100 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_001158 on replicon NC_013457
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013457  VEA_001158  NAD-dependent epimerase/dehydratase  100 
 
 		 314 aa  655    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0868  NAD-dependent epimerase/dehydratase  74.84 
 
 		 311 aa  491  9.999999999999999e-139  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0837  NAD-dependent epimerase/dehydratase  74.51 
 
 		 311 aa  487  1e-136  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3104  NAD-dependent epimerase/dehydratase  73.86 
 
 		 311 aa  486  1e-136  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2822  NAD-dependent epimerase/dehydratase  60.26 
 
 		 314 aa  395  1e-109  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1701  NAD-dependent epimerase/dehydratase  58.82 
 
 		 307 aa  386  1e-106  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.517647  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4306  NAD-dependent epimerase/dehydratase  56.49 
 
 		 308 aa  370  1e-101  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.244764  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1297  saccharopine dehydrogenase related protein  54.79 
 
 		 305 aa  365  1e-100  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3195  NAD-dependent epimerase/dehydratase  55.37 
 
 		 311 aa  364  1e-99  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.67739  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0312  NAD-dependent epimerase/dehydratase  54.49 
 
 		 312 aa  361  9e-99  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.716604  normal  0.0199185 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5717  NAD-dependent epimerase/dehydratase  47.83 
 
 		 304 aa  291  9e-78  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0127633 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3985  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.13 
 
 		 319 aa  219  7e-56  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.875328  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0209  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.36 
 
 		 307 aa  149  8e-35  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0178809  hitchhiker  0.0040496 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3615  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.56 
 
 		 315 aa  140  3e-32  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.036254  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4419  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.94 
 
 		 321 aa  129  4.0000000000000003e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2329  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.27 
 
 		 318 aa  128  2.0000000000000002e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.51179  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3981  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.03 
 
 		 317 aa  125  1e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0549387 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3201  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.14 
 
 		 309 aa  123  4e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1484  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.96 
 
 		 319 aa  120  3e-26  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.357446  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0046  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.07 
 
 		 318 aa  117  3e-25  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.582921 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2007  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.57 
 
 		 317 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0894753  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1426  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.03 
 
 		 316 aa  112  6e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1542  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.38 
 
 		 300 aa  112  1.0000000000000001e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1987  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.71 
 
 		 328 aa  107  2e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2314  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.72 
 
 		 307 aa  107  3e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5665  NmrA-like protein/nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  28.78 
 
 		 324 aa  106  7e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.783073 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5393  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.97 
 
 		 312 aa  103  3e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1559  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.21 
 
 		 312 aa  103  5e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00329554  normal  0.0368212 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2321  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.12 
 
 		 312 aa  93.6  4e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2857  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.38 
 
 		 304 aa  92.8  8e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0030  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.99 
 
 		 329 aa  92.4  8e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1740  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.15 
 
 		 332 aa  92  1e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.377476  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0042  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.65 
 
 		 329 aa  91.3  2e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1143  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.27 
 
 		 325 aa  89.4  7e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.470047  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0027  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.99 
 
 		 329 aa  89.4  8e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.535465  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6997  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.63 
 
 		 304 aa  87.8  2e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1167  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.66 
 
 		 309 aa  87.8  2e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.184838  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2286  NAD-dependent epimerase/dehydratase  22.4 
 
 		 321 aa  86.7  5e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3451  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.52 
 
 		 313 aa  85.5  0.000000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00141609  hitchhiker  0.00437395 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2985  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.74 
 
 		 324 aa  84.3  0.000000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.927449  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2497  putative sugar dehydratase/epimerase  25.42 
 
 		 332 aa  82.8  0.000000000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.96633  normal  0.814546 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0922  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.16 
 
 		 327 aa  82.8  0.000000000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3608  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.01 
 
 		 306 aa  80.1  0.00000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0873  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.26 
 
 		 316 aa  76.3  0.0000000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.765071  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0510  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.61 
 
 		 316 aa  75.9  0.0000000000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0353  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.39 
 
 		 344 aa  75.9  0.0000000000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.860754 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1654  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.45 
 
 		 326 aa  73.9  0.000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.354617  normal  0.0815308 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3811  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.11 
 
 		 309 aa  72.4  0.00000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5344  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.07 
 
 		 352 aa  70.9  0.00000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1458  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.3 
 
 		 326 aa  70.9  0.00000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.780601  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4354  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.18 
 
 		 321 aa  70.5  0.00000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3627  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.62 
 
 		 309 aa  64.7  0.000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2727  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.1 
 
 		 340 aa  64.3  0.000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.430894  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3811  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.72 
 
 		 336 aa  63.5  0.000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.316364  hitchhiker  0.00353615 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4635  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.08 
 
 		 276 aa  63.2  0.000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0341156  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4789  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.91 
 
 		 325 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3578  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.91 
 
 		 325 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5493  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.91 
 
 		 325 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.299821 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4696  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.36 
 
 		 326 aa  60.5  0.00000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.990453 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1558  hypothetical protein  24.68 
 
 		 345 aa  60.8  0.00000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2723  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  24.68 
 
 		 345 aa  60.8  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0189  hypothetical protein  24.68 
 
 		 332 aa  60.5  0.00000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0302861  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2579  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  24.68 
 
 		 345 aa  60.8  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.62087  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1362  hypothetical protein  24.68 
 
 		 345 aa  60.8  0.00000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.169729  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0217  hypothetical protein  24.68 
 
 		 345 aa  60.8  0.00000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.644245  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0998  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  24.68 
 
 		 333 aa  60.5  0.00000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1823  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.41 
 
 		 301 aa  59.7  0.00000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2988  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.19 
 
 		 340 aa  58.5  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.865432  normal  0.0888549 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4766  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.23 
 
 		 308 aa  57.4  0.0000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.504553  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3529  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.44 
 
 		 318 aa  56.2  0.0000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.016337 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4174  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.36 
 
 		 326 aa  54.3  0.000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.93932  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5601  oxidoreductase domain protein  25.72 
 
 		 746 aa  54.3  0.000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5771  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.79 
 
 		 338 aa  53.9  0.000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.783154  normal  0.678603 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3203  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.86 
 
 		 318 aa  53.5  0.000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4014  oxidoreductase domain protein  26.4 
 
 		 680 aa  52.8  0.000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.876961 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02816  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.08 
 
 		 162 aa  50.4  0.00004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0827  hypothetical protein  22.61 
 
 		 318 aa  50.1  0.00005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2134  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.2 
 
 		 329 aa  48.9  0.0001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5995  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.27 
 
 		 352 aa  48.5  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0746307  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1895  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.42 
 
 		 311 aa  48.1  0.0002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2017  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  30.09 
 
 		 196 aa  47.8  0.0002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000204131  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2851  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.86 
 
 		 311 aa  47.8  0.0003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4804  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.78 
 
 		 333 aa  46.6  0.0005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0311388  normal  0.870429 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0823  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.38 
 
 		 340 aa  46.2  0.0008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.895804 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0427  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.12 
 
 		 309 aa  45.8  0.0009  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.159089  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3678  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.46 
 
 		 329 aa  45.4  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0230  ADP-L-glycero-D-manno-heptose-6-epimerase  23.5 
 
 		 310 aa  45.4  0.001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000382346  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1227  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.11 
 
 		 320 aa  44.7  0.002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1329  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.11 
 
 		 327 aa  45.1  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2604  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.91 
 
 		 324 aa  44.3  0.003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.118857 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6615  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.55 
 
 		 320 aa  43.9  0.004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.04011 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1135  NAD-dependent epimerase/dehydratase  21.93 
 
 		 324 aa  43.5  0.004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.721722  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1168  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.08 
 
 		 320 aa  43.5  0.004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2375  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.87 
 
 		 338 aa  43.9  0.004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0148  NAD-dependent epimerase/dehydratase  22.48 
 
 		 317 aa  43.5  0.005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2339  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.48 
 
 		 334 aa  43.5  0.005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0370756  normal  0.0889477 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1490  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.97 
 
 		 336 aa  42.7  0.007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1215  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.01 
 
 		 329 aa  42.7  0.007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.190053  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0477  hypothetical protein  36 
 
 		 305 aa  42.7  0.008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1271  NAD-dependent epimerase/dehydratase  21.77 
 
 		 370 aa  42.4  0.009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.247545 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>