82 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_1335 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009636  Smed_1335  HK97 family phage prohead protease  100 
 
 		 243 aa  490  9.999999999999999e-139  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.348898  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1656  phage prohead protease, HK97 family  58.22 
 
 		 233 aa  243  3e-63  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0868  HK97 family phage prohead protease  53.06 
 
 		 250 aa  178  7e-44  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.844474  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1601  phage prohead protease, HK97 family  38.3 
 
 		 240 aa  122  4e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2996  prohead peptidase  44.38 
 
 		 174 aa  122  4e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.102454  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3708  HK97 family phage prohead protease  44.5 
 
 		 371 aa  120  1.9999999999999998e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2264  phage prohead protease, HK97 family  42.22 
 
 		 216 aa  112  4.0000000000000004e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0493377 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1189  HK97 family phage prohead protease  42.22 
 
 		 216 aa  112  8.000000000000001e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000250589 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0648  prohead peptidase  38.07 
 
 		 231 aa  110  3e-23  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.857863  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0588  protease, putative  42.86 
 
 		 222 aa  109  4.0000000000000004e-23  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.688885  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0589  prohead protease  42.86 
 
 		 222 aa  109  4.0000000000000004e-23  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1681  hypothetical protein  37.61 
 
 		 228 aa  108  6e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1566  head maturation protease, putative  37.61 
 
 		 233 aa  105  9e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000525183 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1338  HK97 family phage prohead protease  37.67 
 
 		 248 aa  102  6e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.155288 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1337  phage prohead protease HK97 family  38.04 
 
 		 189 aa  97.8  1e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  hitchhiker  0.00130891  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2026  peptidase U35, phage prohead HK97  41.51 
 
 		 177 aa  97.8  2e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.671288  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1413  peptidase U35, phage prohead HK97  40 
 
 		 215 aa  97.4  2e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0338  peptidase U35, phage prohead HK97  41.51 
 
 		 177 aa  97.4  2e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.04025  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0554  HK97 family phage prohead protease  40.72 
 
 		 172 aa  97.1  3e-19  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1669  prohead peptidase  37.74 
 
 		 228 aa  95.1  9e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0860  phage prohead protease, HK97 family  40.51 
 
 		 183 aa  94.7  1e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2470  prohead peptidase  39.08 
 
 		 187 aa  93.6  2e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1132  HK97 family phage prohead protease  39.08 
 
 		 187 aa  94  2e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.431565 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1163  peptidase U35, phage prohead HK97  39.35 
 
 		 215 aa  93.6  3e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.446656  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2175  putative phage prohead protease  40.45 
 
 		 205 aa  92.8  4e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2899  HK97 family phage prohead protease  42.14 
 
 		 185 aa  91.3  1e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.575479  normal  0.417432 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1804  peptidase U35, phage prohead HK97  37.58 
 
 		 220 aa  91.7  1e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.409036  normal  0.116646 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1634  prohead peptidase  41.1 
 
 		 183 aa  90.5  2e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.457432  normal  0.754513 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1077  HK97 family phage prohead protease  38.51 
 
 		 187 aa  90.5  2e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.617633 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1718  peptidase U35, phage prohead HK97  36.9 
 
 		 176 aa  90.1  3e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.806315  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3485  HK97 family phage prohead protease  34.18 
 
 		 244 aa  89.4  4e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.41974  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3395  HK97 family phage prohead protease  32.3 
 
 		 236 aa  89.7  4e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.296315  hitchhiker  0.00000000423537 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3484  peptidase U35, phage prohead HK97  36.46 
 
 		 240 aa  89  7e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2095  phage prohead protease, HK97 family  38.51 
 
 		 248 aa  88.2  1e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.407254  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1432  HK97 family phage prohead protease  42.25 
 
 		 156 aa  87.4  2e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.392518 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1706  phage prohead protease, HK97 family  42.25 
 
 		 156 aa  87.4  2e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.614169  normal  0.0428753 
 
 
-
 
NC_002978  WD0447  phage prohead protease  36.67 
 
 		 177 aa  87.8  2e-16  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0713063  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1428  phage prohead protease, HK97 family  42.25 
 
 		 157 aa  86.7  3e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.84162  normal  0.230633 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1969  peptidase U35, phage prohead HK97  37.67 
 
 		 235 aa  85.5  6e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.150043  normal  0.71487 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0012  prohead peptidase  38.78 
 
 		 177 aa  85.1  0.000000000000001  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0921  HK97 family phage prohead protease  36.84 
 
 		 144 aa  84  0.000000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.340053 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3154  HK97 family phage prohead protease  40.91 
 
 		 159 aa  84.3  0.000000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.0071533  normal  0.0125341 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1060  peptidase U35, phage prohead HK97  38.78 
 
 		 190 aa  84.3  0.000000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0756377 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0032  HK97 family phage prohead protease  35.98 
 
 		 177 aa  82  0.000000000000008  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.378426  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0905  HK97 family phage prohead protease  35.15 
 
 		 219 aa  80.5  0.00000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.963792  normal  0.323205 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1853  prophage LambdaSa2, protease, putative  32.02 
 
 		 180 aa  79.7  0.00000000000004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.812797  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1358  HK97 family phage prohead protease  35.71 
 
 		 171 aa  76.6  0.0000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.272379 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3914  HK97 family phage prohead protease  39.73 
 
 		 139 aa  74.7  0.000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.768445  normal  0.030965 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4964  HK97 family phage prohead protease  37.86 
 
 		 184 aa  73.6  0.000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000100699 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3944  HK97 family phage prohead protease  34 
 
 		 213 aa  73.9  0.000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.130087  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0276  HK97 family phage prohead protease  34.52 
 
 		 168 aa  72.4  0.000000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3979  phage prohead protease, HK97 family  36.73 
 
 		 165 aa  71.2  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010721  Mpop_5466  hypothetical protein  34.39 
 
 		 167 aa  69.7  0.00000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3514  prohead peptidase  32.43 
 
 		 526 aa  67.4  0.0000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3586  prohead peptidase  32.43 
 
 		 526 aa  67  0.0000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.286744  normal  0.0669671 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3562  prohead peptidase  32.43 
 
 		 526 aa  67  0.0000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.530159 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0462  prohead peptidase  27.72 
 
 		 248 aa  63.5  0.000000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.523107 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2490  peptidase U35, phage prohead HK97  35.25 
 
 		 165 aa  62.8  0.000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.810682  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1626  peptidase U35, phage prohead HK97  33.12 
 
 		 165 aa  62.8  0.000000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.468737  normal  0.616924 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1483  peptidase U35, phage prohead HK97  33.12 
 
 		 165 aa  62.8  0.000000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.332545 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2000  peptidase U35, phage prohead HK97  35.37 
 
 		 149 aa  62.4  0.000000007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.639084  hitchhiker  0.00378226 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2917  HK97 family phage prohead protease  32.16 
 
 		 579 aa  61.6  0.00000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.595306  normal  0.164671 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3313  phage major capsid protein, HK97 family  30.57 
 
 		 562 aa  60.8  0.00000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000533544 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3121  prohead peptidase  33.77 
 
 		 150 aa  58.9  0.00000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1969  prohead protease protein  34.5 
 
 		 198 aa  57.4  0.0000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.839969  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0569  phage major capsid protein, HK97 family  29.68 
 
 		 514 aa  55.5  0.0000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.361307  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3425  prohead protease  30.52 
 
 		 194 aa  54.3  0.000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3508  prophage LambdaBa01, prohead protease  30.52 
 
 		 194 aa  54.3  0.000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.677368  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3785  prophage lambdaba01, prohead protease  30.52 
 
 		 194 aa  54.3  0.000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3429  HK97 family phage prohead protease  29.87 
 
 		 194 aa  53.5  0.000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010183  BcerKBAB4_5838  hypothetical protein  28.85 
 
 		 194 aa  50.8  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0445  prophage LambdaBa04, prohead protease  28.67 
 
 		 196 aa  48.1  0.0001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2272  phage prohead protease, HK97 family  28.25 
 
 		 220 aa  48.1  0.0001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1696  phage prohead protease, HK97 family  28.25 
 
 		 220 aa  48.1  0.0001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0467  prophage lambdaba04, prohead protease  28.67 
 
 		 196 aa  48.1  0.0001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4980  prophage LambdaBa03, prohead protease  26.58 
 
 		 165 aa  46.6  0.0003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5359  prophage LambdaBa03, prohead protease  26.58 
 
 		 165 aa  46.6  0.0003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2594  HK97 family phage prohead protease  30.71 
 
 		 190 aa  44.3  0.002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0952  HK97 family phage prohead protease  31.5 
 
 		 186 aa  43.9  0.003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1285  HK97 family phage prohead protease  28.83 
 
 		 177 aa  42.4  0.007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.140437  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1896  prohead peptidase  32.07 
 
 		 186 aa  42.4  0.008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12667  phiRv2 prophage protease  29.65 
 
 		 177 aa  41.6  0.01  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  1.81998e-17  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>