262 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_4064 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_4064  NUDIX hydrolase  100 
 
 
206 aa  407  1e-113  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.305578  normal  0.120697 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2649  NUDIX hydrolase  53.65 
 
 
209 aa  162  4.0000000000000004e-39  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0213367  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2054  NUDIX hydrolase  42.06 
 
 
226 aa  127  8.000000000000001e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.762923  normal  0.0850915 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1713  NUDIX hydrolase  46.86 
 
 
203 aa  122  4e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.108614  normal  0.043111 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1198  NUDIX hydrolase  42.08 
 
 
201 aa  121  6e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.639623  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1556  NUDIX hydrolase  42.23 
 
 
206 aa  120  9.999999999999999e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5787  NUDIX hydrolase  40.87 
 
 
238 aa  117  9e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1043  NUDIX hydrolase  49.37 
 
 
238 aa  115  3e-25  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5262  NUDIX hydrolase  39.74 
 
 
240 aa  112  3e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5351  NUDIX hydrolase  39.74 
 
 
239 aa  112  4.0000000000000004e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5641  NUDIX hydrolase  39.74 
 
 
239 aa  112  4.0000000000000004e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0933  hypothetical protein  39.71 
 
 
209 aa  107  1e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.825014 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5012  NUDIX hydrolase  37.88 
 
 
208 aa  95.9  4e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.615251  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4339  NUDIX hydrolase  37.14 
 
 
208 aa  85.1  7e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.975502  normal  0.0924805 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2220  MutT/nudix family protein  39.86 
 
 
195 aa  71.6  0.000000000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4234  NUDIX hydrolase  34.8 
 
 
208 aa  71.6  0.000000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0154099  normal  0.59978 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2126  NUDIX hydrolase  40.54 
 
 
195 aa  71.6  0.000000000009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000453697  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2304  NUDIX hydrolase  40.54 
 
 
195 aa  71.2  0.000000000009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000460151  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1108  hypothetical protein  38.18 
 
 
227 aa  70.9  0.00000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2202  NUDIX hydrolase  39.86 
 
 
195 aa  69.3  0.00000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000103843  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2661  NUDIX hydrolase  38.71 
 
 
207 aa  68.9  0.00000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.975355  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0521  NUDIX hydrolase  33.15 
 
 
245 aa  68.9  0.00000000006  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.661222  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1022  NUDIX hydrolase  47.47 
 
 
204 aa  68.2  0.00000000009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8861  NUDIX hydrolase  33.52 
 
 
239 aa  67.8  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3615  MutT/nudix family protein  38.33 
 
 
191 aa  67.4  0.0000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0685  NUDIX hydrolase  39.72 
 
 
235 aa  66.2  0.0000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.997472 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3351  NUDIX hydrolase  42.15 
 
 
244 aa  66.6  0.0000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.162982 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1465  NUDIX hydrolase  45.45 
 
 
237 aa  65.9  0.0000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.720683 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0937  hypothetical protein  37.32 
 
 
202 aa  65.5  0.0000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0131467 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2225  NUDIX hydrolase  34.25 
 
 
189 aa  65.5  0.0000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000124127  hitchhiker  0.00567873 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3165  NUDIX hydrolase  37.5 
 
 
225 aa  65.1  0.0000000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.036982 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2699  NUDIX hydrolase  41.32 
 
 
222 aa  64.3  0.000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.663503  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4241  NUDIX hydrolase  48.35 
 
 
219 aa  64.3  0.000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0367  NUDIX hydrolase  38.27 
 
 
243 aa  63.9  0.000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0775578  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3024  NUDIX hydrolase  35.21 
 
 
198 aa  63.2  0.000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.43822  normal  0.894324 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4112  NUDIX hydrolase  45.22 
 
 
219 aa  62.8  0.000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0690871  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0080  NUDIX hydrolase  33.93 
 
 
195 aa  63.2  0.000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2360  NUDIX hydrolase  32.88 
 
 
189 aa  63.2  0.000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000190371  hitchhiker  0.00362317 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2036  NUDIX hydrolase  36.96 
 
 
197 aa  62.8  0.000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000390793  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003157  hypothetical nudix hydrolase YeaB  36.89 
 
 
199 aa  62.8  0.000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01910  hypothetical protein  37.7 
 
 
199 aa  62.4  0.000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0727  NUDIX hydrolase  38.21 
 
 
210 aa  61.6  0.000000007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1956  NUDIX hydrolase  36.8 
 
 
200 aa  61.2  0.000000009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00026609  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1462  NUDIX hydrolase  37.59 
 
 
226 aa  60.1  0.00000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.205145  normal  0.0719668 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4757  NUDIX hydrolase  32.84 
 
 
231 aa  60.1  0.00000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0108621  hitchhiker  0.0018252 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36090  ADP-ribose pyrophosphatase  42.45 
 
 
229 aa  60.5  0.00000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.453332  normal  0.430111 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2273  NUDIX hydrolase  37.58 
 
 
210 aa  60.1  0.00000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.456189 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0721  NUDIX hydrolase  40.15 
 
 
234 aa  60.5  0.00000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0953  NUDIX hydrolase  33.71 
 
 
228 aa  60.1  0.00000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0994513  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4317  NUDIX hydrolase  34.12 
 
 
230 aa  60.1  0.00000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.145875 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0949  NUDIX hydrolase  34.27 
 
 
228 aa  60.1  0.00000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0694  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 
214 aa  60.1  0.00000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.496821  normal  0.528067 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1739  NUDIX hydrolase  37.59 
 
 
227 aa  59.7  0.00000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.881669  normal  0.05892 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1289  NUDIX hydrolase  30.53 
 
 
196 aa  59.7  0.00000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0864  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  30.08 
 
 
216 aa  60.1  0.00000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000108978  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0696  nucleotide phosphate derivative pyrophosphohydrolases, MutT/nudix family protein  36.67 
 
 
197 aa  59.7  0.00000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4187  NUDIX hydrolase  34.5 
 
 
228 aa  59.3  0.00000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.351171  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0879  NUDIX hydrolase  33.57 
 
 
234 aa  59.3  0.00000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.29016  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0920  MutT/nudix family protein  35.83 
 
 
204 aa  59.3  0.00000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000137822  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0808  NUDIX hydrolase  33.57 
 
 
234 aa  59.3  0.00000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.655823  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1032  NUDIX hydrolase  34.5 
 
 
228 aa  58.9  0.00000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0594  NUDIX hydrolase  34.5 
 
 
228 aa  58.9  0.00000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0812937  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0882  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  30.95 
 
 
216 aa  58.9  0.00000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1073  NUDIX hydrolase  34.5 
 
 
228 aa  58.9  0.00000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.398605  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2536  NUDIX hydrolase  36.67 
 
 
226 aa  58.5  0.00000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.299915  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1686  MutT/nudix family protein  36.07 
 
 
202 aa  58.9  0.00000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.231925  normal  0.379553 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2230  NUDIX hydrolase  36 
 
 
228 aa  58.5  0.00000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.251821  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5341  NUDIX hydrolase  39.42 
 
 
242 aa  58.2  0.00000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1902  NUDIX hydrolase  38.4 
 
 
189 aa  58.2  0.00000008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0854349  hitchhiker  0.00409955 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1665  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  33.52 
 
 
347 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.571697  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1694  NUDIX hydrolase  45.56 
 
 
235 aa  57.8  0.0000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01947  NTP pyrophosphohydrolase, NUDIX family protein  33.57 
 
 
190 aa  57.8  0.0000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00222276  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2921  NUDIX hydrolase  39.52 
 
 
193 aa  57.4  0.0000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0185259  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0397  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  35.48 
 
 
199 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.206725  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0778  NUDIX hydrolase  34.81 
 
 
200 aa  57.4  0.0000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2167  NUDIX hydrolase  38.66 
 
 
191 aa  57  0.0000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2236  NUDIX hydrolase  45.53 
 
 
216 aa  56.6  0.0000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2540  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  35.48 
 
 
333 aa  57  0.0000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.209584  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0913  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  35.48 
 
 
217 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0234  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  35.48 
 
 
217 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2963  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  35.48 
 
 
483 aa  56.6  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.980156  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2968  NUDIX hydrolase  34.38 
 
 
216 aa  56.2  0.0000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.713083  normal  0.0271269 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0599  NUDIX hydrolase  37.5 
 
 
223 aa  56.2  0.0000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0172735  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0319  NUDIX hydrolase  39.62 
 
 
243 aa  56.2  0.0000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0342181  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2913  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  35.48 
 
 
427 aa  56.2  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.916312  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1318  protein of unknown function DUF1289  36.81 
 
 
267 aa  55.8  0.0000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.196513  normal  0.297563 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2853  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  35.48 
 
 
427 aa  55.8  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1477  NUDIX hydrolase  36.97 
 
 
239 aa  56.2  0.0000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.867637  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2790  NUDIX hydrolase  38.84 
 
 
216 aa  55.5  0.0000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.235631 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1459  NUDIX hydrolase  36.09 
 
 
227 aa  55.8  0.0000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.74222  normal  0.52562 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1585  NUDIX hydrolase  37.27 
 
 
199 aa  55.5  0.0000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.254951  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3054  NUDIX hydrolase  38.71 
 
 
216 aa  55.5  0.0000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0331862 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0239  hypothetical protein  31.68 
 
 
197 aa  55.5  0.0000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1194  NUDIX hydrolase  31.74 
 
 
221 aa  55.1  0.0000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.860148  normal  0.422003 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1022  NUDIX hydrolase  35 
 
 
208 aa  55.1  0.0000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0568169  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2622  NUDIX hydrolase  31.55 
 
 
198 aa  55.1  0.0000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.831356  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2009  NUDIX hydrolase  35.76 
 
 
197 aa  54.3  0.000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.958398  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0119  hypothetical protein  41.41 
 
 
221 aa  54.3  0.000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2973  NUDIX hydrolase  37.04 
 
 
242 aa  53.5  0.000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.233103  normal  0.0737984 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1010  hypothetical protein  33.15 
 
 
238 aa  53.5  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.410062  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>