118 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_2985 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008699  Noca_2985  NAD-dependent epimerase/dehydratase  100 
 
 
324 aa  639    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.927449  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3451  NAD-dependent epimerase/dehydratase  57 
 
 
313 aa  330  2e-89  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00141609  hitchhiker  0.00437395 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3608  NAD-dependent epimerase/dehydratase  50.98 
 
 
306 aa  288  8e-77  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2314  NAD-dependent epimerase/dehydratase  52 
 
 
307 aa  271  8.000000000000001e-72  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0873  NAD-dependent epimerase/dehydratase  49.37 
 
 
316 aa  253  3e-66  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.765071  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2321  NAD-dependent epimerase/dehydratase  48.84 
 
 
312 aa  236  3e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1167  NAD-dependent epimerase/dehydratase  50 
 
 
309 aa  225  8e-58  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.184838  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1823  NAD-dependent epimerase/dehydratase  46.98 
 
 
301 aa  224  2e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2857  NAD-dependent epimerase/dehydratase  41.34 
 
 
304 aa  215  8e-55  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1143  NAD-dependent epimerase/dehydratase  40.82 
 
 
325 aa  187  3e-46  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.470047  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3201  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.29 
 
 
309 aa  186  7e-46  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3627  NAD-dependent epimerase/dehydratase  43.32 
 
 
309 aa  177  3e-43  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3981  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.91 
 
 
317 aa  175  9.999999999999999e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0549387 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5344  NAD-dependent epimerase/dehydratase  39.32 
 
 
352 aa  175  9.999999999999999e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4354  NAD-dependent epimerase/dehydratase  40.58 
 
 
321 aa  174  1.9999999999999998e-42  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4635  NAD-dependent epimerase/dehydratase  40.26 
 
 
276 aa  173  2.9999999999999996e-42  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0341156  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6997  NAD-dependent epimerase/dehydratase  41.18 
 
 
304 aa  171  1e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4766  NAD-dependent epimerase/dehydratase  40.46 
 
 
308 aa  166  4e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.504553  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3811  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.69 
 
 
309 aa  165  1.0000000000000001e-39  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3615  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.54 
 
 
315 aa  165  1.0000000000000001e-39  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.036254  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2329  NAD-dependent epimerase/dehydratase  39.04 
 
 
318 aa  164  2.0000000000000002e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.51179  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1426  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.22 
 
 
316 aa  157  2e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1542  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.42 
 
 
300 aa  155  6e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0027  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.12 
 
 
329 aa  151  1e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.535465  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4419  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.77 
 
 
321 aa  146  4.0000000000000006e-34  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0042  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.97 
 
 
329 aa  144  2e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0030  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.97 
 
 
329 aa  142  6e-33  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1559  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.46 
 
 
312 aa  131  2.0000000000000002e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00329554  normal  0.0368212 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0046  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.25 
 
 
318 aa  120  1.9999999999999998e-26  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.582921 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3985  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.33 
 
 
319 aa  119  7e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.875328  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5717  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.16 
 
 
304 aa  114  2.0000000000000002e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0127633 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1484  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.68 
 
 
319 aa  110  3e-23  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.357446  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2007  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.03 
 
 
317 aa  110  4.0000000000000004e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0894753  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1987  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.4 
 
 
328 aa  104  2e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0209  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.91 
 
 
307 aa  103  5e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0178809  hitchhiker  0.0040496 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5665  NmrA-like protein/nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  28.53 
 
 
324 aa  100  4e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.783073 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001158  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.59 
 
 
314 aa  93.6  5e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0868  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.62 
 
 
311 aa  92.4  1e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0837  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.87 
 
 
311 aa  91.3  2e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3104  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.62 
 
 
311 aa  90.9  3e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2497  putative sugar dehydratase/epimerase  29.03 
 
 
332 aa  86.3  6e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.96633  normal  0.814546 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0312  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.22 
 
 
312 aa  85.9  9e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.716604  normal  0.0199185 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1740  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.49 
 
 
332 aa  85.1  0.000000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.377476  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1458  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.12 
 
 
326 aa  84  0.000000000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.780601  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11950  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  29.66 
 
 
322 aa  79.7  0.00000000000006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.274992  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23000  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  30.77 
 
 
310 aa  77.8  0.0000000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.109037  normal  0.0324264 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3529  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.03 
 
 
318 aa  77.8  0.0000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.016337 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2727  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.85 
 
 
340 aa  77.4  0.0000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.430894  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2822  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.17 
 
 
314 aa  77.8  0.0000000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5995  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.15 
 
 
352 aa  77  0.0000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0746307  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5771  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.84 
 
 
338 aa  76.6  0.0000000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.783154  normal  0.678603 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1701  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.03 
 
 
307 aa  75.1  0.000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.517647  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3203  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.43 
 
 
318 aa  75.1  0.000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1654  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.75 
 
 
326 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.354617  normal  0.0815308 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3195  NAD-dependent epimerase/dehydratase  22.76 
 
 
311 aa  72.8  0.000000000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.67739  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0189  hypothetical protein  28.24 
 
 
332 aa  72  0.00000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0302861  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0998  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  28.24 
 
 
333 aa  72.4  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1362  hypothetical protein  28.24 
 
 
345 aa  72  0.00000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.169729  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1558  hypothetical protein  28.24 
 
 
345 aa  72  0.00000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2723  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  28.24 
 
 
345 aa  72  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2579  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  28.24 
 
 
345 aa  72  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.62087  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0217  hypothetical protein  28.24 
 
 
345 aa  72  0.00000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.644245  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2988  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.3 
 
 
340 aa  70.9  0.00000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.865432  normal  0.0888549 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4306  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.62 
 
 
308 aa  69.7  0.00000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.244764  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3811  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.72 
 
 
336 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.316364  hitchhiker  0.00353615 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3335  hypothetical protein  27.3 
 
 
318 aa  67.8  0.0000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0823  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.43 
 
 
340 aa  65.9  0.0000000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.895804 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0353  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.82 
 
 
344 aa  65.5  0.000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.860754 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3578  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.5 
 
 
325 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1297  saccharopine dehydrogenase related protein  20.98 
 
 
305 aa  64.7  0.000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4789  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.5 
 
 
325 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5493  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.5 
 
 
325 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.299821 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4696  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.49 
 
 
326 aa  64.3  0.000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.990453 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4174  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.82 
 
 
326 aa  63.5  0.000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.93932  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0510  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.57 
 
 
316 aa  63.9  0.000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0922  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.4 
 
 
327 aa  63.2  0.000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3144  hypothetical protein  25 
 
 
370 aa  61.6  0.00000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.428885  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0650  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.82 
 
 
337 aa  55.5  0.000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.349018  normal  0.530155 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2653  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  26.8 
 
 
360 aa  50.1  0.00005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0031  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.67 
 
 
308 aa  50.1  0.00006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.891219  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1636  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.6 
 
 
324 aa  49.7  0.00007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0710053 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2222  dTDP-glucose 4,6 dehydratase  28.68 
 
 
361 aa  48.5  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0048625  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3122  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  26.7 
 
 
364 aa  47.4  0.0003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1075  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.75 
 
 
327 aa  47.4  0.0004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0126  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.8 
 
 
287 aa  46.6  0.0005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2573  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.97 
 
 
287 aa  47  0.0005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1962  NAD-dependent epimerase/dehydratase  20.07 
 
 
326 aa  45.1  0.001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0837  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  30.07 
 
 
361 aa  45.8  0.001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.378615  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6506  UDP-glucose 4-epimerase  28.9 
 
 
326 aa  45.1  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2279  dTDP-glucose 4,6 dehydratase  27.94 
 
 
361 aa  45.8  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000000978054 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2323  dTDP-glucose 4,6 dehydratase  27.94 
 
 
361 aa  45.8  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00762462 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2330  dTDP-glucose 4,6 dehydratase  27.94 
 
 
361 aa  45.8  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.129575 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2437  dTDP-glucose 4,6 dehydratase  27.94 
 
 
361 aa  45.8  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000861453 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2064  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase (UDP-glucose 4-epimerase)  32.28 
 
 
327 aa  44.7  0.002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1848  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.57 
 
 
305 aa  45.1  0.002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2286  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.68 
 
 
311 aa  44.7  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.366265  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0476  ADP-L-glycero-D-mannoheptose-6-epimerase  24.18 
 
 
317 aa  45.1  0.002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1937  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.21 
 
 
311 aa  45.1  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01947  dTDP-glucose 4,6 dehydratase, NAD(P)-binding  26.72 
 
 
361 aa  44.3  0.003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01936  hypothetical protein  26.72 
 
 
361 aa  44.3  0.003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>