29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_02815 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010717  PXO_02815  NAD-dependent epimerase/dehydratase  100 
 
 		 122 aa  241  1.9999999999999999e-63  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0922  NAD-dependent epimerase/dehydratase  55.75 
 
 		 327 aa  127  4.0000000000000003e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4174  NAD-dependent epimerase/dehydratase  55.75 
 
 		 326 aa  127  4.0000000000000003e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.93932  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4696  NAD-dependent epimerase/dehydratase  54.87 
 
 		 326 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.990453 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3811  NAD-dependent epimerase/dehydratase  53.04 
 
 		 336 aa  122  1e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.316364  hitchhiker  0.00353615 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3335  hypothetical protein  57.14 
 
 		 318 aa  121  3e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3578  NAD-dependent epimerase/dehydratase  52.21 
 
 		 325 aa  121  4e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4789  NAD-dependent epimerase/dehydratase  52.21 
 
 		 325 aa  121  4e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5493  NAD-dependent epimerase/dehydratase  52.21 
 
 		 325 aa  121  4e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.299821 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2727  NAD-dependent epimerase/dehydratase  50 
 
 		 340 aa  120  7e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.430894  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3203  NAD-dependent epimerase/dehydratase  54.46 
 
 		 318 aa  120  8e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5995  NAD-dependent epimerase/dehydratase  53.72 
 
 		 352 aa  118  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0746307  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3529  NAD-dependent epimerase/dehydratase  52.68 
 
 		 318 aa  117  3.9999999999999996e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.016337 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2988  NAD-dependent epimerase/dehydratase  50 
 
 		 340 aa  116  9.999999999999999e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.865432  normal  0.0888549 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0217  hypothetical protein  53.98 
 
 		 345 aa  115  3e-25  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.644245  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0189  hypothetical protein  53.98 
 
 		 332 aa  115  3e-25  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0302861  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0998  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  53.98 
 
 		 333 aa  115  3e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1362  hypothetical protein  53.98 
 
 		 345 aa  115  3e-25  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.169729  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1558  hypothetical protein  53.98 
 
 		 345 aa  115  3e-25  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2723  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  53.98 
 
 		 345 aa  115  3e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2579  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  53.98 
 
 		 345 aa  115  3e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.62087  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3144  hypothetical protein  47.83 
 
 		 370 aa  107  4.0000000000000004e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.428885  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1458  NAD-dependent epimerase/dehydratase  44.74 
 
 		 326 aa  101  4e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.780601  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5771  NAD-dependent epimerase/dehydratase  50.89 
 
 		 338 aa  99.8  1e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.783154  normal  0.678603 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0510  NAD-dependent epimerase/dehydratase  50.47 
 
 		 316 aa  98.6  2e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0823  NAD-dependent epimerase/dehydratase  44.25 
 
 		 340 aa  95.5  2e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.895804 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0650  NAD-dependent epimerase/dehydratase  43.9 
 
 		 337 aa  82.8  0.000000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.349018  normal  0.530155 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3492  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.97 
 
 		 335 aa  60.8  0.000000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.312033  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1636  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.39 
 
 		 324 aa  54.7  0.0000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0710053 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>