54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_0137 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011663  Sbal223_0145  peptidase M14 carboxypeptidase A  73.76 
 
 
683 aa  927    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0137  peptidase M14 carboxypeptidase A  100 
 
 
612 aa  1258    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.000376748  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4365  carboxypeptidase  76.12 
 
 
615 aa  943    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0142  peptidase M14 carboxypeptidase A  73.41 
 
 
683 aa  926    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0146  peptidase M14 carboxypeptidase A  73.07 
 
 
683 aa  922    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.358268 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0143  peptidase M14, carboxypeptidase A  71.29 
 
 
663 aa  911    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4754  peptidase M14 carboxypeptidase A  73.68 
 
 
627 aa  963    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0297814  unclonable  0.000000035744 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0033  peptidase M14, carboxypeptidase A  72.5 
 
 
613 aa  924    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4213  peptidase M14 carboxypeptidase A  73.76 
 
 
684 aa  929    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0161  carboxypeptidase  68.43 
 
 
610 aa  865    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0140  peptidase M14, carboxypeptidase A  73.33 
 
 
659 aa  925    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0100  peptidase M14, carboxypeptidase A  69.12 
 
 
619 aa  885    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.719782  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0152  carboxypeptidase  71.88 
 
 
627 aa  921    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0145  peptidase M14, carboxypeptidase A  73.88 
 
 
658 aa  920    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.666966 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0140  peptidase M14, carboxypeptidase A  73.36 
 
 
665 aa  915    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0192  peptidase M14 carboxypeptidase A  51.48 
 
 
631 aa  600  1e-170  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4531  peptidase M14 carboxypeptidase A  47.91 
 
 
609 aa  561  1e-158  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.417367 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24600  putative carboxypeptidase  40.27 
 
 
634 aa  417  9.999999999999999e-116  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2083  peptidase M14, carboxypeptidase A  39.86 
 
 
634 aa  415  1e-114  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00674  zinc carboxypeptidase family  37.19 
 
 
592 aa  339  9e-92  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.76775  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0129  peptidase M14 carboxypeptidase A  34.65 
 
 
581 aa  324  2e-87  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0111  peptidase M14, carboxypeptidase A  33.93 
 
 
581 aa  320  3.9999999999999996e-86  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0118  peptidase M14 carboxypeptidase A  34.08 
 
 
581 aa  320  7e-86  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0115  peptidase M14 carboxypeptidase A  33.86 
 
 
580 aa  296  6e-79  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.231246  normal  0.11459 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5095  peptidase, family M14  29.98 
 
 
576 aa  273  8.000000000000001e-72  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000000522149  normal  0.355242 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6842  peptidase M14 carboxypeptidase A  31.27 
 
 
577 aa  266  1e-69  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.922108  normal  0.679276 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2367  peptidase M14, carboxypeptidase A  30.22 
 
 
580 aa  263  6e-69  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.639683  normal  0.513126 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07966  hypothetical protein  28.88 
 
 
570 aa  260  6e-68  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.684592  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2612  hypothetical protein  27.75 
 
 
575 aa  237  5.0000000000000005e-61  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1907  peptidase M14 carboxypeptidase A  28.74 
 
 
526 aa  186  7e-46  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.327563  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2049  peptidase, family M14  24.7 
 
 
484 aa  155  2.9999999999999998e-36  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.270897  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2152  peptidase M14, carboxypeptidase A  23.45 
 
 
615 aa  100  6e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1797  peptidase M14, carboxypeptidase A  22.44 
 
 
618 aa  97.4  8e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.158 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07121  conserved hypothetical protein  21.86 
 
 
541 aa  94.7  4e-18  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.476588 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2389  peptidase M14, carboxypeptidase A  21.89 
 
 
599 aa  92  2e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.979451  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1198  peptidase M14 carboxypeptidase A  20.31 
 
 
606 aa  88.6  3e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2610  peptidase M14, carboxypeptidase A  20.96 
 
 
606 aa  87.8  6e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.163339 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4756  peptidase M14, carboxypeptidase A  20.86 
 
 
506 aa  71.6  0.00000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2901  peptidase M14, carboxypeptidase A  20.68 
 
 
585 aa  70.1  0.0000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.55349  normal  0.0629312 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2078  hypothetical protein  25.85 
 
 
840 aa  65.5  0.000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.548714 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3379  hypothetical protein  23.74 
 
 
906 aa  55.1  0.000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.520045  normal  0.777695 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0666  peptidase M14 carboxypeptidase A  24.4 
 
 
361 aa  53.1  0.00001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4236  peptidase M14 carboxypeptidase A  28.24 
 
 
497 aa  51.6  0.00004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0580382  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0915  hypothetical protein  24.04 
 
 
923 aa  50.8  0.00007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4249  peptidase M14 carboxypeptidase A  31.31 
 
 
557 aa  49.7  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1110  peptidase M14 carboxypeptidase A  31.36 
 
 
862 aa  48.1  0.0005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.284775  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1015  peptidase M14, carboxypeptidase A  24.88 
 
 
380 aa  46.2  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.967061  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0219  hypothetical protein  21.84 
 
 
858 aa  46.2  0.002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0979  peptidase M14, carboxypeptidase A  26.47 
 
 
380 aa  45.4  0.003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.268801  normal  0.0514044 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01020  Conserved secreted Zn-dependent enzyme from deacylase/carboxypeptidase superfamily protein  23.12 
 
 
823 aa  45.1  0.003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.150102  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2795  peptidase M14 carboxypeptidase A  26.98 
 
 
829 aa  45.1  0.004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0357907  normal  0.190508 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3595  peptidase M14 carboxypeptidase A  26.89 
 
 
553 aa  44.7  0.006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0167852 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03995  Peptidase M14, carboxypeptidase A  22.02 
 
 
885 aa  44.3  0.007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1937  peptidase M14, carboxypeptidase A  27.85 
 
 
375 aa  44.3  0.007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.568911  normal  0.0124059 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>