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for query gene Smed_3062 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



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Plasmid unclonability p-value
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Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009636  Smed_3062  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  100 
 
 		 412 aa  795    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_011989  Avi_4159  MFS permease  55.01 
 
 		 392 aa  421  1e-117  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3222  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  55.44 
 
 		 417 aa  411  1e-113  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1990  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  45.54 
 
 		 452 aa  311  1e-83  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.648809  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3797  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  34.66 
 
 		 405 aa  182  7e-45  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.947543  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0009  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  33.14 
 
 		 394 aa  174  3.9999999999999995e-42  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000450315 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3562  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  33.53 
 
 		 392 aa  171  2e-41  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.424378  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5745  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  30.85 
 
 		 417 aa  160  3e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2067  multidrug resistance protein D  30.48 
 
 		 409 aa  157  4e-37  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0252383  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13380  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  32.96 
 
 		 424 aa  157  4e-37  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.223533  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0115  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  30.29 
 
 		 391 aa  154  2.9999999999999998e-36  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000000000395955  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3251  bicyclomycin/multidrug efflux system  30.67 
 
 		 402 aa  154  2.9999999999999998e-36  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.303475 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1475  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  30.39 
 
 		 405 aa  152  8e-36  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0389  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  30.81 
 
 		 404 aa  152  1e-35  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000107544  unclonable  0.00000000056227 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0664  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  29.9 
 
 		 401 aa  150  3e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1571  MFS family transporter  32.46 
 
 		 392 aa  150  3e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0527  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  34.45 
 
 		 419 aa  151  3e-35  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2800  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  31.07 
 
 		 411 aa  150  4e-35  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3460  drug resistance transporter, Bcr/CflA family  30.33 
 
 		 399 aa  150  5e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0137927  n/a   
 
 
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NC_010571  Oter_4576  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  32.77 
 
 		 400 aa  149  6e-35  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.857973  normal  1 
 
 
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NC_008463  PA14_18090  major facilitator subfamily transporter protein  32.46 
 
 		 392 aa  149  7e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_007298  Daro_0049  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  30.91 
 
 		 400 aa  149  8e-35  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.414965 
 
 
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NC_007204  Psyc_0349  major facilitator superfamily multi-drug efflux pump  30.53 
 
 		 419 aa  149  9e-35  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1787  drug resistance transporter, Bcr/CflA family  30.33 
 
 		 399 aa  148  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0383  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  30.53 
 
 		 419 aa  148  2.0000000000000003e-34  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0372929 
 
 
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NC_002947  PP_0589  Bcr/CflA family multidrug resistance transporter  30.09 
 
 		 393 aa  146  6e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0628  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  30.09 
 
 		 393 aa  146  6e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00837231  normal  0.960264 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3170  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  30.33 
 
 		 399 aa  146  7.0000000000000006e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.496864  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3478  drug resistance transporter, Bcr/CflA family  29.34 
 
 		 399 aa  145  1e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0634  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  30.66 
 
 		 393 aa  145  1e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000940614 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4241  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  31.28 
 
 		 396 aa  145  1e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.122316 
 
 
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NC_010501  PputW619_4575  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  30.13 
 
 		 393 aa  144  2e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0180506  normal  0.0143089 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3177  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  29.64 
 
 		 399 aa  145  2e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000683833  n/a   
 
 
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NC_008825  Mpe_A3595  putative membrane transport protein  30.03 
 
 		 404 aa  145  2e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0011  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  27.37 
 
 		 400 aa  144  2e-33  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.461677  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3263  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  29.34 
 
 		 399 aa  144  3e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00113776  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3518  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  29.34 
 
 		 399 aa  144  3e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0261106  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7148  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  30.43 
 
 		 399 aa  144  4e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1702  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  31.34 
 
 		 412 aa  143  5e-33  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.627963 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2160  hypothetical protein  30.51 
 
 		 407 aa  142  8e-33  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1682  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  28.76 
 
 		 414 aa  142  9e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0153282  normal  1 
 
 
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NC_013037  Dfer_3081  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  28.78 
 
 		 409 aa  142  9.999999999999999e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.707115 
 
 
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NC_006368  lpp2187  hypothetical protein  30.42 
 
 		 407 aa  142  9.999999999999999e-33  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
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NC_011658  BCAH187_A3491  drug resistance transporter, Bcr/CflA family  29.73 
 
 		 399 aa  142  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00320112  n/a   
 
 
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NC_011366  Rleg2_6000  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  30.99 
 
 		 399 aa  142  9.999999999999999e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.923433  normal  0.331381 
 
 
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NC_011992  Dtpsy_2001  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  31.14 
 
 		 412 aa  142  9.999999999999999e-33  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0443671  n/a   
 
 
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NC_009719  Plav_0571  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  32.26 
 
 		 399 aa  141  1.9999999999999998e-32  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0910669  normal  1 
 
 
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NC_010682  Rpic_2375  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  30.85 
 
 		 394 aa  140  3e-32  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.525477 
 
 
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NC_012856  Rpic12D_1975  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  30.41 
 
 		 394 aa  140  4.999999999999999e-32  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_007005  Psyr_0657  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  29.95 
 
 		 398 aa  140  4.999999999999999e-32  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.327939  normal  1 
 
 
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NC_007973  Rmet_0777  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  32.04 
 
 		 418 aa  140  4.999999999999999e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_010159  YpAngola_A1491  bicyclomycin/multidrug efflux system  29.09 
 
 		 399 aa  140  4.999999999999999e-32  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.646257  normal  1 
 
 
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NC_010465  YPK_2792  bicyclomycin/multidrug efflux system  28.85 
 
 		 401 aa  140  4.999999999999999e-32  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009708  YpsIP31758_2717  bicyclomycin/multidrug efflux system  28.85 
 
 		 399 aa  140  6e-32  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0392308  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01631  predicted transporter  29.19 
 
 		 403 aa  139  7.999999999999999e-32  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2373  inner membrane transport protein YdhC  29.19 
 
 		 403 aa  139  7.999999999999999e-32  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00231291  normal  0.112493 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1775  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  31.36 
 
 		 403 aa  139  7.999999999999999e-32  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.394194  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1740  inner membrane transport protein YdhC  29.19 
 
 		 403 aa  139  7.999999999999999e-32  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  5.41176e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1874  inner membrane transport protein YdhC  29.19 
 
 		 403 aa  139  7.999999999999999e-32  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000136238  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1969  inner membrane transport protein YdhC  29.19 
 
 		 403 aa  139  7.999999999999999e-32  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000225757 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01620  hypothetical protein  29.19 
 
 		 403 aa  139  7.999999999999999e-32  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1980  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  29.19 
 
 		 403 aa  139  1e-31  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00451664  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1911  bicyclomycin/multidrug efflux system  27.39 
 
 		 396 aa  139  1e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1537  inner membrane transport protein YdhC  28.9 
 
 		 403 aa  138  2e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0900835  normal  0.0201427 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0753  drug resistance transporter, Bcr/CflA family protein  27.57 
 
 		 398 aa  138  2e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.363927  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1389  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  31.53 
 
 		 387 aa  137  3.0000000000000003e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.0010399  normal  0.0253639 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1904  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  30.75 
 
 		 425 aa  137  4e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5119  drug resistance transporter, Bcr/CflA family  28.97 
 
 		 416 aa  136  5e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1948  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  28.53 
 
 		 393 aa  136  5e-31  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0211544  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0843  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  29.97 
 
 		 424 aa  137  5e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1867  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  30.66 
 
 		 406 aa  136  7.000000000000001e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.960562  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4448  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  31.2 
 
 		 424 aa  136  8e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3242  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  30.41 
 
 		 425 aa  136  8e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4173  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  30.37 
 
 		 400 aa  135  9.999999999999999e-31  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32370  Drug resistance transporter Bcr/CflA subfamily protein  28.4 
 
 		 426 aa  135  9.999999999999999e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0167  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  28.61 
 
 		 398 aa  135  9.999999999999999e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_002939  GSU0264  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  30.33 
 
 		 411 aa  135  1.9999999999999998e-30  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013131  Caci_8150  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  32.2 
 
 		 412 aa  135  1.9999999999999998e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008700  Sama_3448  drug resistance transporter, Bcr/CflA family protein  30.7 
 
 		 400 aa  135  1.9999999999999998e-30  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_010658  SbBS512_E1858  inner membrane transport protein YdhC  28.61 
 
 		 403 aa  134  3e-30  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  0.0000000000000141458  n/a   
 
 
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NC_011992  Dtpsy_2692  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  29.68 
 
 		 411 aa  134  3e-30  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008782  Ajs_3344  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  29.68 
 
 		 411 aa  134  3e-30  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0616341 
 
 
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NC_013889  TK90_2360  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  31.31 
 
 		 404 aa  134  3e-30  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.470045  normal  1 
 
 
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NC_003295  RSc2172  drug transport transmembrane protein  30.2 
 
 		 407 aa  134  3.9999999999999996e-30  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.309598  normal  1 
 
 
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NC_007498  Pcar_1102  major facilitator superfamily permease  28.14 
 
 		 420 aa  133  3.9999999999999996e-30  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.441898  n/a   
 
 
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NC_009456  VC0395_1015  multidrug resistance protein D  30.39 
 
 		 414 aa  133  5e-30  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007974  Rmet_4752  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter Bcr/CflA subfamily  29.43 
 
 		 426 aa  133  5e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.685858  normal  0.328295 
 
 
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NC_013595  Sros_5989  sugar (and other) transporter  30.34 
 
 		 411 aa  133  6e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.291494  normal  0.241739 
 
 
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NC_007511  Bcep18194_B0413  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  27.53 
 
 		 400 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.284146  normal  1 
 
 
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NC_013457  VEA_000830  multidrug resistance protein D  28.83 
 
 		 401 aa  132  1.0000000000000001e-29  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00131991  n/a   
 
 
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NC_007925  RPC_4760  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  28.81 
 
 		 399 aa  132  1.0000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.579597  normal  1 
 
 
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NC_007948  Bpro_0389  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  30.05 
 
 		 409 aa  132  1.0000000000000001e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.100227 
 
 
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NC_011071  Smal_2999  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  30.45 
 
 		 408 aa  132  1.0000000000000001e-29  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.827266  normal  0.0320436 
 
 
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NC_008463  PA14_10470  putative MFS transporter  31.6 
 
 		 402 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009656  PSPA7_0954  MFS family transporter  33.21 
 
 		 414 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.456329  n/a   
 
 
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NC_003295  RSc0216  transport transmembrane protein  31.08 
 
 		 409 aa  131  2.0000000000000002e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_005957  BT9727_3235  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  29.64 
 
 		 399 aa  132  2.0000000000000002e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000154906  n/a   
 
 
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NC_012791  Vapar_1761  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  28.9 
 
 		 411 aa  132  2.0000000000000002e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009456  VC0395_0057  multidrug resistance protein D  28.57 
 
 		 403 aa  131  2.0000000000000002e-29  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0307213  n/a   
 
 
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NC_008786  Veis_4226  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  30.7 
 
 		 465 aa  132  2.0000000000000002e-29  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.693691  normal  1 
 
 
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