211 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sterm_4103 on replicon NC_013517
Organism: Sebaldella termitidis ATCC 33386



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013517  Sterm_4103  transcriptional regulator, DeoR family  100 
 
 
313 aa  627  1e-179  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.000227341  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1069  transcriptional regulator, DeoR family  66.03 
 
 
316 aa  436  1e-121  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000512012  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1071  transcriptional regulator, DeoR family  45.81 
 
 
308 aa  280  2e-74  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0743327  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5499  sorbitol operon regulator SorC  32.27 
 
 
315 aa  184  1.0000000000000001e-45  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4482  sorbitol operon regulator SorC  31.95 
 
 
315 aa  182  5.0000000000000004e-45  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.543234 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4524  sorbitol operon regulator SorC  31.95 
 
 
315 aa  182  5.0000000000000004e-45  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1990  transcriptional regulator, DeoR family  33.23 
 
 
319 aa  181  1e-44  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.356638  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0327  transcriptional regulator, putative  32.37 
 
 
327 aa  178  1e-43  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0172702  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2262  putative transcriptional regulator  33.86 
 
 
316 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0901188 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2980  putative transcriptional regulator  34.18 
 
 
310 aa  171  1e-41  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2979  transcriptional regulator  33.86 
 
 
313 aa  170  4e-41  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2767  transcriptional regulator  33.86 
 
 
362 aa  169  7e-41  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.872952  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0686  transcriptional regulator, DeoR family  33.23 
 
 
317 aa  169  7e-41  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  unclonable  0.0000000719741  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2773  DeoR family transcriptional regulator  33.76 
 
 
310 aa  168  9e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0783216  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3018  deoxyribonucleoside regulator  33.86 
 
 
315 aa  168  1e-40  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3767  transcriptional regulator, DeoR family  32.35 
 
 
321 aa  167  2e-40  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2976  putative transcriptional regulator  33.54 
 
 
310 aa  167  2e-40  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000216017 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3016  transcriptional regulator, putative  33.23 
 
 
310 aa  167  2.9999999999999998e-40  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.241411  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2697  deoxyribonucleoside regulator  33.54 
 
 
310 aa  165  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2717  deoxyribonucleoside regulator  33.23 
 
 
310 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1034  transcriptional regulator, DeoR family  30.57 
 
 
315 aa  159  6e-38  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000316866  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2685  DeoR family transcriptional regulator  30.45 
 
 
317 aa  155  9e-37  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0409  DeoR family transcriptional regulator  28.08 
 
 
334 aa  147  2.0000000000000003e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0717665  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1750  DeoR family transcriptional regulator  30.94 
 
 
315 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00345901  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1468  DeoR family transcriptional regulator  29.08 
 
 
315 aa  146  5e-34  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.000010557  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3452  putative deoxyribonucleoside regulator DeoR  30.97 
 
 
315 aa  146  5e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00224195  hitchhiker  1.06699e-16 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1702  deoxyribonucleoside regulator  30.29 
 
 
315 aa  145  6e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000147991  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1753  deoxyribonucleoside regulator DeoR  30.29 
 
 
315 aa  145  1e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000750924  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1731  deoxyribonucleoside regulator  30.29 
 
 
315 aa  145  1e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000000228989  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1891  deoxyribonucleoside regulator DeoR  30.29 
 
 
315 aa  145  1e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0535512  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1894  putative deoxyribonucleoside regulator DeoR  30.29 
 
 
315 aa  145  1e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0693832  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1926  putative deoxyribonucleoside regulator DeoR  30.29 
 
 
315 aa  145  1e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.60106e-41 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2001  putative deoxyribonucleoside regulator DeoR  30.29 
 
 
316 aa  145  1e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000544844  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1974  deoxyribonucleoside regulator DeoR, putative  30.42 
 
 
315 aa  144  2e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00373249  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1160  citrate lyase regulator, putative  29.39 
 
 
321 aa  141  9.999999999999999e-33  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0152534  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0904  sugar-binding domain-containing protein  30.56 
 
 
314 aa  141  1.9999999999999998e-32  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3505  DeoR family transcriptional regulator  27.78 
 
 
312 aa  140  1.9999999999999998e-32  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3245  sugar-binding domain-containing protein  30.56 
 
 
314 aa  141  1.9999999999999998e-32  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3150  DeoR family transcriptional regulator  27.78 
 
 
312 aa  140  1.9999999999999998e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.114782 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3378  DeoR family transcriptional regulator  30.56 
 
 
314 aa  140  3e-32  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2643  transcriptional regulator, DeoR family  30.86 
 
 
314 aa  138  8.999999999999999e-32  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.000047791  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3131  DeoR family transcriptional regulator  29.06 
 
 
316 aa  136  4e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0115  DeoR family transcriptional regulator  27.3 
 
 
310 aa  135  9.999999999999999e-31  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000000156303  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2050  transcriptional regulator, DeoR family  24.45 
 
 
323 aa  134  1.9999999999999998e-30  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1126  DeoR family transcriptional regulator  30.13 
 
 
307 aa  133  3.9999999999999996e-30  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2252  transcriptional regulator, DeoR family  28.44 
 
 
316 aa  133  3.9999999999999996e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.345657  normal  0.232 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2030  transcriptional regulator, DeoR family  28.04 
 
 
316 aa  132  7.999999999999999e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.130685  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2395  transcriptional regulator, putative  28.35 
 
 
317 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.129773  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2524  DeoR family transcriptional regulator  25.86 
 
 
357 aa  131  2.0000000000000002e-29  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1403  Glycerone kinase  26.47 
 
 
700 aa  131  2.0000000000000002e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.411748  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3075  DeoR family transcriptional regulator  25.74 
 
 
335 aa  128  1.0000000000000001e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0812  transcriptional regulator, DeoR family  25.08 
 
 
320 aa  125  9e-28  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.336139 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2232  DeoR family transcriptional regulator  24.83 
 
 
339 aa  124  2e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4071  Glycerone kinase  27.81 
 
 
694 aa  124  2e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3606  DeoR family transcriptional regulator  25.9 
 
 
334 aa  124  3e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5157  transcriptional regulator, DeoR family  25.99 
 
 
334 aa  124  3e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4114  DeoR family transcriptional regulator  26.1 
 
 
339 aa  122  9.999999999999999e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.562064  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3438  transcriptional regulator, DeoR family  27.74 
 
 
325 aa  121  1.9999999999999998e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.909409 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0255  DeoR family transcriptional regulator  25.47 
 
 
320 aa  121  1.9999999999999998e-26  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.991369  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2134  transcriptional regulator, DeoR family  26.18 
 
 
317 aa  120  3e-26  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.10334  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1594  transcriptional repressor LsrR  26.18 
 
 
317 aa  120  3.9999999999999996e-26  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2125  transcriptional repressor LsrR  26.18 
 
 
317 aa  120  3.9999999999999996e-26  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1713  transcriptional repressor LsrR  26.18 
 
 
317 aa  120  3.9999999999999996e-26  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2146  DeoR family transcriptional regulator  26.18 
 
 
317 aa  120  3.9999999999999996e-26  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0989  transcriptional regulator, DeoR family  25.24 
 
 
321 aa  119  9.999999999999999e-26  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1190  DeoR family transcriptional regulator  25.24 
 
 
326 aa  117  1.9999999999999998e-25  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.11475  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3263  DeoR family transcriptional regulator  26.69 
 
 
321 aa  117  1.9999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3737  transcriptional regulator, DeoR family  27.42 
 
 
325 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0407  transcriptional regulator, putative  23.91 
 
 
321 aa  116  3.9999999999999997e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1660  transcriptional repressor LsrR  25.87 
 
 
317 aa  115  6.9999999999999995e-25  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.853311 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1570  dihydroxyacetone kinase family protein  27.45 
 
 
694 aa  115  7.999999999999999e-25  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0904773  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1816  putative sugar-binding protein  27.21 
 
 
339 aa  115  8.999999999999998e-25  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.129993  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1790  PTS system, mannitol-specific IIBC component  27.21 
 
 
339 aa  115  8.999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0814  putative sugar-binding protein  27.21 
 
 
339 aa  115  8.999999999999998e-25  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1105  putative sugar-binding protein  27.21 
 
 
339 aa  115  8.999999999999998e-25  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2078  putative sugar-binding protein  27.21 
 
 
339 aa  115  8.999999999999998e-25  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0753  transcriptional regulator, DeoR family  24.92 
 
 
332 aa  115  8.999999999999998e-25  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.245916  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1339  DeoR family transcriptional regulator  25.48 
 
 
363 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0050  sorbitol operon transcriptional regulator  27.85 
 
 
319 aa  115  1.0000000000000001e-24  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00407862  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0453  DNA-binding protein  27.21 
 
 
339 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0358  putative transcriptional regulator  27.21 
 
 
339 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.217611  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2156  transcriptional regulator, DeoR family  26.42 
 
 
320 aa  114  2.0000000000000002e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22170  sugar-binding domain-containing protein  24.92 
 
 
310 aa  112  5e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03820  transcriptional regulator with sigma factor-related N-terminal domain  24.36 
 
 
318 aa  112  9e-24  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2312  sugar-binding domain-containing protein  23.78 
 
 
333 aa  111  1.0000000000000001e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2553  DeoR family transcriptional regulator  24.69 
 
 
342 aa  112  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4174  DeoR family transcriptional regulator  28.52 
 
 
310 aa  111  1.0000000000000001e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2598  DeoR family transcriptional regulator  24.69 
 
 
342 aa  112  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0969479  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2592  DeoR family transcriptional regulator  24.69 
 
 
342 aa  112  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0641807  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1639  DeoR family transcriptional regulator  25.71 
 
 
325 aa  111  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.294849  hitchhiker  0.00400864 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2414  DeoR family transcriptional regulator  23.78 
 
 
333 aa  111  1.0000000000000001e-23  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.415693  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0087  transcriptional regulator  24.69 
 
 
326 aa  111  2.0000000000000002e-23  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.284033  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2573  putative sugar-binding region  24.84 
 
 
337 aa  110  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3849  transcriptional regulator  25.57 
 
 
325 aa  109  5e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0550  transcriptional regulator  25.24 
 
 
323 aa  109  5e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3537  DeoR family transcriptional regulator  27.95 
 
 
323 aa  109  5e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.165471 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3426  transcriptional regulator, DeoR family  24.05 
 
 
336 aa  109  6e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000128102  hitchhiker  0.000369774 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3519  Crp/Fnr family sugar-binding transcriptional regulatory  24.05 
 
 
306 aa  108  9.000000000000001e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4471  hypothetical protein  24.84 
 
 
319 aa  108  1e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2010  DeoR family transcriptional regulator  27.27 
 
 
342 aa  108  1e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.389501 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>