149 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeSA_A4463 on replicon NC_011094
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011094  SeSA_A4463  phage portal protein, HK97 family  100 
 
 
434 aa  899    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000679414 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1680  HK97 family phage portal protein  47.22 
 
 
416 aa  366  1e-100  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.905165  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1565  HK97 family phage portal protein  45.06 
 
 
431 aa  345  1e-93  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000649364 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1337  HK97 family phage portal protein  44.52 
 
 
444 aa  344  2e-93  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.253916 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1632  HK97 family phage portal protein  43.49 
 
 
429 aa  316  6e-85  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.543468  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2965  prophage LambdaSo, HK97 family portal protein  41.58 
 
 
432 aa  301  1e-80  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1602  phage portal protein, HK97 family  39.15 
 
 
434 aa  298  2e-79  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2594  phage portal protein, HK97 family  40.1 
 
 
434 aa  289  6e-77  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.601506  normal  0.257209 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3316  HK97 family phage portal protein  39.32 
 
 
416 aa  281  1e-74  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.246565 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1670  Phage portal protein, HK97  40.16 
 
 
407 aa  281  2e-74  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2069  HK97 family phage portal protein  39.32 
 
 
416 aa  280  3e-74  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1087  HK97 family portal protein , putative  37.62 
 
 
444 aa  273  3e-72  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1252  HK97 family phage portal protein  38.42 
 
 
420 aa  270  2.9999999999999997e-71  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1630  HK97 family phage portal protein  37.44 
 
 
440 aa  257  2e-67  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.506997  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0644  HK97 family phage portal protein  35.56 
 
 
401 aa  255  1.0000000000000001e-66  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0398  HK97 family phage portal protein  37.27 
 
 
414 aa  253  4.0000000000000004e-66  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2836  phage portal protein, HK97 family  37.27 
 
 
414 aa  253  4.0000000000000004e-66  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0360  HK97 family phage portal protein  36.71 
 
 
445 aa  251  2e-65  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0989  HK97 family phage portal protein  36.71 
 
 
445 aa  251  2e-65  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1483  hypothetical protein  36 
 
 
421 aa  251  3e-65  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0647  Phage portal protein, HK97  39.61 
 
 
434 aa  249  8e-65  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.239357  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5152  HK97 family phage portal protein  37.47 
 
 
412 aa  238  1e-61  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1286  HK97 family phage portal protein  37.97 
 
 
384 aa  234  3e-60  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.242  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7142  HK97 family phage portal protein  33.77 
 
 
524 aa  227  3e-58  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.994183  hitchhiker  0.00715135 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1544  Phage portal protein, HK97  35.77 
 
 
424 aa  221  3e-56  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1657  phage portal protein, HK97 family  35.79 
 
 
408 aa  216  4e-55  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2269  phage portal protein, HK97 family  34.25 
 
 
413 aa  211  3e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000275865 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2265  phage portal protein, HK97 family  34.25 
 
 
413 aa  210  4e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0612775 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3396  HK97 family phage portal protein  33.52 
 
 
445 aa  209  7e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0697474  hitchhiker  0.00000000693474 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1188  HK97 family phage portal protein  32.97 
 
 
413 aa  208  2e-52  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000136411 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1721  HK97 family phage portal protein  33.6 
 
 
419 aa  204  3e-51  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0869  HK97 family phage portal protein  34.55 
 
 
409 aa  202  7e-51  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3879  HK97 family phage portal protein  35.66 
 
 
423 aa  199  9e-50  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.49861  normal  0.0112805 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2273  phage portal protein, HK97 family  32.97 
 
 
425 aa  193  4e-48  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1697  phage portal protein, HK97 family  32.97 
 
 
425 aa  193  4e-48  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1313  phage portal protein, HK97 family  32.97 
 
 
425 aa  193  4e-48  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1469  HK97 family portal protein  29.86 
 
 
390 aa  189  1e-46  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1336  HK97 family phage portal protein  29.97 
 
 
417 aa  181  2e-44  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.352989  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3972  HK97 family phage portal protein  32.63 
 
 
411 aa  179  8e-44  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.25148 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0862  phage portal protein, HK97 family  30.42 
 
 
389 aa  178  1e-43  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00000000555494  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3945  HK97 family phage portal protein  32.96 
 
 
404 aa  179  1e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.00231416  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1617  HK97 family phage portal protein  30.99 
 
 
426 aa  169  7e-41  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.709388  normal  0.287703 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1996  phage portal protein, HK97 family  30.28 
 
 
473 aa  164  4.0000000000000004e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0457981  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0463  phage portal protein  28.57 
 
 
411 aa  163  6e-39  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.390433 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1682  phage phi-105 ORF25-like protein  28.03 
 
 
407 aa  160  4e-38  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.844077 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0953  HK97 family phage portal protein  30.85 
 
 
404 aa  160  4e-38  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1898  HK97 family phage portal protein  31.83 
 
 
416 aa  159  7e-38  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2492  Phage portal protein, HK97  30.45 
 
 
395 aa  154  2.9999999999999998e-36  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008265  CPR_C0014  phage portal protein, HK97 family  27.7 
 
 
409 aa  149  9e-35  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2595  HK97 family phage portal protein  29.29 
 
 
436 aa  149  1.0000000000000001e-34  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3975  phage portal protein, HK97 family  29.74 
 
 
398 aa  147  3e-34  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2622  phage portal protein, HK97 family  28 
 
 
417 aa  147  5e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.830928  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1045  head portal protein  27.46 
 
 
460 aa  145  2e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.326172  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7331  phage portal protein, HK97 family  28.77 
 
 
428 aa  145  2e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.110514  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4979  hypothetical protein  28.65 
 
 
436 aa  144  4e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5358  hypothetical protein  28.65 
 
 
436 aa  144  4e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6184  portal protein  28.74 
 
 
414 aa  143  5e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2472  phage portal protein, HK97 family  29.74 
 
 
542 aa  140  6e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0858  phage lambdaBa02, DNA replication protein  29.17 
 
 
408 aa  139  7e-32  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3865  HK97 family phage portal protein  27.11 
 
 
429 aa  139  7e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00272242 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1717  Phage portal protein, HK97  28.42 
 
 
406 aa  139  7.999999999999999e-32  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0339  Phage portal protein, HK97  28.76 
 
 
407 aa  139  1e-31  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0482575  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2600  HK97 family phage portal protein  26.7 
 
 
408 aa  139  1e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0139387 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1751  HK97 family phage portal protein  27.23 
 
 
420 aa  138  2e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.518591 
 
 
-
 
NC_010721  Mpop_5463  hypothetical protein  27.01 
 
 
412 aa  137  3.0000000000000003e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2502  phage portal protein, HK97 family  26.82 
 
 
420 aa  135  9.999999999999999e-31  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.160981  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2027  phage portal protein  27.75 
 
 
406 aa  135  9.999999999999999e-31  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2360  head HK97 family portal protein  29.03 
 
 
397 aa  135  1.9999999999999998e-30  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.479162  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2891  putative phage portal protein, HK97 family  26.47 
 
 
833 aa  134  3.9999999999999996e-30  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000639413 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2245  putative phage portal protein, HK97 family  26.47 
 
 
859 aa  134  3.9999999999999996e-30  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000140812 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1540  putative phage portal protein, HK97 family  26.47 
 
 
833 aa  134  5e-30  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.533039 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2199  HK97 family portal protein , putative  34.31 
 
 
225 aa  132  1.0000000000000001e-29  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4113  HK97 family phage portal protein  27.71 
 
 
455 aa  132  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1624  Phage portal protein, HK97  25.21 
 
 
428 aa  128  2.0000000000000002e-28  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0210145  normal 
 
 
-
 
NC_014149  Plim_4251  phage portal protein, HK97 family  28.05 
 
 
544 aa  126  6e-28  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1586  HK97 family phage portal protein  25.97 
 
 
415 aa  126  6e-28  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00170734  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2611  phage portal protein, HK97 family  25.87 
 
 
454 aa  126  8.000000000000001e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.864605  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4284  phage portal protein, HK97 family  25.87 
 
 
454 aa  126  8.000000000000001e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0625  phage portal protein, HK97 family  28.08 
 
 
413 aa  122  9.999999999999999e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0243  HK97 family phage portal protein  26.11 
 
 
441 aa  121  3e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4004  phage portal protein, HK97 family  29.14 
 
 
413 aa  120  3.9999999999999996e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2236  HK97 family phage portal protein  25.45 
 
 
447 aa  119  9.999999999999999e-26  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.759812  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5065  phage portal protein, HK97 family  25.69 
 
 
455 aa  117  5e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2238  phage portal protein, HK97 family  25.25 
 
 
389 aa  114  3e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0330088  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3314  phage portal protein, HK97 family  25.56 
 
 
433 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000016128 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4078  phage portal protein, HK97 family  25.38 
 
 
457 aa  112  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.333282  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3805  hypothetical protein  25.24 
 
 
404 aa  109  9.000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0555  phage portal protein, HK97 family  26.18 
 
 
448 aa  108  2e-22  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0158159  hitchhiker  0.0015106 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1356  HK97 family phage portal protein  25.63 
 
 
393 aa  107  4e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.423386 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3489  Phage portal protein, HK97  26.86 
 
 
391 aa  107  6e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2092  phage portal protein, HK97 family  25.07 
 
 
391 aa  104  3e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1457  phage portal protein, HK97 family  26.43 
 
 
417 aa  103  5e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0274  HK97 family phage portal protein  26.87 
 
 
392 aa  102  1e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1303  phage portal protein, HK97 family  22.84 
 
 
437 aa  100  4e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4093  hypothetical protein  24.45 
 
 
389 aa  100  5e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2997  putative head portal protein  24.11 
 
 
408 aa  100  6e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.429219  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1801  Phage portal protein, HK97  26.96 
 
 
391 aa  98.6  2e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.595196  normal  0.0740588 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1410  Phage portal protein, HK97  26.51 
 
 
391 aa  97.4  4e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1060  HK97 family phage portal protein  24.05 
 
 
412 aa  97.1  6e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1080  HK97 family phage portal protein  24.05 
 
 
412 aa  97.1  6e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>