68 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_0174 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011071  Smal_0174  Sterol-binding domain protein  100 
 
 
211 aa  407  1e-113  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02770  hypothetical protein  70.62 
 
 
214 aa  273  1.0000000000000001e-72  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.763471  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1191  hypothetical protein  64.11 
 
 
215 aa  239  2.9999999999999997e-62  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1099  sterol-binding domain-containing protein  62.2 
 
 
215 aa  236  2e-61  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0060  Sterol-binding domain protein  32.81 
 
 
207 aa  91.7  7e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1206  hypothetical protein  35.71 
 
 
192 aa  85.9  4e-16  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2819  hypothetical protein  29 
 
 
205 aa  85.5  5e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2344  hypothetical protein  32.31 
 
 
202 aa  84.3  0.000000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2971  hypothetical protein  28.5 
 
 
205 aa  83.6  0.000000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2701  hypothetical protein  29.23 
 
 
219 aa  75.5  0.0000000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000952725 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3416  hypothetical protein  31.55 
 
 
213 aa  73.2  0.000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2119  hypothetical protein  23.38 
 
 
204 aa  72.8  0.000000000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.145601  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0066  hypothetical protein  23.38 
 
 
204 aa  72.8  0.000000000003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5062  sterol-binding domain-containing protein  30.48 
 
 
207 aa  72.4  0.000000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5012  hypothetical protein  30.48 
 
 
207 aa  72.4  0.000000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.57602  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4886  hypothetical protein  30.48 
 
 
207 aa  72.4  0.000000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.8199 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0070  hypothetical protein  31.12 
 
 
209 aa  71.2  0.00000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2018  hypothetical protein  28.71 
 
 
220 aa  67.8  0.0000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.987101  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0453  sterol-binding domain-containing protein  28.88 
 
 
207 aa  67  0.0000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.663917  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0522  hypothetical protein  29.44 
 
 
205 aa  66.2  0.0000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.265718  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0386  hypothetical protein  27.6 
 
 
207 aa  59.3  0.00000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.778532  normal  0.105703 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0388  hypothetical protein  27.6 
 
 
207 aa  58.2  0.00000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45420  hypothetical protein  29.41 
 
 
207 aa  57.4  0.0000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.471069  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0102  Sterol-binding domain protein  32 
 
 
211 aa  57.4  0.0000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0697  hypothetical protein  27.01 
 
 
196 aa  57.4  0.0000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0295  hypothetical protein  25.24 
 
 
235 aa  57  0.0000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.126992  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6057  hypothetical protein  26.15 
 
 
208 aa  56.6  0.0000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0433  hypothetical protein  29.08 
 
 
222 aa  56.2  0.0000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2118  hypothetical protein  26.15 
 
 
208 aa  55.5  0.0000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.935864  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5803  hypothetical protein  28.12 
 
 
208 aa  55.5  0.0000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2757  sterol-binding domain-containing protein  26.15 
 
 
208 aa  55.5  0.0000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0217  hypothetical protein  34.95 
 
 
193 aa  55.5  0.0000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2730  hypothetical protein  26.15 
 
 
208 aa  55.5  0.0000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.722232  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0651  Sterol-binding domain protein  25 
 
 
214 aa  55.1  0.0000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.934133 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4210  hypothetical protein  27.5 
 
 
213 aa  54.3  0.000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0376  sterol-binding domain-containing protein  25.51 
 
 
214 aa  53.1  0.000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.340906 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2648  sterol-binding domain-containing protein  26.15 
 
 
208 aa  52.8  0.000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.238877  normal  0.26532 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0350  Sterol-binding domain protein  30.11 
 
 
220 aa  53.1  0.000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.502099 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4048  hypothetical protein  24.49 
 
 
214 aa  52.8  0.000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.601005 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0373  hypothetical protein  28.86 
 
 
223 aa  52  0.000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.443261 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0335  Sterol-binding domain protein  30.11 
 
 
220 aa  52.4  0.000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0401  hypothetical protein  20.67 
 
 
206 aa  52.4  0.000006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.71715  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0569  hypothetical protein  26.15 
 
 
208 aa  52  0.000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.441194  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2781  hypothetical protein  25.64 
 
 
208 aa  51.6  0.000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0555  hypothetical protein  24.87 
 
 
215 aa  51.2  0.00001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66910  hypothetical protein  27.6 
 
 
208 aa  50.8  0.00001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0669  hypothetical protein  25.98 
 
 
224 aa  50.1  0.00002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2431  hypothetical protein  26.79 
 
 
207 aa  49.7  0.00003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0712  hypothetical protein  25.12 
 
 
231 aa  50.1  0.00003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.502118  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0784  hypothetical protein  24.17 
 
 
240 aa  49.7  0.00003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2320  hypothetical protein  26.4 
 
 
215 aa  49.3  0.00004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2758  hypothetical protein  26.4 
 
 
215 aa  49.3  0.00004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0847  hypothetical protein  26.4 
 
 
215 aa  49.3  0.00004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.221821  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2400  hypothetical protein  26.4 
 
 
215 aa  49.3  0.00004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0322  hypothetical protein  20.81 
 
 
210 aa  48.5  0.00007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0685  hypothetical protein  26.4 
 
 
215 aa  48.5  0.00008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3959  hypothetical protein  26.44 
 
 
201 aa  48.5  0.00008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0768978 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5151  hypothetical protein  25.39 
 
 
207 aa  48.5  0.00008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0687  hypothetical protein  23.7 
 
 
231 aa  47.4  0.0002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0460  hypothetical protein  32.71 
 
 
203 aa  47.4  0.0002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1600  protein of unknown function DUF1243  25.13 
 
 
206 aa  46.2  0.0004  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3914  Sterol-binding domain protein  29.86 
 
 
202 aa  45.1  0.0008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0596  hypothetical protein  26.73 
 
 
216 aa  43.9  0.002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.307135  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2997  hypothetical protein  24.29 
 
 
207 aa  43.1  0.003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0989  hypothetical protein  23.91 
 
 
193 aa  42.4  0.005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1895  hypothetical protein  23.04 
 
 
206 aa  42  0.008  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.254922  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4202  hypothetical protein  25.73 
 
 
201 aa  41.6  0.008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4298  hypothetical protein  25.85 
 
 
201 aa  41.6  0.009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.115246  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>