More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_1406 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_1406  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 		 267 aa  545  1e-154  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0615665  normal  0.271714 
 
 
-
 
NC_003296  RS03890  short chain dehydrogenase  53.33 
 
 		 276 aa  302  4.0000000000000003e-81  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.606349 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0983  short chain dehydrogenase  51.85 
 
 		 277 aa  291  1e-77  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.622863  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2717  short chain dehydrogenase  53.7 
 
 		 276 aa  289  3e-77  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2479  short chain dehydrogenase  52.63 
 
 		 279 aa  284  1.0000000000000001e-75  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0029  short chain dehydrogenase  52.26 
 
 		 278 aa  278  5e-74  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.148269  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5810  short chain dehydrogenase  51.3 
 
 		 278 aa  269  4e-71  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.930868  normal  0.729107 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0040  short chain dehydrogenase  51.5 
 
 		 283 aa  267  2e-70  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.262261  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1249  short chain dehydrogenase  49.43 
 
 		 279 aa  265  5e-70  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4288  short chain dehydrogenase  47.74 
 
 		 287 aa  261  6e-69  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.861996 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5046  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.86 
 
 		 291 aa  261  8.999999999999999e-69  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0909  short chain dehydrogenase  45.76 
 
 		 273 aa  244  9.999999999999999e-64  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.34519  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10740  short chain dehydrogenase  44.74 
 
 		 278 aa  238  9e-62  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.896736  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2448  short chain dehydrogenase  46.67 
 
 		 277 aa  236  2e-61  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1352  oxidoreductase  42 
 
 		 275 aa  193  3e-48  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.904457  n/a   
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0007  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.2 
 
 		 300 aa  191  9e-48  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.67964 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0723  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  40.23 
 
 		 275 aa  190  2e-47  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.158642  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1001  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.35 
 
 		 285 aa  183  3e-45  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4155  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  41.85 
 
 		 271 aa  181  1e-44  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1560  Short-chain dehydrogenase of various substrate specificities  36.4 
 
 		 272 aa  181  1e-44  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6366  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.96 
 
 		 280 aa  181  2e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.152344 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2968  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.75 
 
 		 272 aa  175  6e-43  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.118258  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3849  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.79 
 
 		 314 aa  171  1e-41  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0687851  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0069  Short-chain dehydrogenase of various substrate specificities  40 
 
 		 277 aa  169  5e-41  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.367303  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1655  hypothetical protein  40.44 
 
 		 283 aa  169  6e-41  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1586  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.11 
 
 		 271 aa  166  2.9999999999999998e-40  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0736  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.43 
 
 		 272 aa  166  2.9999999999999998e-40  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1733  short chain dehydrogenase  38.18 
 
 		 286 aa  166  2.9999999999999998e-40  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0065  Short-chain dehydrogenase of various substrate specificities  35.23 
 
 		 274 aa  166  4e-40  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4153  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  36.9 
 
 		 273 aa  164  1.0000000000000001e-39  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0964  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.81 
 
 		 306 aa  163  3e-39  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2506  short chain dehydrogenase  37.86 
 
 		 291 aa  163  3e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.444632 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1648  hypothetical protein  39.34 
 
 		 283 aa  161  1e-38  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5220  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.96 
 
 		 279 aa  160  1e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2827  short chain dehydrogenase  36.79 
 
 		 291 aa  161  1e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.199916  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2806  short chain dehydrogenase  36.69 
 
 		 291 aa  159  3e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.928497  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2581  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.23 
 
 		 285 aa  160  3e-38  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.300574 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6615  short chain dehydrogenase  38.11 
 
 		 271 aa  159  3e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.522985  normal  0.0823373 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2787  short chain dehydrogenase  36.79 
 
 		 291 aa  159  6e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4702  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.62 
 
 		 272 aa  158  8e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.315563  normal  0.0714958 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2582  short chain dehydrogenase  36.79 
 
 		 291 aa  158  9e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0166341  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2783  short chain dehydrogenase  37.5 
 
 		 291 aa  158  1e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0502462 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2590  short chain dehydrogenase  37.14 
 
 		 291 aa  157  1e-37  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2507  short chain dehydrogenase  37.14 
 
 		 291 aa  158  1e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3645  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.76 
 
 		 268 aa  157  1e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6182  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.94 
 
 		 271 aa  157  1e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0362247 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2778  short chain dehydrogenase  37.14 
 
 		 281 aa  157  1e-37  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.143428  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3194  short chain dehydrogenase  35.74 
 
 		 256 aa  157  2e-37  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.234456  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1321  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.13 
 
 		 271 aa  157  2e-37  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.318083 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1309  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.4 
 
 		 267 aa  156  3e-37  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6445  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.56 
 
 		 275 aa  156  3e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6701  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.46 
 
 		 271 aa  156  3e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2453  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.26 
 
 		 278 aa  156  3e-37  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.719818  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1248  short chain dehydrogenase  36.14 
 
 		 282 aa  156  4e-37  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3006  short chain dehydrogenase  36.09 
 
 		 258 aa  156  4e-37  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.662258  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4099  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.15 
 
 		 292 aa  156  4e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0934887  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1126  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.47 
 
 		 338 aa  155  5.0000000000000005e-37  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3292  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.2 
 
 		 268 aa  155  9e-37  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.392753  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0101  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.09 
 
 		 272 aa  154  1e-36  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2629  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.09 
 
 		 317 aa  154  1e-36  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1121  short chain dehydrogenase  35.36 
 
 		 256 aa  154  1e-36  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0921359  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2541  short chain dehydrogenase  36.79 
 
 		 291 aa  154  2e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000142979  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1321  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.3 
 
 		 276 aa  152  4e-36  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    decreased coverage  0.00000000000224332 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0888  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.32 
 
 		 281 aa  152  5e-36  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.212887  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1321  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.65 
 
 		 282 aa  152  5.9999999999999996e-36  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.889604  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0558  short chain dehydrogenase  34.83 
 
 		 272 aa  152  5.9999999999999996e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.449424 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7087  short chain dehydrogenase  37.86 
 
 		 284 aa  151  1e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1905  short chain dehydrogenase  36.5 
 
 		 280 aa  150  2e-35  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0945301  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4320  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.87 
 
 		 266 aa  150  2e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.146439  normal  0.0308076 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10768  putative oxidoreductase  36.33 
 
 		 304 aa  150  3e-35  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.465871  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3745  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.02 
 
 		 279 aa  149  5e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0967  short chain dehydrogenase  35.74 
 
 		 256 aa  148  8e-35  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4114  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.09 
 
 		 273 aa  148  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.953941  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2393  short chain dehydrogenase  36.1 
 
 		 344 aa  148  1.0000000000000001e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.895738 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6919  short chain dehydrogenase  44.02 
 
 		 276 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0500  short chain dehydrogenase  33.33 
 
 		 275 aa  147  2.0000000000000003e-34  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0206  short chain dehydrogenase  40.82 
 
 		 284 aa  146  3e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3791  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.85 
 
 		 273 aa  146  3e-34  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0700292  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0604  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.38 
 
 		 268 aa  146  3e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.710903  normal  0.301955 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7041  short chain dehydrogenase  43.48 
 
 		 277 aa  146  4.0000000000000006e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.198805  normal  0.204999 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2060  short chain dehydrogenase  35.32 
 
 		 270 aa  146  4.0000000000000006e-34  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3333  short chain dehydrogenase  41.94 
 
 		 280 aa  146  4.0000000000000006e-34  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6914  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.81 
 
 		 279 aa  145  5e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.851419  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0876  short chain dehydrogenase  40.56 
 
 		 274 aa  145  5e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2502  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.92 
 
 		 279 aa  145  5e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.729969 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3154  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.83 
 
 		 286 aa  145  5e-34  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2694  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.07 
 
 		 280 aa  145  6e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.140446  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1451  short chain dehydrogenase  42.93 
 
 		 277 aa  145  6e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6377  short chain dehydrogenase  42.93 
 
 		 277 aa  145  6e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2175  short chain dehydrogenase  35.58 
 
 		 272 aa  145  6e-34  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.328635  hitchhiker  0.00607004 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1861  oxidoreductase, short chain dehydrogenase/reductase family  32.36 
 
 		 270 aa  145  8.000000000000001e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0952097  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4560  short chain dehydrogenase  42.16 
 
 		 280 aa  144  1e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0967831  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3107  short-chain alcohol-related dehydrogenase  33.94 
 
 		 272 aa  144  1e-33  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2188  thiamine pyrophosphate protein central region  36.48 
 
 		 847 aa  144  2e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.941679 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0301  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.6 
 
 		 305 aa  143  2e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0783167 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0715  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.37 
 
 		 269 aa  144  2e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.965054  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4835  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.77 
 
 		 273 aa  144  2e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000227026 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3022  short chain dehydrogenase  33.46 
 
 		 258 aa  143  4e-33  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.515629  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3209  short chain dehydrogenase  42.31 
 
 		 268 aa  142  4e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.821388  normal  0.102605 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1270  short chain dehydrogenase  33.46 
 
 		 258 aa  143  4e-33  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.276247 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>