222 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_1057 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009636  Smed_1057  hypothetical protein  100 
 
 		 200 aa  408  1e-113  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.535631 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2221  hypothetical protein  60.5 
 
 		 201 aa  265  5e-70  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.378667  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2041  flavin reductase domain protein FMN-binding  62.12 
 
 		 203 aa  264  7e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0801878  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1842  hypothetical protein  62.12 
 
 		 203 aa  263  2e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0994516  normal  0.0170416 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1032  hypothetical protein  57.07 
 
 		 203 aa  226  1e-58  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.863891  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2151  hypothetical protein  56.06 
 
 		 203 aa  225  3e-58  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1068  hypothetical protein  56.57 
 
 		 203 aa  224  7e-58  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0726405  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6898  hypothetical protein  52.26 
 
 		 203 aa  209  2e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.800563  normal  0.546229 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1646  hypothetical protein  51.52 
 
 		 212 aa  208  4e-53  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2943  hypothetical protein  52.02 
 
 		 216 aa  206  1e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1359  hypothetical protein  48.97 
 
 		 208 aa  197  7e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.262276  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4312  hypothetical protein  48.99 
 
 		 205 aa  196  1.0000000000000001e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1820  hypothetical protein  51.03 
 
 		 207 aa  193  1e-48  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1150  flavoprotein oxygenase  45.54 
 
 		 207 aa  194  1e-48  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.462825 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1039  hypothetical protein  47.74 
 
 		 201 aa  192  2e-48  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.708626  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4414  hypothetical protein  47.24 
 
 		 201 aa  191  9e-48  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1899  hypothetical protein  51.83 
 
 		 202 aa  190  1e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.843142  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2703  hypothetical protein  49.74 
 
 		 206 aa  189  2.9999999999999997e-47  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.113365  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4325  hypothetical protein  46.23 
 
 		 201 aa  187  1e-46  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.590963 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1398  hypothetical protein  46.23 
 
 		 201 aa  187  1e-46  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.709674  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4899  hypothetical protein  46.15 
 
 		 205 aa  187  1e-46  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2631  hypothetical protein  48.73 
 
 		 202 aa  186  3e-46  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2682  hypothetical protein  49.22 
 
 		 205 aa  185  5e-46  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4462  hypothetical protein  47.5 
 
 		 209 aa  184  9e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.70984  normal  0.854602 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1011  hypothetical protein  46.53 
 
 		 202 aa  182  4.0000000000000006e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000116177  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0863  flavin reductase domain protein FMN-binding  46 
 
 		 209 aa  181  4.0000000000000006e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1051  hypothetical protein  47.5 
 
 		 230 aa  181  7e-45  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.106662  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2049  hypothetical protein  46.39 
 
 		 205 aa  181  9.000000000000001e-45  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4298  hypothetical protein  46.39 
 
 		 207 aa  180  1e-44  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0081  hypothetical protein  48.45 
 
 		 209 aa  180  1e-44  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2217  hypothetical protein  44.5 
 
 		 207 aa  179  2e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0565603 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4002  hypothetical protein  46.63 
 
 		 207 aa  179  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.548606  normal  0.130195 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4219  hypothetical protein  46.15 
 
 		 205 aa  179  2.9999999999999997e-44  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.269485 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1215  hypothetical protein  46.11 
 
 		 208 aa  178  4.999999999999999e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4071  hypothetical protein  45.36 
 
 		 205 aa  178  4.999999999999999e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.261199  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7205  flavin reductase domain protein FMN-binding  48.76 
 
 		 209 aa  178  5.999999999999999e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.981743  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1242  hypothetical protein  46.11 
 
 		 208 aa  178  5.999999999999999e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1838  hypothetical protein  46.97 
 
 		 194 aa  176  2e-43  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1133  hypothetical protein  45 
 
 		 208 aa  176  2e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.311037 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0487  flavin reductase domain-containing protein  46.97 
 
 		 194 aa  176  2e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.660755  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0498  flavoprotein oxygenase  48.07 
 
 		 209 aa  176  2e-43  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0627  flavin reductase domain-containing protein  46.97 
 
 		 194 aa  176  3e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04002  nitrilotriacetate monooxygenase component B  47.15 
 
 		 209 aa  175  5e-43  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0492  flavoprotein oxygenase  46.7 
 
 		 209 aa  174  7e-43  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0761  hypothetical protein  45.56 
 
 		 208 aa  174  7e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1122  hypothetical protein  45 
 
 		 221 aa  174  7e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3466  hypothetical protein  47.69 
 
 		 209 aa  174  9e-43  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.421094 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6295  hypothetical protein  47.76 
 
 		 208 aa  173  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.19889  normal  0.194247 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0832  hypothetical protein  46.67 
 
 		 206 aa  171  5e-42  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.158602  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3209  flavin reductase-like, FMN-binding  46.34 
 
 		 201 aa  170  1e-41  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0502  flavoprotein oxygenase  45.6 
 
 		 208 aa  170  1e-41  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6051  hypothetical protein  43.72 
 
 		 218 aa  169  2e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.52164  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2065  conserved hypothetical FMN binding protein  45.85 
 
 		 201 aa  169  2e-41  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.111591  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3807  flavin reductase domain protein FMN-binding  43.35 
 
 		 209 aa  169  3e-41  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3621  hypothetical protein  46.34 
 
 		 220 aa  169  3e-41  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3355  flavoprotein oxygenase  45.05 
 
 		 210 aa  168  4e-41  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.522125  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02220  hypothetical protein  44.1 
 
 		 208 aa  168  5e-41  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.686893  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3626  flavoprotein oxygenase  43.41 
 
 		 209 aa  168  5e-41  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3864  flavoprotein oxygenase  43.35 
 
 		 209 aa  167  8e-41  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3528  flavoprotein oxygenase  44.51 
 
 		 208 aa  167  9e-41  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0503  flavoprotein oxygenase  45.05 
 
 		 208 aa  167  9e-41  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0452  flavoprotein oxygenase  45.05 
 
 		 209 aa  167  9e-41  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2316  hypothetical protein  45 
 
 		 201 aa  167  1e-40  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0978794 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2591  flavin reductase domain protein FMN-binding  45 
 
 		 201 aa  167  1e-40  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.40537 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3989  flavoprotein oxygenase  45.05 
 
 		 209 aa  167  1e-40  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0458  flavoprotein oxygenase  45.05 
 
 		 209 aa  167  1e-40  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2270  hypothetical protein  46.56 
 
 		 201 aa  165  4e-40  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2319  hypothetical protein  45.85 
 
 		 201 aa  165  4e-40  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0053  hypothetical protein  49.14 
 
 		 210 aa  164  9e-40  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.234931  normal  0.568294 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1469  flavoprotein oxygenase  46.45 
 
 		 212 aa  163  1.0000000000000001e-39  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07162  conserved hypothetical protein  43.69 
 
 		 241 aa  158  4e-38  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.574629  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4215  hypothetical protein  55.81 
 
 		 184 aa  155  3e-37  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.380151  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4267  hypothetical protein  44 
 
 		 221 aa  154  1e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.308533  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2679  hypothetical protein  44.28 
 
 		 230 aa  152  2.9999999999999998e-36  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2736  hypothetical protein  44.28 
 
 		 230 aa  152  2.9999999999999998e-36  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0267  hypothetical protein  43.15 
 
 		 209 aa  152  5e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3787  hypothetical protein  55.88 
 
 		 140 aa  148  5e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4414  hypothetical protein  39.71 
 
 		 218 aa  147  1.0000000000000001e-34  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.629184  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5792  hypothetical protein  41.18 
 
 		 218 aa  146  2.0000000000000003e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.926616 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6039  hypothetical protein  41 
 
 		 206 aa  145  4.0000000000000006e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.8711  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2269  hypothetical protein  41.79 
 
 		 229 aa  143  2e-33  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6309  hypothetical protein  41.03 
 
 		 207 aa  140  8e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3064  hypothetical protein  41.58 
 
 		 209 aa  140  1.9999999999999998e-32  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.883432  normal  0.0355565 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2435  hypothetical protein  38.16 
 
 		 211 aa  137  7.999999999999999e-32  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3293  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  41.44 
 
 		 216 aa  132  5e-30  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.902968  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2366  flavoprotein oxygenase DIM6/NTAB family-like protein  40.21 
 
 		 203 aa  127  1.0000000000000001e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.460598  normal  0.14144 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2487  hypothetical protein  38.66 
 
 		 203 aa  121  8e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.239635  normal  0.0244852 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_78913  flavoprotein oxygenase  35.71 
 
 		 287 aa  115  3e-25  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2444  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  37.57 
 
 		 199 aa  115  3.9999999999999997e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1479  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  33 
 
 		 206 aa  112  3e-24  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5120  putative flavin reductase  34.24 
 
 		 203 aa  112  3e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0364817  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5507  hypothetical protein  34.24 
 
 		 203 aa  111  8.000000000000001e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000065263  unclonable  4.40126e-26 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43240  hypothetical protein  34.04 
 
 		 202 aa  110  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.531737 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0762  flavin reductase domain protein FMN-binding  36.26 
 
 		 203 aa  110  1.0000000000000001e-23  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1981  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  35.96 
 
 		 197 aa  110  2.0000000000000002e-23  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.780004  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3843  hypothetical protein  33.88 
 
 		 203 aa  109  2.0000000000000002e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000198663  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5413  hypothetical protein  33.7 
 
 		 203 aa  109  3e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.81917e-62 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5447  hypothetical protein  33.7 
 
 		 203 aa  108  4.0000000000000004e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000739812  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5444  hypothetical protein  33.7 
 
 		 203 aa  108  4.0000000000000004e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0011476  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3627  hypothetical protein  33.51 
 
 		 202 aa  108  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.174937  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>