50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_0026 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009092  Shew_0026  hypothetical protein  100 
 
 		 178 aa  370  1e-102  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00253798  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0147  hypothetical protein  81.25 
 
 		 176 aa  301  3.0000000000000004e-81  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.621737  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4698  hypothetical protein  79.55 
 
 		 176 aa  300  8.000000000000001e-81  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3934  hypothetical protein  80.68 
 
 		 176 aa  299  1e-80  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3841  hypothetical protein  80.68 
 
 		 176 aa  299  1e-80  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3547  hypothetical protein  80.57 
 
 		 197 aa  299  1e-80  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4050  hypothetical protein  80.57 
 
 		 176 aa  298  3e-80  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0088  hypothetical protein  79.55 
 
 		 176 aa  297  6e-80  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4255  hypothetical protein  78.98 
 
 		 176 aa  295  3e-79  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4391  hypothetical protein  78.98 
 
 		 176 aa  295  3e-79  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4216  hypothetical protein  78.41 
 
 		 176 aa  293  7e-79  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0125  hypothetical protein  78.41 
 
 		 176 aa  293  7e-79  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4064  hypothetical protein  75.71 
 
 		 190 aa  287  6e-77  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.470038  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0126  hypothetical protein  75.57 
 
 		 176 aa  286  8e-77  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3867  hypothetical protein  68.18 
 
 		 176 aa  262  2e-69  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3600  hypothetical protein  72.56 
 
 		 176 aa  258  3e-68  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2855  hypothetical protein  47.46 
 
 		 178 aa  162  2.0000000000000002e-39  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2112  hypothetical protein  36.31 
 
 		 175 aa  106  2e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.461535 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1307  thioesterase superfamily protein  30.77 
 
 		 170 aa  95.1  4e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0109632  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2747  thioesterase superfamily protein  29.8 
 
 		 190 aa  91.3  7e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.47725  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2560  hypothetical protein  33.76 
 
 		 181 aa  88.2  6e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2447  hypothetical protein  30.82 
 
 		 159 aa  86.7  2e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17120  predicted thioesterase  33.78 
 
 		 183 aa  84.7  7e-16  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0664935  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2773  thioesterase superfamily protein  28.4 
 
 		 181 aa  84.7  7e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000495096 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3069  hypothetical protein  30.2 
 
 		 181 aa  84  0.000000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.422351  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0020  hypothetical protein  32.95 
 
 		 181 aa  82.8  0.000000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1753  thioesterase superfamily protein  29.7 
 
 		 172 aa  80.5  0.00000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0481119 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1459  thioesterase superfamily protein  31.72 
 
 		 200 aa  80.1  0.00000000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.794665  normal  0.592247 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2661  hypothetical protein  32.47 
 
 		 192 aa  79.3  0.00000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19420  predicted thioesterase  31.85 
 
 		 193 aa  79.3  0.00000000000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.605254  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15570  predicted thioesterase  31.47 
 
 		 175 aa  78.6  0.00000000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.509075  normal  1 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_34859  predicted protein  32 
 
 		 236 aa  78.6  0.00000000000005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0662849 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2657  hypothetical protein  28.76 
 
 		 190 aa  75.5  0.0000000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.200121  normal  0.579719 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0342  hypothetical protein  28.19 
 
 		 176 aa  74.7  0.0000000000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2088  thioesterase superfamily protein  29.73 
 
 		 172 aa  72.8  0.000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0701074  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2020  thioesterase superfamily protein  32.5 
 
 		 176 aa  72.4  0.000000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.786855  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0029  hypothetical protein  32.35 
 
 		 175 aa  71.6  0.000000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.786921  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0019  hypothetical protein  33.75 
 
 		 175 aa  68.6  0.00000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.273731  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1361  hypothetical protein  31.76 
 
 		 176 aa  67.8  0.00000000009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0546  hypothetical protein  28.9 
 
 		 187 aa  62.4  0.000000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.287146 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0028  hypothetical protein  27.7 
 
 		 180 aa  62.4  0.000000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0709725  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0640  hypothetical protein  32 
 
 		 185 aa  62  0.000000004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00713767  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2568  hypothetical protein  26.09 
 
 		 173 aa  62  0.000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.192272  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0558  hypothetical protein  34.45 
 
 		 184 aa  62  0.000000005  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.231595  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3336  hypothetical protein  25.16 
 
 		 178 aa  60.8  0.00000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_10158  conserved hypothetical protein  26.39 
 
 		 343 aa  55.5  0.0000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0033  hypothetical protein  29.73 
 
 		 180 aa  52.8  0.000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.156531  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_07874  conserved hypothetical protein  27.59 
 
 		 306 aa  50.8  0.00001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.310859  normal  1 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_33198  predicted protein  28.18 
 
 		 215 aa  43.1  0.002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF02360  expressed protein  25.93 
 
 		 371 aa  42  0.004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.880113  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>