More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_3990 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011313  VSAL_II0357  arylsulfatase  71.4 
 
 		 512 aa  784    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.340259  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3990  sulfatase family protein  100 
 
 		 517 aa  1075    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0419  sulfatase  43.96 
 
 		 513 aa  443  1e-123  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000311  arylsulfatase  45.69 
 
 		 508 aa  437  1e-121  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.63107  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3391  sulfatase  44.01 
 
 		 505 aa  431  1e-119  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.169259 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0562  sulfatase  44.01 
 
 		 505 aa  430  1e-119  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0526  sulfatase  44.42 
 
 		 564 aa  430  1e-119  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6900  sulfatase  43.47 
 
 		 545 aa  427  1e-118  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0879565  normal  0.386644 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5118  sulfatase  43.74 
 
 		 554 aa  422  1e-117  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1946  sulfatase  43.73 
 
 		 546 aa  417  9.999999999999999e-116  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003601  arylsulfatase  42.5 
 
 		 521 aa  417  9.999999999999999e-116  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0660  sulfatase family protein  42.23 
 
 		 525 aa  402  1e-111  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.61402  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000313  arylsulfatase  43.03 
 
 		 515 aa  399  9.999999999999999e-111  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2985  sulfatase family protein  41.41 
 
 		 502 aa  397  1e-109  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0283878  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1195  sulfatase  43.18 
 
 		 552 aa  395  1e-109  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.031071  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1202  sulfatase  41.47 
 
 		 547 aa  396  1e-109  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.191965 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8070  sulfatase  42.89 
 
 		 557 aa  395  1e-109  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.883043  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1142  sulfatase  41.96 
 
 		 555 aa  398  1e-109  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4629  sulfatase  42.11 
 
 		 496 aa  393  1e-108  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.284621  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2095  sulfatase  43.24 
 
 		 512 aa  389  1e-107  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0111977  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1735  sulfatase  42.49 
 
 		 508 aa  389  1e-107  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3411  sulfatase  42.3 
 
 		 526 aa  387  1e-106  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.420036 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2984  sulfatase family protein  40.39 
 
 		 512 aa  384  1e-105  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  unclonable  0.00336122  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0789  sulfatase  40.46 
 
 		 525 aa  383  1e-105  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0797845  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3051  sulfatase  41.04 
 
 		 522 aa  384  1e-105  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.829801  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3791  sulfatase  40.36 
 
 		 548 aa  384  1e-105  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.425915  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3081  arylsulfatase  41.39 
 
 		 496 aa  381  1e-104  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.131802 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2983  putative arylsulfatase  41.22 
 
 		 522 aa  376  1e-103  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0960108  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3032  sulfatase family protein  41.87 
 
 		 522 aa  377  1e-103  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5416  arylsulfatase-like enzyme  42.31 
 
 		 579 aa  378  1e-103  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.443584 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4113  sulfatase  40.61 
 
 		 514 aa  374  1e-102  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.446861  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4188  sulfatase  40.61 
 
 		 514 aa  374  1e-102  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3123  sulfatase  39.48 
 
 		 549 aa  373  1e-102  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2893  sulfatase  41.89 
 
 		 567 aa  370  1e-101  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.269953  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5142  sulfatase  44.57 
 
 		 544 aa  370  1e-101  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4344  sulfatase  40.71 
 
 		 505 aa  365  1e-100  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.712757  normal  0.252658 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2371  sulfatase  40.61 
 
 		 510 aa  363  3e-99  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.852311  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3805  sulfatase  40.32 
 
 		 552 aa  360  4e-98  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2132  putative arylsulfatase  43.37 
 
 		 560 aa  357  2.9999999999999997e-97  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.242707  normal  0.0122075 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3111  arylsulfatase precursor  38.8 
 
 		 533 aa  356  5e-97  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.513855  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4569  arylsulfatase  37.11 
 
 		 542 aa  343  2.9999999999999997e-93  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.149859  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5768  sulfatase  34.24 
 
 		 555 aa  213  4.9999999999999996e-54  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2939  sulfatase  32.6 
 
 		 556 aa  211  2e-53  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6904  sulfatase  33.71 
 
 		 556 aa  211  2e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.430095 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1239  sulfatase  35.47 
 
 		 554 aa  210  5e-53  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0342863  normal  0.143694 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3142  sulfatase  30.63 
 
 		 524 aa  209  8e-53  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.854728  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6681  sulfatase  32.7 
 
 		 561 aa  209  1e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4178  sulfatase  32.39 
 
 		 551 aa  207  4e-52  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0425413  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1647  sulfatase  29.94 
 
 		 590 aa  207  5e-52  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.425588  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5555  sulfatase  32.18 
 
 		 561 aa  207  5e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.708907  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03625  hypothetical protein  31.98 
 
 		 551 aa  205  1e-51  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.173568  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03676  acrylsulfatase-like enzyme  31.98 
 
 		 551 aa  205  1e-51  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.176732  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4166  arylsulfatase  31.98 
 
 		 551 aa  205  1e-51  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00523411  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5237  arylsulfatase  32.19 
 
 		 551 aa  206  1e-51  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0995003  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6751  sulfatase  30.53 
 
 		 569 aa  204  4e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0169669 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0793  sulfatase  30.36 
 
 		 569 aa  198  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0527752  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5097  sulfatase  30.82 
 
 		 550 aa  197  4.0000000000000005e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.551425  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6289  sulfatase  30.48 
 
 		 486 aa  194  3e-48  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.235101 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2738  sulfatase  29.78 
 
 		 466 aa  188  2e-46  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.846304  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3115  cerebroside-sulfatase  27.27 
 
 		 440 aa  186  1.0000000000000001e-45  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.100154  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4498  sulfatase  29.93 
 
 		 462 aa  184  3e-45  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.697848  normal  0.704843 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1030  sulfatase  27.78 
 
 		 470 aa  179  1e-43  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2941  sulfatase  29.06 
 
 		 480 aa  174  5e-42  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.515365 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3980  Cerebroside-sulfatase  30.07 
 
 		 458 aa  173  5.999999999999999e-42  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.459906 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0038  sulfatase  28.77 
 
 		 497 aa  164  4.0000000000000004e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3501  sulfatase  30.41 
 
 		 506 aa  163  8.000000000000001e-39  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.486843  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0038  sulfatase  28.4 
 
 		 497 aa  160  4e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.292867  hitchhiker  0.00560398 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0039  sulfatase  28.45 
 
 		 497 aa  160  5e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.225946 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0040  sulfatase  29.05 
 
 		 497 aa  160  5e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.872346  normal  0.13967 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0040  sulfatase  29.05 
 
 		 497 aa  160  6e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.843312  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2976  sulfatase  28.6 
 
 		 496 aa  160  7e-38  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8255  sulfatase  30.62 
 
 		 482 aa  159  1e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.229678  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0015  sulfatase  30.64 
 
 		 497 aa  157  6e-37  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.689426  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2602  sulfatase  26.44 
 
 		 452 aa  150  4e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.128586 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0555  sulfatase  29.8 
 
 		 486 aa  148  3e-34  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0740  sulfatase  27.95 
 
 		 440 aa  147  6e-34  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0785  sulfatase  28.31 
 
 		 472 aa  145  2e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.288009  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4240  twin-arginine translocation pathway signal  29.43 
 
 		 457 aa  144  3e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.615359  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0360  Steryl-sulfatase  27.78 
 
 		 553 aa  142  1.9999999999999998e-32  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0936  sulfatase  26.39 
 
 		 479 aa  141  3e-32  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1506  sulfatase  30.15 
 
 		 501 aa  141  3e-32  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.265184 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3949  sulfatase  27.43 
 
 		 470 aa  139  8.999999999999999e-32  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.184377  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3913  sulfatase  27.69 
 
 		 522 aa  139  8.999999999999999e-32  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.656698  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4996  sulfatase  26.1 
 
 		 506 aa  138  3.0000000000000003e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.317023 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2890  sulfatase  27.43 
 
 		 523 aa  134  5e-30  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0302  sulfatase  26.46 
 
 		 543 aa  134  6e-30  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.139649 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2166  sulfatase  25.6 
 
 		 497 aa  133  6.999999999999999e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.696706  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3640  sulfatase  27.13 
 
 		 520 aa  133  7.999999999999999e-30  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3999  sulfatase  28.1 
 
 		 467 aa  133  7.999999999999999e-30  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4692  sulfatase  28.12 
 
 		 491 aa  132  1.0000000000000001e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.66699 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6052  sulfatase  26.88 
 
 		 453 aa  131  3e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0895  sulfatase  24.86 
 
 		 471 aa  130  5.0000000000000004e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.281969  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0889  sulfatase  28.21 
 
 		 500 aa  130  6e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00184444  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0354  sulfatase  26.75 
 
 		 493 aa  130  7.000000000000001e-29  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2831  sulfatase  26.12 
 
 		 440 aa  128  2.0000000000000002e-28  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0404074 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5003  sulfatase  24.16 
 
 		 533 aa  128  2.0000000000000002e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3374  sulfatase  27.99 
 
 		 507 aa  127  4.0000000000000003e-28  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1213  sulfatase  28.35 
 
 		 487 aa  126  8.000000000000001e-28  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.255178  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0474  sulfatase  26.38 
 
 		 491 aa  125  2e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0426  sulfatase  26.55 
 
 		 772 aa  124  4e-27  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.452033  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>