283 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_0066 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009901  Spea_0066  flagellar hook-associated protein FlgK  100 
 
 
457 aa  919  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0060  flagellar hook-associated protein FlgK  78.99 
 
 
457 aa  726  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3459  flagellar hook-associated protein FlgK  63.68 
 
 
457 aa  565  1e-160  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3962  flagellar hook-associated protein FlgK  63.46 
 
 
457 aa  566  1e-160  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3642  flagellar hook-associated protein  57.99 
 
 
457 aa  515  1e-145  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04918  flagellar hook-associated protein  39.17 
 
 
457 aa  341  2e-92  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000731  flagellar hook-associated protein FlgK  38.95 
 
 
457 aa  327  3e-88  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0272  lateral flagellar hook associated protein 1  38.43 
 
 
458 aa  280  5e-74  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.508781 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3362  flagellar hook-associated protein FlgK  38.26 
 
 
458 aa  278  1e-73  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3569  flagellar hook-associated protein FlgK  36.7 
 
 
454 aa  275  2e-72  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.303644  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0246  flagellar hook-associated protein FlgK  36.27 
 
 
452 aa  268  1e-70  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0193  flagellar hook-associated protein FlgK  35.84 
 
 
452 aa  262  9e-69  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.363354  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0648  flagellar hook-associated protein FlgK  35.29 
 
 
453 aa  262  1e-68  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0218  flagellar hook-associated protein FlgK  35.08 
 
 
453 aa  259  5e-68  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0215  flagellar hook-associated protein FlgK  35.81 
 
 
455 aa  233  4e-60  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.727542  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4680  flagellar hook-associated protein FlgK  31.44 
 
 
429 aa  214  3e-54  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  2.96928e-05 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0451  flagellar hook-associated protein FlgK  31.82 
 
 
480 aa  179  9e-44  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2841  flagellar hook-associated protein FlgK  35.76 
 
 
681 aa  177  3e-43  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.673988  normal  0.205437 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4381  flagellar hook-associated protein FlgK  35.74 
 
 
680 aa  167  3e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.920436 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3942  flagellar hook-associated protein FlgK  33.96 
 
 
680 aa  162  2e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3043  flagellar hook-associated protein FlgK  28.09 
 
 
477 aa  160  6e-38  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50360  flagellar hook-associated protein FlgK  33.54 
 
 
683 aa  159  9e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0589172  hitchhiker  0.000676236 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3471  flagellar hook-associated protein FlgK  33.23 
 
 
686 aa  156  9e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.230935  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4291  flagellar hook-associated protein FlgK  34.18 
 
 
682 aa  156  9e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.800386  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1149  flagellar hook-associated protein  26.9 
 
 
464 aa  153  8e-36  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3743  flagellar hook-associated protein FlgK  33.14 
 
 
631 aa  152  1e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1474  flagellar hook-associated protein FlgK  33.23 
 
 
676 aa  152  1e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0329611  normal  0.363224 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17140  flagellar hook-associated protein FlgK  27.2 
 
 
471 aa  150  5e-35  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3722  flagellar hook-associated protein FlgK  32.81 
 
 
682 aa  148  2e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0912504  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1944  flagellar hook-associated protein FlgK  31.38 
 
 
686 aa  146  7e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0163464  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0438  flagellar hook-associated protein  26.88 
 
 
477 aa  144  2e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2930  flagellar hook-associated protein  26.9 
 
 
458 aa  142  8e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.685458  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1330  flagellar hook-associated protein FlgK  32.7 
 
 
641 aa  141  2e-32  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.493477  normal  0.0693976 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1226  flagellar hook-associated protein FlgK  34.04 
 
 
637 aa  140  3e-32  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.548532  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1486  flagellar hook-associated protein  32.28 
 
 
665 aa  140  6e-32  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.986864  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2314  flagellar hook-associated protein FlgK  32.75 
 
 
554 aa  140  6e-32  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2007  flagellar hook-associated protein FlgK  32.75 
 
 
554 aa  140  6e-32  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2416  flagellar hook-associated protein FlgK  32.75 
 
 
554 aa  140  7e-32  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.524278  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1969  flagellar hook-associated protein  32.3 
 
 
539 aa  140  7e-32  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2588  flagellar hook-associated protein FlgK  31.96 
 
 
641 aa  139  7e-32  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24090  flagellar hook-associated protein  31.34 
 
 
541 aa  138  2e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.160366  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3239.3  flagellar hook-associated protein  32.59 
 
 
386 aa  138  3e-31  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4099  flagellar hook-associated protein FlgK  27.08 
 
 
478 aa  137  4e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0902  flagellar hook-associated protein FlgK  31.4 
 
 
695 aa  137  5e-31  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.125146  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2243  flagellar hook-associated protein FlgK  31.16 
 
 
547 aa  136  8e-31  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.39076  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2046  flagellar hook-associated protein FlgK  31.34 
 
 
547 aa  136  8e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.147605  normal  0.0499745 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1111  flagellar hook-associated protein FlgK  30.53 
 
 
688 aa  136  9e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0676298  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2564  flagellar hook-associated protein FlgK  31.34 
 
 
547 aa  136  1e-30  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.141155  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01086  hypothetical protein  31.34 
 
 
547 aa  135  1e-30  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0870613  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01078  flagellar hook-associated protein K  31.34 
 
 
547 aa  135  1e-30  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0929939  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2204  hypothetical protein  30.34 
 
 
920 aa  134  2e-30  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3078  flagellar hook-associated protein FlgK  31.16 
 
 
638 aa  134  2e-30  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1205  flagellar hook-associated protein FlgK  31.04 
 
 
547 aa  134  3e-30  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.223316  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2518  flagellar hook-associated protein FlgK  31.04 
 
 
547 aa  134  4e-30  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.38905  hitchhiker  0.00149416 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1461  flagellar hook-associated protein FlgK  31.04 
 
 
547 aa  134  4e-30  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.597207  hitchhiker  1.99333e-06 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1205  flagellar hook-associated protein FlgK  31.04 
 
 
547 aa  134  4e-30  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0984648  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2938  flagellar hook-associated protein FlgK  31.33 
 
 
641 aa  133  6e-30  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2961  flagellar hook-associated protein FlgK  31.23 
 
 
548 aa  133  7e-30  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1338  flagellar hook-associated protein FlgK  31.9 
 
 
641 aa  133  7e-30  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2953  flagellar hook-associated protein FlgK  31.33 
 
 
641 aa  133  8e-30  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1354  flagellar hook-associated protein FlgK  29.59 
 
 
638 aa  132  9e-30  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1606  flagellar hook-associated protein FlgK  32.02 
 
 
637 aa  132  1e-29  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0566107  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1268  flagellar hook-associated protein FlgK  32.08 
 
 
641 aa  132  1e-29  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5634  flagellar hook-associated protein FlgK  29.7 
 
 
631 aa  132  2e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2041  flagellar hook-associated protein FlgK  27.93 
 
 
463 aa  130  5e-29  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.848147 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2189  flagellar hook-associated protein FlgK  30.09 
 
 
553 aa  129  7e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  3.58653e-05 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2005  flagellar hook-associated protein FlgK  30.09 
 
 
553 aa  129  7e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00869488  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1251  flagellar hook-associated protein FlgK  30.09 
 
 
553 aa  129  7e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.577758  normal  0.294007 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1295  flagellar hook-associated protein FlgK  30.09 
 
 
553 aa  129  7e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.216547  hitchhiker  0.000168062 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1280  flagellar hook-associated protein FlgK  30.09 
 
 
553 aa  129  7e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.227106  hitchhiker  0.000609554 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4182  flagellar hook-associated protein FlgK  29.79 
 
 
652 aa  129  8e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1425  flagellar hook-associated protein FlgK  31.01 
 
 
641 aa  129  8e-29  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1675  flagellar hook-associated protein FlgK  26.15 
 
 
525 aa  129  9e-29  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3091  flagellar hook-associated protein FlgK  31.01 
 
 
641 aa  129  1e-28  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.348969  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1562  flagellar hook-associated protein FlgK  29.27 
 
 
640 aa  129  1e-28  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.776714  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0511  flagellar hook-associated protein FlgK  27.49 
 
 
685 aa  129  1e-28  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.288267  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1332  flagellar hook-associated protein  29.7 
 
 
619 aa  128  2e-28  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.143121  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1963  flagellar hook-associated protein FlgK  30.16 
 
 
645 aa  128  2e-28  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1767  flagellar hook-associated protein FlgK  33.23 
 
 
549 aa  127  4e-28  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1100  hypothetical protein  30.09 
 
 
622 aa  126  6e-28  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.782435  normal  0.13317 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1170  flagellar hook-associated protein FlgK  29.67 
 
 
642 aa  125  1e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.793737  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1349  flagellar hook-associated protein FlgK  31.46 
 
 
640 aa  125  2e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1233  flagellar hook-associated protein FlgK  29.82 
 
 
649 aa  123  6e-27  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2239  flagellar hook-associated protein FlgK  26.09 
 
 
464 aa  123  6e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2958  flagellar hook-associated protein FlgK  29.5 
 
 
657 aa  123  7e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.360284 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0746  flagellar hook-associated protein FlgK  27.05 
 
 
486 aa  122  1e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1506  flagellar hook-associated protein FlgK  30.72 
 
 
681 aa  121  2e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1596  flagellar hook-associated protein FlgK  28.97 
 
 
546 aa  121  2e-26  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2309  flagellar hook-associated protein  30.03 
 
 
638 aa  121  3e-26  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.133958 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3031  flagellar hook-associated protein FlgK  24.81 
 
 
541 aa  120  4e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2725  flagellar hook-associated protein FlgK  27.27 
 
 
640 aa  120  5e-26  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  5.57458e-06 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2697  flagellar hook-associated protein FlgK  26.28 
 
 
486 aa  120  5e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1233  flagellar hook-associated protein FlgK  29.24 
 
 
649 aa  119  8e-26  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0150  flagellar hook-associated protein FlgK  30.72 
 
 
657 aa  119  1e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.626735 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2244  flagellar hook-associated protein FlgK  24.27 
 
 
489 aa  118  2e-25  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4782  flagellar hook-associated protein FlgK  30.91 
 
 
645 aa  118  2e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.419966 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3705  flagellar hook-associated protein FlgK  30.91 
 
 
645 aa  118  2e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.117062 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1351  flagellar hook-associated protein FlgK  26.74 
 
 
440 aa  117  3e-25  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5536  putative flagellar hook-associated protein 1 (HAP1, FlgK protein)  30.25 
 
 
611 aa  117  3e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0425173 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1465  hypothetical protein  31.85 
 
 
630 aa  117  5e-25  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>