  28.38 
 
 		 75 aa  49.3  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0038  SirA family protein  25.42 
 
 		 78 aa  48.9  0.00002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  unclonable  0.00000000000000689982  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0940  hypothetical protein  25.68 
 
 		 75 aa  48.5  0.00003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000000596514  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0674  hypothetical protein  27.03 
 
 		 76 aa  48.9  0.00003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.384362  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0830  rhodanese domain protein  27.78 
 
 		 186 aa  48.5  0.00003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00233764  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3088  SirA-like  37.74 
 
 		 75 aa  48.5  0.00003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0937  rhodanese domain protein  27.78 
 
 		 186 aa  48.5  0.00003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000726035  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1011  SirA-like  25.33 
 
 		 75 aa  48.5  0.00003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4069  SirA family protein  32.76 
 
 		 81 aa  48.5  0.00003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>