227 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_5995 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011894  Mnod_5995  NAD-dependent epimerase/dehydratase  100 
 
 
352 aa  684    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0746307  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5771  NAD-dependent epimerase/dehydratase  81.39 
 
 
338 aa  468  1.0000000000000001e-131  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.783154  normal  0.678603 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2727  NAD-dependent epimerase/dehydratase  61.51 
 
 
340 aa  384  1e-105  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.430894  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2988  NAD-dependent epimerase/dehydratase  59.81 
 
 
340 aa  372  1e-102  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.865432  normal  0.0888549 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3203  NAD-dependent epimerase/dehydratase  61.15 
 
 
318 aa  367  1e-100  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0922  NAD-dependent epimerase/dehydratase  61.32 
 
 
327 aa  366  1e-100  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3529  NAD-dependent epimerase/dehydratase  60.19 
 
 
318 aa  367  1e-100  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.016337 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3335  hypothetical protein  63.38 
 
 
318 aa  355  6.999999999999999e-97  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5493  NAD-dependent epimerase/dehydratase  59.94 
 
 
325 aa  343  2.9999999999999997e-93  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.299821 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3578  NAD-dependent epimerase/dehydratase  59.94 
 
 
325 aa  343  2.9999999999999997e-93  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4789  NAD-dependent epimerase/dehydratase  59.94 
 
 
325 aa  343  2.9999999999999997e-93  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4696  NAD-dependent epimerase/dehydratase  59.31 
 
 
326 aa  341  1e-92  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.990453 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4174  NAD-dependent epimerase/dehydratase  59.62 
 
 
326 aa  341  1e-92  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.93932  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0823  NAD-dependent epimerase/dehydratase  54.89 
 
 
340 aa  338  8e-92  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.895804 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3811  NAD-dependent epimerase/dehydratase  58.73 
 
 
336 aa  336  3.9999999999999995e-91  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.316364  hitchhiker  0.00353615 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0510  NAD-dependent epimerase/dehydratase  57.19 
 
 
316 aa  333  2e-90  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0998  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  59.63 
 
 
333 aa  305  5.0000000000000004e-82  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3144  hypothetical protein  52.4 
 
 
370 aa  306  5.0000000000000004e-82  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.428885  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2723  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  59.38 
 
 
345 aa  305  5.0000000000000004e-82  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2579  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  59.38 
 
 
345 aa  305  5.0000000000000004e-82  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.62087  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0189  hypothetical protein  59.38 
 
 
332 aa  305  9.000000000000001e-82  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0302861  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1362  hypothetical protein  59.38 
 
 
345 aa  305  9.000000000000001e-82  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.169729  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1558  hypothetical protein  59.38 
 
 
345 aa  305  9.000000000000001e-82  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0217  hypothetical protein  59.38 
 
 
345 aa  305  9.000000000000001e-82  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.644245  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1458  NAD-dependent epimerase/dehydratase  50.46 
 
 
326 aa  303  3.0000000000000004e-81  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.780601  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0650  NAD-dependent epimerase/dehydratase  56.48 
 
 
337 aa  303  4.0000000000000003e-81  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.349018  normal  0.530155 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1636  NAD-dependent epimerase/dehydratase  52.49 
 
 
324 aa  247  2e-64  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0710053 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3492  NAD-dependent epimerase/dehydratase  44.28 
 
 
335 aa  223  3e-57  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.312033  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02816  NAD-dependent epimerase/dehydratase  61.11 
 
 
162 aa  182  6e-45  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0126  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.25 
 
 
287 aa  154  2e-36  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02815  NAD-dependent epimerase/dehydratase  53.72 
 
 
122 aa  118  9.999999999999999e-26  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2321  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.92 
 
 
312 aa  112  1.0000000000000001e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0027  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.84 
 
 
329 aa  105  1e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.535465  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1987  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.65 
 
 
328 aa  105  1e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5393  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.24 
 
 
312 aa  105  1e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0042  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.45 
 
 
329 aa  104  3e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4419  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.83 
 
 
321 aa  101  2e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0030  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.78 
 
 
329 aa  100  3e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5665  NmrA-like protein/nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  29.41 
 
 
324 aa  98.2  2e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.783073 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1559  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.44 
 
 
312 aa  97.8  2e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00329554  normal  0.0368212 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2286  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.98 
 
 
321 aa  98.2  2e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0046  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37 
 
 
318 aa  97.8  3e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.582921 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2314  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.9 
 
 
307 aa  96.3  8e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3451  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.85 
 
 
313 aa  95.1  2e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00141609  hitchhiker  0.00437395 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1740  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.17 
 
 
332 aa  94  3e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.377476  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3201  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.57 
 
 
309 aa  94.4  3e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0353  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.7 
 
 
344 aa  93.6  5e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.860754 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2497  putative sugar dehydratase/epimerase  32.17 
 
 
332 aa  92  1e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.96633  normal  0.814546 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3981  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.27 
 
 
317 aa  90.5  4e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0549387 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3608  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.74 
 
 
306 aa  89.7  6e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3615  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.33 
 
 
315 aa  89.4  9e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.036254  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2329  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.38 
 
 
318 aa  89.4  1e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.51179  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2857  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.48 
 
 
304 aa  89  1e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1167  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.74 
 
 
309 aa  85.9  9e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.184838  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1654  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.85 
 
 
326 aa  82.4  0.00000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.354617  normal  0.0815308 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1426  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.46 
 
 
316 aa  82  0.00000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4635  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.78 
 
 
276 aa  82  0.00000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0341156  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0873  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.72 
 
 
316 aa  80.5  0.00000000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.765071  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2985  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.74 
 
 
324 aa  79.3  0.00000000000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.927449  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5344  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.75 
 
 
352 aa  74.7  0.000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1542  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.79 
 
 
300 aa  74.7  0.000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4354  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.75 
 
 
321 aa  73.9  0.000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4766  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.38 
 
 
308 aa  72.4  0.00000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.504553  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5717  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.75 
 
 
304 aa  70.1  0.00000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0127633 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3627  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.27 
 
 
309 aa  69.7  0.00000000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6997  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.68 
 
 
304 aa  69.3  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3811  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.34 
 
 
309 aa  68.9  0.0000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1823  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.8 
 
 
301 aa  69.3  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3985  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.12 
 
 
319 aa  67.8  0.0000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.875328  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1701  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.61 
 
 
307 aa  67.4  0.0000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.517647  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1143  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.3 
 
 
325 aa  67  0.0000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.470047  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3195  NAD-dependent epimerase/dehydratase  22.94 
 
 
311 aa  64.7  0.000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.67739  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1215  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.66 
 
 
329 aa  64.3  0.000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.190053  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1783  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.98 
 
 
334 aa  63.2  0.000000007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.81312  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3445  glutamine amidotransferase  30.23 
 
 
332 aa  62.8  0.000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.210367 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4306  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.88 
 
 
308 aa  61.6  0.00000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.244764  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2007  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.06 
 
 
317 aa  60.8  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0894753  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02116  NAD dependent epimerase/dehydratase, putative (AFU_orthologue; AFUA_7G00180)  28.17 
 
 
316 aa  59.7  0.00000007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.218731  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001158  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.27 
 
 
314 aa  59.7  0.00000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1391  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.62 
 
 
314 aa  59.3  0.00000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2822  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.99 
 
 
314 aa  59.3  0.0000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2851  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.42 
 
 
311 aa  58.9  0.0000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0058  dihydrokaempferol 4-reductase  36.14 
 
 
333 aa  58.5  0.0000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23000  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  30.72 
 
 
310 aa  58.2  0.0000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.109037  normal  0.0324264 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2297  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.38 
 
 
310 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1484  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.6 
 
 
319 aa  56.6  0.0000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.357446  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6636  NmrA family protein  53.16 
 
 
297 aa  55.5  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1900  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.54 
 
 
358 aa  55.5  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0547255  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1255  NAD-dependent epimerase/dehydratase:3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  26.87 
 
 
325 aa  55.1  0.000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.410518  normal 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3989  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32 
 
 
332 aa  55.5  0.000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4126  hopanoid-associated sugar epimerase  33.33 
 
 
336 aa  54.3  0.000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1432  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.43 
 
 
328 aa  54.3  0.000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0864  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.9 
 
 
328 aa  53.9  0.000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0312  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.62 
 
 
312 aa  53.1  0.000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.716604  normal  0.0199185 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0109  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.71 
 
 
335 aa  53.5  0.000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4873  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.71 
 
 
335 aa  53.5  0.000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5549  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.71 
 
 
335 aa  53.5  0.000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.482021  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0209  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.66 
 
 
307 aa  53.5  0.000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0178809  hitchhiker  0.0040496 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0433  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.03 
 
 
333 aa  53.5  0.000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4723  hopanoid-associated sugar epimerase  33.71 
 
 
335 aa  53.5  0.000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>