94 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_4635 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_4635  NAD-dependent epimerase/dehydratase  100 
 
 		 276 aa  528  1e-149  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0341156  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2314  NAD-dependent epimerase/dehydratase  44.92 
 
 		 307 aa  228  1e-58  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1167  NAD-dependent epimerase/dehydratase  46.86 
 
 		 309 aa  220  1.9999999999999999e-56  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.184838  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2321  NAD-dependent epimerase/dehydratase  45.03 
 
 		 312 aa  217  1e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3608  NAD-dependent epimerase/dehydratase  44.85 
 
 		 306 aa  217  1e-55  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3451  NAD-dependent epimerase/dehydratase  44.37 
 
 		 313 aa  214  9.999999999999999e-55  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00141609  hitchhiker  0.00437395 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0873  NAD-dependent epimerase/dehydratase  44.44 
 
 		 316 aa  199  5e-50  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.765071  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1823  NAD-dependent epimerase/dehydratase  41.14 
 
 		 301 aa  198  1.0000000000000001e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1143  NAD-dependent epimerase/dehydratase  41.37 
 
 		 325 aa  192  5e-48  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.470047  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2857  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.57 
 
 		 304 aa  181  1e-44  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5344  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.76 
 
 		 352 aa  177  2e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4354  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.76 
 
 		 321 aa  177  2e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2985  NAD-dependent epimerase/dehydratase  40.58 
 
 		 324 aa  176  3e-43  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.927449  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4766  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.62 
 
 		 308 aa  169  5e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.504553  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1426  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.99 
 
 		 316 aa  156  3e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2329  NAD-dependent epimerase/dehydratase  39.26 
 
 		 318 aa  155  5.0000000000000005e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.51179  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3201  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.34 
 
 		 309 aa  154  1e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3615  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.64 
 
 		 315 aa  152  4e-36  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.036254  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4419  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.54 
 
 		 321 aa  145  8.000000000000001e-34  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3981  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.67 
 
 		 317 aa  143  2e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0549387 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3811  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.3 
 
 		 309 aa  142  5e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1542  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.95 
 
 		 300 aa  139  7e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0027  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.79 
 
 		 329 aa  135  5e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.535465  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6997  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.21 
 
 		 304 aa  130  2.0000000000000002e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2007  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.74 
 
 		 317 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0894753  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0042  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.27 
 
 		 329 aa  125  6e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0030  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.71 
 
 		 329 aa  125  8.000000000000001e-28  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3627  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33 
 
 		 309 aa  124  1e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1559  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.89 
 
 		 312 aa  122  4e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00329554  normal  0.0368212 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0046  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.83 
 
 		 318 aa  115  1.0000000000000001e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.582921 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0209  NAD-dependent epimerase/dehydratase  41.06 
 
 		 307 aa  113  3e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0178809  hitchhiker  0.0040496 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1484  NAD-dependent epimerase/dehydratase  40.95 
 
 		 319 aa  105  6e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.357446  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3985  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.73 
 
 		 319 aa  100  2e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.875328  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1987  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.33 
 
 		 328 aa  97.1  3e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5717  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.76 
 
 		 304 aa  96.7  4e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0127633 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1740  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.68 
 
 		 332 aa  92.4  6e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.377476  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5665  NmrA-like protein/nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  32.12 
 
 		 324 aa  92  9e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.783073 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2497  putative sugar dehydratase/epimerase  30.88 
 
 		 332 aa  90.1  4e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.96633  normal  0.814546 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5995  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.28 
 
 		 352 aa  87  3e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0746307  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1654  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.99 
 
 		 326 aa  84  0.000000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.354617  normal  0.0815308 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3104  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.3 
 
 		 311 aa  80.1  0.00000000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0868  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.3 
 
 		 311 aa  79  0.00000000000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2286  NAD-dependent epimerase/dehydratase  22.94 
 
 		 321 aa  77.8  0.0000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3203  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.89 
 
 		 318 aa  77.4  0.0000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3529  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.25 
 
 		 318 aa  77.8  0.0000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.016337 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0837  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.43 
 
 		 311 aa  75.9  0.0000000000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0353  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.19 
 
 		 344 aa  75.9  0.0000000000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.860754 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4306  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.58 
 
 		 308 aa  75.9  0.0000000000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.244764  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1458  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.57 
 
 		 326 aa  75.5  0.000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.780601  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0510  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.29 
 
 		 316 aa  74.3  0.000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1701  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.96 
 
 		 307 aa  72.8  0.000000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.517647  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2727  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.88 
 
 		 340 aa  72.8  0.000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.430894  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4174  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.71 
 
 		 326 aa  70.1  0.00000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.93932  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23000  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  31.09 
 
 		 310 aa  70.1  0.00000000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.109037  normal  0.0324264 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3144  hypothetical protein  29.96 
 
 		 370 aa  68.6  0.0000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.428885  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2822  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.43 
 
 		 314 aa  67.4  0.0000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5393  NAD-dependent epimerase/dehydratase  22.12 
 
 		 312 aa  67  0.0000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3335  hypothetical protein  31.53 
 
 		 318 aa  67.4  0.0000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3492  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.19 
 
 		 335 aa  66.6  0.0000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.312033  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4696  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.39 
 
 		 326 aa  66.6  0.0000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.990453 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001158  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.88 
 
 		 314 aa  65.9  0.0000000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2988  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.18 
 
 		 340 aa  66.2  0.0000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.865432  normal  0.0888549 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5771  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.27 
 
 		 338 aa  65.5  0.000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.783154  normal  0.678603 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0312  NAD-dependent epimerase/dehydratase  22.17 
 
 		 312 aa  62.4  0.000000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.716604  normal  0.0199185 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0650  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.45 
 
 		 337 aa  62  0.00000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.349018  normal  0.530155 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0823  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.89 
 
 		 340 aa  61.2  0.00000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.895804 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3811  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.24 
 
 		 336 aa  59.3  0.00000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.316364  hitchhiker  0.00353615 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11950  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  30.18 
 
 		 322 aa  58.9  0.00000009  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.274992  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0922  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.19 
 
 		 327 aa  57  0.0000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0998  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  30.74 
 
 		 333 aa  56.6  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0189  hypothetical protein  30.74 
 
 		 332 aa  56.6  0.0000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0302861  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1362  hypothetical protein  30.74 
 
 		 345 aa  57  0.0000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.169729  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1558  hypothetical protein  30.74 
 
 		 345 aa  57  0.0000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2723  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  30.74 
 
 		 345 aa  57  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2579  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  30.74 
 
 		 345 aa  57  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.62087  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0217  hypothetical protein  30.74 
 
 		 345 aa  57  0.0000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.644245  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4789  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.92 
 
 		 325 aa  56.2  0.0000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3578  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.92 
 
 		 325 aa  56.2  0.0000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5493  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.92 
 
 		 325 aa  56.2  0.0000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.299821 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3195  NAD-dependent epimerase/dehydratase  20.1 
 
 		 311 aa  55.5  0.000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.67739  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2573  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.45 
 
 		 287 aa  55.1  0.000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0478  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  29.24 
 
 		 320 aa  52.4  0.000007  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  unclonable  0.00000000000851226  decreased coverage  0.0000000042699 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2799  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  26.15 
 
 		 336 aa  50.4  0.00003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0141685  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0126  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.55 
 
 		 287 aa  49.3  0.00007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1636  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.83 
 
 		 324 aa  49.3  0.00008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0710053 
 
 
-
 
NC_004310  BR0715  epimerase/dehydratase family protein, putative  30.8 
 
 		 289 aa  48.1  0.0001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.186861  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2291  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.58 
 
 		 318 aa  46.6  0.0004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.334485  normal  0.485366 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4398  NAD-dependent epimerase/dehydratase  39.81 
 
 		 337 aa  43.9  0.003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2774  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.06 
 
 		 330 aa  43.5  0.003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.746716  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3084  NAD-dependent epimerase/dehydratase  20.81 
 
 		 343 aa  43.9  0.003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.213871 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1297  saccharopine dehydrogenase related protein  17.09 
 
 		 305 aa  43.1  0.004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0706  putative epimerase/dehydratase family protein  28.92 
 
 		 290 aa  43.1  0.006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1577  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.35 
 
 		 330 aa  42.7  0.007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.46913  normal  0.0352982 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2995  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.86 
 
 		 313 aa  42.4  0.009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.376158  normal  0.0242286 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>