143 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_5717 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013730  Slin_5717  NAD-dependent epimerase/dehydratase  100 
 
 
304 aa  631  1e-180  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0127633 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3985  NAD-dependent epimerase/dehydratase  50.51 
 
 
319 aa  302  5.000000000000001e-81  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.875328  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001158  NAD-dependent epimerase/dehydratase  47.83 
 
 
314 aa  291  8e-78  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1701  NAD-dependent epimerase/dehydratase  47.51 
 
 
307 aa  286  2e-76  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.517647  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0868  NAD-dependent epimerase/dehydratase  48.36 
 
 
311 aa  285  8e-76  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0837  NAD-dependent epimerase/dehydratase  48.03 
 
 
311 aa  281  1e-74  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3104  NAD-dependent epimerase/dehydratase  47.7 
 
 
311 aa  280  2e-74  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4306  NAD-dependent epimerase/dehydratase  47.19 
 
 
308 aa  272  6e-72  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.244764  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2822  NAD-dependent epimerase/dehydratase  48.49 
 
 
314 aa  271  1e-71  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0312  NAD-dependent epimerase/dehydratase  44.19 
 
 
312 aa  270  2e-71  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.716604  normal  0.0199185 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3195  NAD-dependent epimerase/dehydratase  41.53 
 
 
311 aa  261  6.999999999999999e-69  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.67739  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1297  saccharopine dehydrogenase related protein  42.76 
 
 
305 aa  261  8.999999999999999e-69  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0209  NAD-dependent epimerase/dehydratase  42.34 
 
 
307 aa  199  5e-50  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0178809  hitchhiker  0.0040496 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3981  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.35 
 
 
317 aa  175  7e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0549387 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3615  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.54 
 
 
315 aa  172  5e-42  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.036254  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2329  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.02 
 
 
318 aa  167  2.9999999999999998e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.51179  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1542  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.43 
 
 
300 aa  164  1.0000000000000001e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3201  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.33 
 
 
309 aa  148  1.0000000000000001e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1426  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.13 
 
 
316 aa  142  8e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1484  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.7 
 
 
319 aa  142  9e-33  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.357446  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0873  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.31 
 
 
316 aa  140  3e-32  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.765071  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4419  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.33 
 
 
321 aa  137  2e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2007  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.85 
 
 
317 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0894753  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2314  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.49 
 
 
307 aa  134  1.9999999999999998e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0046  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.29 
 
 
318 aa  132  9e-30  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.582921 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2321  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.93 
 
 
312 aa  129  5.0000000000000004e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1559  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.67 
 
 
312 aa  127  2.0000000000000002e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00329554  normal  0.0368212 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5393  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.48 
 
 
312 aa  126  6e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5665  NmrA-like protein/nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  29.07 
 
 
324 aa  123  3e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.783073 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2857  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.56 
 
 
304 aa  120  3e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0030  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.02 
 
 
329 aa  118  9.999999999999999e-26  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1823  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.62 
 
 
301 aa  117  1.9999999999999998e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0027  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.99 
 
 
329 aa  115  1.0000000000000001e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.535465  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0042  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.87 
 
 
329 aa  115  1.0000000000000001e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3451  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.54 
 
 
313 aa  112  1.0000000000000001e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00141609  hitchhiker  0.00437395 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1740  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.6 
 
 
332 aa  109  6e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.377476  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3608  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.27 
 
 
306 aa  107  2e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2985  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.13 
 
 
324 aa  107  2e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.927449  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6997  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.13 
 
 
304 aa  108  2e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4354  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.2 
 
 
321 aa  107  4e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5344  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.2 
 
 
352 aa  107  4e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1167  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.8 
 
 
309 aa  105  7e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.184838  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2286  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.79 
 
 
321 aa  105  8e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2497  putative sugar dehydratase/epimerase  29.96 
 
 
332 aa  103  3e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.96633  normal  0.814546 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1987  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.84 
 
 
328 aa  103  4e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1654  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.1 
 
 
326 aa  99.8  5e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.354617  normal  0.0815308 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1143  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.91 
 
 
325 aa  97.8  2e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.470047  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3627  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.28 
 
 
309 aa  95.1  1e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4635  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.29 
 
 
276 aa  94  3e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0341156  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0353  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.48 
 
 
344 aa  92.8  6e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.860754 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0510  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.3 
 
 
316 aa  81.6  0.00000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3811  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.48 
 
 
309 aa  81.6  0.00000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4766  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.36 
 
 
308 aa  81.3  0.00000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.504553  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2727  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.21 
 
 
340 aa  81.3  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.430894  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0922  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.7 
 
 
327 aa  77  0.0000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2988  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.48 
 
 
340 aa  76.3  0.0000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.865432  normal  0.0888549 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0189  hypothetical protein  28.16 
 
 
332 aa  75.1  0.000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0302861  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0998  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  28.16 
 
 
333 aa  75.1  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1362  hypothetical protein  28.16 
 
 
345 aa  75.1  0.000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.169729  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1558  hypothetical protein  28.16 
 
 
345 aa  75.1  0.000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2723  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  28.16 
 
 
345 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2579  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  28.16 
 
 
345 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.62087  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0217  hypothetical protein  28.16 
 
 
345 aa  75.1  0.000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.644245  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3529  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.84 
 
 
318 aa  75.5  0.000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.016337 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1458  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.14 
 
 
326 aa  74.3  0.000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.780601  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3203  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.52 
 
 
318 aa  71.6  0.00000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3578  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.36 
 
 
325 aa  68.9  0.00000000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4789  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.36 
 
 
325 aa  68.9  0.00000000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5493  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.36 
 
 
325 aa  68.9  0.00000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.299821 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0823  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.9 
 
 
340 aa  66.2  0.0000000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.895804 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3811  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.51 
 
 
336 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.316364  hitchhiker  0.00353615 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3335  hypothetical protein  24.84 
 
 
318 aa  62.4  0.000000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5995  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.75 
 
 
352 aa  62.8  0.000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0746307  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4014  oxidoreductase domain protein  28.07 
 
 
680 aa  62.4  0.00000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.876961 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3144  hypothetical protein  24.54 
 
 
370 aa  60.5  0.00000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.428885  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0650  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.45 
 
 
337 aa  60.5  0.00000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.349018  normal  0.530155 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1215  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.19 
 
 
329 aa  60.1  0.00000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.190053  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4696  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.25 
 
 
326 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.990453 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2011  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  22.63 
 
 
330 aa  57.8  0.0000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0984  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.57 
 
 
339 aa  58.2  0.0000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.550308  hitchhiker  0.00907782 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4174  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.58 
 
 
326 aa  55.5  0.000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.93932  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1329  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.4 
 
 
327 aa  54.3  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5771  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28 
 
 
338 aa  53.1  0.000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.783154  normal  0.678603 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1227  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25 
 
 
320 aa  53.5  0.000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0048  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.15 
 
 
335 aa  53.1  0.000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0854575 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0039  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.95 
 
 
335 aa  52.8  0.000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1168  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25 
 
 
320 aa  52.8  0.000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11950  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  25.13 
 
 
322 aa  51.6  0.00001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.274992  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2545  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  23.88 
 
 
375 aa  50.4  0.00003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2612  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  23.88 
 
 
375 aa  50.8  0.00003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13501  dTDP-glucose 4,6-dehydratase rmlB  26.41 
 
 
331 aa  50.8  0.00003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.281235  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08920  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  27.34 
 
 
331 aa  50.4  0.00004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0563626  normal  0.417608 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23000  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  29.46 
 
 
310 aa  50.4  0.00004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.109037  normal  0.0324264 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1848  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.69 
 
 
305 aa  49.7  0.00005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0595  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  24.87 
 
 
334 aa  50.1  0.00005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3050  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.19 
 
 
297 aa  49.7  0.00006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.861172  normal  0.107005 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3492  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.42 
 
 
335 aa  48.9  0.00009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.312033  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1745  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase family protein  24.93 
 
 
387 aa  48.9  0.0001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1372  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  23.62 
 
 
376 aa  48.9  0.0001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1198  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.88 
 
 
299 aa  48.9  0.0001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0547097  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>