More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_5724 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_5724  TIR protein  100 
 
 		 942 aa  1910    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00541848 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2692  heat shock protein 70  32.79 
 
 		 805 aa  318  2e-85  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.603716 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2480  protein of unknown function DUF323  51.33 
 
 		 584 aa  164  5.0000000000000005e-39  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6204  TIR protein  47.55 
 
 		 260 aa  164  7e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.396579  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3242  hypothetical protein  46.43 
 
 		 325 aa  152  2e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4818  TIR protein  42.86 
 
 		 327 aa  152  2e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0092  response regulator receiver protein  46.31 
 
 		 383 aa  152  4e-35  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.170556  n/a   
 
 
-
 
NC_007483  Noc_A0023  hypothetical protein  47.62 
 
 		 320 aa  148  4.0000000000000006e-34  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1783  TIR protein  42.36 
 
 		 316 aa  144  7e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2742  TIR protein  44.1 
 
 		 320 aa  144  9.999999999999999e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000609469  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2982  heat shock protein 70  25.67 
 
 		 812 aa  137  9.999999999999999e-31  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3816  hypothetical protein  45.86 
 
 		 135 aa  127  1e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000096587  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1920  TIR protein  38.1 
 
 		 250 aa  117  8.999999999999998e-25  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.417099 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1029  2-alkenal reductase  26.58 
 
 		 527 aa  115  3e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.777286  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1921  Toll-interleukin receptor  44.83 
 
 		 851 aa  113  2.0000000000000002e-23  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.504102  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0088  TIR protein  35.03 
 
 		 245 aa  111  8.000000000000001e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0832287  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3815  hypothetical protein  41.72 
 
 		 364 aa  110  9.000000000000001e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00546269  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2689  Heat shock protein 70  23.52 
 
 		 562 aa  94.7  6e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5406  TIR protein  32 
 
 		 249 aa  92.4  4e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1477  TIR protein  31.97 
 
 		 183 aa  89  4e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.475025  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1672  molecular chaperone DnaK  25.27 
 
 		 610 aa  83.2  0.00000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0554333  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1578  chaperone DnaK  24.26 
 
 		 610 aa  83.2  0.00000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1638  molecular chaperone DnaK  25.27 
 
 		 610 aa  83.2  0.00000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1148  molecular chaperone DnaK  25.41 
 
 		 609 aa  82.8  0.00000000000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2419  Heat shock protein 70  24.59 
 
 		 640 aa  82.4  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1625  hypothetical protein  33.88 
 
 		 290 aa  80.9  0.00000000000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3231  Fe-S protein assembly chaperone HscA  24.52 
 
 		 628 aa  79.7  0.0000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.124104 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0111  DnaK protein-like  24.64 
 
 		 531 aa  79.7  0.0000000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0754915  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0571  chaperone protein DnaK  24.36 
 
 		 651 aa  79  0.0000000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2079  molecular chaperone DnaK  25.42 
 
 		 612 aa  78.2  0.0000000000008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0440  chaperone protein DnaK  24.26 
 
 		 618 aa  77.8  0.0000000000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1348  chaperone protein DnaK  26.21 
 
 		 614 aa  77.8  0.0000000000009  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4769  heat shock protein Hsp70  24.96 
 
 		 565 aa  77  0.000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.137047 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0889  molecular chaperone DnaK  24.95 
 
 		 617 aa  76.6  0.000000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000150558  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0583  hypothetical protein  36.36 
 
 		 552 aa  76.6  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0566  hypothetical protein  36.36 
 
 		 552 aa  76.6  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0682  molecular chaperone DnaK  23.95 
 
 		 644 aa  76.6  0.000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  hitchhiker  0.00979445  normal  0.319162 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3632  2-alkenal reductase  22.92 
 
 		 832 aa  76.6  0.000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.914422  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0490  chaperone protein DnaK  23.21 
 
 		 623 aa  76.6  0.000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000032469  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1297  chaperone protein HscA  22.46 
 
 		 619 aa  76.6  0.000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0167807 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2437  molecular chaperone DnaK  23.11 
 
 		 609 aa  75.9  0.000000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0177515  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1209  molecular chaperone DnaK  24.76 
 
 		 596 aa  75.9  0.000000000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.0000000215559  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4793  chaperone protein DnaK  22.76 
 
 		 637 aa  75.9  0.000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.126797  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2904  heat shock protein DnaK  24.75 
 
 		 566 aa  75.5  0.000000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.660148  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1649  molecular chaperone DnaK  26.43 
 
 		 600 aa  75.5  0.000000000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.00000228474  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4180  molecular chaperone DnaK  23.82 
 
 		 723 aa  75.5  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.612258 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2977  chaperone protein hscC  24.75 
 
 		 566 aa  75.5  0.000000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.179124  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3202  chaperone protein hscC  24.75 
 
 		 566 aa  75.5  0.000000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.617528  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2588  heat shock protein 70  23.6 
 
 		 536 aa  75.5  0.000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0607  chaperone protein DnaK  25.14 
 
 		 605 aa  75.5  0.000000000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0585  molecular chaperone DnaK  25.63 
 
 		 612 aa  75.1  0.000000000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0310  molecular chaperone DnaK  22.71 
 
 		 644 aa  75.1  0.000000000006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1089  TIR protein  30.97 
 
 		 585 aa  75.1  0.000000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0814211  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1260  2-alkenal reductase  22.99 
 
 		 536 aa  74.7  0.000000000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1361  2-alkenal reductase  22.99 
 
 		 536 aa  74.7  0.000000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.99079  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0252  chaperone protein HscA  22.61 
 
 		 619 aa  74.3  0.000000000009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1750  molecular chaperone DnaK  23.15 
 
 		 690 aa  74.3  0.000000000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.190119  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0201  chaperone protein DnaK  23.03 
 
 		 621 aa  73.9  0.00000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  decreased coverage  0.00131999  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2013  chaperone protein DnaK  27.15 
 
 		 636 aa  73.9  0.00000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1013  molecular chaperone DnaK  23.4 
 
 		 607 aa  73.6  0.00000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4233  chaperone protein DnaK  22.3 
 
 		 623 aa  73.2  0.00000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.716333  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1313  molecular chaperone DnaK  26.18 
 
 		 630 aa  73.6  0.00000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.634921  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1128  molecular chaperone DnaK  26.04 
 
 		 596 aa  73.6  0.00000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38580  molecular chaperone DnaK  25.92 
 
 		 619 aa  73.6  0.00000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0179  heat shock protein 70  23.85 
 
 		 571 aa  73.2  0.00000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.633289  normal  0.123381 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0017  chaperone protein DnaK  25.3 
 
 		 607 aa  73.6  0.00000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0836411  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1309  molecular chaperone  24.13 
 
 		 617 aa  73.6  0.00000000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0486876  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3808  molecular chaperone DnaK  22.81 
 
 		 622 aa  73.2  0.00000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21861  molecular chaperone DnaK  26.18 
 
 		 630 aa  73.6  0.00000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.357564  normal  0.686332 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07165  molecular chaperone DnaK  22.8 
 
 		 636 aa  72.8  0.00000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.703004  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1322  molecular chaperone DnaK  25.1 
 
 		 608 aa  72.8  0.00000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0649  chaperone protein DnaK  24.08 
 
 		 628 aa  72.8  0.00000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04420  chaperone protein DnaK  24.1 
 
 		 619 aa  72.8  0.00000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.21875 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1996  chaperone protein DnaK  25.56 
 
 		 616 aa  72.8  0.00000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.278133  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1313  molecular chaperone DnaK  24.26 
 
 		 626 aa  72.8  0.00000000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  decreased coverage  0.0013795  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl415  molecular chaperone DnaK  23.62 
 
 		 592 aa  72.4  0.00000000004  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  0.847356  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1403  molecular chaperone DnaK  25.19 
 
 		 625 aa  72.4  0.00000000004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  unclonable  0.000000000203004  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1440  Fe-S protein assembly chaperone HscA  21.35 
 
 		 624 aa  72  0.00000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.241862  normal  0.0169038 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0558  molecular chaperone DnaK  24.71 
 
 		 596 aa  71.6  0.00000000006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.0000712029  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0544  molecular chaperone DnaK  24.71 
 
 		 596 aa  71.6  0.00000000006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000156043  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0163  molecular chaperone DnaK  23.02 
 
 		 607 aa  71.6  0.00000000006  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_18401  molecular chaperone DnaK  26.4 
 
 		 634 aa  71.6  0.00000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.188042  normal  0.971493 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2959  molecular chaperone DnaK  27.55 
 
 		 638 aa  71.2  0.00000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.548743 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3221  chaperone protein DnaK  23.86 
 
 		 613 aa  71.6  0.00000000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000155222  hitchhiker  0.000112809 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3040  molecular chaperone DnaK  24.19 
 
 		 611 aa  71.2  0.00000000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00371725  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0097  molecular chaperone DnaK  23.02 
 
 		 609 aa  71.2  0.00000000008  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0295  molecular chaperone DnaK  24.7 
 
 		 633 aa  71.2  0.00000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0369  molecular chaperone DnaK  24.4 
 
 		 591 aa  71.2  0.00000000008  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1166  chaperone protein DnaK  24.09 
 
 		 605 aa  71.2  0.00000000008  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0157  heat shock protein 70  23.06 
 
 		 533 aa  71.2  0.00000000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16221  HSP70 family molecular chaperone  23.74 
 
 		 522 aa  71.2  0.00000000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.477832  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0349  chaperone protein DnaK  24.5 
 
 		 619 aa  70.9  0.0000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.760609 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0378  molecular chaperone DnaK  24.94 
 
 		 653 aa  70.9  0.0000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0633  chaperone protein DnaK  23.95 
 
 		 639 aa  70.9  0.0000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.831647  normal  0.840068 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3734  chaperone protein DnaK  23.63 
 
 		 622 aa  70.5  0.0000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000103994 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1312  molecular chaperone DnaK  25.61 
 
 		 620 aa  70.9  0.0000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.975938  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4187  molecular chaperone DnaK  24.38 
 
 		 691 aa  70.9  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.793765  normal  0.583998 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1027  molecular chaperone DnaK  23.39 
 
 		 607 aa  70.5  0.0000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0288585  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1615  chaperone protein DnaK  26.37 
 
 		 633 aa  70.9  0.0000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.393444 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_28757  heat shock protein 70  21.57 
 
 		 946 aa  70.5  0.0000000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0849325  normal  0.596472 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>