More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_2580 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013730  Slin_2580  glycosyl transferase family 2  100 
 
 
341 aa  706    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.392013 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3866  glycosyl transferase family 2  38.44 
 
 
325 aa  226  5.0000000000000005e-58  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0237  putative glycosyl transferase  34.3 
 
 
334 aa  208  1e-52  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000312549  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1430  glycosyl transferase family protein  32.93 
 
 
338 aa  187  2e-46  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.339779  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2176  glycosyl transferase family protein  30.6 
 
 
324 aa  177  3e-43  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0528602  hitchhiker  0.0000162414 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0768  glycosyl transferase family 2  31.91 
 
 
334 aa  172  5e-42  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0071  glycosyl transferase family 2  30.27 
 
 
334 aa  149  7e-35  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.0258597 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2834  glycosyl transferase family 2  29.41 
 
 
349 aa  146  4.0000000000000006e-34  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29980  Glycosyl transferase, family 2 protein  38.07 
 
 
325 aa  145  1e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.191299  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3795  putative glycosyl transferase  28.99 
 
 
332 aa  136  6.0000000000000005e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.688058 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1509  glycosyl transferase, group 2 family protein  29.78 
 
 
331 aa  134  1.9999999999999998e-30  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0631  glycosyl transferase, group 2 family protein  35.74 
 
 
321 aa  132  6.999999999999999e-30  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0315  glycosyl transferase family 2  35.22 
 
 
311 aa  125  8.000000000000001e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.357577 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3096  glycosyl transferase family 2  31.89 
 
 
350 aa  124  3e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.381079 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1875  glycosyl transferase, group 2 family protein  35.02 
 
 
241 aa  123  4e-27  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2855  glycosyl transferase family 2  31.67 
 
 
306 aa  122  9.999999999999999e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.328226  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0314  glycosyl transferase family 2  33.05 
 
 
348 aa  119  9.999999999999999e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.5289  normal  0.534474 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1120  glycosyl transferase family 2  28.63 
 
 
303 aa  109  5e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.674601 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3263  glycosyl transferase family 2  32.41 
 
 
242 aa  107  3e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1026  hypothetical protein  27.97 
 
 
339 aa  106  5e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.215824  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3027  putative glycosyltransferase  31.51 
 
 
237 aa  102  1e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1577  glycosyl transferase family 2  30.3 
 
 
315 aa  102  1e-20  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2328  glycosyl transferase group 2 family protein  28.06 
 
 
326 aa  98.6  1e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.775783  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4928  glycosyl transferase family 2  30.09 
 
 
234 aa  97.8  2e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.749845 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0055  glycosyl transferase family 2  34.21 
 
 
1171 aa  97.4  3e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.180545  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4473  glycosyl transferase family 2  27.55 
 
 
309 aa  95.1  2e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11550  sugar transferase  29.6 
 
 
336 aa  91.3  2e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3901  glycosyl transferase family 2  31.51 
 
 
313 aa  89.7  6e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1697  glycosyl transferase family protein  29.78 
 
 
336 aa  86.7  5e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.591253  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2378  glycosyl transferase family protein  29.46 
 
 
331 aa  86.3  8e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2417  glycosyl transferase family 2  29.03 
 
 
247 aa  85.5  0.000000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.385127 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11553  sugar transferase  26.91 
 
 
357 aa  84.3  0.000000000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1436  polysaccharide biosynthesis protein/putative rhamnosyl transferase  29.07 
 
 
313 aa  84.3  0.000000000000003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3102  glycosyl transferase family protein  25.46 
 
 
312 aa  83.2  0.000000000000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0611107  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0575  glycosyl transferase family 2  28.7 
 
 
320 aa  81.3  0.00000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.910069  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2949  glycosyl transferase family 2  24.43 
 
 
329 aa  80.9  0.00000000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.384487  normal 
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4080  glycosyl transferase family protein  28.92 
 
 
312 aa  79.3  0.00000000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.106116 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3842  glycosyl transferase family protein  28.92 
 
 
312 aa  79.3  0.00000000000008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.051073  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2348  glycosyl transferase family protein  26.99 
 
 
316 aa  79.3  0.00000000000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0769  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  26.64 
 
 
329 aa  78.6  0.0000000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1218  glycosyl transferase family protein  31 
 
 
301 aa  77.4  0.0000000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.332146  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0398  glycosyl transferase family 2  28.57 
 
 
352 aa  76.3  0.0000000000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1422  glycosyl transferase, group 2 family protein  26.64 
 
 
313 aa  75.9  0.0000000000009  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.000268918  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2680  glycosyl transferase family protein  27.78 
 
 
256 aa  75.5  0.000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.043994  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2566  glycosyl transferase family 2  29.26 
 
 
252 aa  74.7  0.000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1184  glycosyl transferase family protein  33.33 
 
 
801 aa  73.9  0.000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2014  glycosyl transferase family protein  29.87 
 
 
303 aa  73.9  0.000000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.0488163 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2600  glycosyl transferase family 2  26.28 
 
 
311 aa  73.2  0.000000000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2405  glycosyl transferase family 2  26.69 
 
 
298 aa  73.2  0.000000000007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4043  glycosyl transferase family protein  25 
 
 
319 aa  72.4  0.000000000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.87992 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1626  glycosyl transferase family protein  30.53 
 
 
299 aa  72.4  0.00000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1244  glycosyl transferase family protein  24.63 
 
 
390 aa  72.4  0.00000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0207  glycosyltransferase  26.75 
 
 
313 aa  72.4  0.00000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0393294  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1811  glycosyl transferase family protein  26.6 
 
 
294 aa  71.2  0.00000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0703738  normal  0.241248 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0402  glycosyl transferase family 2  33.58 
 
 
342 aa  70.9  0.00000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2418  glycosyl transferase family 2  28.65 
 
 
354 aa  70.5  0.00000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.319221 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3678  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  23.98 
 
 
466 aa  70.5  0.00000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2524  glycosyl transferase family 2  32.06 
 
 
337 aa  70.1  0.00000000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0357419 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0297  glycosyl transferase family protein  25.33 
 
 
313 aa  70.1  0.00000000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0840  glycosyl transferase family protein  24.71 
 
 
318 aa  69.7  0.00000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0249486 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1452  glycosyltransferase-like protein  25.76 
 
 
287 aa  69.3  0.00000000008  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2992  glycosyltransferase-like protein  26.52 
 
 
332 aa  68.6  0.0000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.151276  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0739  glycosyl transferase family 2  24.31 
 
 
348 aa  68.9  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.646928  normal  0.825745 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0710  glycosyl transferase family 2  24.31 
 
 
348 aa  68.6  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1346  glycosyl transferase, group 2 family protein  24.46 
 
 
343 aa  68.2  0.0000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.470467  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3100  glycosyl transferase family protein  25.2 
 
 
325 aa  68.2  0.0000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0346657  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1385  glycosyl transferase family protein  26.61 
 
 
317 aa  67.4  0.0000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.593757  normal  0.173053 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3357  glycosyl transferase family protein  28.51 
 
 
342 aa  67.8  0.0000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.356276 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0348  glycosyl transferase group 1  27.8 
 
 
739 aa  66.6  0.0000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1408  glycosyl transferase family protein  27.38 
 
 
930 aa  67  0.0000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.370987  normal  0.266781 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1778  glycosyl transferase family 2  23.39 
 
 
292 aa  66.6  0.0000000005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.345176  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0985  glycosyl transferase family protein  27.51 
 
 
289 aa  67  0.0000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3238  glycosyl transferase family protein  26.19 
 
 
703 aa  66.6  0.0000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1508  glycosyl transferase family protein  23.48 
 
 
350 aa  66.2  0.0000000007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0142825  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2952  glycosyl transferase family 2  25.1 
 
 
377 aa  66.2  0.0000000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.604226  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1817  glycosyl transferase family 2  26.04 
 
 
308 aa  66.2  0.0000000007  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.296276  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2767  glycosyl transferase family protein  32.54 
 
 
303 aa  65.9  0.0000000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.280211  normal  0.34813 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0318  glycosyl transferase family protein  23.53 
 
 
285 aa  65.9  0.0000000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0743987  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2531  glycosyl transferase family protein  26.61 
 
 
310 aa  65.5  0.000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0838  glycosyl transferase family protein  31.75 
 
 
324 aa  65.5  0.000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.115028  normal  0.0515861 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1565  glycosyl transferase family 2  25.28 
 
 
970 aa  65.5  0.000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000603283  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5173  glycosyl transferase family 2  24.67 
 
 
330 aa  65.9  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.65386  normal  0.331666 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0317  glycosyl transferase family protein  37.84 
 
 
322 aa  65.1  0.000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.38016  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5180  glycosyl transferase family 2  31.78 
 
 
322 aa  64.7  0.000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.48188  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66110  putative glycosyl transferase  27.69 
 
 
294 aa  64.7  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0409  glycosyl transferase family 2  31.45 
 
 
462 aa  64.7  0.000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5735  glycosyl transferase, group 2 family protein  26.92 
 
 
294 aa  64.3  0.000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2950  glycosyl transferase family protein  25.54 
 
 
376 aa  64.3  0.000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.268496 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0407  glycosyl transferase group 1  27.38 
 
 
750 aa  64.3  0.000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0843  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  24.12 
 
 
321 aa  63.9  0.000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2585  glycosyl transferase family 2  28.51 
 
 
264 aa  63.5  0.000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3791  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  25.42 
 
 
317 aa  63.9  0.000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1419  glycosyl transferase family protein  30.83 
 
 
296 aa  63.5  0.000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.12984 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2759  glycosyl transferase family protein  30.43 
 
 
340 aa  63.5  0.000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1479  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  26.25 
 
 
307 aa  63.2  0.000000006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0517693  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3280  glycosyl transferase family 2  24.44 
 
 
341 aa  62.8  0.000000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1499  glycosyltransferase-like protein  22.03 
 
 
350 aa  62.8  0.000000007  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.311462  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2972  glycosyl transferase family 2  27.15 
 
 
294 aa  62.8  0.000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0619  glycosyl transferase family 2  28.11 
 
 
310 aa  62.8  0.000000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0321  glycosyl transferase family protein  27.13 
 
 
342 aa  62.4  0.00000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>