239 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_1654 on replicon NC_010622
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010622  Bphy_1654  NAD-dependent epimerase/dehydratase  100 
 
 
326 aa  653    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.354617  normal  0.0815308 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1740  NAD-dependent epimerase/dehydratase  69.13 
 
 
332 aa  445  1.0000000000000001e-124  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.377476  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2497  putative sugar dehydratase/epimerase  70.36 
 
 
332 aa  440  9.999999999999999e-123  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.96633  normal  0.814546 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5665  NmrA-like protein/nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  59.63 
 
 
324 aa  391  1e-107  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.783073 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1987  NAD-dependent epimerase/dehydratase  60.44 
 
 
328 aa  385  1e-106  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0353  NAD-dependent epimerase/dehydratase  55.59 
 
 
344 aa  342  5e-93  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.860754 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2286  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.1 
 
 
321 aa  149  8e-35  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5393  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.86 
 
 
312 aa  144  1e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1426  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.03 
 
 
316 aa  122  9e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3981  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.7 
 
 
317 aa  112  7.000000000000001e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0549387 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1542  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.25 
 
 
300 aa  110  3e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3615  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.57 
 
 
315 aa  110  4.0000000000000004e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.036254  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3201  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.29 
 
 
309 aa  108  1e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3985  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.45 
 
 
319 aa  107  2e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.875328  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2329  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.97 
 
 
318 aa  105  1e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.51179  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5717  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.01 
 
 
304 aa  103  5e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0127633 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4419  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.35 
 
 
321 aa  102  7e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3578  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.58 
 
 
325 aa  94.7  2e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4789  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.58 
 
 
325 aa  94.7  2e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5493  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.58 
 
 
325 aa  94.7  2e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.299821 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0046  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.58 
 
 
318 aa  94  4e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.582921 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3203  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.44 
 
 
318 aa  93.6  4e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1484  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.61 
 
 
319 aa  92.4  1e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.357446  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1701  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.54 
 
 
307 aa  91.7  1e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.517647  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0510  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.71 
 
 
316 aa  92  1e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0922  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.15 
 
 
327 aa  91.3  2e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0209  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.37 
 
 
307 aa  89.7  6e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0178809  hitchhiker  0.0040496 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2727  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.57 
 
 
340 aa  89.4  8e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.430894  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3335  hypothetical protein  29.65 
 
 
318 aa  89.4  9e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2007  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.91 
 
 
317 aa  89  1e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0894753  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2988  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.34 
 
 
340 aa  87  4e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.865432  normal  0.0888549 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3811  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.24 
 
 
336 aa  86.7  5e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.316364  hitchhiker  0.00353615 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3529  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.5 
 
 
318 aa  86.3  6e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.016337 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4696  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.27 
 
 
326 aa  86.3  7e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.990453 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0042  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.93 
 
 
329 aa  85.5  0.000000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1167  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.55 
 
 
309 aa  84.7  0.000000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.184838  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3144  hypothetical protein  27.5 
 
 
370 aa  84  0.000000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.428885  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4174  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.76 
 
 
326 aa  83.6  0.000000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.93932  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4635  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.05 
 
 
276 aa  83.6  0.000000000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0341156  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0823  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.48 
 
 
340 aa  82.8  0.000000000000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.895804 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2321  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.64 
 
 
312 aa  80.5  0.00000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5771  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.45 
 
 
338 aa  79.7  0.00000000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.783154  normal  0.678603 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0030  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.52 
 
 
329 aa  79.3  0.00000000000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1458  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.48 
 
 
326 aa  78.6  0.0000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.780601  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5995  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.51 
 
 
352 aa  78.6  0.0000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0746307  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0650  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.04 
 
 
337 aa  78.6  0.0000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.349018  normal  0.530155 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2314  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.83 
 
 
307 aa  78.2  0.0000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0027  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.42 
 
 
329 aa  77.8  0.0000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.535465  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0873  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.1 
 
 
316 aa  77.4  0.0000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.765071  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0998  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  28.35 
 
 
333 aa  76.3  0.0000000000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2822  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.78 
 
 
314 aa  76.3  0.0000000000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3104  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.82 
 
 
311 aa  76.3  0.0000000000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2857  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.26 
 
 
304 aa  75.9  0.0000000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001158  NAD-dependent epimerase/dehydratase  22.9 
 
 
314 aa  75.5  0.000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0312  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.3 
 
 
312 aa  75.9  0.000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.716604  normal  0.0199185 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0837  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.69 
 
 
311 aa  75.5  0.000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0189  hypothetical protein  28.68 
 
 
332 aa  75.1  0.000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0302861  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0868  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.45 
 
 
311 aa  74.3  0.000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1362  hypothetical protein  28.68 
 
 
345 aa  75.1  0.000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.169729  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1558  hypothetical protein  28.68 
 
 
345 aa  75.1  0.000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2723  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  28.68 
 
 
345 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2579  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  28.68 
 
 
345 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.62087  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0217  hypothetical protein  28.68 
 
 
345 aa  75.1  0.000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.644245  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3811  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.11 
 
 
309 aa  73.9  0.000000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2985  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.75 
 
 
324 aa  73.6  0.000000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.927449  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3627  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.12 
 
 
309 aa  73.9  0.000000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5344  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.9 
 
 
352 aa  72.8  0.000000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4354  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.9 
 
 
321 aa  72.4  0.000000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3451  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.76 
 
 
313 aa  72  0.00000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00141609  hitchhiker  0.00437395 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3195  NAD-dependent epimerase/dehydratase  21.29 
 
 
311 aa  71.6  0.00000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.67739  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1559  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.5 
 
 
312 aa  70.9  0.00000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00329554  normal  0.0368212 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3608  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.33 
 
 
306 aa  68.9  0.0000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4766  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.98 
 
 
308 aa  63.5  0.000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.504553  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0376  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.89 
 
 
307 aa  62  0.00000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3445  glutamine amidotransferase  26.25 
 
 
332 aa  62.4  0.00000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.210367 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4319  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.19 
 
 
329 aa  60.8  0.00000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4078  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.72 
 
 
328 aa  60.5  0.00000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.347226 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1957  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.27 
 
 
375 aa  60.8  0.00000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.688935  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3492  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.19 
 
 
335 aa  60.1  0.00000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.312033  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1297  saccharopine dehydrogenase related protein  22.57 
 
 
305 aa  60.1  0.00000005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1143  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.08 
 
 
325 aa  59.7  0.00000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.470047  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0427  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  28.29 
 
 
305 aa  58.9  0.0000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0126  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.44 
 
 
287 aa  58.5  0.0000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4306  NAD-dependent epimerase/dehydratase  22.35 
 
 
308 aa  57.4  0.0000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.244764  normal 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3989  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.94 
 
 
332 aa  57.8  0.0000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0935  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.29 
 
 
288 aa  57.4  0.0000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1075  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.89 
 
 
327 aa  56.6  0.0000006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0167  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.7 
 
 
328 aa  56.6  0.0000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2037  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.22 
 
 
299 aa  55.5  0.000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1823  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.08 
 
 
301 aa  55.5  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1432  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.21 
 
 
328 aa  55.5  0.000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2851  NAD-dependent epimerase/dehydratase  21.54 
 
 
311 aa  54.7  0.000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0997  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.86 
 
 
306 aa  54.7  0.000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1685  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.95 
 
 
309 aa  54.7  0.000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5461  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.6 
 
 
330 aa  54.3  0.000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5613  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.27 
 
 
89 aa  54.3  0.000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12401  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  20.67 
 
 
333 aa  53.1  0.000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.509931  hitchhiker  0.00693738 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5423  UDP-glucose 4-epimerase  38.36 
 
 
328 aa  53.1  0.000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0946684  normal  0.770282 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1582  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.08 
 
 
303 aa  52.8  0.000008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2411  UDP-galactose 4-epimerase  34.33 
 
 
333 aa  52.8  0.000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.016358  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>