More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_1203 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009953  Sare_1095  glycosyl transferase group 1  88.43 
 
 		 376 aa  654    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.174275  normal  0.0671242 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1203  glycosyl transferase, group 1  100 
 
 		 386 aa  775    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.359152  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6389  glycosyl transferase group 1  30.63 
 
 		 387 aa  142  9.999999999999999e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.447732  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2669  glycosyl transferase, group 1  31.94 
 
 		 404 aa  142  9.999999999999999e-33  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2189  glycosyl transferase group 1  28.93 
 
 		 394 aa  140  3e-32  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.818253 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5087  glycosyl transferase group 1  34.86 
 
 		 390 aa  133  6e-30  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4622  glycosyl transferase group 1  34.35 
 
 		 391 aa  130  5.0000000000000004e-29  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0028112 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1704  glycosyl transferase group 1  28.75 
 
 		 410 aa  128  1.0000000000000001e-28  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0719  glycosyl transferase group 1  29.67 
 
 		 401 aa  127  4.0000000000000003e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.341706  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3293  glycosyl transferase group 1  35.66 
 
 		 392 aa  126  6e-28  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1173  glycosyl transferase group 1  29.04 
 
 		 391 aa  124  3e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4490  glycosyl transferase, group 1  32.81 
 
 		 398 aa  123  4e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.236565 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5004  glycosyl transferase group 1  32.81 
 
 		 435 aa  120  3e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000372843 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4972  glycosyl transferase group 1  36.05 
 
 		 445 aa  117  3e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1051  putative transferase  30.59 
 
 		 384 aa  116  6.9999999999999995e-25  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2495  glycosyl transferase group 1  30.15 
 
 		 392 aa  111  2.0000000000000002e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.402405  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4364  glycosyl transferase group 1  32.74 
 
 		 393 aa  110  5e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1077  glycosyl transferase group 1  28.46 
 
 		 402 aa  110  5e-23  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000145174 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5224  glycosyl transferase group 1  32.12 
 
 		 384 aa  107  5e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0256  glycosyl transferase group 1  32.86 
 
 		 415 aa  99  1e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.910371  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2877  glycosyl transferase, group 1  28.11 
 
 		 426 aa  93.6  5e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3402  glycosyl transferase group 1  31.18 
 
 		 448 aa  89.7  7e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.204154 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3130  glycosyl transferase group 1  30 
 
 		 448 aa  88.6  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1804  glycosyl transferase group 1  25.7 
 
 		 415 aa  87.4  4e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4356  glycosyl transferase group 1  29.43 
 
 		 409 aa  86.7  7e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.784045 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3553  glycosyl transferase group 1  26.07 
 
 		 403 aa  85.5  0.000000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0516541  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2208  glycosyl transferase group 1  29.07 
 
 		 403 aa  85.9  0.000000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.120517  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3179  glycosyl transferase group 1  28.19 
 
 		 403 aa  84.7  0.000000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6753  glycosyl transferase group 1  29.32 
 
 		 414 aa  81.6  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.610687  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3540  glycosyl transferase group 1  32.21 
 
 		 431 aa  82  0.00000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.782852  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4248  glycosyl transferase group 1  25.59 
 
 		 405 aa  80.9  0.00000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.461257  normal  0.0976118 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4198  glycosyl transferase group 1  28.39 
 
 		 405 aa  78.6  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0391  glycosyl transferase group 1  27.63 
 
 		 414 aa  76.3  0.0000000000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1746  glycosyl transferase, group 1  30.32 
 
 		 346 aa  75.1  0.000000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.418679  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4708  glycosyl transferase group 1  26.12 
 
 		 418 aa  72  0.00000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.514087 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3851  glycosyl transferase, group 1  30.63 
 
 		 353 aa  68.6  0.0000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.243477 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0591  glycosyl transferase group 1  24.51 
 
 		 404 aa  67.8  0.0000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2017  glycosyltransferase  29.63 
 
 		 389 aa  66.2  0.0000000009  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.641598  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1784  glycosyltransferase  27.42 
 
 		 401 aa  65.9  0.000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2954  glycosyl transferase group 1  30.66 
 
 		 376 aa  65.9  0.000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0029  glycosyltransferase  25.96 
 
 		 392 aa  64.3  0.000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0000827208  hitchhiker  0.00854387 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0444  glycosyl transferase group 1  27.96 
 
 		 387 aa  63.9  0.000000004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.990869 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0451  putative glycosyl transferase  21.79 
 
 		 401 aa  63.5  0.000000007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0354  glycosyl transferase group 1  27.18 
 
 		 402 aa  62.8  0.00000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.000079613  normal  0.480518 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1934  glycosyl transferase, group 1  33.89 
 
 		 446 aa  62.4  0.00000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00109377  hitchhiker  0.0000195577 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15990  glycosyl transferase group 1  22.84 
 
 		 419 aa  62.4  0.00000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4615  glycosyl transferase, group 1  27.78 
 
 		 382 aa  61.6  0.00000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.352309  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1723  glycosyl transferase, group 1  29.65 
 
 		 380 aa  61.6  0.00000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.952593  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4020  glycosyl transferase group 1  36.08 
 
 		 339 aa  60.8  0.00000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2857  glycosyl transferase, group 1  30.3 
 
 		 354 aa  60.8  0.00000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.135922  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0232  glycosyl transferase group 1  30.3 
 
 		 354 aa  60.8  0.00000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0250  glycosyl transferase, group 1  30.3 
 
 		 354 aa  60.8  0.00000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2757  glycosyl transferase group 1  31.28 
 
 		 392 aa  60.5  0.00000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.110907  normal  0.856034 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1281  putative glycosyl transferase  33.08 
 
 		 360 aa  60.5  0.00000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.93483  normal  0.480186 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20190  glycosyltransferase  37.5 
 
 		 340 aa  58.9  0.0000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.442507  normal  0.152951 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0911  glycosyl transferase group 1  28.03 
 
 		 373 aa  59.3  0.0000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000886615  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0775  glycosyltransferase-like protein  30.67 
 
 		 371 aa  59.3  0.0000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1194  glycosyl transferase group 1  28.92 
 
 		 355 aa  58.9  0.0000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.169515  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0986  glycosyltransferase  31 
 
 		 383 aa  59.3  0.0000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.075214 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2541  group 1 glycosyl transferase  27 
 
 		 382 aa  59.3  0.0000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.433843  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3352  glycosyl transferase, group 1  29.55 
 
 		 354 aa  58.9  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.41509 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2321  glycosyl transferase group 1  32.99 
 
 		 408 aa  58.5  0.0000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0223153 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0393  putative glycosyl transferase, group 1  23.73 
 
 		 388 aa  58.2  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.336091  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0159  glycosyl transferase group 1  30.43 
 
 		 372 aa  58.2  0.0000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.999055 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0176  glycosyl transferase group 1  29.55 
 
 		 354 aa  57.8  0.0000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0351  glycosyl transferase group 1  25.23 
 
 		 374 aa  57.8  0.0000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.652004 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0478  glycosyl transferase, group 1  17.16 
 
 		 442 aa  57.8  0.0000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.038549  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0163  glycosyl transferase, group 1  29.55 
 
 		 354 aa  57.8  0.0000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.628752  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0654  glycosyltransferase  28.08 
 
 		 390 aa  57  0.0000005  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.385446  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2349  glycosyl transferase group 1  29.75 
 
 		 414 aa  57  0.0000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_04591  putative glycosyl transferase, group 1  22.86 
 
 		 388 aa  57  0.0000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.453112  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17290  UDP-Glycosyltransferase/glycogen phosphorylase  44.12 
 
 		 360 aa  57  0.0000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.655428  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1230  glycosyl transferase group 1  38.55 
 
 		 374 aa  56.6  0.0000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.377048  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3263  glycosyl transferase group 1  27.93 
 
 		 425 aa  56.6  0.0000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1425  glycosyl transferase group 1  31.71 
 
 		 436 aa  56.2  0.0000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0240  glucosyltransferase  26.28 
 
 		 364 aa  56.2  0.0000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1356  glycosyl transferase, group 1  28 
 
 		 373 aa  56.2  0.0000009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  unclonable  0.000000136781  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1760  glycosyl transferase, group 1 family protein  30.65 
 
 		 354 aa  55.5  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.103916  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0568  glycosyl transferase, group 1 family protein  30.65 
 
 		 354 aa  55.5  0.000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2761  glycosyl transferase group 1  30.56 
 
 		 419 aa  55.8  0.000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.399192  normal  0.235509 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2811  glycosyl transferase, group 1 family protein  30.65 
 
 		 354 aa  55.5  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0161  glycosyl transferase, group 1  27.82 
 
 		 365 aa  55.8  0.000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0727  glycosyl transferase, group 1  25.42 
 
 		 382 aa  56.2  0.000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0832639  normal  0.165057 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2751  glycosyl transferase, group 1 family protein  30.65 
 
 		 354 aa  55.5  0.000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.285751  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5604  glycosyl transferase group 1  28.32 
 
 		 336 aa  55.8  0.000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.609172  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2870  glycosyl transferase group 1 protein  30.65 
 
 		 354 aa  55.5  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.707909  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0212  glycogen synthase  23.1 
 
 		 388 aa  55.8  0.000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1853  glycosyl transferase, group 1  27.14 
 
 		 353 aa  56.2  0.000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2842  glycosyl transferase, group 1 family protein  30.65 
 
 		 354 aa  55.5  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.977315  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2920  glycosyl transferase group 1  32.33 
 
 		 435 aa  56.2  0.000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0178  glycosyl transferase group 1  28.86 
 
 		 414 aa  55.8  0.000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0742938  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1042  glycosyl transferase group 1  31.96 
 
 		 354 aa  55.5  0.000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1141  glycosyl transferase, group 1  31.96 
 
 		 355 aa  55.8  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0760697 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2145  glycosyl transferase group 1  30.65 
 
 		 354 aa  55.8  0.000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2590  glycosyl transferase, group 1  26.39 
 
 		 410 aa  55.5  0.000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1038  glycosyl transferase, group 1  31.96 
 
 		 354 aa  55.5  0.000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1914  glycosyl transferase group 1  28.73 
 
 		 344 aa  55.5  0.000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2830  glycosyl transferase group 1  25.53 
 
 		 380 aa  55.8  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0420061 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2438  glycosyl transferase, group 1 family protein  30.65 
 
 		 354 aa  55.5  0.000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.181607  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4899  glycosyl transferase group 1  33.33 
 
 		 363 aa  55.5  0.000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.819948  normal  0.982264 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>