More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_0750 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009636  Smed_0750  cobalamin synthesis protein P47K  100 
 
 		 320 aa  643    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05471  G3E family GTPase  31.75 
 
 		 342 aa  174  1.9999999999999998e-42  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.304233  normal  0.295768 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1823  hypothetical protein  31.67 
 
 		 344 aa  173  2.9999999999999996e-42  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0970938  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0321  cobalamin synthesis protein P47K  35.44 
 
 		 364 aa  166  4e-40  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.276547 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1948  cobalamin synthesis protein/P47K  32.44 
 
 		 349 aa  162  5.0000000000000005e-39  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.871457  normal  0.448238 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4617  cobalamin synthesis protein, P47K  35.88 
 
 		 327 aa  162  6e-39  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.483497  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_14651  G3E family GTPase  32.01 
 
 		 338 aa  162  7e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00856478 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4358  cobalamin synthesis protein P47K  39.25 
 
 		 310 aa  160  3e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1690  hypothetical protein  30.86 
 
 		 349 aa  158  1e-37  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3108  cobalamin synthesis protein, P47K  32.14 
 
 		 362 aa  152  5.9999999999999996e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.190819  normal  0.352092 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2644  cobalamin synthesis protein P47K  29.91 
 
 		 373 aa  152  8e-36  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.341844 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0672  hypothetical protein  40.78 
 
 		 379 aa  150  2e-35  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.177765  normal  0.336631 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1570  hypothetical protein  40.78 
 
 		 372 aa  150  2e-35  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.0281678 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0708  cobalamin synthesis protein P47K  29.59 
 
 		 362 aa  150  3e-35  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07121  G3E family GTPase  31.5 
 
 		 366 aa  150  3e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0123  cobalamin synthesis protein, P47K  37.42 
 
 		 287 aa  150  3e-35  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4200  cobalamin synthesis protein P47K  32.8 
 
 		 336 aa  150  4e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000951795  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2976  cobalamin synthesis protein P47K  33.84 
 
 		 359 aa  149  4e-35  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2341  cobalamin synthesis protein P47K  40 
 
 		 378 aa  147  2.0000000000000003e-34  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2392  cobalamin synthesis protein P47K  40 
 
 		 378 aa  148  2.0000000000000003e-34  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6702  putative cobalamin synthesis protein cobW  35.52 
 
 		 309 aa  147  3e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.203286  normal  0.120205 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1044  cobalamin synthesis protein/P47K  39.06 
 
 		 449 aa  146  5e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.936945  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3846  cobalamin synthesis protein P47K  46.58 
 
 		 341 aa  146  5e-34  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5665  cobalamin synthesis protein P47K  40 
 
 		 320 aa  146  5e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0326957 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11351  cobalamin synthesis protein/P47K  39.06 
 
 		 449 aa  145  7.0000000000000006e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.593368  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2074  cobalamin synthesis protein P47K  34.58 
 
 		 349 aa  145  7.0000000000000006e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0490287  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0865  cobalamin synthesis protein P47K  38.22 
 
 		 346 aa  144  1e-33  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2949  cobalamin synthesis protein P47K  31.98 
 
 		 369 aa  145  1e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.645626  hitchhiker  0.00151664 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0891  cobalamin synthesis protein P47K  38.22 
 
 		 346 aa  144  1e-33  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.441497  normal  0.976092 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0611  cobalamin synthesis protein P47K  34.55 
 
 		 332 aa  145  1e-33  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.71741  normal  0.0611069 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11351  cobalamin synthesis protein/P47K  38.54 
 
 		 449 aa  144  2e-33  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7626  cobalamin synthesis protein/P47K  34.19 
 
 		 345 aa  143  5e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.347938 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11271  cobalamin synthesis protein/P47K  38.02 
 
 		 452 aa  142  7e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3717  cobalamin synthesis protein/P47K  37.5 
 
 		 379 aa  142  8e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4765  cobalamin synthesis protein P47K  41.34 
 
 		 330 aa  142  9e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3924  cobalamin synthesis protein P47K  35.08 
 
 		 344 aa  140  1.9999999999999998e-32  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0777863  normal  0.0144678 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0285  cobalamin synthesis protein/P47K  33.85 
 
 		 323 aa  140  3.9999999999999997e-32  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.980872  normal  0.42321 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1986  cobalamin synthesis protein P47K  32.87 
 
 		 336 aa  139  6e-32  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0441  cobalamin synthesis protein, P47K  39.69 
 
 		 382 aa  139  7e-32  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.319844  normal  0.988623 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0888  cobalamin synthesis protein P47K  31.49 
 
 		 323 aa  139  8.999999999999999e-32  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.908618 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0862  cobalamin synthesis protein P47K  31.49 
 
 		 323 aa  139  8.999999999999999e-32  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1081  cobalamin synthesis protein P47K  29.27 
 
 		 384 aa  139  8.999999999999999e-32  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.640909 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3403  cobalamin synthesis protein P47K  36.92 
 
 		 341 aa  137  2e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_11161  cobalamin synthesis protein/P47K  39.09 
 
 		 457 aa  137  2e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.210673 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6051  cobalamin synthesis protein P47K  35.66 
 
 		 330 aa  137  2e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2838  cobalamin synthesis protein P47K  31.02 
 
 		 356 aa  136  4e-31  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_15201  cobalamin synthesis protein/P47K  37.24 
 
 		 460 aa  135  9.999999999999999e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.527171  normal  1 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0228  cobalamin synthesis protein/P47K  41.98 
 
 		 353 aa  135  9.999999999999999e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0956  hypothetical protein  38.86 
 
 		 380 aa  134  9.999999999999999e-31  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.582353  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3251  cobalamin synthesis protein, P47K  34.46 
 
 		 290 aa  135  9.999999999999999e-31  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.784399  normal  0.367551 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1342  putative cobalamin synthesis protein/P47K family protein  41.67 
 
 		 345 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.245031 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1731  cobalamin synthesis protein P47K  33.21 
 
 		 329 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.425021 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3189  cobalamin synthesis protein P47K  30.51 
 
 		 323 aa  133  3e-30  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0646926 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3078  cobalamin synthesis protein/P47K:cobalamin synthesis CobW, C-terminal  32.39 
 
 		 360 aa  133  3e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.361866  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0536  cobalamin synthesis protein, P47K  32.48 
 
 		 352 aa  134  3e-30  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1909  cobalamin synthesis protein P47K  32.53 
 
 		 323 aa  133  3e-30  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4556  cobalamin synthesis protein, P47K  39.18 
 
 		 347 aa  133  3.9999999999999996e-30  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.107913  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4710  cobalamin synthesis protein P47K  41.62 
 
 		 355 aa  132  5e-30  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.149594 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3663  cobalamin synthesis protein P47K  41.92 
 
 		 363 aa  133  5e-30  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.234992 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1778  cobalamin synthesis protein P47K  33.33 
 
 		 328 aa  132  6e-30  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.468449  normal  0.647209 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2114  cobalamin synthesis protein P47K  33.33 
 
 		 328 aa  132  6e-30  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.56186 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1037  G3E family GTPase  36.22 
 
 		 460 aa  132  6e-30  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19071  cobalamin synthesis protein/P47K  37.37 
 
 		 460 aa  131  1.0000000000000001e-29  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1524  cobalamin synthesis protein P47K  33.1 
 
 		 319 aa  131  1.0000000000000001e-29  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1304  cobalamin synthesis protein, P47K  31.44 
 
 		 320 aa  130  2.0000000000000002e-29  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.405141  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5187  cobalamin synthesis protein P47K  32.31 
 
 		 323 aa  131  2.0000000000000002e-29  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.491695  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0917  cobalamin synthesis protein, CobW  40.72 
 
 		 350 aa  131  2.0000000000000002e-29  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.191872  normal  0.446046 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3685  cobalamin synthesis protein P47K  32.34 
 
 		 335 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.444598  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3021  cobalamin synthesis protein P47K  41.32 
 
 		 358 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0800  cobalamin synthesis protein P47K  33.88 
 
 		 325 aa  130  3e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1611  cobalamin synthesis protein  29.5 
 
 		 395 aa  130  3e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.661095  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0846  cobalamin synthesis protein, P47K  43.35 
 
 		 353 aa  130  3e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.136084 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3425  cobalamin synthesis protein, P47K  40.96 
 
 		 361 aa  130  3e-29  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0953309  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05541  G3E family GTPase  41.92 
 
 		 357 aa  130  3e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.427683  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0080  cobalamin synthesis protein, putative  30.95 
 
 		 400 aa  130  4.0000000000000003e-29  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1584  cobalamin synthesis protein  29.5 
 
 		 395 aa  130  4.0000000000000003e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0280902  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0929  cobalamin synthesis protein P47K  42.33 
 
 		 349 aa  129  5.0000000000000004e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.363072  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05171  G3E family GTPase  37.04 
 
 		 362 aa  129  6e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.842312  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4562  cobalamin synthesis protein P47K  31.67 
 
 		 320 aa  129  6e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00110113 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4831  cobalamin synthesis protein, P47K  42.01 
 
 		 350 aa  129  6e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.293757  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1810  putative cobalamin synthesis protein  29.5 
 
 		 395 aa  129  6e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1776  putative cobalamin synthesis protein  29.81 
 
 		 395 aa  129  7.000000000000001e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.909372  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6990  cobalamin synthesis protein P47K  31.79 
 
 		 360 aa  129  7.000000000000001e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.81769  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6978  cobalamin synthesis protein P47K  32.6 
 
 		 324 aa  129  7.000000000000001e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.227526  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05461  G3E family GTPase  36.98 
 
 		 383 aa  129  8.000000000000001e-29  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.412764  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1836  cobalamin synthesis protein, putative  30.12 
 
 		 395 aa  129  9.000000000000001e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.196672  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5758  cobalamin synthesis protein/P47K:cobalamin synthesis CobW, C-terminal  32.15 
 
 		 318 aa  128  1.0000000000000001e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0133  cobalamin synthesis protein, P47K  37.74 
 
 		 318 aa  129  1.0000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.722195  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3393  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  35.76 
 
 		 399 aa  128  1.0000000000000001e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0189919  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06660  predicted GTPase, G3E family  32.53 
 
 		 364 aa  128  2.0000000000000002e-28  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.747392  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1633  cobalamin synthesis protein  30.21 
 
 		 527 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0829989  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1760  cobalamin synthesis protein  29.19 
 
 		 395 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0491  hypothetical protein  35.98 
 
 		 362 aa  128  2.0000000000000002e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0830931  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1028  cobalamin synthesis protein P47K  35.33 
 
 		 322 aa  127  2.0000000000000002e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.906843  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4501  cobalamin synthesis protein, P47K  41.44 
 
 		 325 aa  127  3e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.687731 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3566  cobalamin synthesis protein, P47K  34.84 
 
 		 399 aa  127  3e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.107446  normal  0.0714729 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4724  cobalamin synthesis protein P47K  30.34 
 
 		 376 aa  127  3e-28  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0581  cobalamin synthesis protein P47K  29.43 
 
 		 394 aa  126  4.0000000000000003e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3568  putative cobalamin synthesis protein  29.19 
 
 		 395 aa  127  4.0000000000000003e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.490171  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3384  cobalamin synthesis protein P47K  40.24 
 
 		 360 aa  126  5e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.162909  normal  0.200467 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>