More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sterm_0086 on replicon NC_013517
Organism: Sebaldella termitidis ATCC 33386



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013517  Sterm_0086  transcriptional regulator, AraC family  100 
 
 
313 aa  650    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.353006  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4724  AraC family transcriptional regulator  32.02 
 
 
290 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.440387  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5086  AraC family transcriptional regulator  32.02 
 
 
290 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4672  AraC family transcriptional regulator  32.02 
 
 
290 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4957  transcriptional regulator, AraC family  29.73 
 
 
290 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4947  transcriptional regulator, AraC family  31.27 
 
 
290 aa  113  4.0000000000000004e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4986  AraC family transcriptional regulator  31.23 
 
 
290 aa  112  6e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4582  AraC family transcriptional regulator  32.93 
 
 
290 aa  112  7.000000000000001e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.763033  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4973  transcriptional regulator, AraC family  31.23 
 
 
290 aa  112  7.000000000000001e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0278  transcriptional regulator, AraC family  31.62 
 
 
290 aa  112  8.000000000000001e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4566  AraC family transcriptional regulator  30.92 
 
 
290 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.017881  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2759  AraC family transcriptional regulator  32.41 
 
 
292 aa  110  3e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0990  AraC family transcriptional regulator  31.05 
 
 
281 aa  110  4.0000000000000004e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2323  transcriptional regulator, AraC family  31.15 
 
 
289 aa  107  2e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.614848  n/a   
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1790  transcriptional regulator, AraC family  27.3 
 
 
282 aa  107  3e-22  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.191731  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0205  transcriptional activator, AraC family  31.58 
 
 
281 aa  107  3e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000524418 
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1798  transcriptional regulator, AraC family  42.54 
 
 
200 aa  106  4e-22  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5265  transcriptional regulator, AraC family  29.48 
 
 
281 aa  105  8e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2556  AraC family transcriptional regulator  34.07 
 
 
290 aa  105  9e-22  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000000235949  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0223  transcriptional activator, AraC family  31.17 
 
 
281 aa  104  2e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000178737 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3142  AraC family transcriptional regulator  34.22 
 
 
301 aa  104  2e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3264  transcriptional regulator, AraC family  30.2 
 
 
287 aa  102  1e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2678  transcriptional regulator, AraC family  28.98 
 
 
284 aa  99.8  5e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3846  transcriptional regulator, AraC family  44.55 
 
 
287 aa  99.8  6e-20  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1802  transcriptional regulator, AraC family  30.68 
 
 
286 aa  99.4  7e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0424  transcriptional regulator, AraC family  32.24 
 
 
281 aa  98.2  1e-19  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3181  AraC family transcriptional regulator  25.77 
 
 
292 aa  96.3  7e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3174  AraC family transcriptional regulator  27.89 
 
 
280 aa  95.5  1e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.626893  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2107  AraC family transcriptional regulator  45 
 
 
313 aa  91.3  2e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.342925  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3344  helix-turn-helix domain-containing protein  30.63 
 
 
232 aa  91.3  2e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.388455  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3138  AraC family transcriptional regulator  26.28 
 
 
281 aa  90.5  3e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2210  transcriptional regulator, AraC family  27.52 
 
 
291 aa  88.2  2e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0674  AraC family transcriptional regulator  37.29 
 
 
265 aa  87.4  3e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1922  transcriptional regulator, AraC family  34.62 
 
 
291 aa  86.3  6e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.890213  normal  0.89853 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06300  methylphosphotriester-DNA alkyltransferase  22.7 
 
 
302 aa  86.3  6e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0137  AraC family transcriptional regulator  41.84 
 
 
315 aa  85.9  7e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.10009 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1784  AraC family transcriptional regulator  26.15 
 
 
280 aa  84  0.000000000000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000275244  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3564  transcriptional regulator, AraC family  27.49 
 
 
285 aa  82.8  0.000000000000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1127  transcriptional regulator, AraC family  27.8 
 
 
288 aa  82.8  0.000000000000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1952  AraC family transcriptional regulator  27.27 
 
 
271 aa  82  0.00000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0598764  normal  0.641899 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0009  helix-turn-helix domain-containing protein  35.43 
 
 
306 aa  82  0.00000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000070115 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2251  transcriptional regulator, AraC family  35.16 
 
 
287 aa  81.3  0.00000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0011  transcriptional regulator, AraC family  38.14 
 
 
285 aa  79.3  0.00000000000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000871788  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1266  AraC family transcriptional regulator  26.56 
 
 
300 aa  77.8  0.0000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.23796  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6275  AraC family transcriptional regulator  24.76 
 
 
279 aa  77.4  0.0000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0165  AraC family transcriptional regulator  26.14 
 
 
298 aa  76.6  0.0000000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4053  AraC family transcriptional regulator  28.88 
 
 
277 aa  76.3  0.0000000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2780  transcriptional regulator, AraC family  28.11 
 
 
285 aa  75.5  0.000000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0531003  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003322  hypothetical protein  27.56 
 
 
310 aa  75.1  0.000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.757084  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1931  AraC family transcriptional regulator  33.04 
 
 
118 aa  74.7  0.000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0129269  hitchhiker  0.0018191 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0176  AraC family transcriptional regulator  37.23 
 
 
299 aa  73.2  0.000000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0192  AraC family transcriptional regulator  37.23 
 
 
299 aa  73.2  0.000000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0179  AraC family transcriptional regulator  37.23 
 
 
299 aa  73.2  0.000000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0147136  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0191  AraC family transcriptional regulator  37.23 
 
 
299 aa  73.2  0.000000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0211  transcriptional regulator, AraC family  37.23 
 
 
299 aa  73.2  0.000000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0910  HTH-type transcription regulator, AraC-family  32.5 
 
 
298 aa  72.8  0.000000000008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.576456  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0329  transcription activator effector binding protein  25.2 
 
 
288 aa  72.4  0.000000000009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0236652  normal  0.0105288 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0182  AraC family transcriptional regulator  37.23 
 
 
299 aa  72.4  0.000000000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1216  AraC family transcriptional regulator  23.46 
 
 
300 aa  72  0.00000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0216  transcriptional regulator, AraC family  37.78 
 
 
299 aa  72  0.00000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0526  transcriptional regulator, AraC family  36.21 
 
 
129 aa  71.6  0.00000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000198595  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1440  helix-turn-helix, AraC type  36.89 
 
 
209 aa  71.2  0.00000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0077  HTH-type transcriptional regulator, AraC-family  38.61 
 
 
289 aa  70.9  0.00000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000611  AraC-type DNA-binding domain-containing protein  24.84 
 
 
289 aa  70.5  0.00000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0208776  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3715  transcriptional regulator, AraC family  26.52 
 
 
279 aa  69.7  0.00000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.424878 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001047  transcriptional regulator AraC family  34.65 
 
 
299 aa  69.7  0.00000000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4171  transcriptional regulator, AraC family  23.08 
 
 
300 aa  69.3  0.00000000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1013  AraC family transcriptional regulator  34.02 
 
 
300 aa  69.3  0.00000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.126228  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3417  transcriptional regulator, AraC family  27.8 
 
 
279 aa  69.3  0.00000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.27768  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1194  transcriptional regulator, AraC family  23.46 
 
 
300 aa  69.3  0.00000000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.926126 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3503  transcription activator, effector binding  29.44 
 
 
294 aa  69.3  0.00000000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00111619  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1036  AraC family transcriptional regulator  34.02 
 
 
300 aa  68.9  0.0000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.139629  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1014  AraC family transcriptional regulator  23.46 
 
 
300 aa  68.6  0.0000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.210728  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1114  AraC family transcriptional regulator  34.02 
 
 
300 aa  68.9  0.0000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1021  AraC family transcriptional regulator  23.65 
 
 
300 aa  68.6  0.0000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1271  transcriptional regulator, AraC family  34.02 
 
 
300 aa  68.9  0.0000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.121916  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06471  hypothetical protein  30.77 
 
 
289 aa  67.8  0.0000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2127  transcription activator effector binding protein  26.83 
 
 
290 aa  68.2  0.0000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1170  transcriptional regulator, AraC family  22.69 
 
 
300 aa  67.8  0.0000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00906983  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7157  transcriptional regulator, AraC family  35.05 
 
 
277 aa  67  0.0000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.367426 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1523  AraC family transcriptional regulator  37.62 
 
 
152 aa  66.6  0.0000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00364512  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0771  AraC family transcriptional regulator  29.75 
 
 
288 aa  66.6  0.0000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.472166 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0853  transcriptional regulator, AraC family  34.38 
 
 
284 aa  66.2  0.0000000006  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2797  transcription activator effector binding  25.19 
 
 
279 aa  66.2  0.0000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.338998 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3144  AraC family transcriptional regulator  31.73 
 
 
243 aa  65.9  0.0000000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1890  AraC family transcriptional regulator  34.31 
 
 
120 aa  65.9  0.0000000008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.520011  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1051  transcriptional regulator, AraC family  31.37 
 
 
276 aa  65.9  0.0000000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3099  AraC family transcriptional regulator  36.36 
 
 
326 aa  64.7  0.000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0261  AraC family transcriptional regulator  34.02 
 
 
281 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3983  transcriptional regulator, AraC family  33 
 
 
291 aa  64.3  0.000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2938  AraC family transcriptional regulator  25.91 
 
 
279 aa  64.3  0.000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.487848  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3482  AraC family transcriptional regulator  34.02 
 
 
140 aa  64.3  0.000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.119803  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1398  AraC family transcriptional regulator  35.05 
 
 
296 aa  63.9  0.000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.584508  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7634  transcriptional regulator AraC family  28.83 
 
 
304 aa  63.5  0.000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.63081  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1217  transcription activator, effector binding  36.21 
 
 
288 aa  62.8  0.000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3673  transcriptional regulator, AraC family  35 
 
 
295 aa  62.4  0.000000009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0529  transcriptional regulator, AraC family  35 
 
 
288 aa  61.6  0.00000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0186  transcriptional regulator, AraC family  30.39 
 
 
452 aa  62.4  0.00000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0568  transcriptional regulator, AraC family  35 
 
 
293 aa  62.4  0.00000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.117041  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1474  transcriptional regulator, AraC family  38 
 
 
286 aa  62  0.00000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>