More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_4020 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_4020  SNARE associated Golgi protein-related protein  100 
 
 		 211 aa  414  9.999999999999999e-116  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0932432  normal  0.0663531 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1709  SNARE associated Golgi protein-related protein  75.65 
 
 		 217 aa  284  8e-76  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12655  transmembrane protein dedA  60.77 
 
 		 218 aa  253  2.0000000000000002e-66  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000783251  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0010  hypothetical protein  46.1 
 
 		 208 aa  114  1.0000000000000001e-24  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.163704  normal  0.0549348 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0626  SNARE associated Golgi protein  42.56 
 
 		 215 aa  112  4.0000000000000004e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.228359  decreased coverage  0.00442875 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1944  SNARE associated Golgi protein  42.57 
 
 		 199 aa  111  7.000000000000001e-24  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0628  hypothetical protein  40.22 
 
 		 199 aa  110  2.0000000000000002e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.341746 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0186  SNARE associated Golgi protein  42.66 
 
 		 209 aa  107  9.000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1394  SNARE associated Golgi protein  40.57 
 
 		 256 aa  107  2e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.527728  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0232  phosphoesterase, PA-phosphatase related  42.86 
 
 		 457 aa  104  9e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3914  SNARE associated Golgi protein  41.4 
 
 		 213 aa  103  2e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.148472 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2070  SNARE associated Golgi protein-related protein  42.95 
 
 		 215 aa  102  3e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000366664  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4966  SNARE associated Golgi protein  37.14 
 
 		 214 aa  102  4e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.248557 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4503  SNARE associated Golgi protein  37.14 
 
 		 214 aa  102  4e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.711425  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4992  SNARE associated Golgi protein  40.19 
 
 		 200 aa  101  1e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1291  SNARE associated Golgi protein  41.26 
 
 		 212 aa  99.8  2e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.677756  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1260  SNARE associated Golgi protein  41.26 
 
 		 212 aa  100  2e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5019  SNARE associated Golgi protein  38.1 
 
 		 214 aa  99.8  3e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.432695  normal  0.972374 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4889  SNARE associated Golgi protein-like protein  41.26 
 
 		 209 aa  98.6  5e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2482  dedA protein  38.93 
 
 		 198 aa  98.6  6e-20  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.323289  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4907  SNARE associated Golgi protein  41.26 
 
 		 227 aa  98.2  8e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.703178 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3975  hypothetical protein  47.06 
 
 		 245 aa  97.8  1e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1186  membrane-associated protein-like protein  40.11 
 
 		 355 aa  97.8  1e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3663  SNARE associated Golgi protein-like protein  36.9 
 
 		 209 aa  97.1  2e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0127  hypothetical protein  39.01 
 
 		 237 aa  93.6  2e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0132  SNARE associated Golgi protein  39.01 
 
 		 237 aa  93.6  2e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.365407  decreased coverage  0.0000235996 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2069  hypothetical protein  38.46 
 
 		 209 aa  93.2  2e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.873256  normal  0.0385471 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0017  SNARE associated Golgi protein  34.18 
 
 		 363 aa  92.8  3e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.447324  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0543  SNARE associated Golgi protein  38.64 
 
 		 172 aa  92.8  4e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.582875  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2256  SNARE associated Golgi protein  39.13 
 
 		 224 aa  91.3  8e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0432  dedA family protein  38.93 
 
 		 172 aa  90.5  1e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0439  dedA family protein  38.64 
 
 		 197 aa  90.9  1e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6926  SNARE associated Golgi protein  30.81 
 
 		 249 aa  91.3  1e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10369  transmembrane protein  32.24 
 
 		 227 aa  90.9  1e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.702136 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1810  SNARE associated Golgi protein  37.23 
 
 		 206 aa  90.1  2e-17  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0031  hypothetical protein  33.68 
 
 		 268 aa  89.4  3e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0915  hypothetical protein  33.66 
 
 		 206 aa  89.7  3e-17  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  hitchhiker  0.00745427  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5318  hypothetical protein  34.91 
 
 		 206 aa  89  5e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.745456  normal  0.776913 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1497  SNARE associated Golgi protein-like protein  35.46 
 
 		 201 aa  87.4  1e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.330026  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4065  SNARE associated Golgi protein-like protein  36.65 
 
 		 240 aa  87.8  1e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0812  DedA family protein  37.23 
 
 		 204 aa  87.8  1e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.0000122435  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4180  SNARE associated Golgi protein  38.24 
 
 		 246 aa  86.7  2e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.531841  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1148  hypothetical protein  30.99 
 
 		 211 aa  86.7  2e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1030  SNARE associated Golgi protein-like protein  38.51 
 
 		 203 aa  86.7  2e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11720  hypothetical protein  33.92 
 
 		 221 aa  86.3  3e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2056  hypothetical protein  36.81 
 
 		 203 aa  85.9  4e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000098362  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0704  SNARE associated Golgi protein  35.77 
 
 		 202 aa  85.1  6e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.693025  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1082  SNARE associated Golgi protein  35.11 
 
 		 205 aa  84.3  0.000000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.822354 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1164  SNARE associated Golgi protein  36.54 
 
 		 203 aa  84.3  0.000000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0526  SNARE associated Golgi protein  32.91 
 
 		 204 aa  84  0.000000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.115863  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2971  SNARE associated Golgi protein-related protein  38.97 
 
 		 286 aa  82.8  0.000000000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1818  SNARE associated Golgi protein  38.65 
 
 		 209 aa  82.8  0.000000000000004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.685944  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0005  integral membrane protein; DedA family protein  35.56 
 
 		 218 aa  82.4  0.000000000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.695694  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1076  hypothetical protein  32.75 
 
 		 221 aa  82  0.000000000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.313022  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1401  hypothetical protein  33.71 
 
 		 200 aa  82  0.000000000000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8388  SNARE associated Golgi protein  32.42 
 
 		 244 aa  80.9  0.00000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.880445 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5157  SNARE associated Golgi protein  35.46 
 
 		 235 aa  80.5  0.00000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1470  secretion system protein Y  33.56 
 
 		 678 aa  80.5  0.00000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1513  secretion system protein Y  33.56 
 
 		 678 aa  80.5  0.00000000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1943  DedA protein  31.03 
 
 		 220 aa  80.5  0.00000000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.777005  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0665  SNARE associated Golgi protein  27.23 
 
 		 212 aa  80.1  0.00000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.267065  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2255  SNARE associated Golgi protein  42.22 
 
 		 213 aa  80.1  0.00000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2342  SNARE associated Golgi protein-like protein  34.67 
 
 		 228 aa  79.3  0.00000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.43138  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0859  SNARE associated Golgi protein  32.37 
 
 		 206 aa  79.3  0.00000000000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4066  SNARE associated Golgi protein-like protein  35.71 
 
 		 248 aa  79.3  0.00000000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2527  membrane protein, DedA family  32.26 
 
 		 215 aa  79  0.00000000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2156  SNARE associated Golgi protein  32.26 
 
 		 215 aa  79  0.00000000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000142104 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0585  SNARE associated Golgi protein  32.75 
 
 		 215 aa  79  0.00000000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.654254 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_27115  predicted protein  34.81 
 
 		 252 aa  78.6  0.00000000000006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.000197052  normal  0.0145567 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1764  SNARE associated Golgi protein  35.37 
 
 		 223 aa  78.6  0.00000000000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000231934 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1317  SNARE associated Golgi protein  33.78 
 
 		 223 aa  78.2  0.00000000000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0112006  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3851  phosphoesterase PA-phosphatase related  33.8 
 
 		 671 aa  78.2  0.00000000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.294206  normal  0.711383 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0667  DedA family protein  33.15 
 
 		 227 aa  77.8  0.0000000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.385755  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1959  hypothetical protein  31.58 
 
 		 211 aa  77.4  0.0000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.822135 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1169  SNARE associated Golgi protein  31.34 
 
 		 217 aa  77.8  0.0000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.922899  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1081  SNARE associated Golgi protein  37.57 
 
 		 217 aa  77.4  0.0000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.831593 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4379  hypothetical protein  35.71 
 
 		 234 aa  77.4  0.0000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.76296  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1554  hypothetical protein  41.29 
 
 		 246 aa  77.8  0.0000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0566  DedA family protein  31.39 
 
 		 206 aa  76.6  0.0000000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.180728 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0592  DedA family protein  30.06 
 
 		 219 aa  77  0.0000000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18740  uncharacterized membrane-associated protein  35.5 
 
 		 248 aa  77  0.0000000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.829246  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2610  hypothetical protein  35.33 
 
 		 222 aa  77  0.0000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0592  SNARE associated Golgi protein  32.16 
 
 		 215 aa  77.4  0.0000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1167  DedA protein (DSG-1 protein)  31.22 
 
 		 219 aa  77  0.0000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.482076  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2799  hypothetical protein  31.25 
 
 		 220 aa  76.3  0.0000000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.606088  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1452  hypothetical protein  34.33 
 
 		 237 aa  76.6  0.0000000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  decreased coverage  0.00552947  normal  0.0731246 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2597  hypothetical protein  29.67 
 
 		 219 aa  76.3  0.0000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.651507 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2609  hypothetical protein  29.67 
 
 		 219 aa  76.6  0.0000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.36856  normal  0.051576 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30240  uncharacterized membrane-associated protein  32.28 
 
 		 228 aa  76.3  0.0000000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.397546 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1595  phosphoesterase, PA-phosphatase related  33.73 
 
 		 458 aa  76.6  0.0000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2555  hypothetical protein  29.67 
 
 		 219 aa  75.9  0.0000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2872  dedA family protein  29.71 
 
 		 201 aa  75.9  0.0000000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0269075  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2603  DedA family protein  30.86 
 
 		 201 aa  75.9  0.0000000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000431988  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35260  uncharacterized membrane-associated protein  31.08 
 
 		 277 aa  75.9  0.0000000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0719  hypothetical protein  32.09 
 
 		 208 aa  75.9  0.0000000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000000531966  normal  0.139707 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1836  SNARE associated Golgi protein  29.76 
 
 		 208 aa  75.9  0.0000000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2509  hypothetical protein  29.67 
 
 		 219 aa  75.9  0.0000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2718  hypothetical protein  29.67 
 
 		 219 aa  75.9  0.0000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.261998  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2987  hypothetical protein  34.88 
 
 		 245 aa  75.5  0.0000000000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3305  DedA protein (DSG-1 protein)  31.98 
 
 		 215 aa  75.5  0.0000000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.25714  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>