65 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_5369 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_5369  hypothetical protein  100 
 
 
162 aa  314  3e-85  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4763  protein of unknown function DUF1232  38.89 
 
 
122 aa  73.2  0.000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5029  protein of unknown function DUF1232  42.39 
 
 
158 aa  70.5  0.00000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2752  hypothetical protein  44.59 
 
 
185 aa  65.1  0.0000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.176431  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9304  hypothetical protein  35.44 
 
 
112 aa  60.8  0.000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.030186  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2125  hypothetical protein  27.78 
 
 
144 aa  55.8  0.0000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.836422  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3525  hypothetical protein  38.89 
 
 
134 aa  55.1  0.0000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.576058 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4460  protein of unknown function DUF1232  56.76 
 
 
138 aa  52  0.000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.441335 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0854  hypothetical protein  42.67 
 
 
118 aa  51.2  0.000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0567626 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0565  protein of unknown function DUF1232  50 
 
 
145 aa  49.3  0.00002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000140761  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4497  protein of unknown function DUF1232  29.63 
 
 
153 aa  48.5  0.00004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.923848 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1529  protein of unknown function DUF1232  38.36 
 
 
120 aa  48.5  0.00004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00770701 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0407  protein of unknown function DUF1232  32.05 
 
 
124 aa  48.1  0.00005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0363693  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1672  hypothetical protein  37.68 
 
 
151 aa  48.1  0.00005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  unclonable  0.000000000000129043  normal  0.0587565 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0707  hypothetical protein  35.71 
 
 
93 aa  47.8  0.00006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000547065  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0721  hypothetical protein  35.71 
 
 
93 aa  47.8  0.00006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000000923081  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2278  protein of unknown function DUF1232  29.73 
 
 
151 aa  47.8  0.00006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0974  hypothetical protein  35.71 
 
 
93 aa  47.8  0.00006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000836995  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0864  hypothetical protein  35.71 
 
 
93 aa  47.8  0.00006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4472  hypothetical protein  35.71 
 
 
93 aa  47.8  0.00006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.200573 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0905  hypothetical protein  35.71 
 
 
93 aa  47.8  0.00006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.6700199999999999e-43 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0720  hypothetical protein  35.71 
 
 
93 aa  47.8  0.00006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0244927  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0772  hypothetical protein  35.71 
 
 
93 aa  47.8  0.00006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000133286  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0809  hypothetical protein  35.71 
 
 
93 aa  47.8  0.00006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.909763  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1681  hypothetical protein  32.76 
 
 
131 aa  47.8  0.00006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.232652 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0901  hypothetical protein  35.71 
 
 
93 aa  47.8  0.00006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.144584  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1265  hypothetical protein  36.36 
 
 
146 aa  47.4  0.00008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  unclonable  0.000000000179686  normal  0.0239094 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4004  hypothetical protein  36.36 
 
 
145 aa  47.4  0.00008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000126182  normal  0.882124 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1715  hypothetical protein  36.36 
 
 
145 aa  47.4  0.00008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  unclonable  0.000000338135  normal  0.0231665 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1307  hypothetical protein  36.36 
 
 
146 aa  47.4  0.00009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000504633  normal  0.282911 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2736  hypothetical protein  28.05 
 
 
148 aa  47  0.0001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.909587  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2537  protein of unknown function DUF1232  30.14 
 
 
155 aa  46.6  0.0001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.36697  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0116  hypothetical protein  43.48 
 
 
145 aa  45.4  0.0003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0098  hypothetical protein  33.8 
 
 
124 aa  45.4  0.0003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0704  hypothetical protein  32.39 
 
 
124 aa  45.1  0.0004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0438  hypothetical protein  26.72 
 
 
152 aa  44.7  0.0005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1315  hypothetical protein  34.48 
 
 
147 aa  43.9  0.001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000812186  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3727  protein of unknown function DUF1232  43.14 
 
 
130 aa  43.5  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.883988  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20980  hypothetical protein  29.67 
 
 
157 aa  43.9  0.001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4050  protein of unknown function DUF1232  43.14 
 
 
130 aa  43.5  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18241  hypothetical protein  48.72 
 
 
123 aa  43.5  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0694351 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0490  hypothetical protein  47.54 
 
 
249 aa  42.7  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3889  hypothetical protein  28.57 
 
 
133 aa  42.7  0.002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.000000344158  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2808  hypothetical protein  32.69 
 
 
126 aa  42.7  0.002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.903772 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2523  hypothetical protein  33.85 
 
 
129 aa  43.1  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0989751  normal  0.209211 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21830  hypothetical protein  32.26 
 
 
143 aa  42.7  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  unclonable  1.21545e-17  normal  0.0258957 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2908  protein of unknown function DUF1232  32.84 
 
 
152 aa  43.1  0.002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1863  hypothetical protein  32.26 
 
 
143 aa  42.7  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  unclonable  0.0000473047  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0280  hypothetical protein  50 
 
 
117 aa  42.7  0.002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2517  protein of unknown function DUF1232  32.79 
 
 
150 aa  42.4  0.003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.545586  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3628  hypothetical protein  28.17 
 
 
142 aa  42.4  0.003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.89928  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2926  hypothetical protein  46 
 
 
91 aa  42  0.003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.828389  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0801  hypothetical protein  40.43 
 
 
123 aa  42.4  0.003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05801  hypothetical protein  46.15 
 
 
121 aa  42  0.004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4012  hypothetical protein  46.94 
 
 
91 aa  41.6  0.004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0234  hypothetical protein  47.06 
 
 
119 aa  41.6  0.004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.74255 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4815  hypothetical protein  31.82 
 
 
182 aa  41.6  0.005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.586532  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0999  hypothetical protein  66.67 
 
 
129 aa  41.6  0.005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.178423  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1595  hypothetical protein  30 
 
 
150 aa  41.2  0.006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  unclonable  0.00000000450152  normal  0.0299142 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1795  hypothetical protein  36.78 
 
 
130 aa  40.8  0.007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2979  hypothetical protein  36.76 
 
 
142 aa  40.8  0.007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.263138  normal  0.0407724 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06321  hypothetical protein  36.36 
 
 
122 aa  40.8  0.008  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3485  protein of unknown function DUF1232  48.78 
 
 
127 aa  40.4  0.009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3677  hypothetical protein  39.53 
 
 
116 aa  40.8  0.009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0247  hypothetical protein  28.81 
 
 
135 aa  40.4  0.01  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>