102 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_4766 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_4766  NAD-dependent epimerase/dehydratase  100 
 
 
308 aa  620  1e-177  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.504553  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5344  NAD-dependent epimerase/dehydratase  57.05 
 
 
352 aa  319  3e-86  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4354  NAD-dependent epimerase/dehydratase  57.05 
 
 
321 aa  319  3.9999999999999996e-86  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2857  NAD-dependent epimerase/dehydratase  55.88 
 
 
304 aa  296  2e-79  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0873  NAD-dependent epimerase/dehydratase  52.63 
 
 
316 aa  285  5e-76  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.765071  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6997  NAD-dependent epimerase/dehydratase  50.51 
 
 
304 aa  273  2.0000000000000002e-72  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1823  NAD-dependent epimerase/dehydratase  47.14 
 
 
301 aa  248  6e-65  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2321  NAD-dependent epimerase/dehydratase  44.04 
 
 
312 aa  239  2.9999999999999997e-62  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2314  NAD-dependent epimerase/dehydratase  42.07 
 
 
307 aa  230  2e-59  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1167  NAD-dependent epimerase/dehydratase  48.84 
 
 
309 aa  224  1e-57  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.184838  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3451  NAD-dependent epimerase/dehydratase  41.88 
 
 
313 aa  199  3.9999999999999996e-50  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00141609  hitchhiker  0.00437395 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3608  NAD-dependent epimerase/dehydratase  39.67 
 
 
306 aa  185  7e-46  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2985  NAD-dependent epimerase/dehydratase  40.46 
 
 
324 aa  179  7e-44  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.927449  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3201  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.12 
 
 
309 aa  172  5e-42  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4635  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.91 
 
 
276 aa  169  6e-41  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0341156  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3981  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33 
 
 
317 aa  163  4.0000000000000004e-39  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0549387 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2329  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.39 
 
 
318 aa  162  8.000000000000001e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.51179  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1143  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.22 
 
 
325 aa  156  5.0000000000000005e-37  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.470047  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1426  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.67 
 
 
316 aa  155  1e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1542  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33 
 
 
300 aa  140  1.9999999999999998e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3615  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.01 
 
 
315 aa  132  1.0000000000000001e-29  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.036254  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0027  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.77 
 
 
329 aa  122  9e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.535465  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3627  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.57 
 
 
309 aa  122  9e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1559  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32 
 
 
312 aa  122  9.999999999999999e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00329554  normal  0.0368212 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0042  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.24 
 
 
329 aa  120  3e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0030  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.24 
 
 
329 aa  120  3.9999999999999996e-26  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4419  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.59 
 
 
321 aa  120  3.9999999999999996e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3811  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.33 
 
 
309 aa  114  2.0000000000000002e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3985  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.33 
 
 
319 aa  110  4.0000000000000004e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.875328  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0046  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.23 
 
 
318 aa  103  4e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.582921 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0209  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.26 
 
 
307 aa  99  8e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0178809  hitchhiker  0.0040496 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1484  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.95 
 
 
319 aa  94.7  2e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.357446  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5717  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.36 
 
 
304 aa  93.2  5e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0127633 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2007  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.08 
 
 
317 aa  88.2  2e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0894753  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2727  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.16 
 
 
340 aa  87.4  3e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.430894  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2286  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.51 
 
 
321 aa  85.5  0.000000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1476  hypothetical protein  97.62 
 
 
42 aa  84.7  0.000000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.2864  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5393  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.53 
 
 
312 aa  82  0.00000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4306  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.32 
 
 
308 aa  81.6  0.00000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.244764  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0510  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.97 
 
 
316 aa  81.3  0.00000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2988  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.3 
 
 
340 aa  79.7  0.00000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.865432  normal  0.0888549 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2497  putative sugar dehydratase/epimerase  25.46 
 
 
332 aa  79  0.00000000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.96633  normal  0.814546 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1987  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.37 
 
 
328 aa  78.6  0.0000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0922  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.39 
 
 
327 aa  77.4  0.0000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1740  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.31 
 
 
332 aa  77.4  0.0000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.377476  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5995  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.07 
 
 
352 aa  76.3  0.0000000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0746307  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5665  NmrA-like protein/nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  27.59 
 
 
324 aa  75.9  0.0000000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.783073 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2822  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.01 
 
 
314 aa  74.3  0.000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0998  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  31.13 
 
 
333 aa  73.6  0.000000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0650  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.21 
 
 
337 aa  73.2  0.000000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.349018  normal  0.530155 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0189  hypothetical protein  31.35 
 
 
332 aa  72.8  0.000000000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0302861  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1362  hypothetical protein  31.35 
 
 
345 aa  72.8  0.000000000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.169729  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1558  hypothetical protein  31.35 
 
 
345 aa  72.8  0.000000000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0217  hypothetical protein  31.35 
 
 
345 aa  72.8  0.000000000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.644245  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2723  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  31.35 
 
 
345 aa  72.4  0.000000000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2579  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  31.35 
 
 
345 aa  72.4  0.000000000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.62087  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3144  hypothetical protein  25.65 
 
 
370 aa  72.4  0.00000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.428885  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4174  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.97 
 
 
326 aa  70.5  0.00000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.93932  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1701  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.7 
 
 
307 aa  70.5  0.00000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.517647  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1654  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.91 
 
 
326 aa  69.7  0.00000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.354617  normal  0.0815308 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3529  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.88 
 
 
318 aa  70.1  0.00000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.016337 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3203  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.21 
 
 
318 aa  69.7  0.00000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0126  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.22 
 
 
287 aa  69.3  0.00000000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0353  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.92 
 
 
344 aa  68.6  0.0000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.860754 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3811  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.68 
 
 
336 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.316364  hitchhiker  0.00353615 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0868  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.11 
 
 
311 aa  68.2  0.0000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3104  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.11 
 
 
311 aa  67.4  0.0000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4696  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.35 
 
 
326 aa  66.6  0.0000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.990453 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0312  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.24 
 
 
312 aa  65.5  0.000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.716604  normal  0.0199185 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001158  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.55 
 
 
314 aa  65.1  0.000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3335  hypothetical protein  27.41 
 
 
318 aa  65.1  0.000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3578  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.34 
 
 
325 aa  63.9  0.000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4789  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.34 
 
 
325 aa  63.9  0.000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5493  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.34 
 
 
325 aa  63.9  0.000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.299821 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0823  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.58 
 
 
340 aa  62.8  0.000000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.895804 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1636  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.62 
 
 
324 aa  63.2  0.000000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0710053 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0837  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.34 
 
 
311 aa  62.4  0.000000009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23000  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  27.42 
 
 
310 aa  62  0.00000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.109037  normal  0.0324264 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5771  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31 
 
 
338 aa  61.2  0.00000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.783154  normal  0.678603 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1458  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.58 
 
 
326 aa  60.8  0.00000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.780601  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3492  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.9 
 
 
335 aa  57.8  0.0000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.312033  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1297  saccharopine dehydrogenase related protein  24.81 
 
 
305 aa  57.4  0.0000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0031  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.21 
 
 
308 aa  53.1  0.000006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.891219  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3195  NAD-dependent epimerase/dehydratase  21.29 
 
 
311 aa  53.1  0.000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.67739  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1215  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.85 
 
 
329 aa  52.8  0.000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.190053  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1962  NAD-dependent epimerase/dehydratase  22.08 
 
 
326 aa  49.7  0.00007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1587  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.3 
 
 
310 aa  48.9  0.0001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0750302  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1826  mRNA-binding protein  25.69 
 
 
313 aa  48.1  0.0002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.334449 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11950  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  26.32 
 
 
322 aa  47.4  0.0003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.274992  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3558  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.45 
 
 
334 aa  47  0.0004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1226  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.85 
 
 
354 aa  46.2  0.0007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.873323  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1168  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.18 
 
 
320 aa  45.1  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0918  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.09 
 
 
330 aa  43.9  0.003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3737  NADH dehydrogenase  24.6 
 
 
317 aa  44.3  0.003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.288709  normal  0.886457 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1329  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.28 
 
 
327 aa  43.9  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0536  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.36 
 
 
310 aa  43.5  0.004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1577  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.12 
 
 
330 aa  43.5  0.004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.46913  normal  0.0352982 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0169  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase (UDP-glucose 4-epimerase)  23.4 
 
 
319 aa  43.1  0.005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1227  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.28 
 
 
320 aa  43.1  0.005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1490  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.75 
 
 
336 aa  43.1  0.005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>