111 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_1605 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011071  Smal_1605  prephenate dehydrogenase  100 
 
 
374 aa  761    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.294712  normal  0.381468 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01188  prephenate dehydrogenase  70.6 
 
 
375 aa  496  1e-139  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.282588  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1510  prephenate dehydrogenase  66.12 
 
 
373 aa  489  1e-137  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1453  prephenate dehydrogenase  66.12 
 
 
373 aa  489  1e-137  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.542491  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2608  Prephenate dehydrogenase  30.85 
 
 
283 aa  119  7e-26  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.749464 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1024  prephenate dehydrogenase  25.58 
 
 
447 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1300  prephenate dehydrogenase  31.17 
 
 
274 aa  110  3e-23  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.580426  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1560  prephenate dehydrogenase  32.16 
 
 
276 aa  111  3e-23  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0599  hypothetical protein  30.84 
 
 
288 aa  110  4.0000000000000004e-23  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0114109  normal  0.0489829 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0227  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  30.74 
 
 
375 aa  102  1e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1033  prephenate dehydrogenase  30.77 
 
 
274 aa  101  2e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.393372  normal  0.590632 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1997  prephenate dehydrogenase  26.33 
 
 
437 aa  100  5e-20  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1502  prephenate dehydrogenase  28.79 
 
 
288 aa  99.8  6e-20  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3767  prephenate dehydrogenase  28.81 
 
 
242 aa  99.8  8e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000142598  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004405  chorismate mutase I/cyclohexadienyl dehydrogenase  30.2 
 
 
375 aa  97.1  4e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0061  prephenate dehydrogenase  25.95 
 
 
443 aa  97.1  5e-19  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.532803  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00993  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  30.2 
 
 
375 aa  96.7  5e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1158  prephenate dehydrogenase  25.72 
 
 
439 aa  96.3  8e-19  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0924  prephenate dehydrogenase  26.69 
 
 
505 aa  95.1  2e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1946  prephenate dehydrogenase  27.97 
 
 
279 aa  94  4e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.772286  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1362  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  32.59 
 
 
379 aa  93.2  7e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01712  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  30.47 
 
 
384 aa  92  1e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.149825  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0827  prephenate dehydrogenase  24.65 
 
 
439 aa  91.3  3e-17  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.666183  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0760  prephenate dehydrogenase  25.32 
 
 
443 aa  89.7  8e-17  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.504632  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1173  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  32.59 
 
 
383 aa  87.4  4e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00322769  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2833  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  30.8 
 
 
379 aa  86.7  6e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00724041  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2915  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  30.8 
 
 
379 aa  86.7  6e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0333151  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1215  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  31.7 
 
 
383 aa  86.7  6e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000459834  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3012  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  30.8 
 
 
379 aa  86.7  7e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0411144  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3098  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  31.7 
 
 
379 aa  86.7  7e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000040953  normal  0.11712 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2915  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  32.58 
 
 
383 aa  85.9  0.000000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.449795  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1259  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  31.7 
 
 
383 aa  85.9  0.000000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0378227  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1164  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  30.63 
 
 
379 aa  85.9  0.000000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00398091  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1292  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  31.7 
 
 
383 aa  85.9  0.000000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0548711  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0287  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  26.94 
 
 
375 aa  84.7  0.000000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1068  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  31.39 
 
 
384 aa  85.5  0.000000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0518794  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1054  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  28.96 
 
 
384 aa  84.7  0.000000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.189276  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1259  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  28.74 
 
 
379 aa  83.2  0.000000000000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00675448  hitchhiker  0.000301963 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3483  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  31.96 
 
 
373 aa  82.8  0.000000000000009  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.250939 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2749  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  30.93 
 
 
384 aa  82.4  0.00000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.186478  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0654  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  24.79 
 
 
377 aa  82.4  0.00000000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2854  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  28.57 
 
 
373 aa  82.4  0.00000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.663764  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3219  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  31.96 
 
 
373 aa  81.6  0.00000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3356  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  31.96 
 
 
373 aa  81.6  0.00000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0894  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  29.36 
 
 
379 aa  79.7  0.00000000000007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.121322  normal  0.591266 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0880  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  29.09 
 
 
373 aa  79.3  0.00000000000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.404976  normal  0.139237 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3079  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  28.17 
 
 
373 aa  79  0.0000000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.394407  normal  0.0294046 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0998  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  29.57 
 
 
372 aa  79  0.0000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02489  fused chorismate mutase T/prephenate dehydrogenase  26.84 
 
 
373 aa  78.2  0.0000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.555514  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2757  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  26.84 
 
 
373 aa  78.2  0.0000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000176639  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2884  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  26.84 
 
 
373 aa  78.2  0.0000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0271953  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1083  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  26.84 
 
 
373 aa  78.2  0.0000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.676844  hitchhiker  0.000106918 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2752  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  26.84 
 
 
373 aa  78.2  0.0000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000708785  normal  0.0483395 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2987  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  26.84 
 
 
373 aa  78.2  0.0000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000572711  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3839  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  27.01 
 
 
373 aa  78.6  0.0000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00182808  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02453  hypothetical protein  26.84 
 
 
373 aa  78.2  0.0000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.58394  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1074  chorismate mutase  26.84 
 
 
373 aa  77.4  0.0000000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.134673  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1588  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  27.23 
 
 
375 aa  77.8  0.0000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1648  hypothetical protein  26.61 
 
 
351 aa  77.4  0.0000000000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.0329926 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3953  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  27.36 
 
 
381 aa  76.6  0.0000000000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3543  prephenate dehydrogenase  27.61 
 
 
254 aa  76.3  0.0000000000009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.372854 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0437  prephenate dehydrogenase  25.71 
 
 
288 aa  74.3  0.000000000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000000137716  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_403  prephenate dehydrogenase  24.64 
 
 
287 aa  74.7  0.000000000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000225812  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1132  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  28.64 
 
 
373 aa  73.9  0.000000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2882  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  28.1 
 
 
373 aa  73.9  0.000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0721758  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2884  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  28.1 
 
 
373 aa  73.9  0.000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.28721 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2813  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  28.1 
 
 
373 aa  73.9  0.000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2996  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  28.1 
 
 
373 aa  73.2  0.000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3147  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  28.18 
 
 
373 aa  73.2  0.000000000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2863  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  28.1 
 
 
373 aa  72.8  0.000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0273979 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1274  prephenate dehydrogenase  27.8 
 
 
245 aa  72.4  0.00000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.885753  normal  0.198911 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6599  chorismate mutase  28.84 
 
 
375 aa  70.5  0.00000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4010  prephenate dehydrogenase  29 
 
 
266 aa  70.1  0.00000000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.246742  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0671  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  27.35 
 
 
374 aa  69.7  0.00000000007  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.106766  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2269  Prephenate dehydrogenase  25.41 
 
 
371 aa  69.3  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00760536 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4379  Prephenate dehydrogenase  29.74 
 
 
266 aa  68.9  0.0000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0691262  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3943  prephenate dehydrogenase  27.53 
 
 
281 aa  68.2  0.0000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0460  prephenate dehydrogenase  23.79 
 
 
287 aa  65.5  0.000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000113439  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0997  prephenate dehydrogenase  28.06 
 
 
237 aa  62.8  0.000000008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.119392  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4492  Prephenate dehydrogenase  27.38 
 
 
267 aa  62.4  0.00000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.192992  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2392  Prephenate dehydrogenase  31.25 
 
 
287 aa  56.2  0.0000009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.801901  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0545  prephenate dehydrogenase  21.71 
 
 
283 aa  54.3  0.000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1063  prephenate dehydrogenase  22.94 
 
 
258 aa  53.5  0.000005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0955  prephenate dehydrogenase  22.18 
 
 
258 aa  53.9  0.000005  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0483  prephenate dehydrogenase  23.18 
 
 
367 aa  52.8  0.00001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4586  Prephenate dehydrogenase  22.9 
 
 
294 aa  52.4  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2357  Prephenate dehydrogenase  30.06 
 
 
243 aa  51.2  0.00003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.350726  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2748  prephenate dehydrogenase  22.34 
 
 
369 aa  50.4  0.00005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2473  prephenate dehydrogenase  24.66 
 
 
258 aa  48.9  0.0002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.413514  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2572  prephenate dehydrogenase  26.8 
 
 
289 aa  47.8  0.0003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.474383  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2024  prephenate dehydrogenase  24.66 
 
 
250 aa  47.8  0.0003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1779  prephenate dehydrogenase  31.25 
 
 
257 aa  47.8  0.0003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.116318 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1424  Prephenate dehydrogenase  31.54 
 
 
278 aa  47.4  0.0004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1785  prephenate dehydrogenase  25.56 
 
 
250 aa  47.4  0.0004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23140  chorismate mutase, clade 2  26.7 
 
 
706 aa  46.2  0.0009  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.839893  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3485  prephenate dehydrogenase  27.63 
 
 
260 aa  45.4  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0118  Prephenate dehydrogenase  26.45 
 
 
262 aa  45.4  0.002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3001  prephenate dehydrogenase  22.33 
 
 
366 aa  44.7  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000103153  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0890  prephenate dehydrogenase  24.86 
 
 
253 aa  44.7  0.003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1368  Prephenate dehydrogenase  30.83 
 
 
332 aa  44.3  0.004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>