More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_3674 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008554  Sfum_3674  two component transcriptional regulator  100 
 
 		 263 aa  528  1e-149  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.400914  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2666  two component transcriptional regulator  51.5 
 
 		 255 aa  232  6e-60  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.128945  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3740  two component transcriptional regulator  53.12 
 
 		 226 aa  229  4e-59  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.487084  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1842  two component transcriptional regulator  51.32 
 
 		 240 aa  228  7e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1478  two component transcriptional regulator  50.85 
 
 		 240 aa  227  1e-58  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000111909  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0902  two component transcriptional regulator  52.23 
 
 		 224 aa  227  1e-58  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.375579  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1196  two-component transcriptional regulator  51.32 
 
 		 238 aa  226  2e-58  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0785  two component transcriptional regulator, winged helix family  50.67 
 
 		 226 aa  226  2e-58  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0435  DNA-binding response regulator  53.39 
 
 		 228 aa  226  3e-58  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0450  two component transcriptional regulator  53.15 
 
 		 227 aa  226  4e-58  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0612  DNA-binding response regulator  51.13 
 
 		 235 aa  223  2e-57  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.688885  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0611  DNA-binding response regulator  51.13 
 
 		 235 aa  223  2e-57  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1442  two component transcriptional regulator  50.66 
 
 		 230 aa  223  2e-57  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3078  two component transcriptional regulator  50.9 
 
 		 234 aa  223  3e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3442  two component transcriptional regulator  49.78 
 
 		 241 aa  223  3e-57  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.297648  normal  0.0871248 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2141  two component transcriptional regulator, winged helix family  49.13 
 
 		 241 aa  222  4e-57  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.316028  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1727  two component transcriptional regulator  51.36 
 
 		 228 aa  222  6e-57  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.284746  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2012  winged helix family two component transcriptional regulator  50.9 
 
 		 241 aa  221  8e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.566736  normal  0.606644 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0944  two component transcriptional regulator  48.87 
 
 		 225 aa  221  9.999999999999999e-57  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.091613  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3517  two component transcriptional regulator  49.78 
 
 		 238 aa  221  9.999999999999999e-57  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0423488  normal  0.321822 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0189  two component transcriptional regulator, winged helix family  50.66 
 
 		 231 aa  220  1.9999999999999999e-56  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.364869 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0943  two component transcriptional regulator  49.77 
 
 		 223 aa  219  3e-56  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0172896  normal  0.994999 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1074  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.88 
 
 		 248 aa  219  3.9999999999999997e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.798214 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0704  two component transcriptional regulator, winged helix family  49.32 
 
 		 227 aa  219  3.9999999999999997e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.205827  normal  0.593451 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0329  response regulator receiver  48.9 
 
 		 232 aa  218  7.999999999999999e-56  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5481  two component transcriptional regulator, winged helix family  49.55 
 
 		 228 aa  217  1e-55  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.537932  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0275  two component transcriptional regulator  50 
 
 		 228 aa  218  1e-55  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0264375 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0376  two component transcriptional regulator, winged helix family  48.9 
 
 		 232 aa  216  2e-55  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9846  two component response regulator  46.15 
 
 		 225 aa  216  2e-55  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0638  two component transcriptional regulator  48.91 
 
 		 233 aa  217  2e-55  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.403787  normal  0.96994 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0925  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.46 
 
 		 248 aa  216  2e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0932454  normal  0.0109566 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0451  DNA-binding response regulator  46.67 
 
 		 224 aa  216  2.9999999999999998e-55  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.313098  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0406  two component transcriptional regulator, winged helix family  48.9 
 
 		 232 aa  216  2.9999999999999998e-55  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.076876  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2913  two component transcriptional regulator  50.66 
 
 		 227 aa  216  2.9999999999999998e-55  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0379396  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1370  two component response regulator  48.89 
 
 		 252 aa  216  4e-55  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3081  two component signal transduction response regulator  48.43 
 
 		 223 aa  215  5e-55  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1233  two component transcriptional regulator  49.33 
 
 		 226 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03339  Response regulator consisting of a CheY-like receiver domain and a winged-helix DNA-binding domain  47.98 
 
 		 226 aa  214  9.999999999999999e-55  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4527  two component transcriptional regulator  49.1 
 
 		 226 aa  213  2.9999999999999995e-54  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4516  two component transcriptional regulator  48.42 
 
 		 225 aa  213  2.9999999999999995e-54  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.158523  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0767  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.51 
 
 		 229 aa  212  3.9999999999999995e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.870104  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4798  two component transcriptional regulator  50.66 
 
 		 230 aa  212  4.9999999999999996e-54  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.358461 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3484  two component transcriptional regulator  46.67 
 
 		 249 aa  212  4.9999999999999996e-54  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.524014  normal  0.179131 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3383  two component transcriptional regulator  45.98 
 
 		 224 aa  211  7.999999999999999e-54  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0243  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.22 
 
 		 224 aa  211  9e-54  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000226454  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2409  two component transcriptional regulator  48.2 
 
 		 226 aa  211  9e-54  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.615174  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2907  winged helix family two component transcriptional regulator  48.2 
 
 		 226 aa  211  1e-53  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  hitchhiker  0.00514074  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2784  two component transcriptional regulator  48.2 
 
 		 226 aa  211  1e-53  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2157  two component transcriptional regulator, winged helix family  49.78 
 
 		 226 aa  211  1e-53  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6011  two component transcriptional regulator  49.78 
 
 		 224 aa  209  3e-53  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2085  two component transcriptional regulator  49.78 
 
 		 224 aa  209  3e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2066  two component transcriptional regulator  49.78 
 
 		 224 aa  209  3e-53  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2236  two component transcriptional regulator  48.68 
 
 		 227 aa  209  4e-53  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.214459  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3447  two component transcriptional regulator  44.44 
 
 		 277 aa  209  4e-53  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.679069  normal  0.861336 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2950  two component transcriptional regulator, winged helix family  48.18 
 
 		 258 aa  209  5e-53  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0307025  normal  0.153934 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0419  two component transcriptional regulator  48.25 
 
 		 229 aa  209  5e-53  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.509677  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1599  two component transcriptional regulator  47.75 
 
 		 228 aa  208  6e-53  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.118902  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0130  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.15 
 
 		 224 aa  208  6e-53  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00147609  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2876  two component transcriptional regulator  47.75 
 
 		 226 aa  208  6e-53  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.5251  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3099  two component transcriptional regulator  54.5 
 
 		 235 aa  208  6e-53  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.663462 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0227  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.78 
 
 		 224 aa  208  9e-53  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3985  two component heavy metal response transcriptional regulator, winged helix family  50.23 
 
 		 226 aa  207  1e-52  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1972  two component transcriptional regulator  50 
 
 		 224 aa  207  2e-52  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.41262  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2102  two component transcriptional regulator  50 
 
 		 224 aa  207  2e-52  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2259  two component heavy metal response transcriptional regulator  49.32 
 
 		 225 aa  206  4e-52  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3743  two component transcriptional regulator  47.14 
 
 		 248 aa  204  8e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4625  two component transcriptional regulator  47.14 
 
 		 248 aa  204  8e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.560718 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5679  two component transcriptional regulator  47.14 
 
 		 248 aa  205  8e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.636814 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5688  two component transcriptional regulator  48.87 
 
 		 224 aa  204  9e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0612982 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0280  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.5 
 
 		 225 aa  204  9e-52  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0451  two component heavy metal response transcriptional regulator  47.06 
 
 		 230 aa  204  1e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3752  two component transcriptional regulator  48.42 
 
 		 224 aa  204  1e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1986  two component heavy metal response transcriptional regulator  47.77 
 
 		 223 aa  204  1e-51  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0566795  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4616  two component transcriptional regulator  48.42 
 
 		 224 aa  204  1e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.055256 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5978  regulatory protein CzcR  47.96 
 
 		 225 aa  203  2e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000269255  normal  0.0723212 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4293  two component transcriptional regulator  46.22 
 
 		 224 aa  204  2e-51  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000934276  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4055  two component heavy metal response transcriptional regulator, winged helix family  48.87 
 
 		 226 aa  203  2e-51  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3297  DNA-binding heavy metal response regulator, putative  46.64 
 
 		 227 aa  202  3e-51  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.441835  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3127  response regulator receiver:transcriptional regulatory protein, C-terminal  46.19 
 
 		 227 aa  202  4e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.674952  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0274  DNA-binding response regulator  45.13 
 
 		 272 aa  202  4e-51  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1780  two component heavy metal response transcriptional regulator, winged helix family  47.96 
 
 		 228 aa  202  4e-51  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.817023  normal  0.826624 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0919  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.49 
 
 		 227 aa  202  5e-51  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.767242 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0378  DNA-binding heavy metal response regulator  46.15 
 
 		 224 aa  201  7e-51  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13760  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  45.54 
 
 		 225 aa  201  7e-51  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4106  two component heavy metal response transcriptional regulator  47.35 
 
 		 223 aa  201  8e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.971428 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1948  response regulator receiver domain-containing protein  48.44 
 
 		 226 aa  201  8e-51  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.679676 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2337  two component heavy metal response transcriptional regulator  46.61 
 
 		 227 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4800  heavy metal response regulator  46.15 
 
 		 224 aa  201  9.999999999999999e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00185939 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1718  two component heavy metal response transcriptional regulator, winged helix family  47.51 
 
 		 228 aa  201  9.999999999999999e-51  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.348336  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5335  two component heavy metal response transcriptional regulator, winged helix family  47.51 
 
 		 228 aa  201  9.999999999999999e-51  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.733276  normal  0.970872 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1236  two component heavy metal response transcriptional regulator  46.58 
 
 		 219 aa  201  9.999999999999999e-51  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2192  two component heavy metal response transcriptional regulator  49.1 
 
 		 230 aa  201  9.999999999999999e-51  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2084  DNA-binding heavy metal response regulator  49.1 
 
 		 230 aa  201  9.999999999999999e-51  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000771382  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1461  two component heavy metal response transcriptional regulator  49.77 
 
 		 227 aa  200  1.9999999999999998e-50  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0655  two component response regulator transcription regulator protein  47.51 
 
 		 228 aa  200  1.9999999999999998e-50  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.81937 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5099  two component heavy metal response transcriptional regulator, winged helix family  46.75 
 
 		 228 aa  200  1.9999999999999998e-50  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0773075 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3888  two component transcriptional regulator  45.7 
 
 		 223 aa  200  1.9999999999999998e-50  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.130623  normal  0.799765 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1760  two component heavy metal response transcriptional regulator, winged helix family  47.06 
 
 		 225 aa  200  1.9999999999999998e-50  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.133831  normal  0.402692 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4757  two component heavy metal response transcriptional regulator  46.9 
 
 		 223 aa  200  1.9999999999999998e-50  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0878196  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3410  two component heavy metal response transcriptional regulator  46.9 
 
 		 223 aa  200  1.9999999999999998e-50  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>