89 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_3195 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009441  Fjoh_3195  NAD-dependent epimerase/dehydratase  100 
 
 		 311 aa  643    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.67739  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0312  NAD-dependent epimerase/dehydratase  79.48 
 
 		 312 aa  517  1e-146  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.716604  normal  0.0199185 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1701  NAD-dependent epimerase/dehydratase  57.52 
 
 		 307 aa  395  1e-109  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.517647  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1297  saccharopine dehydrogenase related protein  58.09 
 
 		 305 aa  386  1e-106  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4306  NAD-dependent epimerase/dehydratase  55.88 
 
 		 308 aa  377  1e-103  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.244764  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001158  NAD-dependent epimerase/dehydratase  55.37 
 
 		 314 aa  364  1e-99  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2822  NAD-dependent epimerase/dehydratase  53.9 
 
 		 314 aa  363  2e-99  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0868  NAD-dependent epimerase/dehydratase  52.92 
 
 		 311 aa  351  8e-96  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3104  NAD-dependent epimerase/dehydratase  52.6 
 
 		 311 aa  349  3e-95  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0837  NAD-dependent epimerase/dehydratase  52.27 
 
 		 311 aa  348  1e-94  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5717  NAD-dependent epimerase/dehydratase  41.53 
 
 		 304 aa  261  8e-69  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0127633 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3985  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.11 
 
 		 319 aa  190  2.9999999999999997e-47  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.875328  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0209  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.66 
 
 		 307 aa  143  4e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0178809  hitchhiker  0.0040496 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3615  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.47 
 
 		 315 aa  126  6e-28  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.036254  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4419  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.74 
 
 		 321 aa  123  4e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0046  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.89 
 
 		 318 aa  111  1.0000000000000001e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.582921 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1426  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.43 
 
 		 316 aa  109  7.000000000000001e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3981  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.21 
 
 		 317 aa  107  3e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0549387 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3201  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.65 
 
 		 309 aa  105  9e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1987  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.16 
 
 		 328 aa  101  1e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2007  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.82 
 
 		 317 aa  101  2e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0894753  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2329  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.17 
 
 		 318 aa  100  4e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.51179  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5393  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.89 
 
 		 312 aa  98.6  1e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1542  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.5 
 
 		 300 aa  98.2  2e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5665  NmrA-like protein/nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  25.65 
 
 		 324 aa  97.4  3e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.783073 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1484  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.03 
 
 		 319 aa  94.7  2e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.357446  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3203  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.66 
 
 		 318 aa  91.7  2e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3529  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.66 
 
 		 318 aa  89.7  5e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.016337 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2286  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.29 
 
 		 321 aa  84  0.000000000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1740  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.41 
 
 		 332 aa  84  0.000000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.377476  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0922  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.35 
 
 		 327 aa  82.8  0.000000000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0030  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.71 
 
 		 329 aa  81.3  0.00000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1559  NAD-dependent epimerase/dehydratase  22.65 
 
 		 312 aa  80.9  0.00000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00329554  normal  0.0368212 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0042  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.37 
 
 		 329 aa  80.5  0.00000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2988  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.07 
 
 		 340 aa  79  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.865432  normal  0.0888549 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0027  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.71 
 
 		 329 aa  78.6  0.0000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.535465  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2497  putative sugar dehydratase/epimerase  24.59 
 
 		 332 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.96633  normal  0.814546 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2727  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.07 
 
 		 340 aa  78.2  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.430894  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2857  NAD-dependent epimerase/dehydratase  22.18 
 
 		 304 aa  77.4  0.0000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2314  NAD-dependent epimerase/dehydratase  21.6 
 
 		 307 aa  77.4  0.0000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4789  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.2 
 
 		 325 aa  75.1  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3578  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.2 
 
 		 325 aa  75.1  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5493  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.2 
 
 		 325 aa  75.1  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.299821 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0998  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  24.81 
 
 		 333 aa  73.9  0.000000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1654  NAD-dependent epimerase/dehydratase  22.58 
 
 		 326 aa  71.6  0.00000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.354617  normal  0.0815308 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0189  hypothetical protein  25.19 
 
 		 332 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0302861  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0217  hypothetical protein  25.19 
 
 		 345 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.644245  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2579  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  25.19 
 
 		 345 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.62087  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2723  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  25.19 
 
 		 345 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1558  hypothetical protein  25.19 
 
 		 345 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1362  hypothetical protein  25.19 
 
 		 345 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.169729  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0510  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.63 
 
 		 316 aa  69.7  0.00000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1458  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.58 
 
 		 326 aa  69.7  0.00000000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.780601  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2985  NAD-dependent epimerase/dehydratase  21.45 
 
 		 324 aa  68.6  0.0000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.927449  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3811  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.94 
 
 		 336 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.316364  hitchhiker  0.00353615 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3811  NAD-dependent epimerase/dehydratase  22.54 
 
 		 309 aa  66.6  0.0000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0353  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.6 
 
 		 344 aa  66.6  0.0000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.860754 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6997  NAD-dependent epimerase/dehydratase  22.3 
 
 		 304 aa  65.9  0.0000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1143  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.18 
 
 		 325 aa  65.1  0.000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.470047  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3335  hypothetical protein  22.34 
 
 		 318 aa  64.3  0.000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3627  NAD-dependent epimerase/dehydratase  21.28 
 
 		 309 aa  63.5  0.000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4696  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.23 
 
 		 326 aa  63.2  0.000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.990453 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0650  NAD-dependent epimerase/dehydratase  22.58 
 
 		 337 aa  62.8  0.000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.349018  normal  0.530155 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3451  NAD-dependent epimerase/dehydratase  22.02 
 
 		 313 aa  62  0.00000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00141609  hitchhiker  0.00437395 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2321  NAD-dependent epimerase/dehydratase  19.03 
 
 		 312 aa  61.2  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4174  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.72 
 
 		 326 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.93932  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5344  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.39 
 
 		 352 aa  59.7  0.00000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0873  NAD-dependent epimerase/dehydratase  21.03 
 
 		 316 aa  59.7  0.00000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.765071  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4354  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.39 
 
 		 321 aa  59.7  0.00000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5995  NAD-dependent epimerase/dehydratase  22.94 
 
 		 352 aa  56.6  0.0000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0746307  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1167  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.67 
 
 		 309 aa  55.1  0.000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.184838  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4635  NAD-dependent epimerase/dehydratase  20.83 
 
 		 276 aa  54.7  0.000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0341156  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3678  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.89 
 
 		 329 aa  54.7  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4766  NAD-dependent epimerase/dehydratase  21.43 
 
 		 308 aa  52  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.504553  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02816  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.56 
 
 		 162 aa  52.4  0.00001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1848  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.31 
 
 		 305 aa  51.6  0.00002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3492  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.83 
 
 		 335 aa  51.6  0.00002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.312033  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3608  NAD-dependent epimerase/dehydratase  20 
 
 		 306 aa  49.3  0.00007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0148  NAD-dependent epimerase/dehydratase  22.29 
 
 		 317 aa  47.8  0.0002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1636  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.14 
 
 		 324 aa  47  0.0004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0710053 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2604  NAD-dependent epimerase/dehydratase  20.72 
 
 		 324 aa  46.2  0.0008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.118857 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0823  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.38 
 
 		 340 aa  45.8  0.001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.895804 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1823  NAD-dependent epimerase/dehydratase  21.8 
 
 		 301 aa  45.1  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1481  epimerase/dehydratase  22.93 
 
 		 332 aa  43.9  0.004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0984  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25 
 
 		 339 aa  43.5  0.004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.550308  hitchhiker  0.00907782 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2375  NAD-dependent epimerase/dehydratase  21.13 
 
 		 338 aa  43.5  0.004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2339  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.6 
 
 		 334 aa  43.1  0.005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0370756  normal  0.0889477 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4748  NAD-dependent epimerase/dehydratase  22.26 
 
 		 307 aa  43.5  0.005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000104829  normal  0.0341268 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0369  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.55 
 
 		 501 aa  42.4  0.01  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.770644  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>