105 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_08930 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013165  Shel_08930  YGGT family protein  100 
 
 		 84 aa  164  4e-40  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.384516  hitchhiker  0.0000000251444 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2082  protein of unknown function YGGT  60.98 
 
 		 86 aa  109  1.0000000000000001e-23  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0261764  hitchhiker  0.000000000000996106 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1036  protein of unknown function YGGT  46.75 
 
 		 89 aa  72.8  0.000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000119033  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09420  YGGT family protein  44.93 
 
 		 86 aa  71.6  0.000000000003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0374287  normal  0.111305 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1906  protein of unknown function YGGT  45.59 
 
 		 90 aa  68.2  0.00000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0477  hypothetical protein  45.21 
 
 		 99 aa  63.5  0.000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3749  ylmG protein  37.04 
 
 		 87 aa  61.2  0.000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0442014  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3640  hypothetical protein  37.04 
 
 		 87 aa  61.2  0.000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000138235  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3657  hypothetical protein  37.04 
 
 		 87 aa  61.2  0.000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.516535  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4037  hypothetical protein  37.04 
 
 		 87 aa  61.2  0.000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000926366  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2547  protein of unknown function YGGT  42.19 
 
 		 87 aa  61.2  0.000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.167983  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3912  ylmG protein  37.04 
 
 		 87 aa  61.2  0.000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000638636 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3943  ylmG protein  35 
 
 		 87 aa  61.2  0.000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00794391  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3950  ylmG protein  37.04 
 
 		 87 aa  61.2  0.000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000361919  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3999  ylmG protein  40.62 
 
 		 87 aa  60.8  0.000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000449706  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1242  ylmG protein  39.06 
 
 		 87 aa  60.1  0.00000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000199997  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1199  cell division membrane protein  40.28 
 
 		 98 aa  58.9  0.00000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3725  protein of unknown function YGGT  41.54 
 
 		 87 aa  59.3  0.00000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00556578  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2189  protein of unknown function YGGT  40.54 
 
 		 96 aa  57.4  0.00000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.318304  normal  0.111036 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0755  ylmG protein  40 
 
 		 96 aa  55.8  0.0000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.298424  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1412  protein of unknown function YGGT  44.44 
 
 		 186 aa  55.5  0.0000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0014  hypothetical protein  38.82 
 
 		 98 aa  53.5  0.0000008  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08491  integral membrane protein  41.67 
 
 		 102 aa  53.5  0.0000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.321113  hitchhiker  0.00153658 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1212  protein of unknown function YGGT  46.77 
 
 		 182 aa  53.5  0.000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0177861 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1237  protein of unknown function YGGT  34.62 
 
 		 89 aa  52.8  0.000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.371486  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0493  protein of unknown function YGGT  38.96 
 
 		 92 aa  52.8  0.000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.197871  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15401  hypothetical protein  37.33 
 
 		 99 aa  52.4  0.000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.393994 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3329  protein of unknown function YGGT  38.27 
 
 		 98 aa  52.4  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1490  cell division membrane protein  42.86 
 
 		 87 aa  52  0.000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1085  protein of unknown function YGGT  37.04 
 
 		 87 aa  50.8  0.000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0000000150484  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09931  hypothetical protein  36.71 
 
 		 92 aa  49.7  0.00001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_10630  predicted protein  42.19 
 
 		 76 aa  50.1  0.00001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3109  hypothetical protein  38.67 
 
 		 92 aa  49.3  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.264306  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1433  hypothetical protein  36.84 
 
 		 98 aa  49.3  0.00002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.116879 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0890  hypothetical protein  35.44 
 
 		 92 aa  49.3  0.00002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09511  hypothetical protein  35.44 
 
 		 92 aa  49.3  0.00002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.545335  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0714  protein of unknown function YGGT  38.89 
 
 		 84 aa  48.9  0.00002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.674624  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0369  protein of unknown function YGGT  40 
 
 		 196 aa  48.9  0.00002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.758714  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1411  protein of unknown function YGGT  36.49 
 
 		 84 aa  48.5  0.00003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000759704  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4087  protein of unknown function YGGT  32.84 
 
 		 186 aa  48.5  0.00003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.300525  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1018  protein of unknown function YGGT  40.48 
 
 		 85 aa  48.9  0.00003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4199  protein of unknown function YGGT  32.84 
 
 		 186 aa  48.5  0.00003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.7106  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4761  protein of unknown function YGGT  47.92 
 
 		 106 aa  48.1  0.00004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.211635 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5096  hypothetical protein  37.31 
 
 		 196 aa  47.8  0.00005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.109817  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0297  hypothetical protein  42.42 
 
 		 100 aa  47.8  0.00005  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.475908  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09691  hypothetical protein  42.42 
 
 		 100 aa  47.8  0.00005  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0755134  normal  0.205345 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5321  hypothetical protein  32.88 
 
 		 196 aa  47.8  0.00006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.223141 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09491  hypothetical protein  37.18 
 
 		 92 aa  47.4  0.00006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.291422  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4969  protein of unknown function YGGT  36.92 
 
 		 196 aa  47.4  0.00008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0595  protein of unknown function YGGT  34.67 
 
 		 86 aa  47  0.00008  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000102021  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5146  protein of unknown function YGGT  36.92 
 
 		 196 aa  47.4  0.00008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.605809  normal  0.987937 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0994  hypothetical protein  39.47 
 
 		 92 aa  47  0.00009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0252519  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03300  hypothetical protein  37.31 
 
 		 178 aa  46.6  0.0001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5048  YGGT family protein  32.88 
 
 		 196 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.710638  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0475  hypothetical protein  32.88 
 
 		 196 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1230  protein of unknown function YGGT  36.07 
 
 		 182 aa  46.2  0.0002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.000000825612  normal  0.409234 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0438  protein of unknown function YGGT  36.05 
 
 		 92 aa  45.4  0.0002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000112129 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0261  YGGT family protein  36.05 
 
 		 92 aa  45.4  0.0002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.634053  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4335  protein of unknown function YGGT  40 
 
 		 97 aa  45.4  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.680603  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03060  hypothetical protein  35.82 
 
 		 197 aa  45.4  0.0003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0479202  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1249  hypothetical protein  39.34 
 
 		 96 aa  44.7  0.0004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0000234986  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1274  hypothetical protein  39.34 
 
 		 96 aa  44.7  0.0004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000722021  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2521  protein of unknown function YGGT  43.18 
 
 		 91 aa  44.7  0.0004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3585  protein of unknown function YGGT  43.18 
 
 		 91 aa  44.7  0.0004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0833218  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0492  hypothetical protein  32.84 
 
 		 197 aa  43.9  0.0007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02782  predicted inner membrane protein  37.5 
 
 		 188 aa  43.5  0.0009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.104199  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0743  protein of unknown function YGGT  37.5 
 
 		 188 aa  43.5  0.0009  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2059  hypothetical protein  37.5 
 
 		 91 aa  43.5  0.0009  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3112  YGGT family protein  37.5 
 
 		 188 aa  43.5  0.0009  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3296  YGGT family protein  37.5 
 
 		 188 aa  43.5  0.0009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0762  protein of unknown function YGGT  37.5 
 
 		 188 aa  43.5  0.0009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000437553 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3094  YGGT family protein  37.5 
 
 		 188 aa  43.5  0.0009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000274597 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4255  YGGT family protein  37.5 
 
 		 188 aa  43.5  0.0009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.809329  normal  0.660406 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02745  hypothetical protein  37.5 
 
 		 188 aa  43.5  0.0009  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.090594  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2785  hypothetical protein  33.78 
 
 		 193 aa  43.1  0.001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.555098  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3001  hypothetical protein  35.71 
 
 		 187 aa  43.5  0.001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1838  hypothetical protein  35.29 
 
 		 189 aa  43.1  0.001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000231673  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1838  protein of unknown function YGGT  41.67 
 
 		 183 aa  43.1  0.001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05130  hypothetical protein  32.84 
 
 		 197 aa  43.5  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.409368  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0989  protein of unknown function YGGT  32.89 
 
 		 114 aa  43.5  0.001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3384  YGGT family protein  37.5 
 
 		 188 aa  43.5  0.001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0339  protein of unknown function YGGT  36.99 
 
 		 192 aa  42.7  0.002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_41246  predicted protein  35.09 
 
 		 91 aa  42.7  0.002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0509332  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4152  protein of unknown function YGGT  31.82 
 
 		 197 aa  42.4  0.002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.762639 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3938  protein of unknown function YGGT  36.11 
 
 		 95 aa  42.4  0.002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0272486 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1971  protein of unknown function YGGT  30.43 
 
 		 84 aa  42.7  0.002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.188366 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1785  protein of unknown function YGGT  37.5 
 
 		 188 aa  41.6  0.003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.40551  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1066  hypothetical protein  36.36 
 
 		 98 aa  41.6  0.004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3096  protein of unknown function YGGT  35.21 
 
 		 102 aa  41.6  0.004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.669144  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0018  protein of unknown function YGGT  28.21 
 
 		 95 aa  41.2  0.004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.292831  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3842  protein of unknown function YGGT  44.07 
 
 		 84 aa  41.6  0.004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2449  protein of unknown function YGGT  38.03 
 
 		 187 aa  41.2  0.005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.550896  normal  1 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_36034  predicted protein  32.88 
 
 		 237 aa  41.2  0.005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.119025  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2595  protein of unknown function YGGT  42.22 
 
 		 182 aa  41.2  0.005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4049  protein of unknown function YGGT  39.44 
 
 		 187 aa  40.8  0.006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0807  protein of unknown function YGGT  38.03 
 
 		 187 aa  40.8  0.006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.968375  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0818  protein of unknown function YGGT  38.03 
 
 		 187 aa  40.8  0.006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0880  hypothetical protein  36.62 
 
 		 187 aa  40.8  0.007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.123554  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0469  protein of unknown function YGGT  38.03 
 
 		 187 aa  40.4  0.007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0948  protein of unknown function YGGT  38.03 
 
 		 187 aa  40.4  0.007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.199708  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>