More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_2877 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013730  Slin_2877  beta-phosphoglucomutase  100 
 
 
219 aa  443  1.0000000000000001e-124  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0767657  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5088  beta-phosphoglucomutase  56.25 
 
 
219 aa  248  4e-65  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00016924  normal  0.408522 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2757  beta-phosphoglucomutase  53.52 
 
 
216 aa  239  2.9999999999999997e-62  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.273253 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0141  beta-phosphoglucomutase  52.4 
 
 
214 aa  228  8e-59  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3242  beta-phosphoglucomutase  56.44 
 
 
219 aa  227  1e-58  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05080  predicted phosphatase/phosphohexomutase  48.82 
 
 
227 aa  216  2e-55  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.071348  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2198  beta-phosphoglucomutase  46.34 
 
 
215 aa  201  6e-51  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.102511  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0670  beta-phosphoglucomutase  47.83 
 
 
207 aa  199  3.9999999999999996e-50  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.922957  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2263  beta-phosphoglucomutase  45.79 
 
 
218 aa  193  1e-48  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.000000132741  hitchhiker  0.000000451899 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0767  beta-phosphoglucomutase  45.89 
 
 
220 aa  184  9e-46  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.180027  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1402  beta-phosphoglucomutase  45.77 
 
 
219 aa  177  1e-43  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.340542  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0217  HAD family sugar phosphatase  41.51 
 
 
220 aa  176  3e-43  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000425935  hitchhiker  0.000000624715 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00430  beta-phosphoglucomutase  40.85 
 
 
216 aa  176  4e-43  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0895  HAD family sugar phosphatase  40.74 
 
 
228 aa  175  5e-43  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1531  beta-phosphoglucomutase  46.12 
 
 
214 aa  174  9.999999999999999e-43  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0997  HAD family sugar phosphatase  41.74 
 
 
223 aa  171  7.999999999999999e-42  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2157  beta-phosphoglucomutase  44.23 
 
 
585 aa  168  5e-41  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2961  beta-phosphoglucomutase  42.31 
 
 
219 aa  167  2e-40  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.423838 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0979  putative beta-phosphoglucomutase  42 
 
 
221 aa  165  4e-40  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1933  beta-phosphoglucomutase  45.45 
 
 
230 aa  165  5.9999999999999996e-40  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0214  beta-phosphoglucomutase  41.12 
 
 
965 aa  162  5.0000000000000005e-39  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.387733  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1021  beta-phosphoglucomutase  43.39 
 
 
209 aa  161  6e-39  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0660798  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1436  beta-phosphoglucomutase  38.65 
 
 
233 aa  160  2e-38  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0665793  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0319  HAD family sugar phosphatase  38.99 
 
 
223 aa  160  2e-38  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3752  HAD family hydrolase  42.06 
 
 
978 aa  159  3e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.625857  normal  0.249828 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0484  HAD family sugar phosphatase  40 
 
 
221 aa  158  6e-38  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0055  beta-phosphoglucomutase  38.89 
 
 
220 aa  157  1e-37  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000775406  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2329  beta-phosphoglucomutase  39.71 
 
 
219 aa  155  5.0000000000000005e-37  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0229968  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3918  beta-phosphoglucomutase  39.22 
 
 
208 aa  155  5.0000000000000005e-37  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0371171 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2308  beta-phosphoglucomutase  39.71 
 
 
219 aa  155  5.0000000000000005e-37  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.961531  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1432  putative beta-phosphoglucomutase  39.71 
 
 
219 aa  155  5.0000000000000005e-37  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1805  beta-phosphoglucomutase  40.19 
 
 
219 aa  154  8e-37  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.185945  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1875  beta-phosphoglucomutase  39.02 
 
 
215 aa  153  2e-36  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1528  putative beta-phosphoglucomutase  38.36 
 
 
219 aa  153  2e-36  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01294  predicted beta-phosphoglucomutase  39.23 
 
 
219 aa  152  4e-36  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.236251  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01305  hypothetical protein  39.23 
 
 
219 aa  152  4e-36  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.203955  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1962  beta-phosphoglucomutase  38.76 
 
 
219 aa  152  5e-36  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.619448 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3311  beta-phosphoglucomutase  40 
 
 
220 aa  150  1e-35  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0304  beta-phosphoglucomutase  37.74 
 
 
986 aa  148  7e-35  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.337026 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0397  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  36.2 
 
 
223 aa  141  7e-33  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3043  HAD family beta-phosphoglucomutase hydrolase  32.39 
 
 
260 aa  112  4.0000000000000004e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.720241  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6404  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  34.62 
 
 
254 aa  109  3e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.929591 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0374  HAD family hydrolase  31.98 
 
 
456 aa  106  3e-22  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000852801  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0395  glycoprotease family protein/hydrolase, beta-phosphoglucomutase family  30.63 
 
 
456 aa  105  7e-22  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_338  hypothetical protein  30.63 
 
 
456 aa  102  3e-21  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00693249  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2878  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  30.19 
 
 
233 aa  102  4e-21  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0071  Beta-phosphoglucomutase hydrolase  30.05 
 
 
234 aa  102  6e-21  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0344  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  29.46 
 
 
250 aa  100  1e-20  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.118132  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3371  fructose-1-phosphatase  34.05 
 
 
188 aa  100  2e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000166362  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0893  fructose-1-phosphatase  34.05 
 
 
188 aa  100  2e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000160736  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2512  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  35.42 
 
 
244 aa  100  2e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0267  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  31.41 
 
 
220 aa  100  2e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.583067  normal  0.103324 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4810  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  32.76 
 
 
252 aa  100  2e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.657489 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3236  fructose-1-phosphatase  34.05 
 
 
188 aa  100  2e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000293158  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02150  haloacid dehalogenase superfamily protein, subfamily IA, variant 3 with third motif having DD or ED/beta-phosphoglucomutase family hydrolase  33.06 
 
 
246 aa  98.6  7e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2161  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  34.69 
 
 
525 aa  98.6  7e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.135077 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4075  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  33 
 
 
230 aa  97.8  1e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.280264  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5751  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  31.58 
 
 
236 aa  97.4  1e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.511728  normal  0.030519 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2065  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  30.35 
 
 
201 aa  97.4  1e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000000166842  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0811  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  28.57 
 
 
225 aa  97.1  2e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.332678 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0452  HAD family hydrolase  33.03 
 
 
221 aa  96.7  2e-19  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4348  Beta-phosphoglucomutase hydrolase  32.35 
 
 
253 aa  97.1  2e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0954836  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1172  Beta-phosphoglucomutase hydrolase  33.89 
 
 
263 aa  97.1  2e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.207951  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1189  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  33.89 
 
 
263 aa  97.1  2e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.832835  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0530  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  35.05 
 
 
257 aa  95.9  4e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1980  HAD family hydrolase  29.5 
 
 
202 aa  95.9  4e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000561924  normal  0.0500569 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1994  HAD family hydrolase  29.5 
 
 
202 aa  95.9  4e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000168215  unclonable  0.0000194697 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2067  HAD family hydrolase  29.5 
 
 
202 aa  95.9  4e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000117425  hitchhiker  0.0000127527 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0342  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  32.38 
 
 
1053 aa  95.9  5e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1014  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  30.33 
 
 
313 aa  95.5  6e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.125364 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4270  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  33.82 
 
 
258 aa  95.1  7e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12643  Predicted phosphatase  29.95 
 
 
216 aa  95.1  7e-19  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.128583  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1199  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  33.47 
 
 
263 aa  95.1  7e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0392368 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4038  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  32.5 
 
 
230 aa  94.7  9e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0496  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  33.19 
 
 
248 aa  94.4  1e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.527594  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2702  HAD family hydrolase  28.86 
 
 
232 aa  94  1e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.653691  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3373  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  32.98 
 
 
231 aa  94.4  1e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.154909  normal  0.78527 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3992  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  31.58 
 
 
218 aa  93.6  2e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.177922  normal  0.23268 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27200  haloacid dehalogenase superfamily protein, subfamily IA, variant 3 with third motif having DD or ED/beta-phosphoglucomutase family hydrolase  32.26 
 
 
249 aa  93.6  2e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.182706  normal  0.5893 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2483  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  31.5 
 
 
233 aa  93.6  2e-18  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0678579  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2701  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  30.21 
 
 
232 aa  94  2e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2091  Beta-phosphoglucomutase hydrolase  29.8 
 
 
233 aa  93.2  3e-18  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4370  Beta-phosphoglucomutase hydrolase  35.15 
 
 
1088 aa  92.8  3e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.402344  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1810  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  37.71 
 
 
238 aa  93.2  3e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2523  HAD family hydrolase  30 
 
 
219 aa  92.8  4e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000000000119514  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1040  HAD family hydrolase  30.66 
 
 
226 aa  92.8  4e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000171478  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1517  HAD family hydrolase  30.14 
 
 
216 aa  92  6e-18  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1027  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  29.92 
 
 
1051 aa  92  6e-18  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0039  HAD family hydrolase  33.94 
 
 
242 aa  91.7  7e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0561  HAD family hydrolase  32.3 
 
 
248 aa  91.3  1e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.213608  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0240  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  30.84 
 
 
268 aa  90.9  1e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.414523 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2141  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  29.74 
 
 
200 aa  90.9  1e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.189137  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1566  HAD family hydrolase  30.14 
 
 
216 aa  90.9  1e-17  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0437  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  32.35 
 
 
244 aa  91.3  1e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2777  HAD family hydrolase  26.82 
 
 
220 aa  90.1  2e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0810098  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1282  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  33.48 
 
 
242 aa  90.1  3e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1765  HAD family hydrolase  31.77 
 
 
236 aa  89.4  4e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0140115 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10160  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  29.58 
 
 
217 aa  89.4  4e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.64096  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0927  Beta-phosphoglucomutase hydrolase  29.27 
 
 
1055 aa  89  6e-17  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1640  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  30.04 
 
 
1051 aa  88.6  7e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>