More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_3166 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008554  Sfum_3166  ABC transporter related  100 
 
 		 242 aa  500  1e-141  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.631435  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3964  ABC transporter related  59.75 
 
 		 258 aa  310  1e-83  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4332  ABC transporter related  59.75 
 
 		 258 aa  310  2e-83  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.282174 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2805  ABC transporter related protein  63.64 
 
 		 242 aa  309  2e-83  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4441  ABC transporter related  59.34 
 
 		 255 aa  308  5e-83  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.103673 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0502  ABC transporter related  62.66 
 
 		 244 aa  307  8e-83  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2217  ABC transporter related  61.41 
 
 		 243 aa  305  4.0000000000000004e-82  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.565902  normal  0.472801 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1477  ABC transporter related  62.81 
 
 		 242 aa  304  7e-82  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0593  ABC transporter related  58.09 
 
 		 241 aa  304  9.000000000000001e-82  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.180749  normal  0.457666 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0567  ABC transporter related  58.09 
 
 		 241 aa  304  9.000000000000001e-82  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2570  ABC transporter related  58.51 
 
 		 241 aa  303  1.0000000000000001e-81  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0998599  normal  0.044732 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2028  ABC transporter related  61 
 
 		 242 aa  303  1.0000000000000001e-81  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00425116  hitchhiker  0.0013644 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2788  ABC transporter related  61.41 
 
 		 243 aa  303  2.0000000000000002e-81  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2258  ABC transporter related  57.44 
 
 		 286 aa  302  3.0000000000000004e-81  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.21556  normal  0.633697 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2835  ABC transporter related  59.5 
 
 		 246 aa  301  6.000000000000001e-81  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.950118  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2763  ATPase  61 
 
 		 243 aa  300  1e-80  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1526  ABC transporter, ATPase subunit  58.26 
 
 		 247 aa  300  2e-80  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.529546  normal  0.291896 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2909  ABC transporter related  59.5 
 
 		 246 aa  299  3e-80  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.530548  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0775  polar amino acid ABC transporter ATP-binding protein  59.34 
 
 		 241 aa  298  4e-80  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2136  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  59.34 
 
 		 241 aa  298  4e-80  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.68203  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0834  ABC polar amino acid transporter, ATPase subunit  59.34 
 
 		 249 aa  298  4e-80  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0918561 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2609  polar amino acid ABC transporter ATP-binding protein  59.34 
 
 		 241 aa  298  4e-80  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.647404  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3005  polar amino acid ABC transporter ATP-binding protein  59.34 
 
 		 241 aa  298  4e-80  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1547  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  59.34 
 
 		 241 aa  298  4e-80  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2005  polar amino acid ABC transporter ATP-binding protein  59.34 
 
 		 241 aa  298  4e-80  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.545359  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0055  general L-amino acid transport ATP-binding protein  59.58 
 
 		 268 aa  298  5e-80  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4546  ABC transporter related  58.09 
 
 		 260 aa  298  5e-80  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.159121  normal  0.0112462 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4480  ABC transporter related  58.09 
 
 		 266 aa  298  6e-80  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.896076  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0713  ABC transporter related protein  60.17 
 
 		 245 aa  298  7e-80  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0161092  normal  0.0156766 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3151  ABC transporter related  58.09 
 
 		 242 aa  298  7e-80  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0859723 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0540  ABC transporter-related protein  61.16 
 
 		 243 aa  297  8e-80  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.453027  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07290  amino acid ABC transporter, ATP binding component  58.85 
 
 		 244 aa  296  1e-79  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.175528  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0396  ABC transporter related  59.17 
 
 		 262 aa  296  2e-79  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.254108  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3911  ABC transporter  55.74 
 
 		 244 aa  296  2e-79  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.357859  normal  0.229432 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0306  ABC glutamate/aspartate transporter, inner membrane subunit GltL  57.02 
 
 		 272 aa  296  2e-79  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1750  ABC glutamate/glutamine/aspartate/asparagine transporter, ATPase subunit bztD  59.17 
 
 		 262 aa  296  2e-79  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.135417  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1048  ABC transporter-like protein  60.17 
 
 		 245 aa  296  2e-79  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2552  ABC transporter related  58.26 
 
 		 245 aa  296  2e-79  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0221216  normal  0.68713 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2561  ABC transporter related  58.68 
 
 		 246 aa  296  2e-79  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.490284  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2068  ABC transporter related  59.09 
 
 		 247 aa  296  2e-79  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4373  ABC transporter related  56.85 
 
 		 264 aa  296  2e-79  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3926  putative amino acid transport protein, ATP-binding protein  57.85 
 
 		 247 aa  296  2e-79  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.296191  normal  0.474627 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0337  ABC transporter related  57.02 
 
 		 272 aa  296  3e-79  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0335  ABC transporter related  60.17 
 
 		 249 aa  296  3e-79  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.739682  normal  0.0719591 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3400  hypothetical protein  59.92 
 
 		 244 aa  295  4e-79  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0818421  normal  0.200559 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2500  ABC transporter related  58.75 
 
 		 262 aa  295  6e-79  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0972134  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0916  ABC transporter related  58.51 
 
 		 242 aa  295  6e-79  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6962  ABC transporter related  57.26 
 
 		 241 aa  294  9e-79  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1461  ABC transporter related  59.75 
 
 		 246 aa  293  1e-78  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0226  ABC transporter related  58.09 
 
 		 253 aa  293  1e-78  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.942715  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0321  glutamate/glutamine/aspartate/asparagine ABC transport ATP-binding  58.33 
 
 		 258 aa  293  2e-78  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.276358  normal  0.457002 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0239  ABC transporter related  57.85 
 
 		 241 aa  293  2e-78  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0693  ABC transporter-related protein  57.92 
 
 		 249 aa  293  2e-78  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.413615  normal  0.685528 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4250  ABC transporter related  59.34 
 
 		 257 aa  292  2e-78  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.682054  normal  0.0122802 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4774  ABC transporter related  59.34 
 
 		 241 aa  293  2e-78  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3860  ABC transporter related  57.68 
 
 		 253 aa  292  3e-78  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.192175  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0377  ABC transporter-like  57.38 
 
 		 244 aa  292  3e-78  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.250088 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1428  ATPase  58.51 
 
 		 242 aa  292  3e-78  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0630  ABC transporter related  57.92 
 
 		 263 aa  292  3e-78  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5813  ABC transporter ATP-binding protein  58.61 
 
 		 244 aa  292  3e-78  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.291445  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1757  ABC transporter related  57.5 
 
 		 257 aa  292  4e-78  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.931252  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02364  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase  56.85 
 
 		 249 aa  292  4e-78  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4538  ABC transporter-like  55.74 
 
 		 244 aa  292  4e-78  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.247485  normal  0.131551 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0679  ABC transporter related  56.85 
 
 		 288 aa  292  4e-78  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1116  ABC transporter related  57.5 
 
 		 267 aa  292  4e-78  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.888431  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67030  ABC transporter ATP-binding protein  58.61 
 
 		 244 aa  291  4e-78  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1075  ABC transporter related  56.02 
 
 		 250 aa  291  5e-78  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4046  ABC transporter ATP-binding protein  55.97 
 
 		 244 aa  291  6e-78  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1100  ABC transporter related  55.6 
 
 		 241 aa  291  6e-78  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3710  ABC transporter related  57.68 
 
 		 252 aa  291  6e-78  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.110417 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1105  ABC transporter related  57.08 
 
 		 258 aa  291  6e-78  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.750493 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6440  ABC transporter related  57.08 
 
 		 258 aa  291  6e-78  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1473  ABC transporter related  57.68 
 
 		 243 aa  291  7e-78  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0234902  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4174  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  55.33 
 
 		 244 aa  291  7e-78  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.481199  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0972  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  56.85 
 
 		 251 aa  291  7e-78  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000308614  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0739  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  57.08 
 
 		 269 aa  291  8e-78  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46950  putative ATP-binding component of ABC transporter  55.97 
 
 		 244 aa  291  8e-78  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.832772  hitchhiker  0.00625095 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3704  ABC transporter related  57.26 
 
 		 253 aa  291  9e-78  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.310389  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1560  ABC transporter related  57.5 
 
 		 257 aa  290  1e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.643949 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0347  glutamate/aspartate ABC transporter, ATP-binding protein  58.09 
 
 		 241 aa  290  1e-77  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.140639  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1208  glutamate/aspartate ABC transporter, ATP-binding protein  58.09 
 
 		 241 aa  290  1e-77  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.99175  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2434  glutamate/aspartate ABC transporter, ATP-binding protein  58.09 
 
 		 241 aa  290  1e-77  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.967343  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3583  ABC transporter related  56.02 
 
 		 241 aa  290  1e-77  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.161673  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3758  ABC amino acid transporter, ATPase subunit  57.68 
 
 		 241 aa  290  1e-77  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.850292 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2090  ABC transporter component  57.26 
 
 		 247 aa  290  1e-77  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.810567  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3674  ABC transporter related  59.34 
 
 		 265 aa  290  1e-77  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0297  ABC transporter related  57.08 
 
 		 263 aa  290  1e-77  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3393  glutamate/aspartate ABC transporter, ATP-binding protein  58.09 
 
 		 241 aa  290  1e-77  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2619  glutamate/aspartate ABC transporter, ATP-binding protein  58.09 
 
 		 241 aa  290  1e-77  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.861271  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3428  glutamate/aspartate ABC transporter, ATP-binding protein  58.09 
 
 		 241 aa  290  1e-77  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.901606  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3359  ABC transporter related  58.51 
 
 		 241 aa  290  2e-77  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00170504  hitchhiker  0.00000222316 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1189  ABC transporter related  57.26 
 
 		 241 aa  290  2e-77  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.703067  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2987  ABC transporter related  60.58 
 
 		 257 aa  290  2e-77  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.715624  normal  0.638101 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1228  glutamate/aspartate ABC transporter, ATP-binding protein  58.09 
 
 		 263 aa  289  2e-77  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0600  His/Glu/Gln/Arg/opine ABC transporter ATPase  58.51 
 
 		 241 aa  290  2e-77  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.252228  normal  0.258453 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2711  ABC transporter related  57.68 
 
 		 241 aa  290  2e-77  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3142  ABC transporter related protein  57.26 
 
 		 241 aa  290  2e-77  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0817  ABC transporter related  57.68 
 
 		 244 aa  289  2e-77  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.251466  normal  0.134022 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0230  ABC transporter related protein  57.26 
 
 		 253 aa  289  3e-77  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.653614  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0796  ABC transporter related  58.75 
 
 		 257 aa  289  3e-77  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.241057  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>