166 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_2253 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009636  Smed_2253  hypothetical protein  100 
 
 		 367 aa  744    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.262355  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3022  protein of unknown function DUF185  68.87 
 
 		 366 aa  524  1e-148  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.838138  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2759  protein of unknown function DUF185  69.15 
 
 		 366 aa  523  1e-147  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.511112  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3172  hypothetical protein  65.56 
 
 		 377 aa  500  1e-140  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0778857  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1638  hypothetical protein  53.91 
 
 		 363 aa  376  1e-103  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1529  hypothetical protein  52.34 
 
 		 365 aa  365  1e-100  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1478  hypothetical protein  52.34 
 
 		 365 aa  365  1e-100  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  decreased coverage  0.00590219  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2151  hypothetical protein  50.28 
 
 		 358 aa  355  5.999999999999999e-97  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0956088  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2549  hypothetical protein  48.38 
 
 		 368 aa  321  1.9999999999999998e-86  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.569612  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0995  hypothetical protein  44.97 
 
 		 366 aa  319  3.9999999999999996e-86  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.199095  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1412  hypothetical protein  44.04 
 
 		 375 aa  293  2e-78  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  hitchhiker  0.00525557  normal  0.308753 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1764  hypothetical protein  43.89 
 
 		 375 aa  292  7e-78  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.526416  normal  0.881912 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4843  protein of unknown function DUF185  44.51 
 
 		 379 aa  287  2e-76  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3094  hypothetical protein  43.82 
 
 		 375 aa  286  5e-76  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2261  hypothetical protein  43.34 
 
 		 356 aa  285  1.0000000000000001e-75  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2503  hypothetical protein  42.66 
 
 		 390 aa  284  2.0000000000000002e-75  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.156222  normal  0.549612 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3876  hypothetical protein  44.13 
 
 		 376 aa  283  2.0000000000000002e-75  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.234317  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4165  hypothetical protein  44.26 
 
 		 376 aa  283  4.0000000000000003e-75  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.576249  normal  0.0725771 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5412  hypothetical protein  47.91 
 
 		 356 aa  282  5.000000000000001e-75  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2212  hypothetical protein  47.16 
 
 		 355 aa  273  5.000000000000001e-72  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5254  protein of unknown function DUF185  44.07 
 
 		 367 aa  266  5e-70  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1134  protein of unknown function DUF185  43.94 
 
 		 369 aa  263  3e-69  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0347191 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0259  hypothetical protein  46.88 
 
 		 353 aa  259  7e-68  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.655158 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2650  hypothetical protein  46.31 
 
 		 363 aa  259  7e-68  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0231  hypothetical protein  47.73 
 
 		 353 aa  251  2e-65  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1579  hypothetical protein  50.51 
 
 		 351 aa  250  3e-65  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3534  hypothetical protein  41.73 
 
 		 386 aa  250  3e-65  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.196392  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0760  hypothetical protein  38.8 
 
 		 366 aa  246  3e-64  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.562403 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3007  protein of unknown function DUF185  47.61 
 
 		 362 aa  246  4e-64  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2884  hypothetical protein  44.99 
 
 		 361 aa  239  4e-62  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.43196  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0619  hypothetical protein  42.07 
 
 		 357 aa  239  6.999999999999999e-62  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.770562  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3290  hypothetical protein  44.35 
 
 		 367 aa  236  4e-61  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.11841  normal  0.216636 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1092  protein of unknown function DUF185  41.92 
 
 		 339 aa  236  5.0000000000000005e-61  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.192418  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3110  protein of unknown function DUF185  45.35 
 
 		 361 aa  235  9e-61  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.922104  normal  0.232642 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0642  hypothetical protein  41.76 
 
 		 364 aa  233  4.0000000000000004e-60  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.175347  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0679  hypothetical protein  43.14 
 
 		 351 aa  233  5e-60  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0487  hypothetical protein  42.69 
 
 		 356 aa  231  2e-59  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0673  hypothetical protein  37.69 
 
 		 402 aa  224  1e-57  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0601  hypothetical protein  38.04 
 
 		 323 aa  221  9.999999999999999e-57  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.434393  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0717  hypothetical protein  32.47 
 
 		 349 aa  219  5e-56  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3334  hypothetical protein  41.03 
 
 		 371 aa  218  1e-55  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.47011 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0313  hypothetical protein  34.39 
 
 		 335 aa  216  5.9999999999999996e-55  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.368023  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0762  hypothetical protein  33.14 
 
 		 335 aa  213  2.9999999999999995e-54  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.244362  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1230  hypothetical protein  40.17 
 
 		 351 aa  212  7e-54  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.369365  normal  0.219943 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0424  hypothetical protein  39.38 
 
 		 324 aa  211  2e-53  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC00510  conserved hypothetical protein  33.59 
 
 		 449 aa  201  1.9999999999999998e-50  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_41366  predicted protein  33.51 
 
 		 461 aa  184  2.0000000000000003e-45  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.151662  normal  0.0721349 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06041  DUF185 domain protein (AFU_orthologue; AFUA_2G09740)  29.49 
 
 		 504 aa  177  3e-43  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.115857  normal  1 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_68115  predicted protein  29.78 
 
 		 515 aa  169  8e-41  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3621  hypothetical protein  29.58 
 
 		 393 aa  142  9.999999999999999e-33  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000385343  normal  0.0821404 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3084  hypothetical protein  31.83 
 
 		 385 aa  134  1.9999999999999998e-30  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0230  hypothetical protein  31.3 
 
 		 386 aa  130  5.0000000000000004e-29  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.885139 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2755  hypothetical protein  31.18 
 
 		 370 aa  130  5.0000000000000004e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0943  hypothetical protein  30.87 
 
 		 385 aa  128  1.0000000000000001e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000189258  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0626  protein of unknown function DUF185  27.6 
 
 		 384 aa  125  9e-28  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.925683  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2793  protein of unknown function DUF185  30.45 
 
 		 386 aa  125  1e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.425322  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0153  protein of unknown function DUF185  31.41 
 
 		 398 aa  124  2e-27  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.850011  normal  0.50101 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2027  hypothetical protein  29.21 
 
 		 388 aa  125  2e-27  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0057  hypothetical protein  29.21 
 
 		 417 aa  124  2e-27  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1418  protein of unknown function DUF185  29.66 
 
 		 385 aa  122  9.999999999999999e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.54059e-28 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0697  protein of unknown function DUF185  33.42 
 
 		 391 aa  121  1.9999999999999998e-26  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.141855  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2997  hypothetical protein  30.6 
 
 		 396 aa  120  3e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2351  protein of unknown function DUF185  29.14 
 
 		 410 aa  119  7e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4813  hypothetical protein  28.19 
 
 		 397 aa  117  1.9999999999999998e-25  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0476  hypothetical protein  31.08 
 
 		 386 aa  117  3.9999999999999997e-25  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1091  hypothetical protein  28.76 
 
 		 387 aa  115  1.0000000000000001e-24  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.25042  decreased coverage  0.00000118713 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0977  protein of unknown function DUF185  29.21 
 
 		 360 aa  115  1.0000000000000001e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.247325  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0329  protein of unknown function DUF185  30.42 
 
 		 393 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1649  protein of unknown function DUF185  28.07 
 
 		 386 aa  112  7.000000000000001e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0325386  hitchhiker  0.0000000752417 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4086  hypothetical protein  30.39 
 
 		 394 aa  112  1.0000000000000001e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2330  hypothetical protein  29.63 
 
 		 394 aa  112  1.0000000000000001e-23  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0383  protein of unknown function DUF185  29.89 
 
 		 378 aa  112  1.0000000000000001e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.000105312  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2363  hypothetical protein  30.33 
 
 		 396 aa  109  9.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.421927  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2977  hypothetical protein  30.33 
 
 		 396 aa  109  9.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0104  hypothetical protein  32.11 
 
 		 404 aa  109  1e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000103575 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2776  hypothetical protein  26.67 
 
 		 370 aa  108  2e-22  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4140  hypothetical protein  30.9 
 
 		 386 aa  107  2e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3886  hypothetical protein  29.73 
 
 		 394 aa  108  2e-22  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.643173  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3044  protein of unknown function DUF185  27.02 
 
 		 387 aa  107  2e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_15641  predicted protein  29.82 
 
 		 349 aa  107  3e-22  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2922  hypothetical protein  26.52 
 
 		 370 aa  107  4e-22  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0519  hypothetical protein  30.33 
 
 		 368 aa  107  4e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.386799  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0155  hypothetical protein  29.14 
 
 		 397 aa  106  6e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.621796  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1711  protein of unknown function DUF185  27.47 
 
 		 395 aa  106  7e-22  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.676361  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_07541  hypothetical protein  26.46 
 
 		 396 aa  105  1e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1815  hypothetical protein  28.99 
 
 		 394 aa  104  2e-21  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.520553  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0337  hypothetical protein  30.18 
 
 		 424 aa  105  2e-21  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4113  hypothetical protein  25.32 
 
 		 370 aa  105  2e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0048  protein of unknown function DUF185  29.23 
 
 		 397 aa  103  3e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.244588 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0037  hypothetical protein  29.38 
 
 		 393 aa  104  3e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2887  hypothetical protein  29.16 
 
 		 396 aa  103  4e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6326  hypothetical protein  29.19 
 
 		 397 aa  103  6e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.883144  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4374  hypothetical protein  24.29 
 
 		 370 aa  102  9e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3205  hypothetical protein  27.19 
 
 		 404 aa  102  9e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0693377 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2972  hypothetical protein  29.73 
 
 		 396 aa  102  9e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.852457  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0045  protein of unknown function DUF185  28.84 
 
 		 397 aa  102  1e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0812  hypothetical protein  27.96 
 
 		 375 aa  102  1e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0497  hypothetical protein  31.15 
 
 		 366 aa  102  1e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0818401 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1996  hypothetical protein  28.42 
 
 		 395 aa  102  1e-20  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4011  hypothetical protein  25.56 
 
 		 370 aa  101  2e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.188919  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>