277 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewana3_0015 on replicon NC_008577
Organism: Shewanella sp. ANA-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008321  Shewmr4_0007  putative signal transduction protein  95.1 
 
 
347 aa  666  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  7.36166e-09 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0007  putative signal transduction protein  95.68 
 
 
347 aa  668  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0608223 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0015  putative signal transduction protein  100 
 
 
347 aa  700  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  1.89797e-08 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0011  putative signal transduction protein  80.69 
 
 
346 aa  568  1e-161  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  6.19076e-07 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0007  putative signal transduction protein  80.4 
 
 
346 aa  568  1e-161  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0011  putative signal transduction protein  79.54 
 
 
346 aa  564  1e-160  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0123691 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0011  putative signal transduction protein  80.12 
 
 
346 aa  567  1e-160  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0005  putative signal transduction protein  80 
 
 
348 aa  560  1e-159  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.373694  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0013  hypothetical protein  95.49 
 
 
266 aa  513  1e-144  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0005  metal dependent phosphohydrolase  60.86 
 
 
354 aa  423  1e-117  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0013  putative signal transduction protein  62.71 
 
 
351 aa  415  1e-115  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  3.60962e-08 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0005  metal dependent phosphohydrolase  59 
 
 
350 aa  410  1e-113  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.387927  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0024  putative signal transduction protein  56.2 
 
 
351 aa  406  1e-112  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00341076 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0011  putative signal transduction protein  58.04 
 
 
334 aa  380  1e-104  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  7.2807e-05 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1460  metal dependent phosphohydrolase  32.2 
 
 
384 aa  179  6e-44  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0287  hypothetical protein  32.6 
 
 
366 aa  148  1e-34  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.381224  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1483  Fis family transcriptional regulator  28.66 
 
 
324 aa  122  1e-26  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.237466  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0667  metal dependent phosphohydrolase  35.45 
 
 
297 aa  92.8  7e-18  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0639089  normal  0.446665 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2064  metal dependent phosphohydrolase  31.3 
 
 
397 aa  89.7  7e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.482341  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0663  metal dependent phosphohydrolase  29.18 
 
 
286 aa  83.6  5e-15  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0294  HD domain-containing protein  25.75 
 
 
303 aa  82.8  9e-15  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0824041  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2448  HDIG domain-containing protein  28.05 
 
 
287 aa  82  1e-14  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0403  metal dependent phosphohydrolase  23.93 
 
 
290 aa  80.1  5e-14  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3744  sensor histidine kinase  26.27 
 
 
718 aa  80.1  5e-14  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.297445 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2635  metal dependent phosphohydrolase  27.32 
 
 
283 aa  79  1e-13  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2652  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  28.31 
 
 
412 aa  75.9  9e-13  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.5401  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0035  metal dependent phosphohydrolase  22.49 
 
 
298 aa  75.5  1e-12  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0283  putative signal transduction protein  29.19 
 
 
277 aa  75.1  2e-12  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2586  putative signal transduction protein  28.8 
 
 
288 aa  74.7  2e-12  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0168081  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0779  metal dependent phosphohydrolase  26.34 
 
 
297 aa  74.7  2e-12  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0559606  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1367  putative signal transduction protein  28.79 
 
 
288 aa  74.7  2e-12  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.276404  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2490  metal dependent phosphohydrolase  28.8 
 
 
288 aa  74.3  3e-12  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.115948  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3899  metal dependent phosphohydrolase  28.25 
 
 
282 aa  73.9  4e-12  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0541019  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02093  HD domain protein  33.08 
 
 
292 aa  73.6  5e-12  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.394256  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2988  putative signal transduction protein  29.48 
 
 
281 aa  73.2  6e-12  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3501  hypothetical protein  29.89 
 
 
274 aa  73.2  6e-12  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  1.51947e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2952  putative signal transduction protein  29.88 
 
 
358 aa  73.2  7e-12  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.281688  normal  0.0690285 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1061  putative signal transduction protein  25.96 
 
 
271 aa  72  1e-11  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.580141  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3052  putative signal transduction protein  24.83 
 
 
349 aa  71.6  2e-11  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1149  putative signal transduction protein  32.79 
 
 
278 aa  71.6  2e-11  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.506889  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1772  metal dependent phosphohydrolase  27.62 
 
 
440 aa  70.1  5e-11  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0702712  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0532  hypothetical protein  27.66 
 
 
274 aa  70.1  6e-11  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1904  putative signal transduction protein  29.19 
 
 
272 aa  70.1  6e-11  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0742  metal dependent phosphohydrolase  22.91 
 
 
427 aa  69.7  7e-11  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3231  putative signal transduction protein  26.98 
 
 
352 aa  68.6  1e-10  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0670  metal dependent phosphohydrolase  22.41 
 
 
287 aa  68.6  2e-10  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0674014  normal  0.44823 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2456  hypothetical protein  28.09 
 
 
287 aa  68.2  2e-10  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3268  metal dependent phosphohydrolase  23.28 
 
 
297 aa  68.6  2e-10  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.927802  hitchhiker  3.64844e-05 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3944  metal dependent phosphohydrolase  22.75 
 
 
299 aa  68.2  2e-10  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0769  metal dependent phosphohydrolase  27.03 
 
 
279 aa  67.4  3e-10  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0888114 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1104  metal dependent phosphohydrolase  29.13 
 
 
371 aa  67.4  3e-10  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.485217  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1965  putative signal transduction protein  30.88 
 
 
399 aa  67.4  3e-10  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.543809  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0351  metal dependent phosphohydrolase  26.23 
 
 
353 aa  67.8  3e-10  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.889768  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1910  metal dependent phosphohydrolase  31.45 
 
 
283 aa  67.4  4e-10  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1497  metal dependent phosphohydrolase  24.1 
 
 
285 aa  67.4  4e-10  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1846  metal dependent phosphohydrolase  26.59 
 
 
283 aa  66.6  5e-10  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4028  metal dependent phosphohydrolase  22.35 
 
 
299 aa  66.6  6e-10  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.78316e-11 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3139  histidine kinase  26.03 
 
 
724 aa  66.2  7e-10  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0348  putative signal transduction protein  28.72 
 
 
285 aa  66.2  7e-10  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.08885e-15 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1670  putative signal transduction protein  23.83 
 
 
297 aa  66.2  8e-10  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2422  cyclic nucleotide-binding protein  27.04 
 
 
430 aa  65.9  9e-10  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4422  metal dependent phosphohydrolase  21.83 
 
 
300 aa  65.5  1e-09  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0476  putative signal transduction protein  25.88 
 
 
274 aa  65.9  1e-09  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.16695  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0367  putative signal transduction protein  28.72 
 
 
285 aa  65.9  1e-09  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1583  putative signal transduction protein  26.25 
 
 
279 aa  65.9  1e-09  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.23287  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2479  hypothetical protein  27.23 
 
 
275 aa  65.9  1e-09  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2245  hypothetical protein  27.89 
 
 
289 aa  65.9  1e-09  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0596147  normal  0.358585 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1403  putative signal transduction protein  25.12 
 
 
280 aa  64.7  2e-09  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0899  putative signal transduction protein  29.03 
 
 
297 aa  64.7  2e-09  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.769292 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4563  hypothetical protein  27.22 
 
 
274 aa  64.7  2e-09  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2909  metal-dependent phosphohydrolase  29.19 
 
 
281 aa  64.7  2e-09  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.600973  normal  0.363943 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1161  metal dependent phosphohydrolase  27.98 
 
 
280 aa  65.1  2e-09  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.663858  normal  0.172045 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1382  histidine kinase  26.04 
 
 
912 aa  64.3  3e-09  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3956  putative signal transduction protein  26.52 
 
 
274 aa  63.9  4e-09  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0188  putative signal transduction protein  25.4 
 
 
274 aa  63.5  5e-09  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2694  metal dependent phosphohydrolase  24.84 
 
 
406 aa  63.5  5e-09  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0187  putative signal transduction protein  25.4 
 
 
274 aa  63.5  5e-09  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4280  putative signal transduction protein  25.4 
 
 
274 aa  63.5  5e-09  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0660971 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1442  hypothetical protein  26.55 
 
 
404 aa  63.5  5e-09  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  7.50338e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4147  putative signal transduction protein  25.4 
 
 
274 aa  63.5  5e-09  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0484  metal-dependent phosphohydrolase  24.38 
 
 
282 aa  62.8  8e-09  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1683  HDIG  26.44 
 
 
299 aa  62.8  8e-09  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1184  histidine kinase  23.89 
 
 
730 aa  62.8  8e-09  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0470361  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0449  hypothetical protein  26.67 
 
 
292 aa  62.4  1e-08  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1873  diguanylate cyclase  30.05 
 
 
509 aa  62.8  1e-08  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.41222  normal  0.823385 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3214  putative signal transduction protein  25 
 
 
293 aa  62.4  1e-08  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1986  metal dependent phosphohydrolase  28.3 
 
 
280 aa  62  1e-08  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0536621  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3758  putative signal transduction protein  25.97 
 
 
274 aa  62.4  1e-08  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3831  putative signal transduction protein  25.97 
 
 
274 aa  62.4  1e-08  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3649  hypothetical protein  25.73 
 
 
283 aa  61.6  2e-08  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1787  HDIG  22.71 
 
 
279 aa  62  2e-08  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.394565 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0100  hypothetical protein  25.76 
 
 
290 aa  60.8  3e-08  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0254877  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3517  metal-dependent hydrolase HDOD  24.1 
 
 
380 aa  61.2  3e-08  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2585  putative signal transduction protein  25.95 
 
 
332 aa  60.8  3e-08  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04660  hypothetical protein  26.11 
 
 
274 aa  60.5  4e-08  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1270  metal dependent phosphohydrolase  24.19 
 
 
279 aa  60.5  4e-08  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2772  metal dependent phosphohydrolase  26.23 
 
 
285 aa  60.5  4e-08  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.846457  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1690  putative signal transduction protein  29.52 
 
 
305 aa  60.8  4e-08  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1981  metal dependent phosphohydrolase  30.07 
 
 
280 aa  60.1  5e-08  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0464  metal dependent phosphohydrolase  23.08 
 
 
284 aa  60.1  5e-08  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>