101 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew185_2743 on replicon NC_009665
Organism: Shewanella baltica OS185



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009665  Shew185_2743  DSBA oxidoreductase  100 
 
 
219 aa  456  1e-127  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.206434  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2726  DSBA oxidoreductase  97.72 
 
 
219 aa  449  1e-125  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.421969  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1633  DSBA oxidoreductase  98.17 
 
 
219 aa  446  1e-125  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0944225  hitchhiker  0.0000450345 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1239  DsbA-like thioredoxin domain-containing protein  54.79 
 
 
219 aa  262  3e-69  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5458  DSBA oxidoreductase  39.91 
 
 
221 aa  178  4.999999999999999e-44  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.521103  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2048  DSBA oxidoreductase  36.61 
 
 
225 aa  171  5.999999999999999e-42  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.960977  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1578  hypothetical protein  38.01 
 
 
221 aa  169  3e-41  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2107  polyketide biosynthesis dithiol-disulfide isomerase-like protein  38.01 
 
 
221 aa  168  5e-41  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2405  polyketide biosynthesis dithiol-disulfide isomerase-like protein  38.12 
 
 
206 aa  162  5.0000000000000005e-39  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0747  polyketide biosynthesis dithiol-disulfide isomerase-like protein  26.84 
 
 
219 aa  68.2  0.00000000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4898  DSBA oxidoreductase  27.27 
 
 
226 aa  65.9  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3265  DSBA oxidoreductase  27.27 
 
 
226 aa  65.9  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.22208 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6909  DSBA oxidoreductase  27.27 
 
 
226 aa  65.5  0.0000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4435  DSBA oxidoreductase  26.77 
 
 
226 aa  63.5  0.000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.639129  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3424  DSBA oxidoreductase  26.77 
 
 
226 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1398  DSBA oxidoreductase  21.67 
 
 
237 aa  61.6  0.00000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.394424  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0326  DSBA oxidoreductase  24.08 
 
 
237 aa  60.5  0.00000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03790  predicted dithiol-disulfide isomerase involved in polyketide biosynthesis  22.81 
 
 
230 aa  60.5  0.00000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.288103  normal  0.160551 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1732  DSBA oxidoreductase  22.91 
 
 
223 aa  55.8  0.0000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.474005 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2508  DSBA oxidoreductase  18.75 
 
 
225 aa  55.8  0.0000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00396553  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1916  DSBA oxidoreductase  22.71 
 
 
223 aa  55.1  0.0000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.093015  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5215  hypothetical protein  22.17 
 
 
336 aa  54.3  0.000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00274094  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4753  DSBA oxidoreductase  24.34 
 
 
219 aa  54.3  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.803331  normal  0.448098 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2368  DSBA oxidoreductase  22.51 
 
 
203 aa  53.5  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.919583  normal  0.0250813 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0485  DSBA oxidoreductase  23.04 
 
 
216 aa  53.1  0.000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1944  DSBA oxidoreductase  21.43 
 
 
200 aa  52.8  0.000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1278  DSBA oxidoreductase  25.65 
 
 
222 aa  52.8  0.000004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.000336164  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1200  DSBA oxidoreductase  21.16 
 
 
237 aa  52.4  0.000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.153386  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1347  DSBA oxidoreductase  20.98 
 
 
233 aa  52.4  0.000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2969  DSBA oxidoreductase  27.51 
 
 
231 aa  52  0.000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0234378  hitchhiker  0.0000221384 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0361  DSBA oxidoreductase  21.31 
 
 
219 aa  51.6  0.000008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.843248 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2493  dithiol-disulfide isomerase  23.44 
 
 
242 aa  51.2  0.00001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.138653 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3082  DSBA oxidoreductase  22.83 
 
 
216 aa  51.6  0.00001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.275459  normal  0.192023 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3441  DSBA oxidoreductase  21.26 
 
 
215 aa  51.2  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.486771  normal  0.667437 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6659  DSBA oxidoreductase  22.01 
 
 
218 aa  50.4  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.405841 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1583  DSBA oxidoreductase  23.4 
 
 
210 aa  50.1  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2369  polyketide biosynthesis associated protein  20.21 
 
 
223 aa  50.4  0.00002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0641  DSBA oxidoreductase  20.69 
 
 
220 aa  50.1  0.00003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.109842 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0210  DSBA oxidoreductase  21.62 
 
 
213 aa  49.3  0.00004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4261  isomerase, putative  22.99 
 
 
232 aa  48.9  0.00005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5468  hypothetical protein  20.83 
 
 
221 aa  48.9  0.00005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1922  DSBA oxidoreductase  22.04 
 
 
218 aa  48.5  0.00007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.65395  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2073  DSBA oxidoreductase  20.66 
 
 
256 aa  48.5  0.00008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.232317  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3785  DSBA oxidoreductase  19 
 
 
210 aa  48.1  0.00009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.400426  normal  0.0244722 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0024  DSBA oxidoreductase  19.52 
 
 
211 aa  48.1  0.00009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1263  hypothetical protein  28.43 
 
 
166 aa  48.1  0.0001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.552972  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1917  DSBA oxidoreductase  23.98 
 
 
217 aa  48.1  0.0001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0273  putative 2-hydroxychromene-2-carboxylate isomerase protein  25.23 
 
 
201 aa  47  0.0002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.723035  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0246  protein disulfide isomerase (S-S rearrangase)  23.56 
 
 
243 aa  47  0.0002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2709  DSBA oxidoreductase  21.24 
 
 
214 aa  47  0.0002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.111017  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18220  predicted dithiol-disulfide isomerase involved in polyketide biosynthesis  22.32 
 
 
218 aa  47.4  0.0002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1398  DSBA oxidoreductase  18.32 
 
 
221 aa  46.6  0.0003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.928742 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0177  DSBA oxidoreductase  22.16 
 
 
236 aa  46.6  0.0003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0249  protein disulfide isomerase (S-S rearrangase)  22.12 
 
 
243 aa  46.2  0.0004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0768855  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0963  DSBA oxidoreductase  21.5 
 
 
230 aa  46.2  0.0004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0391729  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1174  DSBA oxidoreductase  19.37 
 
 
239 aa  45.8  0.0004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.196548 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0738  DSBA oxidoreductase  21.21 
 
 
244 aa  46.2  0.0004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.122622 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0459  hypothetical protein  22.99 
 
 
212 aa  45.8  0.0005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0721  DSBA oxidoreductase  21.55 
 
 
244 aa  45.8  0.0005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.874736  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0329  protein disulfide isomerase  22.12 
 
 
243 aa  45.8  0.0005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00387004  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0301  protein disulfide isomerase  23.08 
 
 
243 aa  45.8  0.0005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0654  DSBA oxidoreductase  25.6 
 
 
220 aa  45.4  0.0007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3961  DSBA oxidoreductase  25.84 
 
 
222 aa  45.4  0.0007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5014  FrnE protein  23.08 
 
 
243 aa  45.1  0.0009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0127936  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12093  hypothetical protein  20.57 
 
 
214 aa  45.1  0.0009  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2718  DSBA oxidoreductase  24.1 
 
 
209 aa  44.7  0.001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0752849  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2832  DSBA oxidoreductase  21.69 
 
 
213 aa  44.3  0.001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.84064  normal  0.0678708 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3639  DSBA oxidoreductase  20.31 
 
 
224 aa  44.7  0.001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0633  DSBA oxidoreductase  25.6 
 
 
220 aa  44.7  0.001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.218426  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0622  DSBA oxidoreductase  21.29 
 
 
217 aa  43.5  0.002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4106  DSBA oxidoreductase  18.46 
 
 
229 aa  43.5  0.002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3756  DSBA oxidoreductase  21.47 
 
 
221 aa  43.5  0.002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.734213  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0240  DSBA oxidoreductase  20.28 
 
 
201 aa  43.5  0.002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3008  DSBA oxidoreductase  22.49 
 
 
248 aa  43.9  0.002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.533985  normal  0.21554 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1717  DSBA oxidoreductase  20.83 
 
 
221 aa  43.9  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2391  dithiol-disulfide isomerase  20.28 
 
 
319 aa  44.3  0.002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.20777  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1502  DSBA oxidoreductase  20.43 
 
 
214 aa  43.9  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.0283596 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0252  DSBA oxidoreductase  21.15 
 
 
243 aa  43.9  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2795  DSBA oxidoreductase  20.43 
 
 
207 aa  43.5  0.002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0308  FrnE protein  23.08 
 
 
243 aa  43.9  0.002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00686429  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2107  DSBA oxidoreductase  22.97 
 
 
226 aa  43.5  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1375  DSBA oxidoreductase  22.94 
 
 
215 aa  43.9  0.002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000103023  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0131  DSBA oxidoreductase  23.18 
 
 
201 aa  43.9  0.002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3389  DSBA oxidoreductase  19.15 
 
 
235 aa  43.5  0.003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.354876  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4223  DSBA oxidoreductase  21.03 
 
 
201 aa  43.5  0.003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.285896 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0123  DSBA oxidoreductase  23.18 
 
 
201 aa  43.1  0.003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.553572  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01056  probable DSBA oxidoreductase  20.39 
 
 
211 aa  43.5  0.003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6638  DsbA oxidoreductase  20.66 
 
 
231 aa  43.1  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0141  DSBA oxidoreductase  23.68 
 
 
219 aa  42.7  0.004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3237  DSBA oxidoreductase  21.43 
 
 
223 aa  43.1  0.004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4029  DSBA oxidoreductase  28.91 
 
 
206 aa  42.7  0.004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0020  DSBA oxidoreductase  20 
 
 
211 aa  42.7  0.004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0967  DSBA oxidoreductase  22.63 
 
 
220 aa  43.1  0.004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.431519  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22550  predicted dithiol-disulfide isomerase involved in polyketide biosynthesis  19.37 
 
 
227 aa  42.7  0.004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1979  DSBA oxidoreductase  22.34 
 
 
224 aa  42.4  0.005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1557  putative DSBA oxidoreductase  19.35 
 
 
222 aa  42.7  0.005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.455666  normal  0.262117 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1148  DSBA oxidoreductase  20.2 
 
 
237 aa  42.4  0.006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1542  DSBA oxidoreductase  22.16 
 
 
224 aa  41.6  0.008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.208286 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0746  DSBA oxidoreductase  21.39 
 
 
215 aa  41.6  0.009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2541  DSBA oxidoreductase  21.6 
 
 
247 aa  41.6  0.009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>