289 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_2314 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_2314  NAD-dependent epimerase/dehydratase  100 
 
 
307 aa  624  1e-178  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2321  NAD-dependent epimerase/dehydratase  67.32 
 
 
312 aa  433  1e-120  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1167  NAD-dependent epimerase/dehydratase  57.65 
 
 
309 aa  320  1.9999999999999998e-86  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.184838  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0873  NAD-dependent epimerase/dehydratase  49.84 
 
 
316 aa  278  6e-74  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.765071  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1823  NAD-dependent epimerase/dehydratase  49.84 
 
 
301 aa  266  2.9999999999999995e-70  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2857  NAD-dependent epimerase/dehydratase  46.85 
 
 
304 aa  262  4.999999999999999e-69  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2985  NAD-dependent epimerase/dehydratase  52 
 
 
324 aa  259  3e-68  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.927449  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3608  NAD-dependent epimerase/dehydratase  44.33 
 
 
306 aa  238  1e-61  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3451  NAD-dependent epimerase/dehydratase  43.18 
 
 
313 aa  228  1e-58  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00141609  hitchhiker  0.00437395 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2329  NAD-dependent epimerase/dehydratase  43.89 
 
 
318 aa  222  4.9999999999999996e-57  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.51179  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1143  NAD-dependent epimerase/dehydratase  41.69 
 
 
325 aa  222  7e-57  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.470047  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5344  NAD-dependent epimerase/dehydratase  42.86 
 
 
352 aa  219  5e-56  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4635  NAD-dependent epimerase/dehydratase  44.41 
 
 
276 aa  218  1e-55  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0341156  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4354  NAD-dependent epimerase/dehydratase  42.86 
 
 
321 aa  218  1e-55  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4766  NAD-dependent epimerase/dehydratase  42.07 
 
 
308 aa  205  6e-52  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.504553  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6997  NAD-dependent epimerase/dehydratase  42.52 
 
 
304 aa  194  1e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3201  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.08 
 
 
309 aa  189  4e-47  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1426  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.08 
 
 
316 aa  185  7e-46  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3811  NAD-dependent epimerase/dehydratase  39.74 
 
 
309 aa  185  8e-46  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4419  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.95 
 
 
321 aa  182  4.0000000000000006e-45  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3615  NAD-dependent epimerase/dehydratase  39.02 
 
 
315 aa  182  5.0000000000000004e-45  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.036254  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3627  NAD-dependent epimerase/dehydratase  40.26 
 
 
309 aa  181  9.000000000000001e-45  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3981  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.11 
 
 
317 aa  181  1e-44  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0549387 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1542  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.89 
 
 
300 aa  177  2e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0027  NAD-dependent epimerase/dehydratase  40.46 
 
 
329 aa  174  1.9999999999999998e-42  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.535465  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0030  NAD-dependent epimerase/dehydratase  41.44 
 
 
329 aa  169  8e-41  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0042  NAD-dependent epimerase/dehydratase  41.1 
 
 
329 aa  167  2.9999999999999998e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0046  NAD-dependent epimerase/dehydratase  39.43 
 
 
318 aa  151  1e-35  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.582921 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3985  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.76 
 
 
319 aa  147  2.0000000000000003e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.875328  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1484  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.01 
 
 
319 aa  141  1.9999999999999998e-32  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.357446  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1559  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.4 
 
 
312 aa  139  7.999999999999999e-32  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00329554  normal  0.0368212 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5717  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.49 
 
 
304 aa  134  3e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0127633 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2007  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.6 
 
 
317 aa  131  2.0000000000000002e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0894753  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0209  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.27 
 
 
307 aa  129  6e-29  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0178809  hitchhiker  0.0040496 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3529  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.13 
 
 
318 aa  107  2e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.016337 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3203  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.81 
 
 
318 aa  107  3e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1987  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.65 
 
 
328 aa  107  3e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001158  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.72 
 
 
314 aa  107  3e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1701  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.87 
 
 
307 aa  99.8  5e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.517647  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0868  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.37 
 
 
311 aa  100  5e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3104  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.08 
 
 
311 aa  98.2  1e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5665  NmrA-like protein/nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  28.71 
 
 
324 aa  98.2  2e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.783073 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2286  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.91 
 
 
321 aa  96.3  5e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0312  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.68 
 
 
312 aa  96.7  5e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.716604  normal  0.0199185 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2727  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.75 
 
 
340 aa  94.7  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.430894  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1740  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.49 
 
 
332 aa  94  3e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.377476  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5393  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.03 
 
 
312 aa  93.6  4e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0837  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.05 
 
 
311 aa  93.6  4e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0189  hypothetical protein  28.48 
 
 
332 aa  90.5  3e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0302861  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1362  hypothetical protein  28.48 
 
 
345 aa  90.5  3e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.169729  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1558  hypothetical protein  28.48 
 
 
345 aa  90.5  3e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2723  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  28.48 
 
 
345 aa  90.5  3e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2579  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  28.48 
 
 
345 aa  90.5  3e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.62087  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0217  hypothetical protein  28.48 
 
 
345 aa  90.5  3e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.644245  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0998  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  28.38 
 
 
333 aa  90.1  4e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2497  putative sugar dehydratase/epimerase  30.04 
 
 
332 aa  89.4  6e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.96633  normal  0.814546 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3335  hypothetical protein  28.43 
 
 
318 aa  89.4  7e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4306  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.42 
 
 
308 aa  89.4  7e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.244764  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5995  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.74 
 
 
352 aa  88.6  1e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0746307  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0922  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.6 
 
 
327 aa  89  1e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0510  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.2 
 
 
316 aa  88.6  1e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0353  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.58 
 
 
344 aa  87.8  2e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.860754 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3578  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.48 
 
 
325 aa  87.8  2e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4789  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.48 
 
 
325 aa  87.8  2e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5493  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.48 
 
 
325 aa  87.8  2e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.299821 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3144  hypothetical protein  27.57 
 
 
370 aa  86.7  4e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.428885  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1297  saccharopine dehydrogenase related protein  23.92 
 
 
305 aa  86.3  6e-16  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2988  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.6 
 
 
340 aa  86.3  6e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.865432  normal  0.0888549 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23000  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  27.65 
 
 
310 aa  85.9  9e-16  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.109037  normal  0.0324264 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0823  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.48 
 
 
340 aa  85.1  0.000000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.895804 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5771  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.37 
 
 
338 aa  85.1  0.000000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.783154  normal  0.678603 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3811  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.94 
 
 
336 aa  83.6  0.000000000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.316364  hitchhiker  0.00353615 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1458  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.3 
 
 
326 aa  82.8  0.000000000000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.780601  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4696  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.76 
 
 
326 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.990453 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11950  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  29.68 
 
 
322 aa  80.5  0.00000000000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.274992  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0650  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.56 
 
 
337 aa  79.7  0.00000000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.349018  normal  0.530155 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0126  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.16 
 
 
287 aa  78.2  0.0000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0997  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.8 
 
 
306 aa  77.4  0.0000000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3195  NAD-dependent epimerase/dehydratase  21.6 
 
 
311 aa  77.4  0.0000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.67739  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2822  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.21 
 
 
314 aa  77  0.0000000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4174  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.75 
 
 
326 aa  76.6  0.0000000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.93932  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1654  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.12 
 
 
326 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.354617  normal  0.0815308 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3899  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.3 
 
 
329 aa  63.5  0.000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0671  UDP-glucose 4-epimerase  26.59 
 
 
327 aa  61.6  0.00000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.301208  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0430  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.1 
 
 
321 aa  62  0.00000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1577  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.76 
 
 
330 aa  61.6  0.00000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.46913  normal  0.0352982 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2854  NAD-dependent epimerase/dehydratase  21.05 
 
 
307 aa  60.5  0.00000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000873024 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4278  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.24 
 
 
312 aa  60.5  0.00000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0211938  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3869  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.46 
 
 
335 aa  60.5  0.00000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.629775  normal  0.828763 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0563  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  24.02 
 
 
321 aa  58.5  0.0000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4813  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  24.41 
 
 
321 aa  58.5  0.0000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0700  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.29 
 
 
309 aa  58.9  0.0000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.182018  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1075  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.03 
 
 
327 aa  58.2  0.0000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3691  UDP-glucose 4-epimerase  25.1 
 
 
319 aa  58.2  0.0000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0424  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.41 
 
 
321 aa  57.8  0.0000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2995  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.48 
 
 
313 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.376158  normal  0.0242286 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2851  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.94 
 
 
311 aa  57.4  0.0000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1432  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.19 
 
 
328 aa  57.4  0.0000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5669  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.58 
 
 
307 aa  57.8  0.0000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00869127 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0510  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  24.41 
 
 
321 aa  57.4  0.0000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>