More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_4878 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014158  Tpau_3316  AMP-dependent synthetase and ligase  63.31 
 
 
541 aa  685    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34080  AMP-binding domain protein  71.19 
 
 
552 aa  796    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.448325  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4818  AMP-binding domain protein  67.29 
 
 
540 aa  723    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12527  AMP-binding domain protein  61.58 
 
 
547 aa  675    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0503764 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3209  AMP-binding domain protein  63.06 
 
 
546 aa  691    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.609491  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2768  AMP-dependent synthetase and ligase  62.01 
 
 
558 aa  694    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000354199 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4872  AMP-binding domain protein  67.85 
 
 
549 aa  744    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1362  AMP-dependent synthetase and ligase  63.48 
 
 
542 aa  671    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.00632075  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3009  AMP-binding domain protein  63.06 
 
 
546 aa  688    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0241  AMP-dependent synthetase and ligase  66.73 
 
 
545 aa  687    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.276778  normal  0.182333 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4437  AMP-binding domain protein  67.29 
 
 
540 aa  721    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2984  AMP-binding domain protein  62.87 
 
 
546 aa  672    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.136347  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0807  AMP-dependent synthetase and ligase  71.56 
 
 
551 aa  800    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.472076  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3103  AMP-dependent synthetase and ligase  67.94 
 
 
550 aa  740    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.8985  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3066  AMP-dependent synthetase and ligase  62.54 
 
 
558 aa  702    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.479156  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4878  AMP-dependent synthetase and ligase  100 
 
 
530 aa  1092    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0148671 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3937  AMP-binding domain protein  68.77 
 
 
539 aa  748    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.104158  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4867  AMP-binding domain protein  65.79 
 
 
538 aa  710    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.223701  normal  0.186874 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2083  AMP-dependent synthetase and ligase  78.57 
 
 
544 aa  880    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4524  AMP-binding domain protein  67.29 
 
 
540 aa  721    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1563  AMP-binding domain protein  66.86 
 
 
538 aa  717    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.716975 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4008  AMP-dependent synthetase and ligase  67.48 
 
 
1043 aa  738    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3108  AMP-binding domain protein  62.5 
 
 
546 aa  688    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.580008  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4723  AMP-binding domain protein  56.1 
 
 
560 aa  634  1e-180  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.712671  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2014  AMP-dependent synthetase and ligase  55.78 
 
 
542 aa  632  1e-180  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.534696  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0344  AMP-binding domain protein  58.48 
 
 
562 aa  618  1e-176  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.100012  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31470  AMP-binding domain protein  56.71 
 
 
564 aa  617  1e-175  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0028776  hitchhiker  0.0000000416298 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3458  acyl-CoA synthetase  57.07 
 
 
562 aa  612  9.999999999999999e-175  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.220235 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4161  AMP-binding domain protein  55.24 
 
 
577 aa  613  9.999999999999999e-175  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2311  acyl-CoA synthetase  56.83 
 
 
557 aa  613  9.999999999999999e-175  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.462118  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0752  AMP-binding domain protein  56.12 
 
 
576 aa  610  1e-173  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17630  acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II  54.85 
 
 
592 aa  608  1e-173  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.100128  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2319  AMP-binding domain protein  56.27 
 
 
565 aa  607  9.999999999999999e-173  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.770298  normal  0.0254377 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2479  acyl-CoA synthetase  56.7 
 
 
557 aa  605  9.999999999999999e-173  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.282098  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0770  AMP-dependent synthetase and ligase  52.79 
 
 
566 aa  607  9.999999999999999e-173  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.404945  normal  0.888891 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1086  AMP-dependent synthetase and ligase  54.76 
 
 
566 aa  605  9.999999999999999e-173  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2679  AMP-binding domain protein  56.94 
 
 
561 aa  604  1.0000000000000001e-171  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.180976  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1627  AMP-dependent synthetase and ligase  52.88 
 
 
571 aa  602  1.0000000000000001e-171  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2941  acyl-CoA synthetase  55.05 
 
 
557 aa  598  1e-170  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.581775  normal  0.0544542 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3833  AMP-binding domain protein  54.56 
 
 
601 aa  600  1e-170  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0288  AMP-binding domain protein  55.68 
 
 
564 aa  600  1e-170  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0229323  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1032  AMP-dependent synthetase and ligase  52.24 
 
 
566 aa  596  1e-169  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0252  AMP-binding domain protein  54.33 
 
 
564 aa  591  1e-168  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3045  AMP-binding domain protein  53.91 
 
 
578 aa  592  1e-168  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4355  AMP-binding domain protein  54.99 
 
 
577 aa  593  1e-168  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0470  AMP-binding domain protein  54.11 
 
 
579 aa  592  1e-168  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.500012  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3764  AMP-binding domain protein  53.91 
 
 
578 aa  592  1e-168  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0462  AMP-binding domain protein  54.5 
 
 
564 aa  590  1e-167  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0580  AMP-binding domain protein  54.69 
 
 
576 aa  590  1e-167  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.566618  normal  0.942666 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5975  AMP-binding domain protein  54.76 
 
 
572 aa  586  1e-166  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1693  AMP-binding domain protein  54.48 
 
 
543 aa  581  1.0000000000000001e-165  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.301435  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2068  AMP-binding domain protein  52.46 
 
 
596 aa  582  1.0000000000000001e-165  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3966  AMP-binding domain protein  53.78 
 
 
576 aa  580  1e-164  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1813  AMP-binding domain protein  54.38 
 
 
560 aa  581  1e-164  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.659175  normal  0.258259 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2959  AMP-binding domain protein  53.78 
 
 
576 aa  580  1e-164  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0176  AMP-binding domain protein  53.78 
 
 
576 aa  580  1e-164  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.970705  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4040  AMP-binding domain protein  53.78 
 
 
576 aa  580  1e-164  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3018  AMP-binding domain protein  53.78 
 
 
576 aa  580  1e-164  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3353  AMP-binding domain protein  53.78 
 
 
576 aa  580  1e-164  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1584  AMP-binding domain protein  53.78 
 
 
570 aa  579  1e-164  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3655  AMP-binding domain protein  53.16 
 
 
565 aa  576  1.0000000000000001e-163  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0315072 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0108  AMP-binding domain protein  53.06 
 
 
575 aa  577  1.0000000000000001e-163  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3306  AMP-binding domain protein  53.37 
 
 
576 aa  577  1.0000000000000001e-163  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.63972  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2693  AMP-dependent synthetase and ligase  52.34 
 
 
562 aa  577  1.0000000000000001e-163  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4063  AMP-binding domain protein  53.16 
 
 
560 aa  574  1.0000000000000001e-162  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.365849  normal  0.0336017 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2361  AMP-dependent synthetase and ligase  55.6 
 
 
550 aa  572  1.0000000000000001e-162  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.727031  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1778  AMP-binding domain protein  53.73 
 
 
560 aa  573  1.0000000000000001e-162  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0198659 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0308  AMP-binding domain protein  51.82 
 
 
584 aa  573  1.0000000000000001e-162  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0339  AMP-binding domain protein  51.61 
 
 
602 aa  574  1.0000000000000001e-162  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3661  AMP-binding domain protein  53.45 
 
 
560 aa  573  1.0000000000000001e-162  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000288335 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0099  AMP-binding domain protein  52.16 
 
 
575 aa  569  1e-161  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0108  AMP-binding domain protein  52.16 
 
 
575 aa  568  1e-161  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.480818  normal  0.901201 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0124  AMP-binding domain protein  51.8 
 
 
575 aa  567  1e-160  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3290  AMP-binding domain protein  51.42 
 
 
575 aa  568  1e-160  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3025  AMP-binding domain protein  51.69 
 
 
576 aa  567  1e-160  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2947  AMP-binding domain protein  51.62 
 
 
575 aa  565  1e-160  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.768033  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0108  AMP-binding domain protein  51.62 
 
 
575 aa  565  1e-160  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.969616  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4372  AMP-dependent synthetase and ligase  53.53 
 
 
539 aa  563  1.0000000000000001e-159  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1467  AMP-binding domain protein  51.25 
 
 
578 aa  562  1.0000000000000001e-159  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0042  AMP-binding domain protein  52.05 
 
 
576 aa  563  1.0000000000000001e-159  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5134  AMP-binding domain protein  53.76 
 
 
518 aa  556  1e-157  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0657606  normal  0.735688 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0610  AMP-binding domain protein  50.9 
 
 
570 aa  557  1e-157  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.920315  normal  0.508617 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1448  AMP-dependent synthetase and ligase  54.7 
 
 
596 aa  558  1e-157  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3892  AMP-binding domain protein  51.16 
 
 
576 aa  558  1e-157  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.239396  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0154  AMP-dependent synthetase and ligase  49.73 
 
 
566 aa  555  1e-157  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0404  hypothetical protein  47.06 
 
 
605 aa  556  1e-157  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.737872  normal  0.0168695 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0318  AMP-binding domain protein  51.44 
 
 
571 aa  554  1e-156  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.922079  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2440  AMP-binding domain protein  51.65 
 
 
544 aa  553  1e-156  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1650  AMP-binding domain protein  49.82 
 
 
549 aa  552  1e-156  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1103  AMP-binding domain protein  49.72 
 
 
552 aa  550  1e-155  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3403  acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II  50.72 
 
 
579 aa  549  1e-155  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0333  AMP-binding domain protein  51.26 
 
 
571 aa  550  1e-155  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0354  AMP-dependent synthetase and ligase  50.9 
 
 
576 aa  549  1e-155  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.725771 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1442  AMP-binding domain protein  48.7 
 
 
550 aa  545  1e-154  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.684137  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0442  AMP-binding domain protein  52.29 
 
 
571 aa  544  1e-153  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.89643  normal  0.841381 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1573  AMP-binding domain protein  49.17 
 
 
552 aa  545  1e-153  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.116566  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2563  AMP-binding domain protein  48.89 
 
 
549 aa  545  1e-153  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.45341e-16 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2593  AMP-binding domain protein  50.09 
 
 
574 aa  538  9.999999999999999e-153  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01449  AMP-binding domain protein  48.15 
 
 
579 aa  538  9.999999999999999e-153  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.300352  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0582  AMP-binding domain protein  48.46 
 
 
587 aa  541  9.999999999999999e-153  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.44238  normal  0.647319 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>