37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_1133 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_1133  hypothetical protein  100 
 
 		 358 aa  729    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0289108 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4018  hypothetical protein  49.85 
 
 		 331 aa  278  1e-73  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.107588  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1132  hypothetical protein  42.77 
 
 		 300 aa  202  6e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0290503 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0370  hypothetical protein  37.5 
 
 		 335 aa  188  1e-46  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0441  hypothetical protein  36.49 
 
 		 333 aa  185  1.0000000000000001e-45  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000118426 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3390  hypothetical protein  36.48 
 
 		 356 aa  183  5.0000000000000004e-45  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.389067 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3632  hypothetical protein  34.87 
 
 		 347 aa  172  7.999999999999999e-42  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.960299  hitchhiker  0.000777335 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0531  hypothetical protein  33.22 
 
 		 338 aa  164  2.0000000000000002e-39  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0202558  normal  0.0548232 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0443  hypothetical protein  32.53 
 
 		 366 aa  160  3e-38  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7309  hypothetical protein  28.66 
 
 		 324 aa  102  1e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3631  hypothetical protein  24.24 
 
 		 336 aa  100  3e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.910562  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2500  hypothetical protein  26.93 
 
 		 339 aa  98.6  1e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000718285  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0930  hypothetical protein  25.99 
 
 		 357 aa  95.5  1e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0294  hypothetical protein  23.39 
 
 		 322 aa  88.6  1e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.590252 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2082  hypothetical protein  33.14 
 
 		 364 aa  88.2  2e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0263451  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0804  hypothetical protein  26.1 
 
 		 349 aa  87  4e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.633218 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0305  hypothetical protein  26.45 
 
 		 317 aa  85.5  0.000000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7968  hypothetical protein  26.33 
 
 		 303 aa  83.6  0.000000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.844249  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2434  hypothetical protein  25.5 
 
 		 324 aa  80.1  0.00000000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.259817  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2527  hypothetical protein  31.69 
 
 		 340 aa  79.3  0.00000000000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06630  metalloendopeptidase-like membrane protein  35.26 
 
 		 547 aa  78.6  0.0000000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.630482  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2764  hypothetical protein  25.41 
 
 		 294 aa  77.8  0.0000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00220  metalloendopeptidase-like membrane protein  35.61 
 
 		 554 aa  70.1  0.00000000005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3579  NLP/P60 protein  22.89 
 
 		 323 aa  62.8  0.000000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3958  NLP/P60 protein  22.29 
 
 		 323 aa  62.8  0.00000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.068937  normal  0.125379 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3070  NLP/P60 protein  24.14 
 
 		 306 aa  56.2  0.0000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00281193  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1943  hypothetical protein  25.18 
 
 		 289 aa  53.5  0.000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.762706  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3144  NLP/P60 protein  26.28 
 
 		 334 aa  52.8  0.000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0327841  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3481  Lytic transglycosylase catalytic  38.14 
 
 		 767 aa  52.4  0.00001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0132558  hitchhiker  0.0026224 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1029  putative secreted protein  30.63 
 
 		 331 aa  52.4  0.00001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.781321  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0032  group B streptococcal surface immunogenic protein  30.25 
 
 		 434 aa  51.6  0.00002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.85122  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2686  Cell wall-associated hydrolase (invasion- associated protein)-like protein  25.9 
 
 		 330 aa  50.4  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0377535  normal  0.257604 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5879  NLP/P60 protein  27.54 
 
 		 333 aa  48.5  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.884921  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0540  hypothetical protein  31.13 
 
 		 366 aa  47.4  0.0004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2244  peptidase M23B  34.09 
 
 		 1048 aa  46.6  0.0007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5947  hypothetical protein  31.19 
 
 		 171 aa  42.7  0.01  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.264862  normal  1 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5545  hypothetical protein  31.19 
 
 		 171 aa  42.7  0.01  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  normal  0.092464 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>