187 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_1302 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_1302  amidohydrolase  100 
 
 		 359 aa  702    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1191  amidohydrolase  90.81 
 
 		 359 aa  621  1e-177  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.251504  normal  0.0810275 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2244  amidohydrolase  67.78 
 
 		 367 aa  459  9.999999999999999e-129  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.244187  normal  0.209508 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5929  amidohydrolase  56.86 
 
 		 356 aa  372  1e-102  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.117607  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1562  amidohydrolase 3  53.85 
 
 		 362 aa  355  6.999999999999999e-97  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.345787  normal  0.0640888 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4010  amidohydrolase  55.74 
 
 		 361 aa  351  1e-95  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12929  hypothetical protein  50.98 
 
 		 370 aa  342  4e-93  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0687  normal  0.519945 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2182  amidohydrolase  50.56 
 
 		 360 aa  329  6e-89  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.322343  normal  0.931322 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09720  Pro-Hyp dipeptidase  54.21 
 
 		 354 aa  325  1e-87  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.885607 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1940  amidohydrolase  51.63 
 
 		 368 aa  324  2e-87  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.864175 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1960  amidohydrolase  51.36 
 
 		 368 aa  323  3e-87  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2006  amidohydrolase  51.36 
 
 		 368 aa  323  3e-87  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0811412  normal  0.722686 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1281  amidohydrolase  51.83 
 
 		 364 aa  321  9.999999999999999e-87  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.413404 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4181  amidohydrolase  51.11 
 
 		 362 aa  308  8e-83  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11020  amidohydrolase, imidazolonepropionase  47.47 
 
 		 366 aa  307  2.0000000000000002e-82  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.161229  normal  0.0546284 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3462  amidohydrolase 3  51.39 
 
 		 365 aa  297  2e-79  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23760  amidohydrolase, imidazolonepropionase  48.6 
 
 		 378 aa  294  1e-78  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.318525 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1397  amidohydrolase  49.44 
 
 		 359 aa  294  2e-78  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.503845  decreased coverage  0.00549847 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2226  amidohydrolase  48.86 
 
 		 360 aa  293  3e-78  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000139869 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3262  amidohydrolase  47.49 
 
 		 361 aa  292  6e-78  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1166  amidohydrolase  52.5 
 
 		 373 aa  291  2e-77  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2486  amidohydrolase  46.99 
 
 		 360 aa  287  2e-76  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.445092  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1612  amidohydrolase  46.31 
 
 		 358 aa  275  8e-73  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0569822  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2082  amidohydrolase  45.53 
 
 		 357 aa  268  8.999999999999999e-71  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1469  amidohydrolase  47.28 
 
 		 362 aa  266  5e-70  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.145414 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09960  amidohydrolase, imidazolonepropionase  47.09 
 
 		 388 aa  260  3e-68  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0916327  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3142  amidohydrolase  47.35 
 
 		 359 aa  254  1.0000000000000001e-66  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000508689  normal  0.129698 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0984  amidohydrolase  41.79 
 
 		 358 aa  225  7e-58  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.000000713577  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5427  amidohydrolase  26.77 
 
 		 432 aa  96.7  6e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.726254  normal  0.0808338 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2716  amidohydrolase  27.38 
 
 		 407 aa  91.7  2e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13368  Xaa-Pro dipeptidase family enzyme  26.4 
 
 		 426 aa  91.7  2e-17  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.256749  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2208  amidohydrolase  27.9 
 
 		 440 aa  91.3  3e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00166067 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04041  Xaa-Pro dipeptidase family enzyme  27.04 
 
 		 430 aa  90.5  4e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2646  amidohydrolase  30.25 
 
 		 391 aa  89.4  8e-17  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1062  amidohydrolase  27.81 
 
 		 426 aa  86.7  6e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.574986 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1219  amidohydrolase  26.27 
 
 		 390 aa  85.9  0.000000000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.82253  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3749  amidohydrolase  30.1 
 
 		 408 aa  85.1  0.000000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.468026  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3822  amidohydrolase  30.1 
 
 		 408 aa  85.1  0.000000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.28333  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3761  amidohydrolase  30.1 
 
 		 408 aa  85.1  0.000000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.225154  normal  0.880819 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5618  amidohydrolase  31.52 
 
 		 422 aa  84.3  0.000000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.313113  normal  0.102085 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2719  amidohydrolase  28.61 
 
 		 440 aa  83.6  0.000000000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0462  amidohydrolase  30.79 
 
 		 401 aa  82.4  0.00000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000842595  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0626  amidohydrolase  29.09 
 
 		 433 aa  82.4  0.00000000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.151482 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2711  amidohydrolase  26.3 
 
 		 400 aa  81.3  0.00000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.959959  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2437  amidohydrolase  30.95 
 
 		 411 aa  80.5  0.00000000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.885711 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3982  amidohydrolase  27.39 
 
 		 445 aa  79.7  0.00000000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4215  amidohydrolase  31.35 
 
 		 412 aa  79.7  0.00000000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.33185  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4277  amidohydrolase  27.22 
 
 		 431 aa  79.3  0.00000000000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0801  amidohydrolase  30.05 
 
 		 437 aa  79.7  0.00000000000008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1408  amidohydrolase  32.27 
 
 		 402 aa  79  0.0000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.321357  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2402  amidohydrolase  29.79 
 
 		 397 aa  79.3  0.0000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3308  amidohydrolase  31.91 
 
 		 419 aa  78.6  0.0000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.692035  normal  0.417277 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3368  amidohydrolase  32.24 
 
 		 414 aa  77.8  0.0000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.929128  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0913  amidohydrolase  29.52 
 
 		 438 aa  77  0.0000000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.887966  normal  0.946432 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0479  amidohydrolase  25.27 
 
 		 401 aa  76.3  0.0000000000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2224  amidohydrolase  30.3 
 
 		 459 aa  76.3  0.0000000000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.331693  normal  0.75215 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1348  putative Xaa-Pro dipeptidase  27.6 
 
 		 434 aa  73.9  0.000000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1852  imidazolonepropionase related amidohydrolase  31.31 
 
 		 410 aa  74.3  0.000000000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4565  amidohydrolase  28.7 
 
 		 423 aa  73.6  0.000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.244661  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3036  amidohydrolase  26.56 
 
 		 407 aa  73.6  0.000000000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0935  amidohydrolase  27.81 
 
 		 428 aa  73.6  0.000000000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.755972  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1826  Pro-Hyp dipeptidase  26.92 
 
 		 426 aa  73.2  0.000000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2609  amidohydrolase  26.12 
 
 		 396 aa  73.2  0.000000000007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3194  hypothetical protein  28.37 
 
 		 447 aa  72.8  0.000000000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.352282  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3741  amidohydrolase  30.26 
 
 		 444 aa  72.8  0.000000000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2978  amidohydrolase  30 
 
 		 429 aa  72.4  0.00000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3597  amidohydrolase  27.22 
 
 		 445 aa  72.4  0.00000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0533  amidohydrolase  28 
 
 		 444 aa  72.4  0.00000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.200592  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0681  amidohydrolase  26.45 
 
 		 432 aa  72.4  0.00000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.312549  normal  0.59002 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2825  amidohydrolase  32.35 
 
 		 433 aa  71.2  0.00000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.886429  normal  0.061566 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1893  amidohydrolase  35.39 
 
 		 409 aa  71.2  0.00000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.342109 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2992  amidohydrolase  29.17 
 
 		 433 aa  71.6  0.00000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2377  amidohydrolase  26.63 
 
 		 421 aa  71.2  0.00000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.134161  normal  0.652305 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1913  amidohydrolase  35.39 
 
 		 409 aa  71.2  0.00000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.406706  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1959  amidohydrolase  35.39 
 
 		 409 aa  71.2  0.00000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3085  amidohydrolase family protein  26.17 
 
 		 694 aa  70.9  0.00000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1571  amidohydrolase  27.51 
 
 		 392 aa  70.5  0.00000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0206923  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0434  putative secreted hydrolase  24.73 
 
 		 430 aa  70.5  0.00000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4292  amidohydrolase  30.61 
 
 		 402 aa  70.5  0.00000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.756284 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0087  amidohydrolase  30.41 
 
 		 423 aa  69.7  0.00000000007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0161193  normal  0.19517 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2826  amidohydrolase  32.65 
 
 		 461 aa  69.3  0.00000000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00342984  normal  0.0235152 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2515  amidohydrolase  29.1 
 
 		 426 aa  69.3  0.0000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0420  amidohydrolase  31.68 
 
 		 418 aa  69.3  0.0000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4188  amidohydrolase  32.62 
 
 		 421 aa  68.9  0.0000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4855  amidohydrolase  32.02 
 
 		 403 aa  68.6  0.0000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.165345  normal  0.275978 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3715  amidohydrolase  30.04 
 
 		 417 aa  68.2  0.0000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.355417  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3788  amidohydrolase  30.04 
 
 		 417 aa  68.2  0.0000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.463322  normal  0.142834 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3728  amidohydrolase  30.04 
 
 		 417 aa  68.2  0.0000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4333  amidohydrolase  26.96 
 
 		 424 aa  68.2  0.0000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.48776  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2646  amidohydrolase  25.07 
 
 		 407 aa  67.8  0.0000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1060  amidohydrolase  28.35 
 
 		 438 aa  67.4  0.0000000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000132044 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0333  amidohydrolase  23.91 
 
 		 407 aa  66.6  0.0000000006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2941  amidohydrolase  23.77 
 
 		 390 aa  66.6  0.0000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.270763  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1413  amidohydrolase  28.17 
 
 		 423 aa  66.6  0.0000000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2334  amidohydrolase  31.55 
 
 		 455 aa  66.6  0.0000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.202717 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3237  amidohydrolase  29.03 
 
 		 404 aa  66.2  0.0000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.136124  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0159  amidohydrolase  29.36 
 
 		 415 aa  65.9  0.0000000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2681  amidohydrolase  26.11 
 
 		 692 aa  65.1  0.000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.398807  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0868  amidohydrolase  32.87 
 
 		 351 aa  64.3  0.000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0983  amidohydrolase  26.12 
 
 		 445 aa  64.3  0.000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>