More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_7946 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_7946  Peptidoglycan glycosyltransferase  100 
 
 
487 aa  969    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0020  peptidoglycan glycosyltransferase  49.18 
 
 
485 aa  416  9.999999999999999e-116  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0113  Peptidoglycan glycosyltransferase  48.05 
 
 
485 aa  414  1e-114  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0705115  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0136  peptidoglycan glycosyltransferase  48.55 
 
 
482 aa  400  9.999999999999999e-111  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00209785 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0172  Peptidoglycan glycosyltransferase  47.34 
 
 
483 aa  385  1e-106  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.81873 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0053  peptidoglycan glycosyltransferase  46.41 
 
 
485 aa  384  1e-105  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  hitchhiker  0.00491745  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00200  cell elongation-specific peptidoglycan D,D-transpeptidase  47.46 
 
 
489 aa  379  1e-104  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.765368  normal  0.710729 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0073  Peptidoglycan glycosyltransferase  48.57 
 
 
485 aa  382  1e-104  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.133397  normal  0.88619 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0028  Peptidoglycan glycosyltransferase  46.28 
 
 
493 aa  369  1e-101  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.790877  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4434  peptidoglycan glycosyltransferase  47.52 
 
 
480 aa  365  1e-99  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.367833 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26970  cell division protein FtsI/penicillin-binding protein 2  44.95 
 
 
481 aa  365  1e-99  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5248  Peptidoglycan glycosyltransferase  43.76 
 
 
484 aa  357  2.9999999999999997e-97  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.847746  normal  0.103074 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0027  Peptidoglycan glycosyltransferase  46.5 
 
 
483 aa  351  2e-95  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0025  penicillin-binding protein, transpeptidase  44.85 
 
 
491 aa  347  2e-94  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.874043 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0024  peptidoglycan glycosyltransferase  42.97 
 
 
490 aa  345  1e-93  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.805359  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0037  Peptidoglycan glycosyltransferase  46.11 
 
 
480 aa  344  2e-93  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0017  peptidoglycan glycosyltransferase  43.7 
 
 
491 aa  341  2e-92  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.768484  normal  0.198111 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0017  peptidoglycan glycosyltransferase  43.7 
 
 
491 aa  341  2e-92  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0025  peptidoglycan glycosyltransferase  43.7 
 
 
491 aa  341  2e-92  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00487065 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0020  Peptidoglycan glycosyltransferase  42.22 
 
 
489 aa  333  3e-90  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00200  cell division protein FtsI/penicillin-binding protein 2  46.56 
 
 
490 aa  333  4e-90  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0810  penicillin-binding protein, transpeptidase  43.03 
 
 
491 aa  331  2e-89  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.647945 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3064  peptidoglycan glycosyltransferase  43.71 
 
 
482 aa  327  4.0000000000000003e-88  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.300447  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0023  Peptidoglycan glycosyltransferase  42.02 
 
 
488 aa  322  7e-87  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0951925  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00380  cell elongation-specific peptidoglycan D,D-transpeptidase  41.62 
 
 
489 aa  321  1.9999999999999998e-86  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.465269 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0032  penicillin-binding protein, transpeptidase domain protein  40.97 
 
 
488 aa  300  4e-80  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00770  cell division protein FtsI/penicillin-binding protein 2  41.15 
 
 
481 aa  300  5e-80  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1381  cell division protein  41.42 
 
 
488 aa  298  1e-79  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0079  Peptidoglycan glycosyltransferase  40.12 
 
 
493 aa  297  2e-79  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0022  Peptidoglycan glycosyltransferase  38.78 
 
 
486 aa  296  6e-79  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000781199 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0029  penicillin-binding protein transpeptidase  39.8 
 
 
504 aa  295  1e-78  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.851817  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10016  penicillin-binding protein pbpA  41.41 
 
 
491 aa  293  3e-78  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0022  peptidoglycan glycosyltransferase  42.06 
 
 
504 aa  293  4e-78  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0022  peptidoglycan glycosyltransferase  38.85 
 
 
486 aa  290  5.0000000000000004e-77  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0027  penicillin-binding protein transpeptidase  40.04 
 
 
495 aa  285  1.0000000000000001e-75  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.474914  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1056  peptidoglycan glycosyltransferase  37.93 
 
 
473 aa  273  7e-72  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000594466  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0065  penicillin-binding protein transpeptidase  39.17 
 
 
489 aa  272  9e-72  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0046  peptidoglycan glycosyltransferase  38.97 
 
 
501 aa  267  2.9999999999999995e-70  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.56645  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0037  Peptidoglycan glycosyltransferase  38.38 
 
 
490 aa  266  8.999999999999999e-70  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0051  peptidoglycan glycosyltransferase  38.34 
 
 
503 aa  261  3e-68  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.948858  normal  0.601931 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3047  peptidoglycan glycosyltransferase  35.39 
 
 
470 aa  254  2.0000000000000002e-66  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000101617  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2305  Peptidoglycan glycosyltransferase  36.55 
 
 
458 aa  246  4.9999999999999997e-64  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.117419  hitchhiker  0.000826968 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6473  penicillin-binding protein transpeptidase  34 
 
 
492 aa  241  2e-62  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0122538 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0089  penicillin-binding protein transpeptidase  36.65 
 
 
493 aa  237  3e-61  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0911  peptidoglycan glycosyltransferase  37.24 
 
 
461 aa  234  2.0000000000000002e-60  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.271036  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0016  Peptidoglycan glycosyltransferase  35.98 
 
 
478 aa  231  2e-59  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1337  penicillin-binding protein transpeptidase  34.5 
 
 
972 aa  231  3e-59  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000416244  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0340  putative penicillin-binding protein  34.18 
 
 
487 aa  229  1e-58  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0332  penicillin binding protein transpeptidase domain-containing protein  34.05 
 
 
487 aa  228  1e-58  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0876  Peptidoglycan glycosyltransferase  33.96 
 
 
503 aa  226  8e-58  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2476  penicillin-binding protein transpeptidase  33.05 
 
 
471 aa  225  1e-57  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3845  Peptidoglycan glycosyltransferase  34.43 
 
 
472 aa  223  6e-57  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03310  cell division membrane protein  34.21 
 
 
921 aa  220  5e-56  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3042  Peptidoglycan glycosyltransferase  35.02 
 
 
924 aa  219  1e-55  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1713  penicillin-binding protein, transpeptidase  34.88 
 
 
476 aa  214  3.9999999999999995e-54  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1376  Peptidoglycan glycosyltransferase  37.25 
 
 
547 aa  210  5e-53  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27060  cell division membrane protein  35.68 
 
 
933 aa  207  4e-52  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.358527  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0579  peptidoglycan glycosyltransferase  37.88 
 
 
578 aa  206  8e-52  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.22857 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3840  peptidoglycan glycosyltransferase  37.39 
 
 
577 aa  202  8e-51  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.527285  hitchhiker  0.000155287 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3956  peptidoglycan glycosyltransferase  36.29 
 
 
570 aa  191  2e-47  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.591181  normal  0.218815 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1118  peptidoglycan glycosyltransferase  36.85 
 
 
584 aa  191  2e-47  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1344  Peptidoglycan glycosyltransferase  33.54 
 
 
954 aa  188  2e-46  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.0271008 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1805  penicillin-binding protein 2  35.1 
 
 
610 aa  184  2.0000000000000003e-45  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0103  penicillin-binding protein 2  35.21 
 
 
611 aa  183  8.000000000000001e-45  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0709  penicillin-binding protein 2  35.29 
 
 
640 aa  182  8.000000000000001e-45  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0864  penicillin-binding protein 2  34.25 
 
 
641 aa  181  2e-44  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0531  penicillin-binding protein 2  34.78 
 
 
646 aa  180  5.999999999999999e-44  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0437698  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3814  penicillin-binding protein transpeptidase  35.03 
 
 
579 aa  179  9e-44  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0233122  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2494  peptidoglycan glycosyltransferase  33.58 
 
 
645 aa  176  9e-43  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1106  penicillin-binding protein 2  35.59 
 
 
646 aa  175  9.999999999999999e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.906879  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12060  penicillin-binding protein 2  35.71 
 
 
646 aa  176  9.999999999999999e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0817  peptidoglycan glycosyltransferase  33.7 
 
 
643 aa  174  1.9999999999999998e-42  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.171924  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0571  peptidoglycan glycosyltransferase  36.14 
 
 
634 aa  174  2.9999999999999996e-42  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.784328  normal  0.541139 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2616  Peptidoglycan glycosyltransferase  34.2 
 
 
573 aa  174  2.9999999999999996e-42  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0091  peptidoglycan glycosyltransferase  31.86 
 
 
709 aa  173  5.999999999999999e-42  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.371789  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09030  stage V sporulation protein D  31.13 
 
 
695 aa  171  2e-41  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0317  peptidoglycan glycosyltransferase  33.66 
 
 
646 aa  171  3e-41  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1164  penicillin-binding protein 2  33.06 
 
 
647 aa  171  4e-41  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.498916  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0327  peptidoglycan glycosyltransferase  29.4 
 
 
557 aa  170  4e-41  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.282636  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1401  penicillin-binding protein 2  33.52 
 
 
574 aa  171  4e-41  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00257822  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1415  peptidoglycan glycosyltransferase  33.41 
 
 
609 aa  169  8e-41  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.55122  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2545  peptidoglycan glycosyltransferase  33.58 
 
 
642 aa  169  8e-41  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0345  penicillin-binding protein 2  29.35 
 
 
557 aa  169  1e-40  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2090  peptidoglycan glycosyltransferase  32.81 
 
 
597 aa  168  2e-40  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.27584  normal  0.426365 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2079  penicillin-binding protein 2  32.08 
 
 
639 aa  167  2.9999999999999998e-40  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1455  peptidoglycan glycosyltransferase  30.35 
 
 
657 aa  167  2.9999999999999998e-40  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.991408  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2504  penicillin-binding protein 2  32.15 
 
 
669 aa  166  5.9999999999999996e-40  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0162762  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1545  peptidoglycan glycosyltransferase  33.33 
 
 
633 aa  167  5.9999999999999996e-40  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00213347  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2771  Peptidoglycan glycosyltransferase  31.89 
 
 
672 aa  166  8e-40  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.47482  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0595  peptidoglycan glycosyltransferase  32.44 
 
 
634 aa  165  1.0000000000000001e-39  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000785776  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0378  penicillin-binding protein 2  29.07 
 
 
586 aa  165  2.0000000000000002e-39  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2413  peptidoglycan glycosyltransferase  33.69 
 
 
632 aa  164  3e-39  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0462384  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4970  peptidoglycan glycosyltransferase  34.14 
 
 
631 aa  164  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.474352 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0113  peptidoglycan glycosyltransferase  32.28 
 
 
636 aa  164  5.0000000000000005e-39  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4807  penicillin-binding protein 2  33.81 
 
 
629 aa  163  6e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0974911 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0614  penicillin-binding protein 2  33.89 
 
 
629 aa  163  6e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2460  penicillin-binding protein 2  32.78 
 
 
645 aa  163  6e-39  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0054  peptidoglycan glycosyltransferase  32.05 
 
 
793 aa  163  7e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.171257  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4682  peptidoglycan glycosyltransferase  33.81 
 
 
629 aa  163  7e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4860  penicillin-binding protein 2  33.81 
 
 
629 aa  162  9e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.493297  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>