125 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_0823 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_0823  NAD-dependent epimerase/dehydratase  100 
 
 		 340 aa  692    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.895804 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3335  hypothetical protein  61.01 
 
 		 318 aa  378  1e-104  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2727  NAD-dependent epimerase/dehydratase  55.31 
 
 		 340 aa  360  2e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.430894  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2988  NAD-dependent epimerase/dehydratase  54.83 
 
 		 340 aa  353  2.9999999999999997e-96  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.865432  normal  0.0888549 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3203  NAD-dependent epimerase/dehydratase  55.56 
 
 		 318 aa  348  5e-95  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3529  NAD-dependent epimerase/dehydratase  55.24 
 
 		 318 aa  348  9e-95  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.016337 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0650  NAD-dependent epimerase/dehydratase  58.14 
 
 		 337 aa  347  1e-94  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.349018  normal  0.530155 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0922  NAD-dependent epimerase/dehydratase  52.83 
 
 		 327 aa  342  7e-93  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1458  NAD-dependent epimerase/dehydratase  54.83 
 
 		 326 aa  337  1.9999999999999998e-91  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.780601  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4174  NAD-dependent epimerase/dehydratase  54.09 
 
 		 326 aa  333  2e-90  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.93932  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3578  NAD-dependent epimerase/dehydratase  54.4 
 
 		 325 aa  333  3e-90  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4789  NAD-dependent epimerase/dehydratase  54.4 
 
 		 325 aa  333  3e-90  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5493  NAD-dependent epimerase/dehydratase  54.4 
 
 		 325 aa  333  3e-90  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.299821 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4696  NAD-dependent epimerase/dehydratase  53.77 
 
 		 326 aa  333  4e-90  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.990453 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5995  NAD-dependent epimerase/dehydratase  54.89 
 
 		 352 aa  330  2e-89  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0746307  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3811  NAD-dependent epimerase/dehydratase  52.62 
 
 		 336 aa  327  1.0000000000000001e-88  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.316364  hitchhiker  0.00353615 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3144  hypothetical protein  52.92 
 
 		 370 aa  325  6e-88  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.428885  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0998  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  55.17 
 
 		 333 aa  321  9.000000000000001e-87  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1362  hypothetical protein  54.86 
 
 		 345 aa  317  1e-85  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.169729  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1558  hypothetical protein  54.86 
 
 		 345 aa  317  1e-85  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2723  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  54.86 
 
 		 345 aa  318  1e-85  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2579  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  54.86 
 
 		 345 aa  318  1e-85  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.62087  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0217  hypothetical protein  54.86 
 
 		 345 aa  317  1e-85  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.644245  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0189  hypothetical protein  54.86 
 
 		 332 aa  317  2e-85  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0302861  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0510  NAD-dependent epimerase/dehydratase  51.4 
 
 		 316 aa  298  9e-80  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1636  NAD-dependent epimerase/dehydratase  53.75 
 
 		 324 aa  287  2e-76  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0710053 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5771  NAD-dependent epimerase/dehydratase  51.7 
 
 		 338 aa  286  4e-76  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.783154  normal  0.678603 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3492  NAD-dependent epimerase/dehydratase  40.49 
 
 		 335 aa  206  3e-52  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.312033  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02816  NAD-dependent epimerase/dehydratase  54.6 
 
 		 162 aa  172  9e-42  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0126  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.14 
 
 		 287 aa  165  1.0000000000000001e-39  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1987  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.09 
 
 		 328 aa  97.1  5e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02815  NAD-dependent epimerase/dehydratase  44.25 
 
 		 122 aa  95.5  1e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5393  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.92 
 
 		 312 aa  94.7  2e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5665  NmrA-like protein/nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  28.66 
 
 		 324 aa  92.8  7e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.783073 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4419  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.35 
 
 		 321 aa  91.3  2e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1167  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.53 
 
 		 309 aa  87  4e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.184838  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2314  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.48 
 
 		 307 aa  85.1  0.000000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2321  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.31 
 
 		 312 aa  81.3  0.00000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3451  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.19 
 
 		 313 aa  81.3  0.00000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00141609  hitchhiker  0.00437395 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1426  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.22 
 
 		 316 aa  79.3  0.00000000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1143  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.51 
 
 		 325 aa  77.8  0.0000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.470047  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3608  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.75 
 
 		 306 aa  77.8  0.0000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2497  putative sugar dehydratase/epimerase  29.35 
 
 		 332 aa  77.8  0.0000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.96633  normal  0.814546 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1740  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.84 
 
 		 332 aa  77.8  0.0000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.377476  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0353  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.17 
 
 		 344 aa  77.4  0.0000000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.860754 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1654  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.72 
 
 		 326 aa  75.9  0.000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.354617  normal  0.0815308 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2286  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.13 
 
 		 321 aa  74.7  0.000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3201  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.53 
 
 		 309 aa  74.3  0.000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23000  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  29.82 
 
 		 310 aa  70.1  0.00000000006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.109037  normal  0.0324264 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3615  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.4 
 
 		 315 aa  67.8  0.0000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.036254  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5717  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.9 
 
 		 304 aa  66.2  0.0000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0127633 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1823  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.04 
 
 		 301 aa  66.2  0.0000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3981  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.66 
 
 		 317 aa  65.5  0.000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0549387 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2985  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.08 
 
 		 324 aa  63.9  0.000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.927449  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0873  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.13 
 
 		 316 aa  63.5  0.000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.765071  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3985  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.87 
 
 		 319 aa  63.2  0.000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.875328  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5344  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.77 
 
 		 352 aa  62.4  0.00000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4354  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.68 
 
 		 321 aa  61.6  0.00000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2007  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.38 
 
 		 317 aa  61.2  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0894753  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2329  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.62 
 
 		 318 aa  60.5  0.00000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.51179  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5980  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.43 
 
 		 292 aa  59.3  0.00000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.853501  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3627  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.43 
 
 		 309 aa  59.3  0.00000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2857  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.09 
 
 		 304 aa  59.3  0.0000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1484  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.05 
 
 		 319 aa  57.8  0.0000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.357446  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1819  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.85 
 
 		 343 aa  57  0.0000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000110086  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0042  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.24 
 
 		 329 aa  56.6  0.0000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4635  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.84 
 
 		 276 aa  56.6  0.0000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0341156  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0427  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.77 
 
 		 309 aa  56.2  0.0000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.159089  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1542  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.77 
 
 		 300 aa  56.2  0.0000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0030  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.24 
 
 		 329 aa  55.8  0.0000009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2822  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.06 
 
 		 314 aa  55.8  0.000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0027  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.94 
 
 		 329 aa  55.5  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.535465  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3811  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.99 
 
 		 309 aa  53.5  0.000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4766  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.03 
 
 		 308 aa  53.5  0.000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.504553  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4306  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.83 
 
 		 308 aa  53.5  0.000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.244764  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1215  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.84 
 
 		 329 aa  52.8  0.000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.190053  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1559  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.51 
 
 		 312 aa  52.8  0.000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00329554  normal  0.0368212 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2079  NmrA family protein  32.18 
 
 		 605 aa  52.4  0.00001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8881  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.85 
 
 		 341 aa  51.6  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.282171  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0046  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.71 
 
 		 318 aa  52  0.00002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.582921 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0338  UDP-glucose 4-epimerase  22.59 
 
 		 314 aa  51.2  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0206  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.81 
 
 		 352 aa  51.6  0.00002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2297  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.94 
 
 		 310 aa  50.8  0.00003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4319  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.32 
 
 		 329 aa  51.2  0.00003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1701  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.22 
 
 		 307 aa  50.4  0.00004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.517647  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0303  UDP-glucose 4-epimerase, putative  22.67 
 
 		 314 aa  50.1  0.00006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4923  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.95 
 
 		 325 aa  48.5  0.0001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0323  UDP-glucose 4-epimerase  22.3 
 
 		 315 aa  49.3  0.0001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.428855  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4540  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.95 
 
 		 325 aa  48.5  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.451447  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0864  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.4 
 
 		 328 aa  48.1  0.0002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4627  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.95 
 
 		 325 aa  48.5  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0308  UDP-glucose 4-epimerase  22.98 
 
 		 314 aa  48.1  0.0002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0058  dihydrokaempferol 4-reductase  27.22 
 
 		 333 aa  47.8  0.0003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1900  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.87 
 
 		 358 aa  47.8  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0547255  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0209  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.96 
 
 		 307 aa  47.4  0.0004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0178809  hitchhiker  0.0040496 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0825  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.52 
 
 		 347 aa  47.4  0.0004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.862979  normal  0.686614 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0257  NAD-dependent epimerase/dehydratase  21.74 
 
 		 315 aa  47.4  0.0004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2058  NmrA family protein  31.93 
 
 		 506 aa  46.6  0.0006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.584993  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1255  NAD-dependent epimerase/dehydratase:3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  27.11 
 
 		 325 aa  46.2  0.0007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.410518  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2392  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.84 
 
 		 316 aa  46.6  0.0007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.325743  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>