More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_01850 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013165  Shel_01850  aspartate aminotransferase  100 
 
 		 395 aa  808    Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02010  aspartate aminotransferase  60.56 
 
 		 393 aa  499  1e-140  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.951604 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0186  aspartate aminotransferase  60.15 
 
 		 393 aa  478  1e-134  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0140573  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0108  aspartate aminotransferase  57.11 
 
 		 394 aa  451  1e-125  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.301084 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3530  aspartate aminotransferase  46.56 
 
 		 395 aa  382  1e-105  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00117906  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0522  aspartate aminotransferase  45.15 
 
 		 396 aa  369  1e-101  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.138181  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2311  aspartate aminotransferase  45.41 
 
 		 398 aa  367  1e-100  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000726355  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1965  aspartate aminotransferase  43.77 
 
 		 393 aa  325  7e-88  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1888  aspartate aminotransferase  42.02 
 
 		 396 aa  316  4e-85  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000042706  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2600  aspartate aminotransferase  43.08 
 
 		 397 aa  315  6e-85  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00026488  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0081  aspartate aminotransferase  44.5 
 
 		 395 aa  314  1.9999999999999998e-84  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0248669  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1313  aspartate aminotransferase  40.66 
 
 		 397 aa  311  1e-83  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000211162 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1046  aspartate aminotransferase  42.41 
 
 		 398 aa  311  1e-83  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0961  aspartate aminotransferase  41.95 
 
 		 397 aa  308  8e-83  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.173671 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2093  aspartate aminotransferase  41.84 
 
 		 393 aa  308  1.0000000000000001e-82  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0365484  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3287  aspartate aminotransferase  42.22 
 
 		 397 aa  307  2.0000000000000002e-82  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0240122  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1171  aspartate aminotransferase  42.86 
 
 		 396 aa  304  2.0000000000000002e-81  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27170  aspartate aminotransferase  42.64 
 
 		 393 aa  303  4.0000000000000003e-81  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.842798  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1148  aspartate aminotransferase  40.89 
 
 		 395 aa  301  2e-80  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000148908  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0580  aspartate aminotransferase  39.29 
 
 		 397 aa  299  6e-80  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3354  aspartate aminotransferase  40.9 
 
 		 396 aa  298  1e-79  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1061  aspartate aminotransferase  41.05 
 
 		 398 aa  296  5e-79  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0613658  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2027  aspartate aminotransferase  37.82 
 
 		 396 aa  285  1.0000000000000001e-75  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00000000277317  hitchhiker  0.0077207 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0732  aspartate aminotransferase  39.69 
 
 		 397 aa  281  1e-74  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3303  aspartate aminotransferase  40 
 
 		 397 aa  275  1.0000000000000001e-72  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.597513  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2889  aspartate aminotransferase  37.82 
 
 		 394 aa  268  1e-70  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.425013 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1103  aspartate aminotransferase  39.21 
 
 		 461 aa  268  2e-70  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2089  aspartate aminotransferase  39.74 
 
 		 398 aa  267  2.9999999999999995e-70  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.12088  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2140  aspartate aminotransferase  36.83 
 
 		 393 aa  264  2e-69  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0565  aspartate aminotransferase  41.6 
 
 		 398 aa  254  2.0000000000000002e-66  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0562  aspartate aminotransferase  41.6 
 
 		 398 aa  253  3e-66  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0533  aspartate aminotransferase  41.85 
 
 		 400 aa  249  7e-65  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.865322  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3157  aminotransferase  33.51 
 
 		 405 aa  202  9.999999999999999e-51  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2832  aminotransferase class I and II  33.16 
 
 		 404 aa  195  1e-48  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.642914 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5530  aminotransferase class I and II  33.33 
 
 		 397 aa  186  8e-46  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.490736 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3525  aminotransferase  30.58 
 
 		 403 aa  169  1e-40  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2315  aminotransferase  31.28 
 
 		 389 aa  166  5.9999999999999996e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1558  aminotransferase class I and II  30.65 
 
 		 389 aa  162  1e-38  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1633  aminotransferase class I and II  30.48 
 
 		 389 aa  158  1e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1291  aminotransferase class I and II  30.97 
 
 		 389 aa  158  2e-37  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.406231  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0542  aminotransferase, class I and II  29.11 
 
 		 367 aa  155  2e-36  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0515807  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4968  aminotransferase class I and II  31.73 
 
 		 404 aa  152  8e-36  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.121403 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2798  aminotransferase class I and II  30.27 
 
 		 396 aa  152  1e-35  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0003  aminotransferase, class I and II  31.76 
 
 		 386 aa  152  1e-35  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.987312  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0003  aminotransferase, class I and II  29.02 
 
 		 385 aa  150  5e-35  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2545  aspartate aminotransferase  30.49 
 
 		 392 aa  149  7e-35  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.112284  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0003  aminotransferase  29.63 
 
 		 387 aa  148  1.0000000000000001e-34  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0517  aminotransferase  27.27 
 
 		 375 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0698  L-aspartate aminotransferase  31.5 
 
 		 401 aa  148  2.0000000000000003e-34  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00325114  normal  0.844303 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3724  aminotransferase class I and II  29.55 
 
 		 404 aa  147  3e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.856402  normal  0.603693 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0044  aromatic amino acid aminotransferase  30.77 
 
 		 395 aa  147  3e-34  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1817  aminotransferase class I and II  28.61 
 
 		 385 aa  145  1e-33  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1490  L-aspartate aminotransferase  31.52 
 
 		 396 aa  145  1e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1696  aminotransferase, class I and II  29.44 
 
 		 397 aa  144  2e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0798597  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0744  aminotransferase  29.49 
 
 		 394 aa  143  4e-33  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0285306  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1888  aminotransferase  28.57 
 
 		 370 aa  143  5e-33  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0376  aminotransferase, class I and II  27.08 
 
 		 373 aa  143  6e-33  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.276364  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4784  aspartate aminotransferase  28.13 
 
 		 387 aa  142  9.999999999999999e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1587  aminotransferase class I and II  26.67 
 
 		 375 aa  142  9.999999999999999e-33  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.472479  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1955  aminotransferase  29.07 
 
 		 392 aa  141  1.9999999999999998e-32  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0276062 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2099  aminotransferase  28.57 
 
 		 391 aa  141  1.9999999999999998e-32  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0325  aminotransferase class I and II  26.41 
 
 		 375 aa  141  1.9999999999999998e-32  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.303015  hitchhiker  0.000770827 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2861  hypothetical protein  31.1 
 
 		 390 aa  141  1.9999999999999998e-32  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1569  aminotransferase  30.61 
 
 		 398 aa  140  3e-32  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0710  aspartate aminotransferase  29.87 
 
 		 382 aa  140  3e-32  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0388  aminotransferase class I and II  29.82 
 
 		 392 aa  140  3.9999999999999997e-32  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3512  hypothetical protein  27.34 
 
 		 396 aa  138  2e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1128  aspartate/tyrosine/aromatic aminotransferase  28.93 
 
 		 394 aa  138  2e-31  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0056  aspartate aminotransferase  26.19 
 
 		 379 aa  137  3.0000000000000003e-31  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0880  aminotransferase, class I and II  28.5 
 
 		 396 aa  137  3.0000000000000003e-31  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0507  aspartate aminotransferase  28.82 
 
 		 393 aa  137  3.0000000000000003e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1192  aminotransferase class I and II  25.45 
 
 		 375 aa  137  4e-31  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0003  aminotransferase class I and II  28.31 
 
 		 388 aa  137  4e-31  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.00871395 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03600  aspartate aminotransferase  28.82 
 
 		 411 aa  137  4e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.589987  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1440  aspartate aminotransferase, putative  29.89 
 
 		 399 aa  137  4e-31  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0755  aspartate aminotransferase  28.35 
 
 		 395 aa  137  4e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0928  aspartate aminotransferase  28.61 
 
 		 392 aa  137  5e-31  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.436477  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1747  aminotransferase, class I and II  29.46 
 
 		 396 aa  136  5e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1188  aminotransferase  27.86 
 
 		 404 aa  137  5e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0134588  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0421  aspartate aminotransferase  28.8 
 
 		 380 aa  136  7.000000000000001e-31  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.248364  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1457  aminotransferase class I and II  27.32 
 
 		 400 aa  136  7.000000000000001e-31  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14321  aminotransferases class-I  31 
 
 		 392 aa  136  7.000000000000001e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1200  aminotransferase  27.67 
 
 		 393 aa  136  7.000000000000001e-31  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.241319  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0545  aminotransferase class I and II  29.89 
 
 		 373 aa  135  9e-31  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2710  aminotransferase A  29.64 
 
 		 387 aa  135  9.999999999999999e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0183593  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1134  aspartate aminotransferase  26.7 
 
 		 387 aa  134  1.9999999999999998e-30  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.338962  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4126  aromatic amino acid aminotransferase  28.49 
 
 		 394 aa  134  1.9999999999999998e-30  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1627  aminotransferase, class I and II  30.75 
 
 		 393 aa  135  1.9999999999999998e-30  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.703964 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1911  aspartate aminotransferase  29.66 
 
 		 386 aa  134  1.9999999999999998e-30  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0860695  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0059  aspartate aminotransferase  28.2 
 
 		 376 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2047  aminotransferase class I and II  31.67 
 
 		 396 aa  135  1.9999999999999998e-30  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0730244  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3007  hypothetical protein  29.56 
 
 		 390 aa  135  1.9999999999999998e-30  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1250  aspartate aminotransferase  26.93 
 
 		 389 aa  134  3e-30  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000000188564  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3740  aminotransferase class I and II  28.61 
 
 		 397 aa  134  3e-30  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0346922  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3240  aminotransferase, class I and II  30.87 
 
 		 388 aa  134  3e-30  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.64695  normal  0.434806 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1620  aspartate aminotransferase  30.98 
 
 		 401 aa  134  3e-30  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.83573  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1623  aspartate aminotransferase  27.79 
 
 		 397 aa  134  3e-30  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.399039  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4133  aminotransferase A  29.07 
 
 		 385 aa  134  3.9999999999999996e-30  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.562408  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3750  aminotransferase A  29.18 
 
 		 387 aa  133  3.9999999999999996e-30  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2062  aminotransferase class I and II  28.57 
 
 		 374 aa  134  3.9999999999999996e-30  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.928457  normal  0.422192 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>