195 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A2cp1_0042 on replicon NC_011891
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011891  A2cp1_0042  NAD-dependent epimerase/dehydratase  100 
 
 
329 aa  632  1e-180  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0030  NAD-dependent epimerase/dehydratase  96.96 
 
 
329 aa  543  1e-153  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0027  NAD-dependent epimerase/dehydratase  93.19 
 
 
329 aa  536  1e-151  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.535465  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4419  NAD-dependent epimerase/dehydratase  57.48 
 
 
321 aa  330  3e-89  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1426  NAD-dependent epimerase/dehydratase  40.07 
 
 
316 aa  218  1e-55  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0046  NAD-dependent epimerase/dehydratase  48.59 
 
 
318 aa  206  5e-52  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.582921 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3201  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.2 
 
 
309 aa  205  7e-52  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3981  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.84 
 
 
317 aa  205  1e-51  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0549387 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2321  NAD-dependent epimerase/dehydratase  40.2 
 
 
312 aa  203  3e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2314  NAD-dependent epimerase/dehydratase  41.12 
 
 
307 aa  196  3e-49  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1167  NAD-dependent epimerase/dehydratase  41.86 
 
 
309 aa  175  9.999999999999999e-43  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.184838  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1542  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.87 
 
 
300 aa  172  5.999999999999999e-42  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3608  NAD-dependent epimerase/dehydratase  39.47 
 
 
306 aa  172  6.999999999999999e-42  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2329  NAD-dependent epimerase/dehydratase  39 
 
 
318 aa  167  2.9999999999999998e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.51179  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2857  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.49 
 
 
304 aa  167  2.9999999999999998e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2985  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.36 
 
 
324 aa  166  5e-40  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.927449  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3615  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.74 
 
 
315 aa  164  3e-39  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.036254  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3985  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.41 
 
 
319 aa  154  1e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.875328  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3451  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.73 
 
 
313 aa  152  5e-36  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00141609  hitchhiker  0.00437395 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5717  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.87 
 
 
304 aa  151  1e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0127633 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1143  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.1 
 
 
325 aa  150  3e-35  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.470047  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0873  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.93 
 
 
316 aa  149  6e-35  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.765071  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4635  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.58 
 
 
276 aa  145  1e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0341156  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5344  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.13 
 
 
352 aa  142  6e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4354  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.13 
 
 
321 aa  142  7e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1559  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.91 
 
 
312 aa  138  2e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00329554  normal  0.0368212 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0209  NAD-dependent epimerase/dehydratase  39.74 
 
 
307 aa  138  2e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0178809  hitchhiker  0.0040496 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4766  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.88 
 
 
308 aa  134  3e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.504553  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2007  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.6 
 
 
317 aa  132  7.999999999999999e-30  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0894753  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3627  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.18 
 
 
309 aa  132  9e-30  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1823  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.11 
 
 
301 aa  128  1.0000000000000001e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2822  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.67 
 
 
314 aa  128  1.0000000000000001e-28  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3529  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.21 
 
 
318 aa  124  2e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.016337 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3203  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.21 
 
 
318 aa  122  7e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5771  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.76 
 
 
338 aa  120  3e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.783154  normal  0.678603 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5995  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.6 
 
 
352 aa  119  4.9999999999999996e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0746307  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6997  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.43 
 
 
304 aa  119  7e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3811  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.84 
 
 
336 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.316364  hitchhiker  0.00353615 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5665  NmrA-like protein/nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  33.12 
 
 
324 aa  117  1.9999999999999998e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.783073 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1701  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.79 
 
 
307 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.517647  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1458  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.25 
 
 
326 aa  115  7.999999999999999e-25  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.780601  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0922  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.26 
 
 
327 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3578  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.66 
 
 
325 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4789  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.66 
 
 
325 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2727  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.45 
 
 
340 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.430894  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5493  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.66 
 
 
325 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.299821 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001158  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.65 
 
 
314 aa  113  5e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3811  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.44 
 
 
309 aa  112  6e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1484  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.46 
 
 
319 aa  112  7.000000000000001e-24  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.357446  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2988  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.17 
 
 
340 aa  112  1.0000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.865432  normal  0.0888549 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4174  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.33 
 
 
326 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.93932  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0189  hypothetical protein  32.23 
 
 
332 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0302861  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1362  hypothetical protein  32.23 
 
 
345 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.169729  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1558  hypothetical protein  32.23 
 
 
345 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2723  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  32.23 
 
 
345 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2579  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  32.23 
 
 
345 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.62087  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0217  hypothetical protein  32.23 
 
 
345 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.644245  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4696  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.48 
 
 
326 aa  110  3e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.990453 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3104  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.55 
 
 
311 aa  109  5e-23  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0868  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.55 
 
 
311 aa  109  7.000000000000001e-23  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1987  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.11 
 
 
328 aa  108  9.000000000000001e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0353  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.43 
 
 
344 aa  107  2e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.860754 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3335  hypothetical protein  32.69 
 
 
318 aa  107  3e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0998  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  32.12 
 
 
333 aa  106  4e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1297  saccharopine dehydrogenase related protein  23.26 
 
 
305 aa  106  5e-22  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0312  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.77 
 
 
312 aa  105  8e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.716604  normal  0.0199185 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0650  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.38 
 
 
337 aa  105  1e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.349018  normal  0.530155 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0837  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.27 
 
 
311 aa  105  1e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4306  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.42 
 
 
308 aa  105  2e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.244764  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0510  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.87 
 
 
316 aa  103  6e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3144  hypothetical protein  29.19 
 
 
370 aa  98.6  1e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.428885  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3195  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.37 
 
 
311 aa  96.7  5e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.67739  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1654  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.09 
 
 
326 aa  95.9  8e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.354617  normal  0.0815308 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1740  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.16 
 
 
332 aa  94.4  2e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.377476  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2286  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.03 
 
 
321 aa  92.8  7e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5393  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.26 
 
 
312 aa  90.1  4e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23000  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  32.99 
 
 
310 aa  90.1  4e-17  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.109037  normal  0.0324264 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2497  putative sugar dehydratase/epimerase  31.16 
 
 
332 aa  87.8  2e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.96633  normal  0.814546 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0823  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.25 
 
 
340 aa  82  0.00000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.895804 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3492  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.94 
 
 
335 aa  79.7  0.00000000000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.312033  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1636  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.5 
 
 
324 aa  78.2  0.0000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0710053 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2851  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.87 
 
 
311 aa  75.5  0.000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11950  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  35.27 
 
 
322 aa  73.6  0.000000000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.274992  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02816  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.08 
 
 
162 aa  73.6  0.000000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3117  NAD-dependent epimerase/dehydratase  22.83 
 
 
326 aa  62.4  0.000000009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1168  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.94 
 
 
320 aa  62.4  0.00000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2973  NAD-dependent epimerase/dehydratase  22.83 
 
 
326 aa  62.4  0.00000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3445  glutamine amidotransferase  30.41 
 
 
332 aa  61.2  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.210367 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1227  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.69 
 
 
320 aa  60.8  0.00000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1329  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.31 
 
 
327 aa  59.7  0.00000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1685  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.89 
 
 
309 aa  58.5  0.0000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3108  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.12 
 
 
328 aa  57.4  0.0000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0340  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.06 
 
 
299 aa  57.4  0.0000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0126  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.21 
 
 
287 aa  57  0.0000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2297  NAD-dependent epimerase/dehydratase  21.13 
 
 
310 aa  56.6  0.0000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3558  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.28 
 
 
334 aa  54.7  0.000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2404  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.36 
 
 
307 aa  55.1  0.000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1178  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.62 
 
 
317 aa  54.7  0.000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0253268  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1075  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.28 
 
 
327 aa  54.7  0.000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3989  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.31 
 
 
332 aa  53.5  0.000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>